src/gdcmHeader.cxx

   1 #include "gdcm.h"
   2 #include <stdio.h>
   3 // For nthos:
   4 #ifdef _MSC_VER
   5 #include <winsock.h>
   6 #else
   7 #include <netinet/in.h>
   8 #endif
   9 #include <cctype>               // for isalpha
  10 #include <map>
  11 #include <sstream>
  12 #include "gdcmUtil.h"
  13
  14 #define HEADER_LENGHT_TO_READ 256 // on ne lit plus que le debut
  15
  16 namespace Error {
  17         struct FileReadError {
  18                 FileReadError(FILE* fp, const char* Mesg) {
  19                         if (feof(fp))
  20                                 dbg.Verbose(1, "EOF encountered :", Mesg);
  21                         if (ferror(fp))
  22                                 dbg.Verbose(1, "Error on reading :", Mesg);
  23                 }
  24         };
  25 }
  26
  27 //FIXME: this looks dirty to me...
  28 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  29
  30 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
  31 gdcmDictSet* gdcmHeader::Dicts = new gdcmDictSet();
  32
  33 void gdcmHeader::Initialise(void) {
  34         if (!gdcmHeader::dicom_vr)
  35                 InitVRDict();
  36         RefPubDict = gdcmHeader::Dicts->GetDefaultPublicDict();
  37         RefShaDict = (gdcmDict*)0;
  38 }
  39
  40 gdcmHeader::gdcmHeader (const char* InFilename) {
  41         filename = InFilename;
  42         Initialise();
  43         fp=fopen(InFilename,"rw");
  44         dbg.Error(!fp, "gdcmHeader::gdcmHeader cannot open file", InFilename);
  45         ParseHeader();
  46 }
  47
  48 gdcmHeader::~gdcmHeader (void) {
  49         fclose(fp);
  50         return;
  51 }
  52
  53 void gdcmHeader::InitVRDict (void) {
  54         if (dicom_vr) {
  55                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::InitVRDict:", "VR dictionary allready set");
  56                 return;
  57         }
  58         VRHT *vr = new VRHT;
  59         (*vr)["AE"] = "Application Entity";       // 16 car max
  60         (*vr)["AS"] = "Age String";               // 4 car fixe
  61         (*vr)["AT"] = "Attribute Tag";            // 2 unsigned short int
  62         (*vr)["CS"] = "Code String";              // 16 car max
  63         (*vr)["DA"] = "Date";                     // 8 car fixe
  64         (*vr)["DS"] = "Decimal String";           // Decimal codé Binaire 16 max
  65         (*vr)["DT"] = "Date Time";                // 26 car max
  66         (*vr)["FL"] = "Floating Point Single";    // 4 octets IEEE 754:1985
  67         (*vr)["FD"] = "Floating Point Double";    // 8 octets IEEE 754:1985
  68         (*vr)["IS"] = "Integer String";           // en format externe 12 max
  69         (*vr)["LO"] = "Long String";              // 64 octets max
  70         (*vr)["LT"] = "Long Text";                // 10240 max
  71         (*vr)["OB"] = "Other Byte String";
  72         (*vr)["OW"] = "Other Word String";
  73         (*vr)["PN"] = "Person Name";
  74         (*vr)["SH"] = "Short String";             // 16 car max
  75         (*vr)["SL"] = "Signed Long";
  76         (*vr)["SQ"] = "Sequence of Items";        // Not Applicable
  77         (*vr)["SS"] = "Signed Short";             // 2 octets
  78         (*vr)["ST"] = "Short Text";               // 1024 car max
  79         (*vr)["TM"] = "Time";                     // 16 car max
  80         (*vr)["UI"] = "Unique Identifier";        // 64 car max
  81         (*vr)["UN"] = "Unknown";
  82         (*vr)["UT"] = "Unlimited Text";           //  2 puissance 32 -1 car max
  83         (*vr)["UL"] = "Unsigned Long ";           // 4 octets fixe
  84         (*vr)["US"] = "Unsigned Short ";          // 2 octets fixe
  85    dicom_vr = vr;
  86 }
  87
  88 /**
  89  * \ingroup gdcmHeader
  90  * \brief   La seule maniere sure que l'on aie pour determiner
  91  *          si on est en   LITTLE_ENDIAN,       BIG-ENDIAN,
  92  *          BAD-LITTLE-ENDIAN, BAD-BIG-ENDIAN
  93  *          est de trouver l'element qui donne la longueur d'un 'GROUP'
  94  *          (on sait que la longueur de cet element vaut 0x00000004)
  95  *          et de regarder comment cette longueur est codee en memoire
  96  *
  97  *          Le probleme vient de ce que parfois, il n'y en a pas ...
