src/gdcmHeader.cxx

   1 // gdcmHeader.cxx
   2
   3 #include <stdio.h>
   4 #include <cerrno>
   5 // For nthos:
   6 #ifdef _MSC_VER
   7 #include <winsock.h>
   8 #else
   9 #include <netinet/in.h>
  10 #endif
  11 #include <cctype>    // for isalpha
  12 #include <sstream>
  13 #include "gdcmUtil.h"
  14 #include "gdcmHeader.h"
  15
  16 // Refer to gdcmHeader::CheckSwap()
  17 #define HEADER_LENGTH_TO_READ       256
  18 // Refer to gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue()
  19 #define _MaxSizeLoadElementValue_   1024
  20
  21 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
  22
  23 void gdcmHeader::Initialise(void) {
  24    if (!gdcmHeader::dicom_vr)
  25       InitVRDict();
  26    Dicts = new gdcmDictSet();
  27    RefPubDict = Dicts->GetDefaultPubDict();
  28    RefShaDict = (gdcmDict*)0;
  29 }
  30
  31 gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
  32   throw(gdcmFileError) {
  33   SetMaxSizeLoadElementValue(_MaxSizeLoadElementValue_);
  34   filename = InFilename;
  35   Initialise();
  36   fp=fopen(InFilename,"rb");
  37   if(exception_on_error) {
  38     if(!fp)
  39       throw gdcmFileError("gdcmHeader::gdcmHeader(const char *, bool)");
  40   }
  41   else
  42     dbg.Error(!fp, "gdcmHeader::gdcmHeader cannot open file", InFilename);
  43   ParseHeader();
  44   AddAndDefaultElements();
  45 }
  46
  47
  48 gdcmHeader::~gdcmHeader (void) {
  49    //FIXME obviously there is much to be done here !
  50    fclose(fp);
  51    return;
  52 }
  53
  54 void gdcmHeader::InitVRDict (void) {
  55    if (dicom_vr) {
  56       dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::InitVRDict:", "VR dictionary allready set");
  57       return;
  58    }
  59    VRHT *vr = new VRHT;
  60    (*vr)["AE"] = "Application Entity";       // At most 16 bytes
  61    (*vr)["AS"] = "Age String";               // Exactly 4 bytes
  62    (*vr)["AT"] = "Attribute Tag";            // 2 16-bit unsigned short integers
  63    (*vr)["CS"] = "Code String";              // At most 16 bytes
  64    (*vr)["DA"] = "Date";                     // Exactly 8 bytes
  65    (*vr)["DS"] = "Decimal String";           // At most 16 bytes
  66    (*vr)["DT"] = "Date Time";                // At most 26 bytes
  67    (*vr)["FL"] = "Floating Point Single";    // 32-bit IEEE 754:1985 float
  68    (*vr)["FD"] = "Floating Point Double";    // 64-bit IEEE 754:1985 double
  69    (*vr)["IS"] = "Integer String";           // At most 12 bytes
  70    (*vr)["LO"] = "Long String";              // At most 64 chars
  71    (*vr)["LT"] = "Long Text";                // At most 10240 chars
  72    (*vr)["OB"] = "Other Byte String";        // String of bytes (vr independant)
  73    (*vr)["OW"] = "Other Word String";        // String of 16-bit words (vr dep)
  74    (*vr)["PN"] = "Person Name";              // At most 64 chars
  75    (*vr)["SH"] = "Short String";             // At most 16 chars
  76    (*vr)["SL"] = "Signed Long";              // Exactly 4 bytes
  77    (*vr)["SQ"] = "Sequence of Items";        // Not Applicable
  78    (*vr)["SS"] = "Signed Short";             // Exactly 2 bytes
  79    (*vr)["ST"] = "Short Text";               // At most 1024 chars
  80    (*vr)["TM"] = "Time";                     // At most 16 bytes
  81    (*vr)["UI"] = "Unique Identifier";        // At most 64 bytes
  82    (*vr)["UL"] = "Unsigned Long ";           // Exactly 4 bytes
  83    (*vr)["UN"] = "Unknown";                  // Any length of bytes
  84    (*vr)["US"] = "Unsigned Short ";          // Exactly 2 bytes
  85    (*vr)["UT"] = "Unlimited Text";           // At most 2^32 -1 chars
  86    dicom_vr = vr;
  87 }
  88
  89 /**
  90  * \ingroup gdcmHeader
  91  * \brief   Discover what the swap code is (among little endian, big endian,
  92  *          bad little endian, bad big endian).
  93  *
  94  */
  95 void gdcmHeader::CheckSwap()
  96 {
  97    // The only guaranted way of finding the swap code is to find a
  98    // group tag since we know it's length has to be of four bytes i.e.
  99    // 0x00000004. Finding the swap code in then straigthforward. Trouble
 100    // occurs when we can't find such group...
 101    guint32  s;
 102    guint32  x=4;  // x : pour ntohs
 103    bool net2host; // true when HostByteOrder is the same as NetworkByteOrder
 104
 105    int lgrLue;
 106    char * entCur;
 107    char deb[HEADER_LENGTH_TO_READ];
 108
 109    // First, compare HostByteOrder and NetworkByteOrder in order to
 110    // determine if we shall need to swap bytes (i.e. the Endian type).
 111    if (x==ntohs(x))
 112       net2host = true;
 113    else
 114       net2host = false;
 115
 116    // The easiest case is the one of a DICOM header, since it possesses a
 117    // file preamble where it suffice to look for the string "DICM".
 118    lgrLue = fread(deb, 1, HEADER_LENGTH_TO_READ, fp);
 119
 120    entCur = deb + 128;
 121    if(memcmp(entCur, "DICM", (size_t)4) == 0) {
 122       filetype = TrueDicom;
 123       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "looks like DICOM Version3");
 124    } else {
 125       filetype = Unknown;
 126       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "not a DICOM Version3 file");
 127    }
 128
 129    if(filetype == TrueDicom) {
 130       // Next, determine the value representation (VR). Let's skip to the
 131       // first element (0002, 0000) and check there if we find "UL", in
 132       // which case we (almost) know it is explicit VR.
 133       // WARNING: if it happens to be implicit VR then what we will read
 134       // is the length of the group. If this ascii representation of this
 135       // length happens to be "UL" then we shall believe it is explicit VR.
 136       // FIXME: in order to fix the above warning, we could read the next
 137       // element value (or a couple of elements values) in order to make
 138       // sure we are not commiting a big mistake.
