src/gdcmHeader.cxx

   1 // gdcmHeader.cxx
   2
   3 #include <stdio.h>
   4 #include <cerrno>
   5 // For nthos:
   6 #ifdef _MSC_VER
   7 #include <winsock.h>
   8 #else
   9 #include <netinet/in.h>
  10 #endif
  11 #include <cctype>               // for isalpha
  12 #include <sstream>
  13 #include "gdcmUtil.h"
  14 #include "gdcmHeader.h"
  15
  16 #define HEADER_LENGTH_TO_READ           256     // on ne lit plus que le debut
  17 #define _MaxSizeLoadElementValue_       1024    // longueur au dela de laquelle on ne charge plus les valeurs
  18
  19 //FIXME: this looks dirty to me...
  20
  21 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  22
  23 // str est un pointeur dans un tableau de caractères, qui doit contenir,
  24 // à cet endroit la, la représentation binaire d'un entier (16 ou 32 bits)
  25 // je veux récupérer ça ... dans un entier.
  26 // s'il y a une autre solution, évitant des cast et les indirections,
  27 // je suis preneur
  28
  29 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
  30
  31 void gdcmHeader::Initialise(void) {
  32         if (!gdcmHeader::dicom_vr)
  33                 InitVRDict();
  34         Dicts = new gdcmDictSet();
  35         RefPubDict = Dicts->GetDefaultPubDict();
  36         RefShaDict = (gdcmDict*)0;
  37 }
  38
  39
  40 gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
  41   throw(gdcmFileError) {
  42   SetMaxSizeLoadElementValue(_MaxSizeLoadElementValue_);
  43   filename = InFilename;
  44   Initialise();
  45   fp=fopen(InFilename,"rb");
  46   if(exception_on_error) {
  47     if(!fp)
  48       throw gdcmFileError("gdcmHeader::gdcmHeader(const char *, bool)");
  49   }
  50   else
  51     dbg.Error(!fp, "gdcmHeader::gdcmHeader cannot open file", InFilename);
  52   ParseHeader();
  53   AddAndDefaultElements();
  54 }
  55
  56
  57 gdcmHeader::~gdcmHeader (void) {
  58         fclose(fp);
  59         return;
  60 }
  61
  62 void gdcmHeader::InitVRDict (void) {
  63         if (dicom_vr) {
  64                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::InitVRDict:", "VR dictionary allready set");
  65                 return;
  66         }
  67         VRHT *vr = new VRHT;
  68         (*vr)["AE"] = "Application Entity";       // At most 16 bytes
  69         (*vr)["AS"] = "Age String";               // Exactly 4 bytes
  70         (*vr)["AT"] = "Attribute Tag";            // 2 16-bit unsigned short integers
  71         (*vr)["CS"] = "Code String";              // At most 16 bytes
  72         (*vr)["DA"] = "Date";                     // Exactly 8 bytes
  73         (*vr)["DS"] = "Decimal String";           // At most 16 bytes
  74         (*vr)["DT"] = "Date Time";                // At most 26 bytes
  75         (*vr)["FL"] = "Floating Point Single";    // 32-bit IEEE 754:1985 float
  76         (*vr)["FD"] = "Floating Point Double";    // 64-bit IEEE 754:1985 double
  77         (*vr)["IS"] = "Integer String";           // At most 12 bytes
  78         (*vr)["LO"] = "Long String";              // At most 64 chars
  79         (*vr)["LT"] = "Long Text";                // At most 10240 chars
  80         (*vr)["OB"] = "Other Byte String";        // String of bytes (vr independant)
  81         (*vr)["OW"] = "Other Word String";        // String of 16-bit words (vr dep)
  82         (*vr)["PN"] = "Person Name";              // At most 64 chars
  83         (*vr)["SH"] = "Short String";             // At most 16 chars
  84         (*vr)["SL"] = "Signed Long";              // Exactly 4 bytes
  85         (*vr)["SQ"] = "Sequence of Items";        // Not Applicable
  86         (*vr)["SS"] = "Signed Short";             // Exactly 2 bytes
  87         (*vr)["ST"] = "Short Text";               // At most 1024 chars
  88         (*vr)["TM"] = "Time";                     // At most 16 bytes
  89         (*vr)["UI"] = "Unique Identifier";        // At most 64 bytes
  90         (*vr)["UL"] = "Unsigned Long ";           // Exactly 4 bytes
  91         (*vr)["UN"] = "Unknown";                  // Any length of bytes
  92         (*vr)["US"] = "Unsigned Short ";          // Exactly 2 bytes
  93         (*vr)["UT"] = "Unlimited Text";           // At most 2^32 -1 chars
  94    dicom_vr = vr;
  95 }
  96
  97 /**
  98  * \ingroup gdcmHeader
  99  * \brief   Discover what the swap code is (among little endian, big endian,
 100  *          bad little endian, bad big endian).
 101  *
 102  */
 103 void gdcmHeader::CheckSwap()
 104 {
 105         // The only guaranted way of finding the swap code is to find a
 106         // group tag since we know it's length has to be of four bytes i.e.
 107         // 0x00000004. Finding the swap code in then straigthforward. Trouble
 108         // occurs when we can't find such group...
 109         guint32  s;
 110         guint32  x=4;  // x : pour ntohs
 111         bool net2host; // true when HostByteOrder is the same as NetworkByteOrder
 112
 113         int lgrLue;
 114         char * entCur;
 115         char deb[HEADER_LENGTH_TO_READ];
 116
 117         // First, compare HostByteOrder and NetworkByteOrder in order to
 118         // determine if we shall need to swap bytes (i.e. the Endian type).
 119         if (x==ntohs(x))
 120                 net2host = true;
 121         else
 122                 net2host = false;
 123
 124         // The easiest case is the one of a DICOM header, since it possesses a
 125         // file preamble where it suffice to look for the string "DICM".
