src/gdcmHeader.cxx

   1 #include "gdcm.h"
   2 extern "C" {
   3 #include "glib.h"
   4 }
   5 #include <stdio.h>
   6 // For nthos:
   7 #ifdef _MSC_VER
   8 #include <winsock.h>
   9 #else
  10 #include <netinet/in.h>
  11 #endif
  12 #include <cctype>               // for isalpha
  13 #include <map>
  14 #include <sstream>
  15 #include "gdcmUtil.h"
  16
  17 #define HEADER_LENGHT_TO_READ 256 // on ne lit plus que le debut
  18
  19 namespace Error {
  20         struct FileReadError {
  21                 FileReadError(FILE* fp, const char* Mesg) {
  22                         if (feof(fp))
  23                                 dbg.Verbose(1, "EOF encountered :", Mesg);
  24                         if (ferror(fp))
  25                                 dbg.Verbose(1, "Error on reading :", Mesg);
  26                 }
  27         };
  28 }
  29
  30 //FIXME: this looks dirty to me...
  31 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  32
  33 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
  34 gdcmDictSet* gdcmHeader::Dicts = new gdcmDictSet();
  35
  36 void gdcmHeader::Initialise(void) {
  37         if (!gdcmHeader::dicom_vr)
  38                 InitVRDict();
  39         RefPubDict = gdcmHeader::Dicts->GetDefaultPublicDict();
  40         RefShaDict = (gdcmDict*)0;
  41 }
  42
  43 gdcmHeader::gdcmHeader (const char* InFilename) {
  44         filename = InFilename;
  45         Initialise();
  46         fp=fopen(InFilename,"rw");
  47         dbg.Error(!fp, "gdcmHeader::gdcmHeader cannot open file", InFilename);
  48         ParseHeader();
  49 }
  50
  51 gdcmHeader::~gdcmHeader (void) {
  52         fclose(fp);
  53         return;
  54 }
  55
  56 void gdcmHeader::InitVRDict (void) {
  57         if (dicom_vr) {
  58                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::InitVRDict:", "VR dictionary allready set");
  59                 return;
  60         }
  61         VRHT *vr = new VRHT;
  62         (*vr)["AE"] = "Application Entity";       // 16 car max
  63         (*vr)["AS"] = "Age String";               // 4 car fixe
  64         (*vr)["AT"] = "Attribute Tag";            // 2 unsigned short int
  65         (*vr)["CS"] = "Code String";              // 16 car max
  66         (*vr)["DA"] = "Date";                     // 8 car fixe
  67         (*vr)["DS"] = "Decimal String";           // Decimal codé Binaire 16 max
  68         (*vr)["DT"] = "Date Time";                // 26 car max
  69         (*vr)["FL"] = "Floating Point Single";    // 4 octets IEEE 754:1985
  70         (*vr)["FD"] = "Floating Point Double";    // 8 octets IEEE 754:1985
  71         (*vr)["IS"] = "Integer String";           // en format externe 12 max
  72         (*vr)["LO"] = "Long String";              // 64 octets max
  73         (*vr)["LT"] = "Long Text";                // 10240 max
  74         (*vr)["OB"] = "Other Byte String";
  75         (*vr)["OW"] = "Other Word String";
  76         (*vr)["PN"] = "Person Name";
  77         (*vr)["SH"] = "Short String";             // 16 car max
  78         (*vr)["SL"] = "Signed Long";
  79         (*vr)["SQ"] = "Sequence of Items";        // Not Applicable
  80         (*vr)["SS"] = "Signed Short";             // 2 octets
  81         (*vr)["ST"] = "Short Text";               // 1024 car max
  82         (*vr)["TM"] = "Time";                     // 16 car max
  83         (*vr)["UI"] = "Unique Identifier";        // 64 car max
  84         (*vr)["UN"] = "Unknown";
  85         (*vr)["UT"] = "Unlimited Text";           //  2 puissance 32 -1 car max
  86         (*vr)["UL"] = "Unsigned Long ";           // 4 octets fixe
  87         (*vr)["US"] = "Unsigned Short ";          // 2 octets fixe
  88    dicom_vr = vr;
  89 }
  90
  91 /**
  92  * \ingroup gdcmHeader
  93  * \brief   La seule maniere sure que l'on aie pour determiner
  94  *          si on est en   LITTLE_ENDIAN,       BIG-ENDIAN,
  95  *          BAD-LITTLE-ENDIAN, BAD-BIG-ENDIAN
  96  *          est de trouver l'element qui donne la longueur d'un 'GROUP'
  97  *          (on sait que la longueur de cet element vaut 0x00000004)
  98  *          et de regarder comment cette longueur est codee en memoire
  99  *
 100  *          Le probleme vient de ce que parfois, il n'y en a pas ...