 139       // We need to skip :
 140       // * the 128 bytes of File Preamble (often padded with zeroes),
 141       // * the 4 bytes of "DICM" string,
 142       // * the 4 bytes of the first tag (0002, 0000),
 143       // i.e. a total of  136 bytes.
 144       entCur = deb + 136;
 145       if(memcmp(entCur, "UL", (size_t)2) == 0) {
 146          filetype = ExplicitVR;
 147          dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 148                      "explicit Value Representation");
 149       } else {
 150          filetype = ImplicitVR;
 151          dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 152                      "not an explicit Value Representation");
 153       }
 154
 155       if (net2host) {
 156          sw = 4321;
 157          dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 158                         "HostByteOrder != NetworkByteOrder");
 159       } else {
 160          sw = 0;
 161          dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 162                         "HostByteOrder = NetworkByteOrder");
 163       }
 164
 165       // Position the file position indicator at first tag (i.e.
 166       // after the file preamble and the "DICM" string).
 167       rewind(fp);
 168       fseek (fp, 132L, SEEK_SET);
 169       return;
 170    } // End of TrueDicom
 171
 172    // Alas, this is not a DicomV3 file and whatever happens there is no file
 173    // preamble. We can reset the file position indicator to where the data
 174    // is (i.e. the beginning of the file).
 175    rewind(fp);
 176
 177    // Our next best chance would be to be considering a 'clean' ACR/NEMA file.
 178    // By clean we mean that the length of the first tag is written down.
 179    // If this is the case and since the length of the first group HAS to be
 180    // four (bytes), then determining the proper swap code is straightforward.
 181
 182    entCur = deb + 4;
 183    // We assume the array of char we are considering contains the binary
 184    // representation of a 32 bits integer. Hence the following dirty
 185    // trick :
 186    s = *((guint32 *)(entCur));
 187
 188    switch (s) {
 189    case 0x00040000 :
 190       sw = 3412;
 191       filetype = ACR;
 192       return;
 193    case 0x04000000 :
 194       sw = 4321;
 195       filetype = ACR;
 196       return;
 197    case 0x00000400 :
 198       sw = 2143;
 199       filetype = ACR;
 200       return;
 201    case 0x00000004 :
 202       sw = 0;
 203       filetype = ACR;
 204       return;
 205    default :
 206       dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 207                      "ACR/NEMA unfound swap info (time to raise bets)");
 208    }
 209
 210    // We are out of luck. It is not a DicomV3 nor a 'clean' ACR/NEMA file.
 211    // It is time for despaired wild guesses. So, let's assume this file
 212    // happens to be 'dirty' ACR/NEMA, i.e. the length of the group is
 213    // not present. Then the only info we have is the net2host one.
 214    if (! net2host )
 215       sw = 0;
 216    else
 217       sw = 4321;
 218    return;
 219 }
 220
 221 void gdcmHeader::SwitchSwapToBigEndian(void) {
 222    dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::SwitchSwapToBigEndian",
 223                   "Switching to BigEndian mode.");
 224    if ( sw == 0    ) {
 225       sw = 4321;
 226       return;
 227    }
 228    if ( sw == 4321 ) {
 229       sw = 0;
 230       return;
 231    }
 232    if ( sw == 3412 ) {
 233       sw = 2143;
 234       return;
 235    }
 236    if ( sw == 2143 )
 237       sw = 3412;
 238 }
 239
 240 void gdcmHeader::GetPixels(size_t lgrTotale, void* _Pixels) {
 241    size_t pixelsOffset;
 242    pixelsOffset = GetPixelOffset();
 243    fseek(fp, pixelsOffset, SEEK_SET);
 244    fread(_Pixels, 1, lgrTotale, fp);
 245 }
 246
 247
 248
 249 /**
 250  * \ingroup   gdcmHeader
 251  * \brief     Find the value representation of the current tag.
 252  */
 253 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
 254    if (filetype != ExplicitVR)
 255       return;
 256
 257    char VR[3];
 258    string vr;
 259    int lgrLue;
 260    long PositionOnEntry = ftell(fp);
 261    // Warning: we believe this is explicit VR (Value Representation) because
 262    // we used a heuristic that found "UL" in the first tag. Alas this
 263    // doesn't guarantee that all the tags will be in explicit VR. In some
 264    // cases (see e-film filtered files) one finds implicit VR tags mixed
 265    // within an explicit VR file. Hence we make sure the present tag
 266    // is in explicit VR and try to fix things if it happens not to be
 267    // the case.
 268    bool RealExplicit = true;
 269
 270    lgrLue=fread (&VR, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 271    VR[2]=0;
 272    vr = string(VR);
 273
 274    // Assume we are reading a falsely explicit VR file i.e. we reached
 275    // a tag where we expect reading a VR but are in fact we read the
 276    // first to bytes of the length. Then we will interogate (through find)
 277    // the dicom_vr dictionary with oddities like "\004\0" which crashes
 278    // both GCC and VC++ implementations of the STL map. Hence when the
 279    // expected VR read happens to be non-ascii characters we consider
 280    // we hit falsely explicit VR tag.
 281
 282    if ( (!isalpha(VR[0])) && (!isalpha(VR[1])) )
 283       RealExplicit = false;
 284
 285    // CLEANME searching the dicom_vr at each occurence is expensive.
 286    // PostPone this test in an optional integrity check at the end
 287    // of parsing or only in debug mode.
 288    if ( RealExplicit && !dicom_vr->count(vr) )
 289       RealExplicit = false;
 290
 291    if ( RealExplicit ) {
 292       if ( ElVal->IsVrUnknown() ) {
 293          // When not a dictionary entry, we can safely overwrite the vr.
 294          ElVal->SetVR(vr);
 295          return;
 296       }
 297       if ( ElVal->GetVR() == vr ) {
 298          // The vr we just read and the dictionary agree. Nothing to do.
 299          return;
 300       }
 301       // The vr present in the file and the dictionary disagree. We assume
 302       // the file writer knew best and use the vr of the file. Since it would
 303       // be unwise to overwrite the vr of a dictionary (since it would
 304       // compromise it's next user), we need to clone the actual DictEntry
 305       // and change the vr for the read one.
 306       gdcmDictEntry* NewTag = new gdcmDictEntry(ElVal->GetGroup(),
 307                                  ElVal->GetElement(),
 308                                  vr,
 309                                  "FIXME",
 310                                  ElVal->GetName());
 311       ElVal->SetDictEntry(NewTag);
 312       return;
 313    }
 314
 315    // We thought this was explicit VR, but we end up with an
 316    // implicit VR tag. Let's backtrack.