 126         lgrLue = fread(deb, 1, HEADER_LENGTH_TO_READ, fp);
 127
 128         entCur = deb + 128;
 129         if(memcmp(entCur, "DICM", (size_t)4) == 0) {
 130                 filetype = TrueDicom;
 131                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "looks like DICOM Version3");
 132         } else {
 133                 filetype = Unknown;
 134                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "not a DICOM Version3 file");
 135         }
 136
 137         if(filetype == TrueDicom) {
 138                 // Next, determine the value representation (VR). Let's skip to the
 139                 // first element (0002, 0000) and check there if we find "UL", in
 140                 // which case we (almost) know it is explicit VR.
 141                 // WARNING: if it happens to be implicit VR then what we will read
 142                 // is the length of the group. If this ascii representation of this
 143                 // length happens to be "UL" then we shall believe it is explicit VR.
 144                 // FIXME: in order to fix the above warning, we could read the next
 145                 // element value (or a couple of elements values) in order to make
 146                 // sure we are not commiting a big mistake.
 147                 // We need to skip :
 148                 // * the 128 bytes of File Preamble (often padded with zeroes),
 149                 // * the 4 bytes of "DICM" string,
 150                 // * the 4 bytes of the first tag (0002, 0000),
 151                 // i.e. a total of  136 bytes.
 152                 entCur = deb + 136;
 153                 if(memcmp(entCur, "UL", (size_t)2) == 0) {
 154                         filetype = ExplicitVR;
 155                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 156                                     "explicit Value Representation");
 157                 } else {
 158                         filetype = ImplicitVR;
 159                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 160                                     "not an explicit Value Representation");
 161                 }
 162
 163                 if (net2host) {
 164                         sw = 4321;
 165                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 166                                        "HostByteOrder != NetworkByteOrder");
 167                 } else {
 168                         sw = 0;
 169                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 170                                        "HostByteOrder = NetworkByteOrder");
 171                 }
 172
 173                 // Position the file position indicator at first tag (i.e.
 174                 // after the file preamble and the "DICM" string).
 175                 rewind(fp);
 176                 fseek (fp, 132L, SEEK_SET);
 177                 return;
 178         } // End of TrueDicom
 179
 180         // Alas, this is not a DicomV3 file and whatever happens there is no file
 181         // preamble. We can reset the file position indicator to where the data
 182         // is (i.e. the beginning of the file).
 183         rewind(fp);
 184
 185         // Our next best chance would be to be considering a 'clean' ACR/NEMA file.
 186         // By clean we mean that the length of the first tag is written down.
 187         // If this is the case and since the length of the first group HAS to be
 188         // four (bytes), then determining the proper swap code is straightforward.
 189
 190         entCur = deb + 4;
 191         s = str2num(entCur, guint32);
 192
 193         switch (s) {
 194         case 0x00040000 :
 195                 sw = 3412;
 196                 filetype = ACR;
 197                 return;
 198         case 0x04000000 :
 199                 sw = 4321;
 200                 filetype = ACR;
 201                 return;
 202         case 0x00000400 :
 203                 sw = 2143;
 204                 filetype = ACR;
 205                 return;
 206         case 0x00000004 :
 207                 sw = 0;
 208                 filetype = ACR;
 209                 return;
 210         default :
 211                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 212                                "ACR/NEMA unfound swap info (time to raise bets)");
 213         }
 214
 215         // We are out of luck. It is not a DicomV3 nor a 'clean' ACR/NEMA file.
 216         // It is time for despaired wild guesses. So, let's assume this file
 217         // happens to be 'dirty' ACR/NEMA, i.e. the length of the group is
 218         // not present. Then the only info we have is the net2host one.
 219         if (! net2host )
 220                 sw = 0;
 221         else
 222                 sw = 4321;
 223         return;
 224 }
 225
 226 void gdcmHeader::SwitchSwapToBigEndian(void) {
 227         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::SwitchSwapToBigEndian",
 228                        "Switching to BigEndian mode.");
 229         if ( sw == 0    ) {
 230                 sw = 4321;
 231                 return;
 232         }
 233         if ( sw == 4321 ) {
 234                 sw = 0;
 235                 return;
 236         }
 237         if ( sw == 3412 ) {
 238                 sw = 2143;
 239                 return;
 240         }
 241         if ( sw == 2143 )
 242                 sw = 3412;
 243 }
 244
 245 void gdcmHeader::GetPixels(size_t lgrTotale, void* _Pixels) {
 246         size_t pixelsOffset;
 247         pixelsOffset = GetPixelOffset();
 248         fseek(fp, pixelsOffset, SEEK_SET);
 249         fread(_Pixels, 1, lgrTotale, fp);
 250 }
 251
 252
 253
 254 /**
 255  * \ingroup   gdcmHeader
 256  * \brief     Find the value representation of the current tag.
 257  */
 258 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
 259         if (filetype != ExplicitVR)
 260                 return;
 261
 262         char VR[3];
 263         string vr;
 264         int lgrLue;
 265         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 266         // Warning: we believe this is explicit VR (Value Representation) because
 267         // we used a heuristic that found "UL" in the first tag. Alas this
 268         // doesn't guarantee that all the tags will be in explicit VR. In some
 269         // cases (see e-film filtered files) one finds implicit VR tags mixed
 270         // within an explicit VR file. Hence we make sure the present tag
 271         // is in explicit VR and try to fix things if it happens not to be
 272         // the case.
 273         bool RealExplicit = true;
 274
 275         lgrLue=fread (&VR, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 276         VR[2]=0;
 277         vr = string(VR);
 278
 279         // Assume we are reading a falsely explicit VR file i.e. we reached
 280         // a tag where we expect reading a VR but are in fact we read the
 281         // first to bytes of the length. Then we will interogate (through find)
 282         // the dicom_vr dictionary with oddities like "\004\0" which crashes
 283         // both GCC and VC++ implementations of the STL map. Hence when the
 284         // expected VR read happens to be non-ascii characters we consider
 285         // we hit falsely explicit VR tag.
