7 static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb);
9 /////////////////////////////////////////////////////////////////
12 * \brief Constructor dedicated to writing a new DICOMV3 part10 compliant
13 * \file (see SetFileName, SetDcmTag and Write)
14 * \Opens (in read only and when possible) an existing file and checks
15 * \for DICOM compliance. Returns NULL on failure.
16 * \Note: the in-memory representation of all available tags found in
17 * \the DICOM header is post-poned to first header information access.
18 * \This avoid a double parsing of public part of the header when
19 * \one sets an a posteriori shadow dictionary (efficiency can be
20 * \seen as a side effect).
27 gdcmFile::gdcmFile(string & filename)
28 :gdcmHeader(filename.c_str())
30 if (DEBUG) printf("On a echappe a gdcmHeader !\n");
34 /////////////////////////////////////////////////////////////////
37 * \brief Renvoie la longueur A ALLOUER pour recevoir les pixels de l'image
38 * \ ou DES images dans le cas d'un multiframe
39 * \ ATTENTION : il ne s'agit PAS de la longueur du groupe des Pixels
40 * \ (dans le cas d'images compressees, elle n'a pas de sens).
42 * @param void Rien en entree
44 * @return longueur a allouer
47 size_t gdcmFile::GetImageDataSize(void) {
48 int nbLignes, nbCol, nbFrames, nb;
49 string str_nbFrames, str_nb;
51 nbLignes=atoi(gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
53 nbCol =atoi(gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
55 printf("nbCol %d\n",nbCol);
56 printf("nbLig %d\n",nbLignes);
60 str_nbFrames=gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
62 if (str_nbFrames == "gdcm::Unfound" ) {
65 nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
67 printf("nbFrames %d\n",nbFrames);
69 // Nombre de Bits Alloues pour le stockage d'un Pixel
70 str_nb=gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
72 if (str_nb == "gdcm::Unfound" ) {
75 nb = atoi(str_nb.c_str() );
80 size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
85 /////////////////////////////////////////////////////////////////
88 * \brief amene en mémoire les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
89 * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
93 * @return Pointeur sur la zone mémoire contenant les Pixels lus
96 void * gdcmFile::GetImageData (void) {
101 int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
102 string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
104 unsigned short int mask = 0xffff;
107 nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
108 // Nombre de Colonnes
109 nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
112 str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
115 if (str_nbFrames == "gdcm::Unfound" ) {
118 nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
121 // Nombre de Bits Alloues
122 str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
124 if (str_nb == "gdcm::Unfound" ) {
127 nb = atoi(str_nb.c_str() );
130 // Nombre de Bits Utilises
131 str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
133 if (str_nbu == "gdcm::Unfound" ) {
136 nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
139 // Position du Bit de Poids Fort
140 str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
142 if (str_highBit == "gdcm::Unfound" ) {
145 highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
148 // Signe des Pixels 0 : Unsigned
149 str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
151 if (str_signe == "gdcm::Unfound" ) {
154 signe = atoi(str_signe.c_str() );
157 // Longueur en Octets des Pixels a lire
158 size_t _lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
160 //Pixels = (char *) g_malloc(_lgrTotale);
161 _Pixels = (char *) malloc(_lgrTotale);
163 GetPixels(lgrTotale, _Pixels);
165 // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
167 int _sw = GetSwapCode();
169 _Swap (_Pixels, _sw, _lgrTotale, nb);
172 // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
174 // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
175 // avec moins de 32 bits utilises
176 // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
177 // --> ne marchera pas dans ce cas
179 mask = mask >> (nb-nbu);
180 int l=(int)_lgrTotale/(nb/8);
181 unsigned short *deb = (unsigned short *)_Pixels;
182 for(int i=0;i<l;i++) {
183 *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
188 printf ("on est sorti\n");
190 // On l'affecte à un champ du dcmFile
193 lgrTotale = _lgrTotale;
199 /////////////////////////////////////////////////////////////////
202 * \brief amene en mémoire dans une zone précisee par l'utilisateur
203 * \les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
204 * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
211 int gdcmFile::PutImageDataHere (void* destination, size_t MaxSize) {
213 void * Pixels = destination; // pour garder le code identique avec GetImageData
216 int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
217 string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
219 unsigned short int mask = 0xffff;
222 nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
223 // Nombre de Colonnes
224 nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
227 str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
230 if (str_nbFrames == "gdcm::Unfound" ) {
233 nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
236 // Nombre de Bits Alloues
237 str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
239 if (str_nb == "gdcm::Unfound" ) {
242 nb = atoi(str_nb.c_str() );
245 // Nombre de Bits Utilises
246 str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
248 if (str_nbu == "gdcm::Unfound" ) {
251 nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
254 // Position du Bit de Poids Fort
255 str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
257 if (str_highBit == "gdcm::Unfound" ) {
260 highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
264 str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
266 if (str_signe == "gdcm::Unfound" ) {
269 signe = atoi(str_signe.c_str() );
272 // Longueur en Octets des Pixels a lire
273 size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
275 // si lgrTotale < MaxSize ==> Gros pb . A VOIR
277 lgrTotale = MaxSize; // pour garder le code identique avec GetImageData
278 //Pixels = (char *) malloc(lgrTotale); // pour garder le code identique avec GetImageData
280 GetPixels(lgrTotale, Pixels);
282 // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
284 int _sw = GetSwapCode();
286 _Swap (Pixels, _sw, lgrTotale, nb);
289 // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
291 // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
292 // avec moins de 32 bits utilises
293 // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
294 // --> ne marchera pas dans ce cas
296 mask = mask >> (nb-nbu);
297 int l=(int)lgrTotale/(nb/8);
298 unsigned short *deb = (unsigned short *)Pixels;
299 for(int i=0;i<l;i++) {
300 *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
305 printf ("on est sorti\n");
307 // VOIR s'il ne faudrait pas l'affecter à un champ du dcmHeader
309 //return (Pixels); // pour garder le code identique avec GetImageData
314 // Je laisse le code integral, au cas ça puisse etre reutilise ailleurs
317 static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb) {
336 ((unsigned short int*)im)[i]= ((((unsigned short int*)im)[i])>>8)
337 | ((((unsigned short int*)im)[i])<<8);
341 printf("valeur de SWAP (16 bits) non autorisee : %d\n", swap);
353 faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 4321 */
354 fort =((unsigned long int*)im)[i]>>16;
355 fort= (fort>>8) | (fort<<8);
356 faible=(faible>>8) | (faible<<8);
358 ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|fort;
364 faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 2143 */
365 fort=((unsigned long int*)im)[i]>>16;
366 fort= (fort>>8) | (fort<<8);
367 faible=(faible>>8) | (faible<<8);
369 ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|faible;
375 faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 3412 */
376 fort=((unsigned long int*)im)[i]>>16;
378 ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|fort;
383 printf("valeur de SWAP (32 bits) non autorisee : %d\n", swap);
391 /////////////////////////////////////////////////////////////////
394 * \brief Ecrit sur disque les pixels d'UNE image
395 * \Aucun test n'est fait sur l'"Endiannerie" du processeur.
396 * \ C'est à l'utilisateur d'appeler son Reader correctement
397 * \(Equivalent a IdImaWriteRawFile)
404 int gdcmFile::WriteRawData (string nomFichier) {
407 fp1 = fopen(nomFichier.c_str(),"wb");
409 printf("Echec ouverture (ecriture) Fichier [%s] \n",nomFichier.c_str());
413 fwrite (Pixels,lgrTotale, 1, fp1);