 317    dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindVR:", "Falsely explicit vr file");
 318    fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 319    // When this element is known in the dictionary we shall use, e.g. for
 320    // the semantics (see  the usage of IsAnInteger), the vr proposed by the
 321    // dictionary entry. Still we have to flag the element as implicit since
 322    // we know now our assumption on expliciteness is not furfilled.
 323    // avoid  .
 324    if ( ElVal->IsVrUnknown() )
 325       ElVal->SetVR("Implicit");
 326    ElVal->SetImplicitVr();
 327 }
 328
 329 /**
 330  * \ingroup gdcmHeader
 331  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 332  *          and if it corresponds to a ImplicitVRLittleEndian one.
 333  *
 334  * @return  True when ImplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 335  */
 336 bool gdcmHeader::IsImplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 337    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 338    if ( !Element )
 339       return false;
 340    LoadElementValueSafe(Element);
 341    string Transfer = Element->GetValue();
 342    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2" )
 343       return true;
 344    return false;
 345 }
 346
 347 /**
 348  * \ingroup gdcmHeader
 349  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 350  *          and if it corresponds to a ExplicitVRLittleEndian one.
 351  *
 352  * @return  True when ExplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 353  */
 354 bool gdcmHeader::IsExplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 355    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 356    if ( !Element )
 357       return false;
 358    LoadElementValueSafe(Element);
 359    string Transfer = Element->GetValue();
 360    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.1" )
 361       return true;
 362    return false;
 363 }
 364
 365 /**
 366  * \ingroup gdcmHeader
 367  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 368  *          and if it corresponds to a DeflatedExplicitVRLittleEndian one.
 369  *
 370  * @return  True when DeflatedExplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 371  */
 372 bool gdcmHeader::IsDeflatedExplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 373    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 374    if ( !Element )
 375       return false;
 376    LoadElementValueSafe(Element);
 377    string Transfer = Element->GetValue();
 378    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.1.99" )
 379       return true;
 380    return false;
 381 }
 382
 383 /**
 384  * \ingroup gdcmHeader
 385  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 386  *          and if it corresponds to a Explicit VR Big Endian one.
 387  *
 388  * @return  True when big endian found. False in all other cases.
 389  */
 390 bool gdcmHeader::IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax(void) {
 391    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 392    if ( !Element )
 393       return false;
 394    LoadElementValueSafe(Element);
 395    string Transfer = Element->GetValue();
 396    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.2" )
 397       return true;
 398    return false;
 399 }
 400
 401 /**
 402  * \ingroup gdcmHeader
 403  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 404  *          and if it corresponds to a JPEGBaseLineProcess1 one.
 405  *
 406  * @return  True when JPEGBaseLineProcess1found. False in all other cases.
 407  */
 408 bool gdcmHeader::IsJPEGBaseLineProcess1TransferSyntax(void) {
 409    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 410    if ( !Element )
 411       return false;
 412    LoadElementValueSafe(Element);
 413    string Transfer = Element->GetValue();
 414    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.50" )
 415       return true;
 416    return false;
 417 }
 418
 419 /**
 420  * \ingroup gdcmHeader
 421  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 422  *          and if it corresponds to a JPEGExtendedProcess2-4 one.
 423  *
 424  * @return  True when JPEGExtendedProcess2-4 found. False in all other cases.
 425  */
 426 bool gdcmHeader::IsJPEGExtendedProcess2_4TransferSyntax(void) {
 427    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 428    if ( !Element )
 429       return false;
 430    LoadElementValueSafe(Element);
 431    string Transfer = Element->GetValue();
 432    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.51" )
 433       return true;
 434    return false;
 435 }
 436
 437 /**
 438  * \ingroup gdcmHeader
 439  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 440  *          and if it corresponds to a JPEGExtendeProcess3-5 one.
 441  *
 442  * @return  True when JPEGExtendedProcess3-5 found. False in all other cases.
 443  */
 444 bool gdcmHeader::IsJPEGExtendedProcess3_5TransferSyntax(void) {
 445    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 446    if ( !Element )
 447       return false;
 448    LoadElementValueSafe(Element);
 449    string Transfer = Element->GetValue();
 450    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.52" )
 451       return true;
 452    return false;
 453 }
 454
 455 /**
 456  * \ingroup gdcmHeader
 457  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 458  *          and if it corresponds to a JPEGSpectralSelectionProcess6-8 one.
 459  *
 460  * @return  True when JPEGSpectralSelectionProcess6-8 found. False in all
 461  *          other cases.
 462  */
 463 bool gdcmHeader::IsJPEGSpectralSelectionProcess6_8TransferSyntax(void) {
 464    ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 465    if ( !Element )
 466       return false;
 467    LoadElementValueSafe(Element);
 468    string Transfer = Element->GetValue();
 469    if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.53" )
 470       return true;
 471    return false;
 472 }
 473
 474 /**
 475  * \ingroup gdcmHeader
 476  * \brief   When the length of an element value is obviously wrong (because
 477  *          the parser went Jabberwocky) one can hope improving things by
 478  *          applying this heuristic.
 479  */
 480 void gdcmHeader::FixFoundLength(ElValue * ElVal, guint32 FoundLength) {
 481    if ( FoundLength == 0xffffffff)
 482       FoundLength = 0;
 483    ElVal->SetLength(FoundLength);
 484 }
 485
 486 guint32 gdcmHeader::FindLengthOB(void) {
 487    // See PS 3.5-2001, section A.4 p. 49 on encapsulation of encoded pixel data.
 488    guint16 g;
 489    guint16 n;
 490    long PositionOnEntry = ftell(fp);
 491    bool FoundSequenceDelimiter = false;
 492    guint32 TotalLength = 0;
 493    guint32 ItemLength;
 494
 495    while ( ! FoundSequenceDelimiter) {
 496       g = ReadInt16();
 497       n = ReadInt16();
 498       if (errno == 1)
 499          return 0;
 500       TotalLength += 4;  // We even have to decount the group and element
 501       if ( g != 0xfffe ) {
 502          dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindLengthOB: ",
 503                      "wrong group for an item sequence.");
 504          errno = 1;
 505          return 0;
 506       }
 507       if ( n == 0xe0dd )
 508          FoundSequenceDelimiter = true;
 509       else if ( n != 0xe000) {
 510          dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindLengthOB: ",
 511                      "wrong element for an item sequence.");
 512          errno = 1;
 513          return 0;
 514       }
 515       ItemLength = ReadInt32();
 516       TotalLength += ItemLength + 4;  // We add 4 bytes since we just read
 517                                       // the ItemLength with ReadInt32
 518       SkipBytes(ItemLength);
 519    }
 520    fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 521    return TotalLength;
 522 }
 523
 524 void gdcmHeader::FindLength(ElValue * ElVal) {
 525    guint16 element = ElVal->GetElement();
 526    string  vr      = ElVal->GetVR();
 527    guint16 length16;
 528
 529    if ( (filetype == ExplicitVR) && ! ElVal->IsImplicitVr() ) {
 530
 531       if ( (vr=="OB") || (vr=="OW") || (vr=="SQ") || (vr=="UN") ) {
 532          // The following reserved two bytes (see PS 3.5-2001, section
 533          // 7.1.2 Data element structure with explicit vr p27) must be
 534          // skipped before proceeding on reading the length on 4 bytes.