 286
 287         if ( (!isalpha(VR[0])) && (!isalpha(VR[1])) )
 288                 RealExplicit = false;
 289
 290         // CLEANME searching the dicom_vr at each occurence is expensive.
 291         // PostPone this test in an optional integrity check at the end
 292         // of parsing or only in debug mode.
 293         if ( RealExplicit && !dicom_vr->count(vr) )
 294                 RealExplicit = false;
 295
 296         if ( RealExplicit ) {
 297                 if ( ElVal->IsVrUnknown() ) {
 298                         // When not a dictionary entry, we can safely overwrite the vr.
 299                         ElVal->SetVR(vr);
 300                         return;
 301                 }
 302                 if ( ElVal->GetVR() == vr ) {
 303                         // The vr we just read and the dictionary agree. Nothing to do.
 304                         return;
 305                 }
 306                 // The vr present in the file and the dictionary disagree. We assume
 307                 // the file writer knew best and use the vr of the file. Since it would
 308                 // be unwise to overwrite the vr of a dictionary (since it would
 309                 // compromise it's next user), we need to clone the actual DictEntry
 310                 // and change the vr for the read one.
 311                 gdcmDictEntry* NewTag = new gdcmDictEntry(ElVal->GetGroup(),
 312                                            ElVal->GetElement(),
 313                                            vr,
 314                                            "FIXME",
 315                                            ElVal->GetName());
 316                 ElVal->SetDictEntry(NewTag);
 317                 return;
 318         }
 319
 320         // We thought this was explicit VR, but we end up with an
 321         // implicit VR tag. Let's backtrack.
 322         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindVR:", "Falsely explicit vr file");
 323         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 324         // When this element is known in the dictionary we shall use, e.g. for
 325         // the semantics (see  the usage of IsAnInteger), the vr proposed by the
 326         // dictionary entry. Still we have to flag the element as implicit since
 327         // we know now our assumption on expliciteness is not furfilled.
 328         // avoid  .
 329         if ( ElVal->IsVrUnknown() )
 330                 ElVal->SetVR("Implicit");
 331         ElVal->SetImplicitVr();
 332 }
 333
 334 /**
 335  * \ingroup gdcmHeader
 336  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 337  *          and if it corresponds to a ImplicitVRLittleEndian one.
 338  *
 339  * @return  True when ImplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 340  */
 341 bool gdcmHeader::IsImplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 342         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 343         if ( !Element )
 344                 return false;
 345         LoadElementValueSafe(Element);
 346         string Transfer = Element->GetValue();
 347         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2" )
 348                 return true;
 349         return false;
 350 }
 351
 352 /**
 353  * \ingroup gdcmHeader
 354  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 355  *          and if it corresponds to a ExplicitVRLittleEndian one.
 356  *
 357  * @return  True when ExplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 358  */
 359 bool gdcmHeader::IsExplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 360         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 361         if ( !Element )
 362                 return false;
 363         LoadElementValueSafe(Element);
 364         string Transfer = Element->GetValue();
 365         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.1" )
 366                 return true;
 367         return false;
 368 }
 369
 370 /**
 371  * \ingroup gdcmHeader
 372  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 373  *          and if it corresponds to a DeflatedExplicitVRLittleEndian one.
 374  *
 375  * @return  True when DeflatedExplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 376  */
 377 bool gdcmHeader::IsDeflatedExplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 378         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 379         if ( !Element )
 380                 return false;
 381         LoadElementValueSafe(Element);
 382         string Transfer = Element->GetValue();
 383         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.1.99" )
 384                 return true;
 385         return false;
 386 }
 387
 388
 389 /**
 390  * \ingroup gdcmHeader
 391  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 392  *          and if it corresponds to a Explicit VR Big Endian one.
 393  *
 394  * @return  True when big endian found. False in all other cases.
 395  */
 396 bool gdcmHeader::IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax(void) {
 397         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 398         if ( !Element )
 399                 return false;
 400         LoadElementValueSafe(Element);
 401         string Transfer = Element->GetValue();
 402         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.2" )
 403                 return true;
 404         return false;
 405 }
 406
 407
 408 /**
 409  * \ingroup gdcmHeader
 410  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 411  *          and if it corresponds to a JPEGBaseLineProcess1 one.
 412  *
 413  * @return  True when JPEGBaseLineProcess1found. False in all other cases.
 414  */
 415 bool gdcmHeader::IsJPEGBaseLineProcess1TransferSyntax(void) {
 416         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 417         if ( !Element )
 418                 return false;
 419         LoadElementValueSafe(Element);
 420         string Transfer = Element->GetValue();
 421         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.50" )
 422                 return true;
 423         return false;
 424 }
 425
 426 /**
 427  * \ingroup gdcmHeader
 428  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 429  *          and if it corresponds to a JPEGExtendedProcess2-4 one.
 430  *
 431  * @return  True when JPEGExtendedProcess2-4 found. False in all other cases.
 432  */
 433 bool gdcmHeader::IsJPEGExtendedProcess2_4TransferSyntax(void) {
 434         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 435         if ( !Element )
 436                 return false;
 437         LoadElementValueSafe(Element);
 438         string Transfer = Element->GetValue();
 439         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.51" )
 440                 return true;
 441         return false;
 442 }
 443
 444
 445 /**
 446  * \ingroup gdcmHeader
 447  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 448  *          and if it corresponds to a JPEGExtendeProcess3-5 one.
 449  *
 450  * @return  True when JPEGExtendedProcess3-5 found. False in all other cases.
 451  */
 452 bool gdcmHeader::IsJPEGExtendedProcess3_5TransferSyntax(void) {
 453         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 454         if ( !Element )
 455                 return false;
 456         LoadElementValueSafe(Element);
 457         string Transfer = Element->GetValue();
 458         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.52" )
 459                 return true;
 460         return false;
 461 }
 462
 463 /**
 464  * \ingroup gdcmHeader
 465  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 466  *          and if it corresponds to a JPEGSpectralSelectionProcess6-8 one.