  98  *
  99  *          On fait alors le pari qu'on a a faire a du LITTLE_ENDIAN propre.
 100  *          (Ce qui est la norme -pas respectee- depuis ACR-NEMA)
 101  *          Si ce n'est pas le cas, on ne peut rien faire.
 102  *
 103  *          (il faudrait avoir des fonctions auxquelles
 104  *          on passe le code Swap en parametre, pour faire des essais 'manuels')
 105  */
 106 void gdcmHeader::CheckSwap()
 107 {
 108         guint32  s;
 109         guint32  x=4;  // x : pour ntohs
 110         bool net2host; // true when HostByteOrder is the same as NetworkByteOrder
 111
 112         int lgrLue;
 113         char * entCur;
 114         char deb[HEADER_LENGHT_TO_READ];
 115
 116         // First, compare HostByteOrder and NetworkByteOrder in order to
 117         // determine if we shall need to swap bytes (i.e. the Endian type).
 118         if (x==ntohs(x))
 119                 net2host = true;
 120         else
 121                 net2host = false;
 122
 123         // The easiest case is the one of a DICOM header, since it possesses a
 124         // file preamble where it suffice to look for the sting "DICM".
 125         lgrLue = fread(deb, 1, HEADER_LENGHT_TO_READ, fp);
 126
 127         entCur = deb + 128;
 128         if(memcmp(entCur, "DICM", (size_t)4) == 0) {
 129                 filetype = TrueDicom;
 130                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "looks like DICOM Version3");
 131         } else {
 132                 filetype = Unknown;
 133                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "not a DICOM Version3 file");
 134         }
 135
 136         if(filetype == TrueDicom) {
 137                 // Next, determine the value representation (VR). Let's skip to the
 138                 // first element (0002, 0000) and check there if we find "UL", in
 139                 // which case we (almost) know it is explicit VR.
 140                 // WARNING: if it happens to be implicit VR then what we will read
 141                 // is the length of the group. If this ascii representation of this
 142                 // length happens to be "UL" then we shall believe it is explicit VR.
 143                 // FIXME: in order to fix the above warning, we could read the next
 144                 // element value (or a couple of elements values) in order to make
 145                 // sure we are not commiting a big mistake.
 146                 // We need to skip :
 147                 // * the 128 bytes of File Preamble (often padded with zeroes),
 148                 // * the 4 bytes of "DICM" string,
 149                 // * the 4 bytes of the first tag (0002, 0000),
 150                 // i.e. a total of  136 bytes.
 151                 entCur = deb + 136;
 152                 if(memcmp(entCur, "UL", (size_t)2) == 0) {
 153                         filetype = ExplicitVR;
 154                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 155                                     "explicit Value Representation");
 156                 } else {
 157                         filetype = ImplicitVR;
 158                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 159                                     "not an explicit Value Representation");
 160                 }
 161
 162                 if (net2host) {
 163                         sw = 4321;
 164                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 165                                        "HostByteOrder != NetworkByteOrder");
 166                 } else {
 167                         sw = 0;
 168                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 169                                        "HostByteOrder = NetworkByteOrder");
 170                 }
 171
 172                 // Position the file position indicator at first tag (i.e.
 173                 // after the file preamble and the "DICM" string).
 174                 rewind(fp);
 175                 fseek (fp, 132L, SEEK_SET);
 176                 return;
 177         } // End of TrueDicom
 178
 179         // Alas, this is not a DicomV3 file and whatever happens there is no file
 180         // preamble. We can reset the file position indicator to where the data
 181         // is (i.e. the beginning of the file).
 182         rewind(fp);
 183
 184         // Our next best chance would be to be considering a 'clean' ACR/NEMA file.
 185         // By clean we mean that the length of the first tag is written down.
 186         // If this is the case and since the length of the first group HAS to be
 187         // four (bytes), then determining the proper swap code is straightforward.
 188
 189         entCur = deb + 4;
 190         s = str2num(entCur, int);
 191
 192         switch (s) {
 193         case 0x00040000 :
 194                 sw=3412;
 195                 filetype = ACR;
 196                 return;
 197         case 0x04000000 :
 198                 sw=4321;
 199                 filetype = ACR;
 200                 return;
 201         case 0x00000400 :
 202                 sw=2143;
 203                 filetype = ACR;
 204                 return;
 205         case 0x00000004 :
 206                 sw=0;
 207                 filetype = ACR;
 208                 return;
 209         default :
 210                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 211                                "ACE/NEMA unfound swap info (time to raise bets)");
 212         }
 213
 214         // We are out of luck. It is not a DicomV3 nor a 'clean' ACR/NEMA file.