 101  *
 102  *          On fait alors le pari qu'on a a faire a du LITTLE_ENDIAN propre.
 103  *          (Ce qui est la norme -pas respectee- depuis ACR-NEMA)
 104  *          Si ce n'est pas le cas, on ne peut rien faire.
 105  *
 106  *          (il faudrait avoir des fonctions auxquelles
 107  *          on passe le code Swap en parametre, pour faire des essais 'manuels')
 108  */
 109 void gdcmHeader::CheckSwap()
 110 {
 111         guint32  s;
 112         guint32  x=4;  // x : pour ntohs
 113         bool net2host; // true when HostByteOrder is the same as NetworkByteOrder
 114
 115         int lgrLue;
 116         char * entCur;
 117         char deb[HEADER_LENGHT_TO_READ];
 118
 119         // First, compare HostByteOrder and NetworkByteOrder in order to
 120         // determine if we shall need to swap bytes (i.e. the Endian type).
 121         if (x==ntohs(x))
 122                 net2host = true;
 123         else
 124                 net2host = false;
 125
 126         // The easiest case is the one of a DICOM header, since it possesses a
 127         // file preamble where it suffice to look for the sting "DICM".
 128         lgrLue = fread(deb, 1, HEADER_LENGHT_TO_READ, fp);
 129
 130         entCur = deb + 128;
 131         if(memcmp(entCur, "DICM", (size_t)4) == 0) {
 132                 filetype = TrueDicom;
 133                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "looks like DICOM Version3");
 134         } else {
 135                 filetype = Unknown;
 136                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "not a DICOM Version3 file");
 137         }
 138
 139         if(filetype == TrueDicom) {
 140                 // Next, determine the value representation (VR). Let's skip to the
 141                 // first element (0002, 0000) and check there if we find "UL", in
 142                 // which case we (almost) know it is explicit VR.
 143                 // WARNING: if it happens to be implicit VR then what we will read
 144                 // is the length of the group. If this ascii representation of this
 145                 // length happens to be "UL" then we shall believe it is explicit VR.
 146                 // FIXME: in order to fix the above warning, we could read the next
 147                 // element value (or a couple of elements values) in order to make
 148                 // sure we are not commiting a big mistake.
 149                 // We need to skip :
 150                 // * the 128 bytes of File Preamble (often padded with zeroes),
 151                 // * the 4 bytes of "DICM" string,
 152                 // * the 4 bytes of the first tag (0002, 0000),
 153                 // i.e. a total of  136 bytes.
 154                 entCur = deb + 136;
 155                 if(memcmp(entCur, "UL", (size_t)2) == 0) {
 156                         filetype = ExplicitVR;
 157                         dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 158                                     "explicit Value Representation");
 159                 } else {
 160                         filetype = ImplicitVR;
 161                         dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 162                                     "not an explicit Value Representation");
 163                 }
 164
 165                 if (net2host) {
 166                         sw = 4321;
 167                         dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 168                                        "HostByteOrder != NetworkByteOrder");
 169                 } else {
 170                         sw = 0;
 171                         dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 172                                        "HostByteOrder = NetworkByteOrder");
 173                 }
 174
 175                 // Position the file position indicator at first tag (i.e.
 176                 // after the file preamble and the "DICM" string).
 177                 rewind(fp);
 178                 fseek (fp, 132L, SEEK_SET);
 179                 return;
 180         } // End of TrueDicom
 181
 182         // Alas, this is not a DicomV3 file and whatever happens there is no file
 183         // preamble. We can reset the file position indicator to where the data
 184         // is (i.e. the beginning of the file).
 185         rewind(fp);
 186
 187         // Our next best chance would be to be considering a 'clean' ACR/NEMA file.
 188         // By clean we mean that the length of the first tag is written down.
 189         // If this is the case and since the length of the first group HAS to be
 190         // four (bytes), then determining the proper swap code is straightforward.