 467  *
 468  * @return  True when JPEGSpectralSelectionProcess6-8 found. False in all other cases.
 469  */
 470 bool gdcmHeader::IsJPEGSpectralSelectionProcess6_8TransferSyntax(void) {
 471         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 472         if ( !Element )
 473                 return false;
 474         LoadElementValueSafe(Element);
 475         string Transfer = Element->GetValue();
 476         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.53" )
 477                 return true;
 478         return false;
 479 }
 480
 481 //
 482 // Euhhhhhhh
 483 // Il y en a encore DIX-SEPT, comme ça.
 484 // Il faudrait trouver qq chose + rusé ...
 485 //
 486 // --> probablement TOUS les supprimer (Eric dixit)
 487 //
 488
 489
 490 void gdcmHeader::FixFoundLength(ElValue * ElVal, guint32 FoundLength) {
 491         // Heuristic: a final fix.
 492         if ( FoundLength == 0xffffffff)
 493                 FoundLength = 0;
 494         ElVal->SetLength(FoundLength);
 495 }
 496
 497 guint32 gdcmHeader::FindLengthOB(void) {
 498         // See PS 3.5-2001, section A.4 p. 49 on encapsulation of encoded pixel data.
 499         guint16 g;
 500         guint16 n;
 501         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 502         bool FoundSequenceDelimiter = false;
 503         guint32 TotalLength = 0;
 504         guint32 ItemLength;
 505
 506         while ( ! FoundSequenceDelimiter) {
 507                 g = ReadInt16();
 508                 n = ReadInt16();
 509                 if (errno == 1)
 510                         return 0;
 511                 TotalLength += 4;  // We even have to decount the group and element
 512                 if ( g != 0xfffe ) {
 513                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindLengthOB: ",
 514                                     "wrong group for an item sequence.");
 515                         errno = 1;
 516                         return 0;
 517                 }
 518                 if ( n == 0xe0dd )
 519                         FoundSequenceDelimiter = true;
 520                 else if ( n != 0xe000) {
 521                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindLengthOB: ",
 522                                     "wrong element for an item sequence.");
 523                         errno = 1;
 524                         return 0;
 525                 }
 526                 ItemLength = ReadInt32();
 527                 TotalLength += ItemLength + 4;  // We add 4 bytes since we just read
 528                                                 // the ItemLength with ReadInt32
 529                 SkipBytes(ItemLength);
 530         }
 531         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 532         return TotalLength;
 533 }
 534
 535 void gdcmHeader::FindLength(ElValue * ElVal) {
 536         guint16 element = ElVal->GetElement();
 537         string  vr      = ElVal->GetVR();
 538         guint16 length16;
 539
 540         if ( (filetype == ExplicitVR) && ! ElVal->IsImplicitVr() ) {
 541
 542                 if ( (vr=="OB") || (vr=="OW") || (vr=="SQ") || (vr=="UN") ) {
 543                         // The following reserved two bytes (see PS 3.5-2001, section
 544                         // 7.1.2 Data element structure with explicit vr p27) must be
 545                         // skipped before proceeding on reading the length on 4 bytes.
 546                         fseek(fp, 2L, SEEK_CUR);
 547                         guint32 length32 = ReadInt32();
 548                         if ( (vr == "OB") && (length32 == 0xffffffff) ) {
 549                                 ElVal->SetLength(FindLengthOB());
 550                                 return;
 551                         }
 552                         FixFoundLength(ElVal, length32);
 553                         return;
 554                 }
 555
 556                 // Length is encoded on 2 bytes.
 557                 length16 = ReadInt16();
 558
 559                 // We can tell the current file is encoded in big endian (like
 560                 // Data/US-RGB-8-epicard) when we find the "Transfer Syntax" tag
 561                 // and it's value is the one of the encoding of a big endian file.
 562                 // In order to deal with such big endian encoded files, we have
 563                 // (at least) two strategies:
 564                 // * when we load the "Transfer Syntax" tag with value of big endian
 565                 //   encoding, we raise the proper flags. Then we wait for the end
 566                 //   of the META group (0x0002) among which is "Transfer Syntax",
 567                 //   before switching the swap code to big endian. We have to postpone
 568                 //   the switching of the swap code since the META group is fully encoded
 569                 //   in little endian, and big endian coding only starts at the next
 570                 //   group. The corresponding code can be hard to analyse and adds
 571                 //   many additional unnecessary tests for regular tags.
 572                 // * the second strategy consists in waiting for trouble, that shall appear
 573                 //   when we find the first group with big endian encoding. This is
 574                 //   easy to detect since the length of a "Group Length" tag (the
 575                 //   ones with zero as element number) has to be of 4 (0x0004). When we
 576                 //   encouter 1024 (0x0400) chances are the encoding changed and we
 577                 //   found a group with big endian encoding.
 578                 // We shall use this second strategy. In order make sure that we
 579                 // can interpret the presence of an apparently big endian encoded
 580                 // length of a "Group Length" without committing a big mistake, we
 581                 // add an additional check: we look in the allready parsed elements
 582                 // for the presence of a "Transfer Syntax" whose value has to be "big
 583                 // endian encoding". When this is the case, chances are we got our
 584                 // hands on a big endian encoded file: we switch the swap code to
 585                 // big endian and proceed...
 586                 if ( (element  == 0x000) && (length16 == 0x0400) ) {
 587                         if ( ! IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax() ) {
 588                                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::FindLength", "not explicit VR");
 589                                 errno = 1;
 590                                 return;
 591                         }
 592                         length16 = 4;
 593                         SwitchSwapToBigEndian();
 594                         // Restore the unproperly loaded values i.e. the group, the element
 595                         // and the dictionary entry depending on them.
 596                         guint16 CorrectGroup   = SwapShort(ElVal->GetGroup());
 597                         guint16 CorrectElem    = SwapShort(ElVal->GetElement());
 598                         gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByKey(CorrectGroup, CorrectElem);
 599                         if (!NewTag) {
 600                                 // This correct tag is not in the dictionary. Create a new one.