 215         // It is time for despaired wild guesses. So, let's assume this file
 216         // happens to be 'dirty' ACR/NEMA, i.e. the length of the group it
 217         // not present. Then the only info we have is the net2host one.
 218         //FIXME  Si c'est du RAW, ca degagera + tard
 219
 220         if (! net2host )
 221                 sw = 0;
 222         else
 223                 sw = 4321;
 224         return;
 225 }
 226
 227 /**
 228  * \ingroup   gdcmHeader
 229  * \brief     recupere la longueur d'un champ DICOM.
 230  *            Preconditions:
 231  *            1/ le fichier doit deja avoir ete ouvert,
 232  *            2/ CheckSwap() doit avoir ete appele
 233  *            3/ la  partie 'group'  ainsi que la  partie 'elem'
 234  *               de l'acr_element doivent avoir ete lues.
 235  *
 236  *            ACR-NEMA : we allways get
 237  *                 GroupNumber   (2 Octets)
 238  *                 ElementNumber (2 Octets)
 239  *                 ElementSize   (4 Octets)
 240  *            DICOM en implicit Value Representation :
 241  *                 GroupNumber   (2 Octets)
 242  *                 ElementNumber (2 Octets)
 243  *                 ElementSize   (4 Octets)
 244  *
 245  *            DICOM en explicit Value Representation :
 246  *                 GroupNumber         (2 Octets)
 247  *                 ElementNumber       (2 Octets)
 248  *                 ValueRepresentation (2 Octets)
 249  *                 ElementSize         (2 Octets)
 250  *
 251  *            ATTENTION : dans le cas ou ValueRepresentation = OB, OW, SQ, UN
 252  *                 GroupNumber         (2 Octets)
 253  *                 ElementNumber       (2 Octets)
 254  *                 ValueRepresentation (2 Octets)
 255  *                 zone reservee       (2 Octets)
 256  *                 ElementSize         (4 Octets)
 257  *
 258  * @param sw  code swap
 259  * @param skippedLength  pointeur sur nombre d'octets que l'on a saute qd
 260  *                       la lecture est finie
 261  * @param longueurLue    pointeur sur longueur (en nombre d'octets)
 262  *                       effectivement lue
 263  * @return               longueur retenue pour le champ
 264  */
 265
 266 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
 267         char VR[3];
 268         string vr;
 269         int lgrLue;
 270         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 271         // Warning: we believe this is explicit VR (Value Representation) because
 272         // we used a heuristic that found "UL" in the first tag. Alas this
 273         // doesn't guarantee that all the tags will be in explicit VR. In some
 274         // cases (see e-film filtered files) one finds implicit VR tags mixed
 275         // within an explicit VR file. Hence we make sure the present tag
 276         // is in explicit VR and try to fix things if it happens not to be
 277         // the case.
 278         bool RealExplicit = true;
 279
 280         if (filetype != ExplicitVR)
 281                 return;
 282
 283         lgrLue=fread (&VR, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 284         VR[2]=0;
 285         vr = string(VR);
 286
 287         // Assume we are reading a falsely explicit VR file i.e. we reached
 288         // a tag where we expect reading a VR but are in fact we read the
 289         // first to bytes of the length. Then we will interogate (through find)
 290         // the dicom_vr dictionary with oddities like "\004\0" which crashes
 291         // both GCC and VC++ implentations of the STL map. Hence when the
 292         // expected VR read happens to be non-ascii characters we consider
 293         // we hit falsely explicit VR tag.
 294
 295         if ( (!isalpha(VR[0])) && (!isalpha(VR[1])) )
 296                 RealExplicit = false;
 297
 298         // CLEANME searching the dicom_vr at each occurence is expensive.
 299         // PostPone this test in an optional integrity check at the end
 300         // of parsing or only in debug mode.
 301         if ( RealExplicit && !dicom_vr->count(vr) )
 302                 RealExplicit = false;
 303
 304         if ( RealExplicit ) {
 305                 if ( ElVal->IsVrUnknown() )
 306                         ElVal->SetVR(vr);
 307                 return;
 308         }
 309
 310         // We thought this was explicit VR, but we end up with an
 311         // implicit VR tag. Let's backtrack.