 191
 192         entCur = deb + 4;
 193         s = str2num(entCur, int);
 194
 195         switch (s) {
 196         case 0x00040000 :
 197                 sw=3412;
 198                 filetype = ACR;
 199                 return;
 200         case 0x04000000 :
 201                 sw=4321;
 202                 filetype = ACR;
 203                 return;
 204         case 0x00000400 :
 205                 sw=2143;
 206                 filetype = ACR;
 207                 return;
 208         case 0x00000004 :
 209                 sw=0;
 210                 filetype = ACR;
 211                 return;
 212         default :
 213                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 214                                "ACE/NEMA unfound swap info (time to raise bets)");
 215         }
 216
 217         // We are out of luck. It is not a DicomV3 nor a 'clean' ACR/NEMA file.
 218         // It is time for despaired wild guesses. So, let's assume this file
 219         // happens to be 'dirty' ACR/NEMA, i.e. the length of the group it
 220         // not present. Then the only info we have is the net2host one.
 221         //FIXME  Si c'est du RAW, ca degagera + tard
 222
 223         if (! net2host )
 224                 sw = 0;
 225         else
 226                 sw = 4321;
 227         return;
 228 }
 229
 230 /**
 231  * \ingroup   gdcmHeader
 232  * \brief     recupere la longueur d'un champ DICOM.
 233  *            Preconditions:
 234  *            1/ le fichier doit deja avoir ete ouvert,
 235  *            2/ CheckSwap() doit avoir ete appele
 236  *            3/ la  partie 'group'  ainsi que la  partie 'elem'
 237  *               de l'acr_element doivent avoir ete lues.
 238  *
 239  *            ACR-NEMA : we allways get
 240  *                 GroupNumber   (2 Octets)
 241  *                 ElementNumber (2 Octets)
 242  *                 ElementSize   (4 Octets)
 243  *            DICOM en implicit Value Representation :
 244  *                 GroupNumber   (2 Octets)
 245  *                 ElementNumber (2 Octets)
 246  *                 ElementSize   (4 Octets)
 247  *
 248  *            DICOM en explicit Value Representation :
 249  *                 GroupNumber         (2 Octets)
 250  *                 ElementNumber       (2 Octets)
 251  *                 ValueRepresentation (2 Octets)
 252  *                 ElementSize         (2 Octets)
 253  *
 254  *            ATTENTION : dans le cas ou ValueRepresentation = OB, OW, SQ, UN
 255  *                 GroupNumber         (2 Octets)
 256  *                 ElementNumber       (2 Octets)
 257  *                 ValueRepresentation (2 Octets)
 258  *                 zone reservee       (2 Octets)
 259  *                 ElementSize         (4 Octets)
 260  *
 261  * @param sw  code swap
 262  * @param skippedLength  pointeur sur nombre d'octets que l'on a saute qd
 263  *                       la lecture est finie
 264  * @param longueurLue    pointeur sur longueur (en nombre d'octets)
 265  *                       effectivement lue
 266  * @return               longueur retenue pour le champ
 267  */
 268
 269 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
 270         char VR[3];
 271         string vr;
 272         int lgrLue;
 273         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 274         // Warning: we believe this is explicit VR (Value Representation) because
 275         // we used a heuristic that found "UL" in the first tag. Alas this
 276         // doesn't guarantee that all the tags will be in explicit VR. In some
 277         // cases (see e-film filtered files) one finds implicit VR tags mixed
 278         // within an explicit VR file. Hence we make sure the present tag
 279         // is in explicit VR and try to fix things if it happens not to be
 280         // the case.
 281         bool RealExplicit = true;
 282
 283         if (filetype != ExplicitVR)
 284                 return;
 285
 286         lgrLue=fread (&VR, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 287         VR[2]=0;
 288         vr = string(VR);
 289
 290         // Assume we are reading a falsely explicit VR file i.e. we reached
 291         // a tag where we expect reading a VR but are in fact we read the
 292         // first to bytes of the length. Then we will interogate (through find)
 293         // the dicom_vr dictionary with oddities like "\004\0" which crashes
 294         // both GCC and VC++ implentations of the STL map. Hence when the
 295         // expected VR read happens to be non-ascii characters we consider
 296         // we hit falsely explicit VR tag.
 297
 298         if ( (!isalpha(VR[0])) && (!isalpha(VR[1])) )
 299                 RealExplicit = false;
 300
 301         // CLEANME searching the dicom_vr at each occurence is expensive.
 302         // PostPone this test in an optional integrity check at the end
 303         // of parsing or only in debug mode.