 601                                 NewTag = new gdcmDictEntry(CorrectGroup, CorrectElem);
 602                         }
 603                         // FIXME this can create a memory leaks on the old entry that be
 604                         // left unreferenced.
 605                         ElVal->SetDictEntry(NewTag);
 606                 }
 607
 608                 // Heuristic: well some files are really ill-formed.
 609                 if ( length16 == 0xffff) {
 610                         length16 = 0;
 611                         dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::FindLength",
 612                                     "Erroneous element length fixed.");
 613                 }
 614                 FixFoundLength(ElVal, (guint32)length16);
 615                 return;
 616         }
 617
 618         // Either implicit VR or a non DICOM conformal (see not below) explicit
 619         // VR that ommited the VR of (at least) this element. Farts happen.
 620         // [Note: according to the part 5, PS 3.5-2001, section 7.1 p25
 621         // on Data elements "Implicit and Explicit VR Data Elements shall
 622         // not coexist in a Data Set and Data Sets nested within it".]
 623         // Length is on 4 bytes.
 624         FixFoundLength(ElVal, ReadInt32());
 625 }
 626
 627 /**
 628  * \ingroup gdcmHeader
 629  * \brief   Swaps back the bytes of 4-byte long integer accordingly to
 630  *          processor order.
 631  *
 632  * @return  The suggested integer.
 633  */
 634 guint32 gdcmHeader::SwapLong(guint32 a) {
 635         // FIXME: il pourrait y avoir un pb pour les entiers negatifs ...
 636         switch (sw) {
 637         case    0 :
 638                 break;
 639         case 4321 :
 640                 a=(   ((a<<24) & 0xff000000) | ((a<<8)  & 0x00ff0000)    |
 641                       ((a>>8)  & 0x0000ff00) | ((a>>24) & 0x000000ff) );
 642                 break;
 643
 644         case 3412 :
 645                 a=(   ((a<<16) & 0xffff0000) | ((a>>16) & 0x0000ffff) );
 646                 break;
 647
 648         case 2143 :
 649                 a=(    ((a<<8) & 0xff00ff00) | ((a>>8) & 0x00ff00ff)  );
 650                 break;
 651         default :
 652                 dbg.Error(" gdcmHeader::SwapLong : unset swap code");
 653                 a=0;
 654         }
 655         return(a);
 656 }
 657
 658 /**
 659  * \ingroup gdcmHeader
 660  * \brief   Swaps the bytes so they agree with the processor order
 661  * @return  The properly swaped 16 bits integer.
 662  */
 663 guint16 gdcmHeader::SwapShort(guint16 a) {
 664         if ( (sw==4321)  || (sw==2143) )
 665                 a =(((a<<8) & 0x0ff00) | ((a>>8)&0x00ff));
 666         return (a);
 667 }
 668
 669 void gdcmHeader::SkipBytes(guint32 NBytes) {
 670         //FIXME don't dump the returned value
 671         (void)fseek(fp, (long)NBytes, SEEK_CUR);
 672 }
 673
 674 void gdcmHeader::SkipElementValue(ElValue * ElVal) {
 675         SkipBytes(ElVal->GetLength());
 676 }
 677
 678 void gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue(long NewSize) {
 679         if (NewSize < 0)
 680                 return;
 681         if ((guint32)NewSize >= (guint32)0xffffffff) {
 682                 MaxSizeLoadElementValue = 0xffffffff;
 683                 return;
 684         }
 685         MaxSizeLoadElementValue = NewSize;
 686 }
 687
 688 /**
 689  * \ingroup       gdcmHeader
 690  * \brief         Loads the element content if it's length is not bigger
 691  *                than the value specified with
 692  *                gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue()
 693  */
 694 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
 695         size_t item_read;
 696         guint16 group  = ElVal->GetGroup();
 697         guint16 elem   = ElVal->GetElement();
 698         string  vr     = ElVal->GetVR();
 699         guint32 length = ElVal->GetLength();
 700         bool SkipLoad  = false;
 701
 702         fseek(fp, (long)ElVal->GetOffset(), SEEK_SET);
 703
 704         // Sequences not treated yet !
 705         //
 706         // Ne faudrait-il pas au contraire trouver immediatement
 707         // une maniere 'propre' de traiter les sequences (vr = SQ)
 708         // car commencer par les ignorer risque de conduire a qq chose
 709         // qui pourrait ne pas etre generalisable
 710         //
 711         if( vr == "SQ" )
 712                 SkipLoad = true;
 713
 714         // Heuristic : a sequence "contains" a set of tags (called items). It looks
 715         // like the last tag of a sequence (the one that terminates the sequence)
 716         // has a group of 0xfffe (with a dummy length).
 717         if( group == 0xfffe )
 718                 SkipLoad = true;
 719
 720         // The group length doesn't represent data to be loaded in memory, since
 721         // each element of the group shall be loaded individualy.
 722         if( elem == 0 )
 723                 //SkipLoad = true;              // modif sauvage JPR
 724                                                                 // On charge la longueur du groupe
 725                                                                 // quand l'element 0x0000 est présent !
 726
 727         if ( SkipLoad ) {
 728                           // FIXME the following skip is not necessary
 729                 SkipElementValue(ElVal);
 730                 ElVal->SetLength(0);
 731                 ElVal->SetValue("gdcm::Skipped");
 732                 return;
 733         }
 734
 735         // When the length is zero things are easy:
 736         if ( length == 0 ) {
 737                 ElVal->SetValue("");
 738                 return;
 739         }
 740
 741         // The elements whose length is bigger than the specified upper bound
 742         // are not loaded. Instead we leave a short notice of the offset of
 743         // the element content and it's length.