 535          fseek(fp, 2L, SEEK_CUR);
 536          guint32 length32 = ReadInt32();
 537          if ( (vr == "OB") && (length32 == 0xffffffff) ) {
 538             ElVal->SetLength(FindLengthOB());
 539             return;
 540          }
 541          FixFoundLength(ElVal, length32);
 542          return;
 543       }
 544
 545       // Length is encoded on 2 bytes.
 546       length16 = ReadInt16();
 547
 548       // We can tell the current file is encoded in big endian (like
 549       // Data/US-RGB-8-epicard) when we find the "Transfer Syntax" tag
 550       // and it's value is the one of the encoding of a big endian file.
 551       // In order to deal with such big endian encoded files, we have
 552       // (at least) two strategies:
 553       // * when we load the "Transfer Syntax" tag with value of big endian
 554       //   encoding, we raise the proper flags. Then we wait for the end
 555       //   of the META group (0x0002) among which is "Transfer Syntax",
 556       //   before switching the swap code to big endian. We have to postpone
 557       //   the switching of the swap code since the META group is fully encoded
 558       //   in little endian, and big endian coding only starts at the next
 559       //   group. The corresponding code can be hard to analyse and adds
 560       //   many additional unnecessary tests for regular tags.
 561       // * the second strategy consists in waiting for trouble, that shall
 562       //   appear when we find the first group with big endian encoding. This
 563       //   is easy to detect since the length of a "Group Length" tag (the
 564       //   ones with zero as element number) has to be of 4 (0x0004). When we
 565       //   encouter 1024 (0x0400) chances are the encoding changed and we
 566       //   found a group with big endian encoding.
 567       // We shall use this second strategy. In order to make sure that we
 568       // can interpret the presence of an apparently big endian encoded
 569       // length of a "Group Length" without committing a big mistake, we
 570       // add an additional check: we look in the allready parsed elements
 571       // for the presence of a "Transfer Syntax" whose value has to be "big
 572       // endian encoding". When this is the case, chances are we have got our
 573       // hands on a big endian encoded file: we switch the swap code to
 574       // big endian and proceed...
 575       if ( (element  == 0x000) && (length16 == 0x0400) ) {
 576          if ( ! IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax() ) {
 577             dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::FindLength", "not explicit VR");
 578             errno = 1;
 579             return;
 580          }
 581          length16 = 4;
 582          SwitchSwapToBigEndian();
 583          // Restore the unproperly loaded values i.e. the group, the element
 584          // and the dictionary entry depending on them.
 585          guint16 CorrectGroup   = SwapShort(ElVal->GetGroup());
 586          guint16 CorrectElem    = SwapShort(ElVal->GetElement());
 587          gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByKey(CorrectGroup, CorrectElem);
 588          if (!NewTag) {
 589             // This correct tag is not in the dictionary. Create a new one.
 590             NewTag = new gdcmDictEntry(CorrectGroup, CorrectElem);
 591          }
 592          // FIXME this can create a memory leaks on the old entry that be
 593          // left unreferenced.
 594          ElVal->SetDictEntry(NewTag);
 595       }
 596
 597       // Heuristic: well some files are really ill-formed.
 598       if ( length16 == 0xffff) {
 599          length16 = 0;
 600          dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::FindLength",
 601                      "Erroneous element length fixed.");
 602       }
 603       FixFoundLength(ElVal, (guint32)length16);
 604       return;
 605    }
 606
 607    // Either implicit VR or a non DICOM conformal (see not below) explicit
 608    // VR that ommited the VR of (at least) this element. Farts happen.
 609    // [Note: according to the part 5, PS 3.5-2001, section 7.1 p25
 610    // on Data elements "Implicit and Explicit VR Data Elements shall
 611    // not coexist in a Data Set and Data Sets nested within it".]
 612    // Length is on 4 bytes.
 613    FixFoundLength(ElVal, ReadInt32());
 614 }
 615
 616 /**
 617  * \ingroup gdcmHeader
 618  * \brief   Swaps back the bytes of 4-byte long integer accordingly to
 619  *          processor order.
 620  *
 621  * @return  The suggested integer.
 622  */
 623 guint32 gdcmHeader::SwapLong(guint32 a) {
 624    // FIXME: il pourrait y avoir un pb pour les entiers negatifs ...
 625    switch (sw) {
 626    case    0 :
 627       break;
 628    case 4321 :
 629       a=(   ((a<<24) & 0xff000000) | ((a<<8)  & 0x00ff0000)    |
 630             ((a>>8)  & 0x0000ff00) | ((a>>24) & 0x000000ff) );
 631       break;
 632
 633    case 3412 :
 634       a=(   ((a<<16) & 0xffff0000) | ((a>>16) & 0x0000ffff) );
 635       break;
 636
 637    case 2143 :
 638       a=(    ((a<<8) & 0xff00ff00) | ((a>>8) & 0x00ff00ff)  );
 639       break;
 640    default :
 641       dbg.Error(" gdcmHeader::SwapLong : unset swap code");
 642       a=0;
 643    }
 644    return(a);
 645 }
 646
 647 /**
 648  * \ingroup gdcmHeader
 649  * \brief   Swaps the bytes so they agree with the processor order
 650  * @return  The properly swaped 16 bits integer.
