7 static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb);
9 /////////////////////////////////////////////////////////////////
12 * \brief Constructor dedicated to writing a new DICOMV3 part10 compliant
13 * \file (see SetFileName, SetDcmTag and Write)
14 * \Opens (in read only and when possible) an existing file and checks
15 * \for DICOM compliance. Returns NULL on failure.
16 * \Note: the in-memory representation of all available tags found in
17 * \the DICOM header is post-poned to first header information access.
18 * \This avoid a double parsing of public part of the header when
19 * \one sets an a posteriori shadow dictionary (efficiency can be
20 * \seen as a side effect).
27 gdcmFile::gdcmFile(string & filename)
28 :gdcmHeader(filename.c_str())
30 if (DEBUG) printf("On a echappe a gdcmHeader !\n");
34 /////////////////////////////////////////////////////////////////
37 * \brief Renvoie la longueur A ALLOUER pour recevoir les pixels de l'image
38 * \ ou DES images dans le cas d'un multiframe
39 * \ ATTENTION : il ne s'agit PAS de la longueur du groupe des Pixels
40 * \ (dans le cas d'images compressees, elle n'a pas de sens).
42 * @param void Rien en entree
44 * @return longueur a allouer
47 size_t gdcmFile::GetImageDataSize(void) {
48 int nbLignes, nbCol, nbFrames, nb;
49 string str_nbFrames, str_nb;
51 nbLignes=atoi(gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
53 nbCol =atoi(gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
55 printf("nbCol %d\n",nbCol);
56 printf("nbLig %d\n",nbLignes);
60 str_nbFrames=gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
62 if (str_nbFrames == "gdcm::Unfound" ) {
65 nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
67 printf("nbFrames %d\n",nbFrames);
69 // Nombre de Bits Alloues pour le stockage d'un Pixel
70 str_nb=gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
72 if (str_nb == "gdcm::Unfound" ) {
75 nb = atoi(str_nb.c_str() );
80 size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
85 /////////////////////////////////////////////////////////////////
88 * \brief amene en mémoire les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
89 * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
93 * @return Pointeur sur la zone mémoire contenant les Pixels lus
96 void * gdcmFile::GetImageData (void) {
101 int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
102 string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
104 unsigned short int mask = 0xffff;
107 nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
108 // Nombre de Colonnes
109 nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
112 str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
115 if (str_nbFrames == "gdcm::Unfound" ) {
118 nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
121 // Nombre de Bits Alloues
122 str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
124 if (str_nb == "gdcm::Unfound" ) {
127 nb = atoi(str_nb.c_str() );
130 // Nombre de Bits Utilises
131 str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
133 if (str_nbu == "gdcm::Unfound" ) {
136 nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
139 // Position du Bit de Poids Fort
140 str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
142 if (str_highBit == "gdcm::Unfound" ) {
145 highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
148 // Signe des Pixels 0 : Unsigned
149 str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
151 if (str_signe == "gdcm::Unfound" ) {
154 signe = atoi(str_signe.c_str() );
157 // Longueur en Octets des Pixels a lire
158 size_t _lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
160 //Pixels = (char *) g_malloc(_lgrTotale);
161 _Pixels = (char *) malloc(_lgrTotale);
163 GetPixels(lgrTotale, _Pixels);
165 // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
167 int _sw = GetSwapCode();
169 _Swap (_Pixels, _sw, _lgrTotale, nb);
172 // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
174 // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
175 // avec moins de 32 bits utilises
176 // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
177 // --> ne marchera pas dans ce cas
179 mask = mask >> (nb-nbu);
180 int l=(int)_lgrTotale/(nb/8);
181 unsigned short *deb = (unsigned short *)_Pixels;
182 for(int i=0;i<l;i++) {
183 *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
188 printf ("on est sorti\n");
190 // On l'affecte à un champ du dcmFile
193 lgrTotale = _lgrTotale;
196 // ca fait double emploi, il faudra nettoyer ça
202 /////////////////////////////////////////////////////////////////
205 * \brief amene en mémoire dans une zone précisee par l'utilisateur
206 * \les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
207 * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
214 int gdcmFile::PutImageDataHere (void* destination, size_t MaxSize) {
216 void * Pixels = destination; // pour garder le code identique avec GetImageData
219 int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
220 string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
222 unsigned short int mask = 0xffff;
225 nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
226 // Nombre de Colonnes
227 nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
230 str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
233 if (str_nbFrames == "gdcm::Unfound" ) {
236 nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
239 // Nombre de Bits Alloues
240 str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
242 if (str_nb == "gdcm::Unfound" ) {
245 nb = atoi(str_nb.c_str() );
248 // Nombre de Bits Utilises
249 str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
251 if (str_nbu == "gdcm::Unfound" ) {
254 nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
257 // Position du Bit de Poids Fort
258 str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
260 if (str_highBit == "gdcm::Unfound" ) {
263 highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
267 str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
269 if (str_signe == "gdcm::Unfound" ) {
272 signe = atoi(str_signe.c_str() );
275 // Longueur en Octets des Pixels a lire
276 size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
278 // si lgrTotale < MaxSize ==> Gros pb . A VOIR
280 lgrTotale = MaxSize; // pour garder le code identique avec GetImageData
281 //Pixels = (char *) malloc(lgrTotale); // pour garder le code identique avec GetImageData
283 GetPixels(lgrTotale, Pixels);
285 // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
287 int _sw = GetSwapCode();
289 _Swap (Pixels, _sw, lgrTotale, nb);
292 // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
294 // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
295 // avec moins de 32 bits utilises
296 // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
297 // --> ne marchera pas dans ce cas
299 mask = mask >> (nb-nbu);
300 int l=(int)lgrTotale/(nb/8);
301 unsigned short *deb = (unsigned short *)Pixels;
302 for(int i=0;i<l;i++) {
303 *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
308 printf ("on est sorti\n");
310 // VOIR s'il ne faudrait pas l'affecter à un champ du dcmHeader
312 //return (Pixels); // pour garder le code identique avec GetImageData
317 // Je laisse le code integral, au cas ça puisse etre reutilise ailleurs
320 static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb) {
339 ((unsigned short int*)im)[i]= ((((unsigned short int*)im)[i])>>8)
340 | ((((unsigned short int*)im)[i])<<8);
344 printf("valeur de SWAP (16 bits) non autorisee : %d\n", swap);
356 faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 4321 */
357 fort =((unsigned long int*)im)[i]>>16;
358 fort= (fort>>8) | (fort<<8);
359 faible=(faible>>8) | (faible<<8);
361 ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|fort;
367 faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 2143 */
368 fort=((unsigned long int*)im)[i]>>16;
369 fort= (fort>>8) | (fort<<8);
370 faible=(faible>>8) | (faible<<8);
372 ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|faible;
378 faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 3412 */
379 fort=((unsigned long int*)im)[i]>>16;
381 ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|fort;
386 printf("valeur de SWAP (32 bits) non autorisee : %d\n", swap);
394 /////////////////////////////////////////////////////////////////
397 * \brief Ecrit sur disque les pixels d'UNE image
398 * \Aucun test n'est fait sur l'"Endiannerie" du processeur.
399 * \ C'est à l'utilisateur d'appeler son Reader correctement
400 * \(Equivalent a IdImaWriteRawFile)
407 int gdcmFile::WriteRawData (string nomFichier) {
410 fp1 = fopen(nomFichier.c_str(),"wb");
412 printf("Echec ouverture (ecriture) Fichier [%s] \n",nomFichier.c_str());
416 fwrite (Pixels,lgrTotale, 1, fp1);