 744         if (length > MaxSizeLoadElementValue) {
 745                 ostringstream s;
 746                 s << "gdcm::NotLoaded.";
 747                 s << " Address:" << (long)ElVal->GetOffset();
 748                 s << " Length:"  << ElVal->GetLength();
 749                 ElVal->SetValue(s.str());
 750                 return;
 751         }
 752
 753         // When an integer is expected, read and convert the following two or
 754         // four bytes properly i.e. as an integer as opposed to a string.
 755         if ( IsAnInteger(ElVal) ) {
 756                 guint32 NewInt;
 757                 if( length == 2 ) {
 758                         NewInt = ReadInt16();
 759                 } else if( length == 4 ) {
 760                         NewInt = ReadInt32();
 761                 } else
 762                         dbg.Error(true, "LoadElementValue: Inconsistency when reading Int.");
 763
 764                 //FIXME: make the following an util fonction
 765                 ostringstream s;
 766                 s << NewInt;
 767                 ElVal->SetValue(s.str());
 768                 return;
 769         }
 770
 771         // FIXME The exact size should be length if we move to strings or whatever
 772         char* NewValue = (char*)malloc(length+1);
 773         if( !NewValue) {
 774                 dbg.Verbose(1, "LoadElementValue: Failed to allocate NewValue");
 775                 return;
 776         }
 777         NewValue[length]= 0;
 778
 779         item_read = fread(NewValue, (size_t)length, (size_t)1, fp);
 780         if ( item_read != 1 ) {
 781                 free(NewValue);
 782                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::LoadElementValue","unread element value");
 783                 ElVal->SetValue("gdcm::UnRead");
 784                 return;
 785         }
 786         ElVal->SetValue(NewValue);
 787 }
 788
 789 /**
 790  * \ingroup       gdcmHeader
 791  * \brief         Loads the element while preserving the current
 792  *                underlying file position indicator as opposed to
 793  *                to LoadElementValue that modifies it.
 794  * @param ElVal   Element whose value shall be loaded.
 795  * @return
 796  */
 797 void gdcmHeader::LoadElementValueSafe(ElValue * ElVal) {
 798         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 799         LoadElementValue(ElVal);
 800         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 801 }
 802
 803
 804 guint16 gdcmHeader::ReadInt16(void) {
 805         guint16 g;
 806         size_t item_read;
 807         item_read = fread (&g, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 808         errno = 0;
 809         if ( item_read != 1 ) {
 810                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ReadInt16", " File read error");
 811                 errno = 1;
 812                 return 0;
 813         }
 814         g = SwapShort(g);
 815         return g;
 816 }
 817
 818 guint32 gdcmHeader::ReadInt32(void) {
 819         guint32 g;
 820         size_t item_read;
 821         item_read = fread (&g, (size_t)4,(size_t)1, fp);
 822         errno = 0;
 823         if ( item_read != 1 ) {
 824                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ReadInt32", " File read error");
 825                 errno = 1;
 826                 return 0;
 827         }
 828         g = SwapLong(g);
 829         return g;
 830 }
 831
 832 /**
 833  * \ingroup gdcmHeader
 834  * \brief   Build a new Element Value from all the low level arguments.
 835  *          Check for existence of dictionary entry, and build
 836  *          a default one when absent.
 837  * @param   Group group   of the underlying DictEntry
 838  * @param   Elem  element of the underlying DictEntry
 839  */
 840 ElValue* gdcmHeader::NewElValueByKey(guint16 Group, guint16 Elem) {
 841         // Find out if the tag we encountered is in the dictionaries:
 842         gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByKey(Group, Elem);
 843         if (!NewTag)
 844                 NewTag = new gdcmDictEntry(Group, Elem);
 845
 846         ElValue* NewElVal = new ElValue(NewTag);
 847         if (!NewElVal) {
 848                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::NewElValueByKey",
 849                             "failed to allocate ElValue");
 850                 return (ElValue*)0;
 851         }
 852    return NewElVal;
 853 }
 854
 855 /**
 856  * \ingroup gdcmHeader
 857  * \brief   Build a new Element Value from all the low level arguments.
 858  *          Check for existence of dictionary entry, and build
 859  *          a default one when absent.
 860  * @param   Name    Name of the underlying DictEntry
 861  */
 862 ElValue* gdcmHeader::NewElValueByName(string Name) {
 863
 864    gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByName(Name);
 865    if (!NewTag)
 866       NewTag = new gdcmDictEntry(0xffff, 0xffff, "LO", "Unknown", Name);
 867
 868    ElValue* NewElVal = new ElValue(NewTag);
 869    if (!NewElVal) {
 870       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ObtainElValueByName",
 871                   "failed to allocate ElValue");
 872       return (ElValue*)0;
 873    }
 874    return NewElVal;
 875 }
 876
 877
 878 /**
 879  * \ingroup gdcmHeader
 880  * \brief   Read the next tag without loading it's value
 881  * @return  On succes the newly created ElValue, NULL on failure.
 882  */
 883
 884 ElValue * gdcmHeader::ReadNextElement(void) {
 885         guint16 g;
 886         guint16 n;
 887         ElValue * NewElVal;
 888
 889         g = ReadInt16();
 890         n = ReadInt16();
 891         if (errno == 1)
 892                 // We reached the EOF (or an error occured) and header parsing
 893                 // has to be considered as finished.
 894                 return (ElValue *)0;
 895
 896         NewElVal = NewElValueByKey(g, n);
 897         FindVR(NewElVal);
 898         FindLength(NewElVal);
 899         if (errno == 1)
 900                 // Call it quits
 901                 return (ElValue *)0;
 902         NewElVal->SetOffset(ftell(fp));
 903         return NewElVal;
 904 }
 905
 906 bool gdcmHeader::IsAnInteger(ElValue * ElVal) {
 907         guint16 group   = ElVal->GetGroup();
 908         guint16 element = ElVal->GetElement();
 909         string  vr      = ElVal->GetVR();
 910         guint32 length  = ElVal->GetLength();
 911
 912         // When we have some semantics on the element we just read, and if we
 913         // a priori know we are dealing with an integer, then we shall be
 914         // able to swap it's element value properly.