 651  */
 652 guint16 gdcmHeader::SwapShort(guint16 a) {
 653    if ( (sw==4321)  || (sw==2143) )
 654       a =(((a<<8) & 0x0ff00) | ((a>>8)&0x00ff));
 655    return (a);
 656 }
 657
 658 void gdcmHeader::SkipBytes(guint32 NBytes) {
 659    //FIXME don't dump the returned value
 660    (void)fseek(fp, (long)NBytes, SEEK_CUR);
 661 }
 662
 663 void gdcmHeader::SkipElementValue(ElValue * ElVal) {
 664    SkipBytes(ElVal->GetLength());
 665 }
 666
 667 void gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue(long NewSize) {
 668    if (NewSize < 0)
 669       return;
 670    if ((guint32)NewSize >= (guint32)0xffffffff) {
 671       MaxSizeLoadElementValue = 0xffffffff;
 672       return;
 673    }
 674    MaxSizeLoadElementValue = NewSize;
 675 }
 676
 677 /**
 678  * \ingroup       gdcmHeader
 679  * \brief         Loads the element content if it's length is not bigger
 680  *                than the value specified with
 681  *                gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue()
 682  */
 683 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
 684    size_t item_read;
 685    guint16 group  = ElVal->GetGroup();
 686    guint16 elem   = ElVal->GetElement();
 687    string  vr     = ElVal->GetVR();
 688    guint32 length = ElVal->GetLength();
 689    bool SkipLoad  = false;
 690
 691    fseek(fp, (long)ElVal->GetOffset(), SEEK_SET);
 692
 693    // Sequences not treated yet !
 694    //
 695    // Ne faudrait-il pas au contraire trouver immediatement
 696    // une maniere 'propre' de traiter les sequences (vr = SQ)
 697    // car commencer par les ignorer risque de conduire a qq chose
 698    // qui pourrait ne pas etre generalisable
 699    //
 700    if( vr == "SQ" )
 701       SkipLoad = true;
 702
 703    // Heuristic : a sequence "contains" a set of tags (called items). It looks
 704    // like the last tag of a sequence (the one that terminates the sequence)
 705    // has a group of 0xfffe (with a dummy length).
 706    if( group == 0xfffe )
 707       SkipLoad = true;
 708
 709    // The group length doesn't represent data to be loaded in memory, since
 710    // each element of the group shall be loaded individualy.
 711    if( elem == 0 )
 712       //SkipLoad = true;      // modif sauvage JPR
 713                         // On charge la longueur du groupe
 714                         // quand l'element 0x0000 est présent !
 715
 716    if ( SkipLoad ) {
 717            // FIXME the following skip is not necessary
 718       SkipElementValue(ElVal);
 719       ElVal->SetLength(0);
 720       ElVal->SetValue("gdcm::Skipped");
 721       return;
 722    }
 723
 724    // When the length is zero things are easy:
 725    if ( length == 0 ) {
 726       ElVal->SetValue("");
 727       return;
 728    }
 729
 730    // The elements whose length is bigger than the specified upper bound
 731    // are not loaded. Instead we leave a short notice of the offset of
 732    // the element content and it's length.
 733    if (length > MaxSizeLoadElementValue) {
 734       ostringstream s;
 735       s << "gdcm::NotLoaded.";
 736       s << " Address:" << (long)ElVal->GetOffset();
 737       s << " Length:"  << ElVal->GetLength();
 738       ElVal->SetValue(s.str());
 739       return;
 740    }
 741
 742    // When an integer is expected, read and convert the following two or
 743    // four bytes properly i.e. as an integer as opposed to a string.
 744    if ( IsAnInteger(ElVal) ) {
 745       guint32 NewInt;
 746       if( length == 2 ) {
 747          NewInt = ReadInt16();
 748       } else if( length == 4 ) {
 749          NewInt = ReadInt32();
 750       } else
 751          dbg.Error(true, "LoadElementValue: Inconsistency when reading Int.");
 752
 753       //FIXME: make the following an util fonction
 754       ostringstream s;
 755       s << NewInt;
 756       ElVal->SetValue(s.str());
 757       return;
 758    }
 759
 760    // FIXME The exact size should be length if we move to strings or whatever
 761    char* NewValue = (char*)malloc(length+1);
 762    if( !NewValue) {
 763       dbg.Verbose(1, "LoadElementValue: Failed to allocate NewValue");
 764       return;
 765    }
 766    NewValue[length]= 0;
 767
 768    item_read = fread(NewValue, (size_t)length, (size_t)1, fp);
 769    if ( item_read != 1 ) {
 770       free(NewValue);
 771       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::LoadElementValue","unread element value");
 772       ElVal->SetValue("gdcm::UnRead");
 773       return;
 774    }
 775    ElVal->SetValue(NewValue);
 776 }
 777
 778 /**
 779  * \ingroup       gdcmHeader
 780  * \brief         Loads the element while preserving the current
 781  *                underlying file position indicator as opposed to
 782  *                to LoadElementValue that modifies it.
 783  * @param ElVal   Element whose value shall be loaded.
 784  * @return
 785  */
 786 void gdcmHeader::LoadElementValueSafe(ElValue * ElVal) {
 787    long PositionOnEntry = ftell(fp);
 788    LoadElementValue(ElVal);
 789    fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 790 }
 791
 792
 793 guint16 gdcmHeader::ReadInt16(void) {
 794    guint16 g;
 795    size_t item_read;
 796    item_read = fread (&g, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 797    errno = 0;
 798    if ( item_read != 1 ) {
 799       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ReadInt16", " File read error");
 800       errno = 1;
 801       return 0;
 802    }
 803    g = SwapShort(g);
 804    return g;
 805 }
 806
 807 guint32 gdcmHeader::ReadInt32(void) {
 808    guint32 g;
 809    size_t item_read;
 810    item_read = fread (&g, (size_t)4,(size_t)1, fp);
 811    errno = 0;
 812    if ( item_read != 1 ) {
 813       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ReadInt32", " File read error");
 814       errno = 1;
 815       return 0;
 816    }
 817    g = SwapLong(g);
 818    return g;
 819 }
 820
 821 /**
 822  * \ingroup gdcmHeader
 823  * \brief   Build a new Element Value from all the low level arguments.
 824  *          Check for existence of dictionary entry, and build
 825  *          a default one when absent.
 826  * @param   Group group   of the underlying DictEntry
 827  * @param   Elem  element of the underlying DictEntry
 828  */
 829 ElValue* gdcmHeader::NewElValueByKey(guint16 Group, guint16 Elem) {
 830    // Find out if the tag we encountered is in the dictionaries:
 831    gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByKey(Group, Elem);
 832    if (!NewTag)
 833       NewTag = new gdcmDictEntry(Group, Elem);
 834
 835    ElValue* NewElVal = new ElValue(NewTag);
 836    if (!NewElVal) {
 837       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::NewElValueByKey",
 838                   "failed to allocate ElValue");
 839       return (ElValue*)0;
 840    }
 841    return NewElVal;
 842 }
 843
 844 /**
 845  * \ingroup gdcmHeader
 846  * \brief   Build a new Element Value from all the low level arguments.