 304         if ( RealExplicit && !dicom_vr->count(vr) )
 305                 RealExplicit = false;
 306
 307         if ( RealExplicit ) {
 308                 ElVal->SetVR(vr);
 309                 return;
 310         }
 311
 312         // We thought this was explicit VR, but we end up with an
 313         // implicit VR tag. Let's backtrack.
 314         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindVR:",
 315                        "Falsely explicit vr file");
 316         ElVal->SetVR("Implicit");
 317         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 318 }
 319
 320 void gdcmHeader::FindLength( ElValue * ElVal) {
 321         guint32 length32;
 322         guint16 length16;
 323         string vr = ElVal->GetVR();
 324
 325         if ( (filetype == ExplicitVR) && (vr != "Implicit") ) {
 326                 if ( (vr=="OB") || (vr=="OW") || (vr=="SQ") || (vr=="UN") ) {
 327
 328                         // The following two bytes are reserved, so we skip them,
 329                         // and we proceed on reading the length on 4 bytes.
 330                         fseek(fp, 2L,SEEK_CUR);
 331                         length32 = ReadInt32();
 332
 333                 } else {
 334                         // Length is encoded on 2 bytes.
 335                         length16 = ReadInt16();
 336
 337                         if ( length16 == 0xffff) {
 338                                 length32 = 0;
 339                         } else {
 340                                 length32 = length16;
 341                         }
 342                 }
 343         } else {
 344                 // Either implicit VR or an explicit VR that (at least for this
 345                 // element) lied a little bit. Length is on 4 bytes.
 346                 length32 = ReadInt32();
 347         }
 348
 349         // Traitement des curiosites sur la longueur
 350         if ( length32 == 0xffffffff)
 351                 length32=0;
 352
 353         ElVal->SetLength(length32);
 354 }
 355
 356
 357 /**
 358  * \ingroup gdcmHeader
 359  * \brief   remet les octets dans un ordre compatible avec celui du processeur
 360
 361  * @return  longueur retenue pour le champ
 362  */
 363 guint32 gdcmHeader::SwapLong(guint32 a) {
 364         // FIXME: il pourrait y avoir un pb pour les entiers negatifs ...
 365         switch (sw) {
 366         case    0 :
 367                 break;
 368         case 4321 :
 369                 a=(   ((a<<24) & 0xff000000) | ((a<<8)  & 0x00ff0000)    |
 370                       ((a>>8)  & 0x0000ff00) | ((a>>24) & 0x000000ff) );
 371                 break;
 372
 373         case 3412 :
 374                 a=(   ((a<<16) & 0xffff0000) | ((a>>16) & 0x0000ffff) );
 375                 break;
 376
 377         case 2143 :
 378                 a=(    ((a<<8) & 0xff00ff00) | ((a>>8) & 0x00ff00ff)  );
 379                 break;
 380         default :
 381                 dbg.Error(" gdcmHeader::SwapLong : unset swap code");
 382                 a=0;
 383         }
 384         return(a);
 385 }
 386
 387 /**
 388  * \ingroup gdcmHeader
 389  * \brief   Swaps the bytes so they agree with the processor order
 390
 391  * @return  longueur retenue pour le champ
 392  */
 393 guint16 gdcmHeader::SwapShort(guint16 a) {
 394         //FIXME how could sw be equal to 2143 since we never set it this way ?
 395         if ( (sw==4321)  || (sw==2143) )
 396                 a =(((a<<8) & 0x0ff00) | ((a>>8)&0x00ff));
 397         return (a);
 398 }
 399
 400 void gdcmHeader::SkipElementValue(ElValue * ElVal) {
 401         //FIXME don't dump the returned value
 402         (void)fseek(fp, (long)ElVal->GetLength(), SEEK_CUR);
 403 }
 404
 405 /**
 406  * \ingroup       gdcmHeader
 407  * \brief         Loads the element if it's size is not to big.
 408  * @param ElVal   Element whose value shall be loaded.
 409  * @param MaxSize Size treshold above which the element value is not
 410  *                loaded in memory. The element value is allways loaded
 411  *                when MaxSize is equal to UINT32_MAX.
 412  * @return
 413  */
 414 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
 415         size_t item_read;
 416         guint16 group  = ElVal->GetGroup();
 417         guint16 elem   = ElVal->GetElement();
 418         string  vr     = ElVal->GetVR();
 419         guint32 length = ElVal->GetLength();
 420         fseek(fp, (long)ElVal->GetOffset(), SEEK_SET);
 421
 422         // Sequences not treated yet !