 915         if ( element == 0 )  {  // This is the group length of the group
 916                 if (length == 4)
 917                         return true;
 918                 else
 919                         dbg.Error("gdcmHeader::IsAnInteger",
 920                                   "Erroneous Group Length element length.");
 921         }
 922
 923         if ( group % 2 != 0 )
 924                 // We only have some semantics on documented elements, which are
 925                 // the even ones.
 926                 return false;
 927
 928         if ( (length != 4) && ( length != 2) )
 929                 // Swapping only make sense on integers which are 2 or 4 bytes long.
 930                 return false;
 931
 932         if ( (vr == "UL") || (vr == "US") || (vr == "SL") || (vr == "SS") )
 933                 return true;
 934
 935         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0005) )
 936                 // The "Image Dimensions" tag is retained from ACR/NEMA and contains
 937                 // the number of dimensions of the contained object (1 for Signal,
 938                 // 2 for Image, 3 for Volume, 4 for Sequence).
 939                 return true;
 940
 941         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0200) )
 942                 // This tag is retained from ACR/NEMA
 943                 return true;
 944
 945         return false;
 946 }
 947
 948 /**
 949  * \ingroup gdcmHeader
 950  * \brief   Recover the offset (from the beginning of the file) of the pixels.
 951  */
 952 size_t gdcmHeader::GetPixelOffset(void) {
 953         // If this file complies with the norm we should encounter the
 954         // "Image Location" tag (0x0028,  0x0200). This tag contains the
 955         // the group that contains the pixel data (hence the "Pixel Data"
 956         // is found by indirection through the "Image Location").
 957         // Inside the group pointed by "Image Location" the searched element
 958         // is conventionally the element 0x0010 (when the norm is respected).
 959         //    When the "Image Location" is absent we default to group 0x7fe0.
 960         guint16 grPixel;
 961         guint16 numPixel;
 962         string ImageLocation = GetPubElValByName("Image Location");
 963         if ( ImageLocation == "gdcm::Unfound" ) {
 964                 grPixel = 0x7fe0;
 965         } else {
 966                 grPixel = (guint16) atoi( ImageLocation.c_str() );
 967         }
 968         if (grPixel != 0x7fe0)
 969                 // FIXME is this still necessary ?
 970                 // Now, this looks like an old dirty fix for Philips imager
 971                 numPixel = 0x1010;
 972         else
 973                 numPixel = 0x0010;
 974         ElValue* PixelElement = PubElVals.GetElementByNumber(grPixel, numPixel);
 975         if (PixelElement)
 976                 return PixelElement->GetOffset();
 977         else
 978                 return 0;
 979 }
 980
 981 /**
 982  * \ingroup gdcmHeader
 983  * \brief   Searches both the public and the shadow dictionary (when they
 984  *          exist) for the presence of the DictEntry with given
 985  *          group and element. The public dictionary has precedence on the
 986  *          shadow one.
 987  * @param   group   group of the searched DictEntry
 988  * @param   element element of the searched DictEntry
 989  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
 990  */
 991 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByKey(guint16 group, guint16 element) {
 992         gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
 993         if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
 994                 dbg.Verbose(0, "FIXME in gdcmHeader::GetDictEntry",
 995                      "we SHOULD have a default dictionary");
 996         }
 997         if (RefPubDict) {
 998                 found = RefPubDict->GetTagByKey(group, element);
 999                 if (found)
1000                         return found;
1001         }
1002         if (RefShaDict) {
1003                 found = RefShaDict->GetTagByKey(group, element);
1004                 if (found)
1005                         return found;
1006         }
1007         return found;
1008 }
1009
1010 /**
1011  * \ingroup gdcmHeader
1012  * \brief   Searches both the public and the shadow dictionary (when they
1013  *          exist) for the presence of the DictEntry with given name.
1014  *          The public dictionary has precedence on the shadow one.
1015  * @earam   Name name of the searched DictEntry
1016  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
1017  */
1018 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByName(string Name) {
1019         gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
1020         if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
1021                 dbg.Verbose(0, "FIXME in gdcmHeader::GetDictEntry",
1022                      "we SHOULD have a default dictionary");
1023         }
1024         if (RefPubDict) {
1025                 found = RefPubDict->GetTagByName(Name);
1026                 if (found)
1027                         return found;
1028         }
1029         if (RefShaDict) {
1030                 found = RefShaDict->GetTagByName(Name);
1031                 if (found)
1032                         return found;
1033         }
1034         return found;
1035 }
1036
1037 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1038         return PubElVals.GetElValueByNumber(group, element);
1039 }
1040
1041 string gdcmHeader::GetPubElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1042         ElValue* elem =  PubElVals.GetElementByNumber(group, element);
1043         if ( !elem )
1044                 return "gdcm::Unfound";
1045         return elem->GetVR();
1046 }
1047
1048 string gdcmHeader::GetPubElValByName(string TagName) {
1049         return PubElVals.GetElValueByName(TagName);
1050 }
1051
1052 string gdcmHeader::GetPubElValRepByName(string TagName) {
1053         ElValue* elem =  PubElVals.GetElementByName(TagName);
1054         if ( !elem )
1055                 return "gdcm::Unfound";
1056         return elem->GetVR();
1057 }
1058
1059 string gdcmHeader::GetShaElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1060         return ShaElVals.GetElValueByNumber(group, element);
1061 }
1062
1063 string gdcmHeader::GetShaElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1064         ElValue* elem =  ShaElVals.GetElementByNumber(group, element);
1065         if ( !elem )
1066                 return "gdcm::Unfound";
1067         return elem->GetVR();
1068 }
1069
1070 string gdcmHeader::GetShaElValByName(string TagName) {
1071         return ShaElVals.GetElValueByName(TagName);
1072 }
1073
1074 string gdcmHeader::GetShaElValRepByName(string TagName) {
1075         ElValue* elem =  ShaElVals.GetElementByName(TagName);
1076         if ( !elem )
1077                 return "gdcm::Unfound";
1078         return elem->GetVR();
1079 }
1080
1081 string gdcmHeader::GetElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1082         string pub = GetPubElValByNumber(group, element);
1083         if (pub.length())
1084                 return pub;
1085         return GetShaElValByNumber(group, element);
1086 }
1087
1088 string gdcmHeader::GetElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1089         string pub = GetPubElValRepByNumber(group, element);
1090         if (pub.length())
1091                 return pub;
1092         return GetShaElValRepByNumber(group, element);
1093 }
1094
1095 string gdcmHeader::GetElValByName(string TagName) {
1096         string pub = GetPubElValByName(TagName);
1097         if (pub.length())
1098                 return pub;
1099         return GetShaElValByName(TagName);
1100 }
1101
1102 string gdcmHeader::GetElValRepByName(string TagName) {
1103         string pub = GetPubElValRepByName(TagName);
1104         if (pub.length())
1105                 return pub;
1106         return GetShaElValRepByName(TagName);
1107 }
1108
1109 /**
1110  * \ingroup gdcmHeader
1111  * \brief   Accesses an existing ElValue in the PubElVals of this instance
1112  *          through it's (group, element) and modifies it's content with
1113  *          the given value.