 847  *          Check for existence of dictionary entry, and build
 848  *          a default one when absent.
 849  * @param   Name    Name of the underlying DictEntry
 850  */
 851 ElValue* gdcmHeader::NewElValueByName(string Name) {
 852
 853    gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByName(Name);
 854    if (!NewTag)
 855       NewTag = new gdcmDictEntry(0xffff, 0xffff, "LO", "Unknown", Name);
 856
 857    ElValue* NewElVal = new ElValue(NewTag);
 858    if (!NewElVal) {
 859       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ObtainElValueByName",
 860                   "failed to allocate ElValue");
 861       return (ElValue*)0;
 862    }
 863    return NewElVal;
 864 }
 865
 866 /**
 867  * \ingroup gdcmHeader
 868  * \brief   Read the next tag but WITHOUT loading it's value
 869  * @return  On succes the newly created ElValue, NULL on failure.
 870  */
 871 ElValue * gdcmHeader::ReadNextElement(void) {
 872    guint16 g;
 873    guint16 n;
 874    ElValue * NewElVal;
 875
 876    g = ReadInt16();
 877    n = ReadInt16();
 878    if (errno == 1)
 879       // We reached the EOF (or an error occured) and header parsing
 880       // has to be considered as finished.
 881       return (ElValue *)0;
 882
 883    NewElVal = NewElValueByKey(g, n);
 884    FindVR(NewElVal);
 885    FindLength(NewElVal);
 886    if (errno == 1)
 887       // Call it quits
 888       return (ElValue *)0;
 889    NewElVal->SetOffset(ftell(fp));
 890    return NewElVal;
 891 }
 892
 893 /**
 894  * \ingroup gdcmHeader
 895  * \brief   Apply some heuristics to predict wether the considered
 896  *          element value contains/represents an integer or not.
 897  * @param   ElVal The element value on which to apply the predicate.
 898  * @return  The result of the heuristical predicate.
 899  */
 900 bool gdcmHeader::IsAnInteger(ElValue * ElVal) {
 901    guint16 group   = ElVal->GetGroup();
 902    guint16 element = ElVal->GetElement();
 903    string  vr      = ElVal->GetVR();
 904    guint32 length  = ElVal->GetLength();
 905
 906    // When we have some semantics on the element we just read, and if we
 907    // a priori know we are dealing with an integer, then we shall be
 908    // able to swap it's element value properly.
 909    if ( element == 0 )  {  // This is the group length of the group
 910       if (length == 4)
 911          return true;
 912       else
 913          dbg.Error("gdcmHeader::IsAnInteger",
 914                    "Erroneous Group Length element length.");
 915    }
 916
 917    if ( group % 2 != 0 )
 918       // We only have some semantics on documented elements, which are
 919       // the even ones.
 920       return false;
 921
 922    if ( (length != 4) && ( length != 2) )
 923       // Swapping only make sense on integers which are 2 or 4 bytes long.
 924       return false;
 925
 926    if ( (vr == "UL") || (vr == "US") || (vr == "SL") || (vr == "SS") )
 927       return true;
 928
 929    if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0005) )
 930       // The "Image Dimensions" tag is retained from ACR/NEMA and contains
 931       // the number of dimensions of the contained object (1 for Signal,
 932       // 2 for Image, 3 for Volume, 4 for Sequence).
 933       return true;
 934
 935    if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0200) )
 936       // This tag is retained from ACR/NEMA
 937       return true;
 938
 939    return false;
 940 }
 941
 942 /**
 943  * \ingroup gdcmHeader
 944  * \brief   Recover the offset (from the beginning of the file) of the pixels.
 945  */
 946 size_t gdcmHeader::GetPixelOffset(void) {
 947    // If this file complies with the norm we should encounter the
 948    // "Image Location" tag (0x0028,  0x0200). This tag contains the
 949    // the group that contains the pixel data (hence the "Pixel Data"
 950    // is found by indirection through the "Image Location").
 951    // Inside the group pointed by "Image Location" the searched element
 952    // is conventionally the element 0x0010 (when the norm is respected).
 953    //    When the "Image Location" is absent we default to group 0x7fe0.
 954    guint16 grPixel;
 955    guint16 numPixel;
 956    string ImageLocation = GetPubElValByName("Image Location");
 957    if ( ImageLocation == "gdcm::Unfound" ) {
 958       grPixel = 0x7fe0;
 959    } else {
 960       grPixel = (guint16) atoi( ImageLocation.c_str() );
 961    }
 962    if (grPixel != 0x7fe0)
 963       // FIXME is this still necessary ?
 964       // Now, this looks like an old dirty fix for Philips imager
 965       numPixel = 0x1010;
 966    else
 967       numPixel = 0x0010;
 968    ElValue* PixelElement = PubElVals.GetElementByNumber(grPixel, numPixel);
 969    if (PixelElement)
 970       return PixelElement->GetOffset();
 971    else
 972       return 0;
 973 }
 974
 975 /**
 976  * \ingroup gdcmHeader
 977  * \brief   Searches both the public and the shadow dictionary (when they
 978  *          exist) for the presence of the DictEntry with given
 979  *          group and element. The public dictionary has precedence on the
 980  *          shadow one.
 981  * @param   group   group of the searched DictEntry
 982  * @param   element element of the searched DictEntry
 983  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
 984  */
 985 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByKey(guint16 group, guint16 element) {
 986    gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
 987    if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
 988       dbg.Verbose(0, "FIXME in gdcmHeader::GetDictEntry",
 989                      "we SHOULD have a default dictionary");
 990    }
 991    if (RefPubDict) {
 992       found = RefPubDict->GetTagByKey(group, element);
 993       if (found)
 994          return found;
 995    }
 996    if (RefShaDict) {
 997       found = RefShaDict->GetTagByKey(group, element);
 998       if (found)
 999          return found;
1000    }
1001    return found;
1002 }
1003
1004 /**
1005  * \ingroup gdcmHeader
1006  * \brief   Searches both the public and the shadow dictionary (when they
1007  *          exist) for the presence of the DictEntry with given name.
1008  *          The public dictionary has precedence on the shadow one.