 423         if( vr == "SQ" ) {
 424                 SkipElementValue(ElVal);
 425                 ElVal->SetLength(0);
 426                 return;
 427         }
 428         // A sequence "contains" a set of tags (called items). It looks like
 429         // the last tag of a sequence (the one that terminates the sequence)
 430         // has a group of 0xfffe (with a dummy length).
 431         if( group == 0xfffe) {
 432                 SkipElementValue(ElVal);
 433                 ElVal->SetLength(0);
 434                 return;
 435         }
 436
 437         if ( IsAnInteger(group, elem, vr, length) ) {
 438                 guint32 NewInt;
 439                 if( length == 2 ) {
 440                         NewInt = ReadInt16();
 441                 } else if( length == 4 ) {
 442                         NewInt = ReadInt32();
 443                 } else
 444                         dbg.Error(true, "LoadElementValue: Inconsistency when reading Int.");
 445
 446                 //FIXME: make the following an util fonction
 447                 ostringstream s;
 448                 s << NewInt;
 449                 ElVal->SetValue(s.str());
 450                 return;
 451         }
 452
 453         // FIXME The exact size should be length if we move to strings or whatever
 454         char* NewValue = (char*)g_malloc(length+1);
 455         if( !NewValue) {
 456                 dbg.Verbose(1, "LoadElementValue: Failed to allocate NewValue");
 457                 return;
 458         }
 459         NewValue[length]= 0;
 460
 461         // FIXME les elements trop long (seuil a fixer a la main) ne devraient
 462         // pas etre charge's !!!! Voir TODO.
 463         item_read = fread(NewValue, (size_t)length, (size_t)1, fp);
 464         if ( item_read != 1 ) {
 465                 g_free(NewValue);
 466                 Error::FileReadError(fp, "gdcmHeader::LoadElementValue");
 467                 ElVal->SetValue("gdcm::UnRead");
 468                 return;
 469         }
 470         ElVal->SetValue(NewValue);
 471 }
 472
 473
 474 guint16 gdcmHeader::ReadInt16(void) {
 475         guint16 g;
 476         size_t item_read;
 477         item_read = fread (&g, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 478         if ( item_read != 1 )
 479                 throw Error::FileReadError(fp, "gdcmHeader::ReadInt16");
 480         g = SwapShort(g);
 481         return g;
 482 }
 483
 484 guint32 gdcmHeader::ReadInt32(void) {
 485         guint32 g;
 486         size_t item_read;
 487         item_read = fread (&g, (size_t)4,(size_t)1, fp);
 488         if ( item_read != 1 )
 489                 throw Error::FileReadError(fp, "gdcmHeader::ReadInt32");
 490         g = SwapLong(g);
 491         return g;
 492 }
 493
 494 /**
 495  * \ingroup gdcmHeader
 496  * \brief   Read the next tag without loading it's value
 497  * @return  On succes the newly created ElValue, NULL on failure.
 498  */
 499
 500 ElValue * gdcmHeader::ReadNextElement(void) {
 501         guint16 g;
 502         guint16 n;
 503         ElValue * NewElVal;
 504
 505         try {
 506                 g = ReadInt16();
 507                 n = ReadInt16();
 508         }
 509         catch ( Error::FileReadError ) {
 510                 // We reached the EOF (or an error occured) and header parsing
 511                 // has to be considered as finished.
 512                 return (ElValue *)0;
 513         }
 514
 515         // Find out if the tag we encountered is in the dictionaries:
 516         gdcmDictEntry * NewTag = IsInDicts(g, n);
 517         if (!NewTag)
 518                 NewTag = new gdcmDictEntry(g, n, "Unknown", "Unknown", "Unknown");
 519
 520         NewElVal = new ElValue(NewTag);
 521         if (!NewElVal) {
 522                 dbg.Verbose(1, "ReadNextElement: failed to allocate ElValue");
 523                 return (ElValue*)0;
 524         }
 525
 526         FindVR(NewElVal);
 527         FindLength(NewElVal);
 528         NewElVal->SetOffset(ftell(fp));
 529         return NewElVal;
 530 }
 531
 532 bool gdcmHeader::IsAnInteger(guint16 group, guint16 element,
 533                                      string vr, guint32 length ) {
 534         // When we have some semantics on the element we just read, and we
 535         // a priori now we are dealing with an integer, then we can swap it's
 536         // element value properly.