1114  * @param   content new value to substitute with
1115  * @param   group   group of the ElVal to modify
1116  * @param   element element of the ElVal to modify
1117  */
1118 int gdcmHeader::SetPubElValByNumber(string content, guint16 group,
1119                                     guint16 element)
1120 {
1121         //CLEANME TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
1122         //CLEANME PubElVals.tagHt[key]->SetValue(content);
1123         return (  PubElVals.SetElValueByNumber (content, group, element) );
1124 }
1125
1126 /**
1127  * \ingroup gdcmHeader
1128  * \brief   Accesses an existing ElValue in the PubElVals of this instance
1129  *          through tag name and modifies it's content with the given value.
1130  * @param   content new value to substitute with
1131  * @param   TagName name of the tag to be modified
1132  */
1133 int gdcmHeader::SetPubElValByName(string content, string TagName) {
1134         //CLEANME TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
1135         //CLEANME PubElVals.tagHt[key]->SetValue(content);
1136         return (  PubElVals.SetElValueByName (content, TagName) );
1137 }
1138
1139 /**
1140  * \ingroup gdcmHeader
1141  * \brief   Accesses an existing ElValue in the ShaElVals of this instance
1142  *          through it's (group, element) and modifies it's content with
1143  *          the given value.
1144  * @param   content new value to substitute with
1145  * @param   group   group of the ElVal to modify
1146  * @param   element element of the ElVal to modify
1147  */
1148 int gdcmHeader::SetShaElValByNumber(string content,
1149                                     guint16 group, guint16 element)
1150 {
1151         return (  ShaElVals.SetElValueByNumber (content, group, element) );
1152 }
1153
1154 /**
1155  * \ingroup gdcmHeader
1156  * \brief   Accesses an existing ElValue in the ShaElVals of this instance
1157  *          through tag name and modifies it's content with the given value.
1158  * @param   content new value to substitute with
1159  * @param   TagName name of the tag to be modified
1160  */
1161 int gdcmHeader::SetShaElValByName(string content, string TagName) {
1162         return (  ShaElVals.SetElValueByName (content, TagName) );
1163 }
1164
1165 /**
1166  * \ingroup gdcmHeader
1167  * \brief   Parses the header of the file but WITHOUT loading element values.
1168  */
1169 void gdcmHeader::ParseHeader(bool exception_on_error) throw(gdcmFormatError) {
1170         ElValue * newElValue = (ElValue *)0;
1171
1172         rewind(fp);
1173         CheckSwap();
1174         while ( (newElValue = ReadNextElement()) ) {
1175                 SkipElementValue(newElValue);
1176                 PubElVals.Add(newElValue);
1177         }
1178 }
1179
1180 /**
1181  * \ingroup gdcmHeader
1182  * \brief   Once the header is parsed add some gdcm convenience/helper elements
1183  *          in the ElValSet. For example add:
1184  *          - gdcmImageType which is an entry containing a short for the
1185  *            type of image and whose value ranges in
1186  *               I8   (unsigned 8 bit image)
1187  *               I16  (unsigned 8 bit image)
1188  *               IS16 (signed 8 bit image)
1189  *          - gdcmXsize, gdcmYsize, gdcmZsize whose values are respectively
1190  *            the ones of the official DICOM fields Rows, Columns and Planes.
1191  */
1192 void gdcmHeader::AddAndDefaultElements(void) {
1193         ElValue* NewEntry = (ElValue*)0;
1194
1195         NewEntry = NewElValueByName("gdcmXSize");
1196         NewEntry->SetValue(GetElValByName("Rows"));
1197         PubElVals.Add(NewEntry);
1198
1199         NewEntry = NewElValueByName("gdcmYSize");
1200         NewEntry->SetValue(GetElValByName("Columns"));
1201         PubElVals.Add(NewEntry);
1202
1203         NewEntry = NewElValueByName("gdcmZSize");
1204         NewEntry->SetValue(GetElValByName("Planes"));
1205         PubElVals.Add(NewEntry);
1206 }
1207
1208 /**
1209  * \ingroup gdcmHeader
1210  * \brief   Loads the element values of all the elements present in the
1211  *          public tag based hash table.
1212  */
1213 void gdcmHeader::LoadElements(void) {
1214         rewind(fp);
1215         TagElValueHT ht = PubElVals.GetTagHt();
1216         for (TagElValueHT::iterator tag = ht.begin(); tag != ht.end(); ++tag) {
1217                 LoadElementValue(tag->second);
1218                 }
1219 }
1220
1221 void gdcmHeader::PrintPubElVal(ostream & os) {
1222         PubElVals.Print(os);
1223 }
1224
1225 void gdcmHeader::PrintPubDict(ostream & os) {
1226         RefPubDict->Print(os);
1227 }