1009  * @param   Name name of the searched DictEntry
1010  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
1011  */
1012 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByName(string Name) {
1013    gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
1014    if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
1015       dbg.Verbose(0, "FIXME in gdcmHeader::GetDictEntry",
1016                      "we SHOULD have a default dictionary");
1017    }
1018    if (RefPubDict) {
1019       found = RefPubDict->GetTagByName(Name);
1020       if (found)
1021          return found;
1022    }
1023    if (RefShaDict) {
1024       found = RefShaDict->GetTagByName(Name);
1025       if (found)
1026          return found;
1027    }
1028    return found;
1029 }
1030
1031 /**
1032  * \ingroup gdcmHeader
1033  * \brief   Searches within the public dictionary for element value of
1034  *          a given tag.
1035  * @param   group Group of the researched tag.
1036  * @param   element Element of the researched tag.
1037  * @return  Corresponding element value when it exists, and the string
1038  *          "gdcm::Unfound" otherwise.
1039  */
1040 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1041    return PubElVals.GetElValueByNumber(group, element);
1042 }
1043
1044 /**
1045  * \ingroup gdcmHeader
1046  * \brief   Searches within the public dictionary for element value
1047  *          representation of a given tag.
1048  *
1049  *          Obtaining the VR (Value Representation) might be needed by caller
1050  *          to convert the string typed content to caller's native type
1051  *          (think of C++ vs Python). The VR is actually of a higher level
1052  *          of semantics than just the native C++ type.
1053  * @param   group Group of the researched tag.
1054  * @param   element Element of the researched tag.
1055  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1056  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1057  */
1058 string gdcmHeader::GetPubElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1059    ElValue* elem =  PubElVals.GetElementByNumber(group, element);
1060    if ( !elem )
1061       return "gdcm::Unfound";
1062    return elem->GetVR();
1063 }
1064
1065 /**
1066  * \ingroup gdcmHeader
1067  * \brief   Searches within the public dictionary for element value of
1068  *          a given tag.
1069  * @param   TagName name of the researched element.
1070  * @return  Corresponding element value when it exists, and the string
1071  *          "gdcm::Unfound" otherwise.
1072  */
1073 string gdcmHeader::GetPubElValByName(string TagName) {
1074    return PubElVals.GetElValueByName(TagName);
1075 }
1076
1077 /**
1078  * \ingroup gdcmHeader
1079  * \brief   Searches within the elements parsed with the public dictionary for
1080  *          the element value representation of a given tag.
1081  *
1082  *          Obtaining the VR (Value Representation) might be needed by caller
1083  *          to convert the string typed content to caller's native type
1084  *          (think of C++ vs Python). The VR is actually of a higher level
1085  *          of semantics than just the native C++ type.
1086  * @param   TagName name of the researched element.
1087  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1088  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1089  */
1090 string gdcmHeader::GetPubElValRepByName(string TagName) {
1091    ElValue* elem =  PubElVals.GetElementByName(TagName);
1092    if ( !elem )
1093       return "gdcm::Unfound";
1094    return elem->GetVR();
1095 }
1096
1097 /**
1098  * \ingroup gdcmHeader
1099  * \brief   Searches within elements parsed with the SHADOW dictionary
1100  *          for the element value of a given tag.
1101  * @param   group Group of the researched tag.
1102  * @param   element Element of the researched tag.
1103  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1104  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1105  */
1106 string gdcmHeader::GetShaElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1107    return ShaElVals.GetElValueByNumber(group, element);
1108 }
1109
1110 /**
1111  * \ingroup gdcmHeader
1112  * \brief   Searches within the elements parsed with the SHADOW dictionary
1113  *          for the element value representation of a given tag.
1114  *
1115  *          Obtaining the VR (Value Representation) might be needed by caller
1116  *          to convert the string typed content to caller's native type
1117  *          (think of C++ vs Python). The VR is actually of a higher level
1118  *          of semantics than just the native C++ type.
1119  * @param   group Group of the researched tag.
1120  * @param   element Element of the researched tag.
1121  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1122  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1123  */
1124 string gdcmHeader::GetShaElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1125    ElValue* elem =  ShaElVals.GetElementByNumber(group, element);
1126    if ( !elem )
1127       return "gdcm::Unfound";
1128    return elem->GetVR();
1129 }
1130
1131 /**
1132  * \ingroup gdcmHeader
1133  * \brief   Searches within the elements parsed with the shadow dictionary
1134  *          for an element value of given tag.
1135  * @param   TagName name of the researched element.
1136  * @return  Corresponding element value when it exists, and the string
1137  *          "gdcm::Unfound" otherwise.
1138  */
1139 string gdcmHeader::GetShaElValByName(string TagName) {
1140    return ShaElVals.GetElValueByName(TagName);
1141 }
1142
1143 /**
1144  * \ingroup gdcmHeader
1145  * \brief   Searches within the elements parsed with the shadow dictionary for
1146  *          the element value representation of a given tag.
1147  *
1148  *          Obtaining the VR (Value Representation) might be needed by caller
1149  *          to convert the string typed content to caller's native type
1150  *          (think of C++ vs Python). The VR is actually of a higher level
1151  *          of semantics than just the native C++ type.
1152  * @param   TagName name of the researched element.
1153  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1154  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1155  */
1156 string gdcmHeader::GetShaElValRepByName(string TagName) {
1157    ElValue* elem =  ShaElVals.GetElementByName(TagName);
1158    if ( !elem )
1159       return "gdcm::Unfound";
1160    return elem->GetVR();
1161 }
1162
1163 /**
1164  * \ingroup gdcmHeader
1165  * \brief   Searches within elements parsed with the public dictionary
1166  *          and then within the elements parsed with the shadow dictionary
1167  *          for the element value of a given tag.
1168  * @param   group Group of the researched tag.
1169  * @param   element Element of the researched tag.
1170  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1171  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1172  */
1173 string gdcmHeader::GetElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1174    string pub = GetPubElValByNumber(group, element);
1175    if (pub.length())
1176       return pub;
1177    return GetShaElValByNumber(group, element);
1178 }
1179
1180 /**
1181  * \ingroup gdcmHeader
1182  * \brief   Searches within elements parsed with the public dictionary
1183  *          and then within the elements parsed with the shadow dictionary
1184  *          for the element value representation of a given tag.
1185  *
1186  *          Obtaining the VR (Value Representation) might be needed by caller
1187  *          to convert the string typed content to caller's native type
1188  *          (think of C++ vs Python). The VR is actually of a higher level
1189  *          of semantics than just the native C++ type.