 312         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindVR:", "Falsely explicit vr file");
 313         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 314         // When this element is known in the dictionary we shall use, e.g. for
 315         // the semantics (see  the usage of IsAnInteger), the vr proposed by the
 316         // dictionary entry. Still we have to flag the element as implicit since
 317         // we know now our assumption on expliciteness is not furfilled.
 318         // avoid  .
 319         if ( ElVal->IsVrUnknown() )
 320                 ElVal->SetVR("Implicit");
 321         ElVal->SetImplicitVr();
 322 }
 323
 324 void gdcmHeader::FindLength( ElValue * ElVal) {
 325         guint32 length32;
 326         guint16 length16;
 327         string vr = ElVal->GetVR();
 328
 329         if ( (filetype == ExplicitVR) && ! ElVal->IsImplicitVr() ) {
 330                 if ( (vr=="OB") || (vr=="OW") || (vr=="SQ") || (vr=="UN") ) {
 331
 332                         // The following two bytes are reserved, so we skip them,
 333                         // and we proceed on reading the length on 4 bytes.
 334                         fseek(fp, 2L,SEEK_CUR);
 335                         length32 = ReadInt32();
 336
 337                 } else {
 338                         // Length is encoded on 2 bytes.
 339                         length16 = ReadInt16();
 340
 341                         if ( length16 == 0xffff) {
 342                                 length32 = 0;
 343                         } else {
 344                                 length32 = length16;
 345                         }
 346                 }
 347         } else {
 348                 // Either implicit VR or an explicit VR that (at least for this
 349                 // element) lied a little bit. Length is on 4 bytes.
 350                 length32 = ReadInt32();
 351         }
 352
 353         // Traitement des curiosites sur la longueur
 354         if ( length32 == 0xffffffff)
 355                 length32=0;
 356
 357         ElVal->SetLength(length32);
 358 }
 359
 360
 361 /**
 362  * \ingroup gdcmHeader
 363  * \brief   remet les octets dans un ordre compatible avec celui du processeur
 364
 365  * @return  longueur retenue pour le champ
 366  */
 367 guint32 gdcmHeader::SwapLong(guint32 a) {
 368         // FIXME: il pourrait y avoir un pb pour les entiers negatifs ...
 369         switch (sw) {
 370         case    0 :
 371                 break;
 372         case 4321 :
 373                 a=(   ((a<<24) & 0xff000000) | ((a<<8)  & 0x00ff0000)    |
 374                       ((a>>8)  & 0x0000ff00) | ((a>>24) & 0x000000ff) );
 375                 break;
 376
 377         case 3412 :
 378                 a=(   ((a<<16) & 0xffff0000) | ((a>>16) & 0x0000ffff) );
 379                 break;
 380
 381         case 2143 :
 382                 a=(    ((a<<8) & 0xff00ff00) | ((a>>8) & 0x00ff00ff)  );
 383                 break;
 384         default :
 385                 dbg.Error(" gdcmHeader::SwapLong : unset swap code");
 386                 a=0;
 387         }
 388         return(a);
 389 }
 390
 391 /**
 392  * \ingroup gdcmHeader
 393  * \brief   Swaps the bytes so they agree with the processor order
 394
 395  * @return  longueur retenue pour le champ
 396  */
 397 guint16 gdcmHeader::SwapShort(guint16 a) {
 398         //FIXME how could sw be equal to 2143 since we never set it this way ?
 399         if ( (sw==4321)  || (sw==2143) )
 400                 a =(((a<<8) & 0x0ff00) | ((a>>8)&0x00ff));
 401         return (a);
 402 }
 403
 404 void gdcmHeader::SkipElementValue(ElValue * ElVal) {
 405         //FIXME don't dump the returned value
 406         (void)fseek(fp, (long)ElVal->GetLength(), SEEK_CUR);
 407 }
 408
 409 /**
 410  * \ingroup       gdcmHeader
 411  * \brief         Loads the element if it's size is not to big.
 412  * @param ElVal   Element whose value shall be loaded.
 413  * @param MaxSize Size treshold above which the element value is not
 414  *                loaded in memory. The element value is allways loaded
 415  *                when MaxSize is equal to UINT32_MAX.
 416  * @return
 417  */
 418 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
 419         size_t item_read;
 420         guint16 group  = ElVal->GetGroup();
 421         guint16 elem   = ElVal->GetElement();
 422         string  vr     = ElVal->GetVR();
 423         guint32 length = ElVal->GetLength();
 424
 425         fseek(fp, (long)ElVal->GetOffset(), SEEK_SET);
 426
 427         // Sequences not treated yet !