 537         if ( element == 0 )  {  // This is the group length of the group
 538                 if (length != 4)
 539                         dbg.Error("gdcmHeader::ShouldBeSwaped", "should be four");
 540                 return true;
 541         }
 542
 543         if ( group % 2 != 0 )
 544                 // We only have some semantics on documented elements, which are
 545                 // the even ones.
 546                 return false;
 547
 548         if ( (length != 4) && ( length != 2) )
 549                 // Swapping only make sense on integers which are 2 or 4 bytes long.
 550                 return false;
 551
 552         if ( (vr == "UL") || (vr == "US") || (vr == "SL") || (vr == "SS") )
 553                 return true;
 554
 555         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0005) )
 556                 // This tag is retained from ACR/NEMA
 557                 // CHECKME Why should "Image Dimensions" be a single integer ?
 558                 return true;
 559
 560         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0200) )
 561                 // This tag is retained from ACR/NEMA
 562                 return true;
 563
 564         return false;
 565 }
 566
 567 /**
 568  * \ingroup gdcmHeader
 569  * \brief   Recover the offset (from the beginning of the file) of the pixels.
 570  */
 571 size_t gdcmHeader::GetPixelOffset(void) {
 572         // If this file complies with the norm we should encounter the
 573         // "Image Location" tag (0x0028,  0x0200). This tag contains the
 574         // the group that contains the pixel data (hence the "Pixel Data"
 575         // is found by indirection through the "Image Location").
 576         // Inside the group pointed by "Image Location" the searched element
 577         // is conventionally the element 0x0010 (when the norm is respected).
 578         //    When the "Image Location" is absent we default to group 0x7fe0.
 579         guint16 grPixel;
 580         guint16 numPixel;
 581         string ImageLocation = GetPubElValByName("Image Location");
 582         if ( ImageLocation == "UNFOUND" ) {
 583                 grPixel = 0x7FE0;
 584         } else {
 585                 grPixel = (guint16) atoi( ImageLocation.c_str() );
 586         }
 587         if (grPixel != 0x7fe0)
 588                 // FIXME is this still necessary ?
 589                 // Now, this looks like an old dirty fix for Philips imager
 590                 numPixel = 0x1010;
 591         else
 592                 numPixel = 0x0010;
 593         ElValue* PixelElement = PubElVals.GetElement(grPixel, numPixel);
 594         if (PixelElement)
 595                 return PixelElement->GetOffset();
 596         else
 597                 return 0;
 598 }
 599
 600 gdcmDictEntry * gdcmHeader::IsInDicts(guint32 group, guint32 element) {
 601         gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
 602         if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
 603                 //FIXME build a default dictionary !
 604                 printf("FIXME in gdcmHeader::IsInDicts\n");
 605         }
 606         if (RefPubDict) {
 607                 found = RefPubDict->GetTag(group, element);
 608                 if (found)
 609                         return found;
 610         }
 611         if (RefShaDict) {
 612                 found = RefShaDict->GetTag(group, element);
 613                 if (found)
 614                         return found;
 615         }
 616         return found;
 617 }
 618
 619 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
 620         return PubElVals.GetElValue(group, element);
 621 }
 622
 623 string gdcmHeader::GetPubElValByName(string TagName) {
 624         return PubElVals.GetElValue(TagName);
 625 }
 626
 627 /**
 628  * \ingroup gdcmHeader
 629  * \brief   Parses the header of the file but does NOT load element values.
 630  */
 631 void gdcmHeader::ParseHeader(void) {
 632         ElValue * newElValue = (ElValue *)0;
 633
 634         rewind(fp);
 635         CheckSwap();
 636         while ( (newElValue = ReadNextElement()) ) {
 637                 SkipElementValue(newElValue);
 638                 PubElVals.Add(newElValue);
 639         }
 640 }
 641
 642 /**
 643  * \ingroup gdcmHeader
 644  * \brief   Loads the element values of all the elements present in the
 645  *          public tag based hash table.
 646  */
 647 void gdcmHeader::LoadElements(void) {
 648         rewind(fp);
 649         TagElValueHT ht = PubElVals.GetTagHt();
 650         for (TagElValueHT::iterator tag = ht.begin(); tag != ht.end(); ++tag)
 651                 LoadElementValue(tag->second);
 652 }
 653
 654 void gdcmHeader::PrintPubElVal(ostream & os) {
 655         PubElVals.Print(os);
 656 }
 657
 658 void gdcmHeader::PrintPubDict(ostream & os) {
 659         RefPubDict->Print(os);
 660 }