1190  * @param   group Group of the researched tag.
1191  * @param   element Element of the researched tag.
1192  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1193  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1194  */
1195 string gdcmHeader::GetElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1196    string pub = GetPubElValRepByNumber(group, element);
1197    if (pub.length())
1198       return pub;
1199    return GetShaElValRepByNumber(group, element);
1200 }
1201
1202 /**
1203  * \ingroup gdcmHeader
1204  * \brief   Searches within elements parsed with the public dictionary
1205  *          and then within the elements parsed with the shadow dictionary
1206  *          for the element value of a given tag.
1207  * @param   TagName name of the researched element.
1208  * @return  Corresponding element value when it exists,
1209  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1210  */
1211 string gdcmHeader::GetElValByName(string TagName) {
1212    string pub = GetPubElValByName(TagName);
1213    if (pub.length())
1214       return pub;
1215    return GetShaElValByName(TagName);
1216 }
1217
1218 /**
1219  * \ingroup gdcmHeader
1220  * \brief   Searches within elements parsed with the public dictionary
1221  *          and then within the elements parsed with the shadow dictionary
1222  *          for the element value representation of a given tag.
1223  *
1224  *          Obtaining the VR (Value Representation) might be needed by caller
1225  *          to convert the string typed content to caller's native type
1226  *          (think of C++ vs Python). The VR is actually of a higher level
1227  *          of semantics than just the native C++ type.
1228  * @param   TagName name of the researched element.
1229  * @return  Corresponding element value representation when it exists,
1230  *          and the string "gdcm::Unfound" otherwise.
1231  */
1232 string gdcmHeader::GetElValRepByName(string TagName) {
1233    string pub = GetPubElValRepByName(TagName);
1234    if (pub.length())
1235       return pub;
1236    return GetShaElValRepByName(TagName);
1237 }
1238
1239 /**
1240  * \ingroup gdcmHeader
1241  * \brief   Accesses an existing ElValue in the PubElVals of this instance
1242  *          through it's (group, element) and modifies it's content with
1243  *          the given value.
1244  * @param   content new value to substitute with
1245  * @param   group   group of the ElVal to modify
1246  * @param   element element of the ElVal to modify
1247  */
1248 int gdcmHeader::SetPubElValByNumber(string content, guint16 group,
1249                                     guint16 element)
1250 {
1251    return (  PubElVals.SetElValueByNumber (content, group, element) );
1252 }
1253
1254 /**
1255  * \ingroup gdcmHeader
1256  * \brief   Accesses an existing ElValue in the PubElVals of this instance
1257  *          through tag name and modifies it's content with the given value.
1258  * @param   content new value to substitute with
1259  * @param   TagName name of the tag to be modified
1260  */
1261 int gdcmHeader::SetPubElValByName(string content, string TagName) {
1262    return (  PubElVals.SetElValueByName (content, TagName) );
1263 }
1264
1265 /**
1266  * \ingroup gdcmHeader
1267  * \brief   Accesses an existing ElValue in the ShaElVals of this instance
1268  *          through it's (group, element) and modifies it's content with
1269  *          the given value.
1270  * @param   content new value to substitute with
1271  * @param   group   group of the ElVal to modify
1272  * @param   element element of the ElVal to modify
1273  */
1274 int gdcmHeader::SetShaElValByNumber(string content,
1275                                     guint16 group, guint16 element)
1276 {
1277    return (  ShaElVals.SetElValueByNumber (content, group, element) );
1278 }
1279
1280 /**
1281  * \ingroup gdcmHeader
1282  * \brief   Accesses an existing ElValue in the ShaElVals of this instance
1283  *          through tag name and modifies it's content with the given value.
1284  * @param   content new value to substitute with
1285  * @param   TagName name of the tag to be modified
1286  */
1287 int gdcmHeader::SetShaElValByName(string content, string TagName) {
1288    return (  ShaElVals.SetElValueByName (content, TagName) );
1289 }
1290
1291 /**
1292  * \ingroup gdcmHeader
1293  * \brief   Parses the header of the file but WITHOUT loading element values.
1294  */
1295 void gdcmHeader::ParseHeader(bool exception_on_error) throw(gdcmFormatError) {
1296    ElValue * newElValue = (ElValue *)0;
1297
1298    rewind(fp);
1299    CheckSwap();
1300    while ( (newElValue = ReadNextElement()) ) {
1301       SkipElementValue(newElValue);
1302       PubElVals.Add(newElValue);
1303    }
1304 }
1305
1306 /**
1307  * \ingroup gdcmHeader
1308  * \brief   Once the header is parsed add some gdcm convenience/helper elements
1309  *          in the ElValSet. For example add:
1310  *          - gdcmImageType which is an entry containing a short for the
1311  *            type of image and whose value ranges in
1312  *               I8   (unsigned 8 bit image)
1313  *               I16  (unsigned 8 bit image)
1314  *               IS16 (signed 8 bit image)
1315  *          - gdcmXsize, gdcmYsize, gdcmZsize whose values are respectively
1316  *            the ones of the official DICOM fields Rows, Columns and Planes.
1317  */
1318 void gdcmHeader::AddAndDefaultElements(void) {
1319    ElValue* NewEntry = (ElValue*)0;
1320
1321    NewEntry = NewElValueByName("gdcmXSize");
1322    NewEntry->SetValue(GetElValByName("Rows"));
1323    PubElVals.Add(NewEntry);
1324
1325    NewEntry = NewElValueByName("gdcmYSize");
1326    NewEntry->SetValue(GetElValByName("Columns"));
1327    PubElVals.Add(NewEntry);
1328
1329    NewEntry = NewElValueByName("gdcmZSize");
1330    NewEntry->SetValue(GetElValByName("Planes"));
1331    PubElVals.Add(NewEntry);
1332 }
1333
1334 /**
1335  * \ingroup gdcmHeader
1336  * \brief   Loads the element values of all the elements present in the
1337  *          public tag based hash table.
1338  */
1339 void gdcmHeader::LoadElements(void) {
1340    rewind(fp);
1341    TagElValueHT ht = PubElVals.GetTagHt();
1342    for (TagElValueHT::iterator tag = ht.begin(); tag != ht.end(); ++tag) {
1343       LoadElementValue(tag->second);
1344       }
1345 }
1346
1347 void gdcmHeader::PrintPubElVal(ostream & os) {
1348    PubElVals.Print(os);
1349 }
1350
1351 void gdcmHeader::PrintPubDict(ostream & os) {
1352    RefPubDict->Print(os);
1353 }