 428         if( vr == "SQ" ) {
 429                 SkipElementValue(ElVal);
 430                 ElVal->SetLength(0);
 431                 return;
 432         }
 433         // A sequence "contains" a set of tags (called items). It looks like
 434         // the last tag of a sequence (the one that terminates the sequence)
 435         // has a group of 0xfffe (with a dummy length).
 436         if( group == 0xfffe) {
 437                 SkipElementValue(ElVal);
 438                 ElVal->SetLength(0);
 439                 return;
 440         }
 441
 442         if ( IsAnInteger(group, elem, vr, length) ) {
 443                 guint32 NewInt;
 444                 if( length == 2 ) {
 445                         NewInt = ReadInt16();
 446                 } else if( length == 4 ) {
 447                         NewInt = ReadInt32();
 448                 } else
 449                         dbg.Error(true, "LoadElementValue: Inconsistency when reading Int.");
 450
 451                 //FIXME: make the following an util fonction
 452                 ostringstream s;
 453                 s << NewInt;
 454                 ElVal->SetValue(s.str());
 455                 return;
 456         }
 457
 458         // FIXME The exact size should be length if we move to strings or whatever
 459         char* NewValue = (char*)g_malloc(length+1);
 460         if( !NewValue) {
 461                 dbg.Verbose(1, "LoadElementValue: Failed to allocate NewValue");
 462                 return;
 463         }
 464         NewValue[length]= 0;
 465
 466         // FIXME les elements trop long (seuil a fixer a la main) ne devraient
 467         // pas etre charge's !!!! Voir TODO.
 468         item_read = fread(NewValue, (size_t)length, (size_t)1, fp);
 469         if ( item_read != 1 ) {
 470                 g_free(NewValue);
 471                 Error::FileReadError(fp, "gdcmHeader::LoadElementValue");
 472                 ElVal->SetValue("gdcm::UnRead");
 473                 return;
 474         }
 475         ElVal->SetValue(NewValue);
 476 }
 477
 478
 479 guint16 gdcmHeader::ReadInt16(void) {
 480         guint16 g;
 481         size_t item_read;
 482         item_read = fread (&g, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 483         if ( item_read != 1 )
 484                 throw Error::FileReadError(fp, "gdcmHeader::ReadInt16");
 485         g = SwapShort(g);
 486         return g;
 487 }
 488
 489 guint32 gdcmHeader::ReadInt32(void) {
 490         guint32 g;
 491         size_t item_read;
 492         item_read = fread (&g, (size_t)4,(size_t)1, fp);
 493         if ( item_read != 1 )
 494                 throw Error::FileReadError(fp, "gdcmHeader::ReadInt32");
 495         g = SwapLong(g);
 496         return g;
 497 }
 498
 499 /**
 500  * \ingroup gdcmHeader
 501  * \brief   Read the next tag without loading it's value
 502  * @return  On succes the newly created ElValue, NULL on failure.
 503  */
 504
 505 ElValue * gdcmHeader::ReadNextElement(void) {
 506         guint16 g;
 507         guint16 n;
 508         ElValue * NewElVal;
 509
 510         try {
 511                 g = ReadInt16();
 512                 n = ReadInt16();
 513         }
 514         catch ( Error::FileReadError ) {
 515                 // We reached the EOF (or an error occured) and header parsing
 516                 // has to be considered as finished.
 517                 return (ElValue *)0;
 518         }
 519
 520         // Find out if the tag we encountered is in the dictionaries:
 521         gdcmDictEntry * NewTag = IsInDicts(g, n);
 522         if (!NewTag)
 523                 NewTag = new gdcmDictEntry(g, n);
 524
 525         NewElVal = new ElValue(NewTag);
 526         if (!NewElVal) {
 527                 dbg.Verbose(1, "ReadNextElement: failed to allocate ElValue");
 528                 return (ElValue*)0;
 529         }
 530
 531         FindVR(NewElVal);
 532         FindLength(NewElVal);
 533         NewElVal->SetOffset(ftell(fp));
 534         return NewElVal;
 535 }
 536
 537 bool gdcmHeader::IsAnInteger(guint16 group, guint16 element,
 538                                      string vr, guint32 length ) {
 539         // When we have some semantics on the element we just read, and if we
 540         // a priori know we are dealing with an integer, then we shall be
 541         // able to swap it's element value properly.
 542         if ( element == 0 )  {  // This is the group length of the group
 543                 if (length != 4)
 544                         dbg.Error("gdcmHeader::ShouldBeSwaped", "should be four");
 545                 return true;
 546         }
 547
 548         if ( group % 2 != 0 )
 549                 // We only have some semantics on documented elements, which are
 550                 // the even ones.
 551                 return false;
 552
 553         if ( (length != 4) && ( length != 2) )
 554                 // Swapping only make sense on integers which are 2 or 4 bytes long.
 555                 return false;
 556
 557         if ( (vr == "UL") || (vr == "US") || (vr == "SL") || (vr == "SS") )
 558                 return true;
 559
 560         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0005) )
 561                 // This tag is retained from ACR/NEMA
 562                 // CHECKME Why should "Image Dimensions" be a single integer ?
 563                 return true;
 564
 565         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0200) )
 566                 // This tag is retained from ACR/NEMA
 567                 return true;
 568
 569         return false;
 570 }
 571
 572 /**
 573  * \ingroup gdcmHeader
 574  * \brief   Recover the offset (from the beginning of the file) of the pixels.
 575  */
 576 size_t gdcmHeader::GetPixelOffset(void) {
 577         // If this file complies with the norm we should encounter the
 578         // "Image Location" tag (0x0028,  0x0200). This tag contains the
 579         // the group that contains the pixel data (hence the "Pixel Data"
 580         // is found by indirection through the "Image Location").
 581         // Inside the group pointed by "Image Location" the searched element
 582         // is conventionally the element 0x0010 (when the norm is respected).
 583         //    When the "Image Location" is absent we default to group 0x7fe0.
 584         guint16 grPixel;
 585         guint16 numPixel;
 586         string ImageLocation = GetPubElValByName("Image Location");
 587         if ( ImageLocation == "UNFOUND" ) {
 588                 grPixel = 0x7FE0;
 589         } else {
 590                 grPixel = (guint16) atoi( ImageLocation.c_str() );
 591         }
 592         if (grPixel != 0x7fe0)
 593                 // FIXME is this still necessary ?
 594                 // Now, this looks like an old dirty fix for Philips imager
 595                 numPixel = 0x1010;
 596         else
 597                 numPixel = 0x0010;
 598         ElValue* PixelElement = PubElVals.GetElement(grPixel, numPixel);
 599         if (PixelElement)
 600                 return PixelElement->GetOffset();
 601         else
 602                 return 0;
 603 }
 604
 605 gdcmDictEntry * gdcmHeader::IsInDicts(guint32 group, guint32 element) {
 606         gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
 607         if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
 608                 //FIXME build a default dictionary !
 609                 printf("FIXME in gdcmHeader::IsInDicts\n");
 610         }
 611         if (RefPubDict) {
 612                 found = RefPubDict->GetTag(group, element);
 613                 if (found)
 614                         return found;
 615         }
 616         if (RefShaDict) {
 617                 found = RefShaDict->GetTag(group, element);
 618                 if (found)
 619                         return found;
 620         }
 621         return found;
 622 }
 623
 624 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
 625         return PubElVals.GetElValue(group, element);
 626 }
 627
 628 string gdcmHeader::GetPubElValByName(string TagName) {
 629         return PubElVals.GetElValue(TagName);
 630 }
 631
 632 /**
 633  * \ingroup gdcmHeader
 634  * \brief   Parses the header of the file but does NOT load element values.
 635  */
 636 void gdcmHeader::ParseHeader(void) {
 637         ElValue * newElValue = (ElValue *)0;
 638
 639         rewind(fp);
 640         CheckSwap();
 641         while ( (newElValue = ReadNextElement()) ) {
 642                 SkipElementValue(newElValue);
 643                 PubElVals.Add(newElValue);
 644         }
 645 }
 646
 647 /**
 648  * \ingroup gdcmHeader
 649  * \brief   Loads the element values of all the elements present in the
 650  *          public tag based hash table.
 651  */
 652 void gdcmHeader::LoadElements(void) {
 653         rewind(fp);
 654         TagElValueHT ht = PubElVals.GetTagHt();
 655         for (TagElValueHT::iterator tag = ht.begin(); tag != ht.end(); ++tag)
 656                 LoadElementValue(tag->second);
 657 }
 658
 659 void gdcmHeader::PrintPubElVal(ostream & os) {
 660         PubElVals.Print(os);
 661 }
 662
 663 void gdcmHeader::PrintPubDict(ostream & os) {
 664         RefPubDict->Print(os);
 665 }