src/gdcmHeader.cxx

   1 // gdcmHeader.cxx
   2
   3 #include "gdcm.h"
   4 #include <stdio.h>
   5 #include <cerrno>
   6 // For nthos:
   7 #ifdef _MSC_VER
   8 #include <winsock.h>
   9 #else
  10 #include <netinet/in.h>
  11 #endif
  12 #include <cctype>               // for isalpha
  13 #include <map>
  14 #include <sstream>
  15 #include "gdcmUtil.h"
  16
  17 #define HEADER_LENGTH_TO_READ           256     // on ne lit plus que le debut
  18 #define _MaxSizeLoadElementValue_       1024    // longueur au dela de laquelle on ne charge plus les valeurs
  19
  20 //FIXME: this looks dirty to me...
  21
  22 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  23
  24 // str est un pointeur dans un tableau de caractères, qui doit contenir,
  25 // à cet endroit la, la représentation binaire d'un entier (16 ou 32 bits)
  26 // je veux récupérer ça ... dans un entier.
  27 // s'il y a une autre solution, évitant des cast et les indirections,
  28 // je suis preneur
  29
  30 VRHT * gdcmHeader::dicom_vr = (VRHT*)0;
  31
  32 void gdcmHeader::Initialise(void) {
  33         if (!gdcmHeader::dicom_vr)
  34                 InitVRDict();
  35         Dicts = new gdcmDictSet();
  36         RefPubDict = Dicts->GetDefaultPubDict();
  37         RefShaDict = (gdcmDict*)0;
  38 }
  39
  40
  41 gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
  42   throw(gdcmFileError) {
  43   SetMaxSizeLoadElementValue(_MaxSizeLoadElementValue_);
  44   filename = InFilename;
  45   Initialise();
  46   fp=fopen(InFilename,"rb");
  47   if(exception_on_error) {
  48     if(!fp)
  49       throw gdcmFileError("gdcmHeader::gdcmHeader(const char *, bool)");
  50   }
  51   else
  52     dbg.Error(!fp, "gdcmHeader::gdcmHeader cannot open file", InFilename);
  53   ParseHeader();
  54   AddAndDefaultElements();
  55 }
  56
  57
  58 gdcmHeader::~gdcmHeader (void) {
  59         fclose(fp);
  60         return;
  61 }
  62
  63 void gdcmHeader::InitVRDict (void) {
  64         if (dicom_vr) {
  65                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::InitVRDict:", "VR dictionary allready set");
  66                 return;
  67         }
  68         VRHT *vr = new VRHT;
  69         (*vr)["AE"] = "Application Entity";       // At most 16 bytes
  70         (*vr)["AS"] = "Age String";               // Exactly 4 bytes
  71         (*vr)["AT"] = "Attribute Tag";            // 2 16-bit unsigned short integers
  72         (*vr)["CS"] = "Code String";              // At most 16 bytes
  73         (*vr)["DA"] = "Date";                     // Exactly 8 bytes
  74         (*vr)["DS"] = "Decimal String";           // At most 16 bytes
  75         (*vr)["DT"] = "Date Time";                // At most 26 bytes
  76         (*vr)["FL"] = "Floating Point Single";    // 32-bit IEEE 754:1985 float
  77         (*vr)["FD"] = "Floating Point Double";    // 64-bit IEEE 754:1985 double
  78         (*vr)["IS"] = "Integer String";           // At most 12 bytes
  79         (*vr)["LO"] = "Long String";              // At most 64 chars
  80         (*vr)["LT"] = "Long Text";                // At most 10240 chars
  81         (*vr)["OB"] = "Other Byte String";        // String of bytes (vr independant)
  82         (*vr)["OW"] = "Other Word String";        // String of 16-bit words (vr dep)
  83         (*vr)["PN"] = "Person Name";              // At most 64 chars
  84         (*vr)["SH"] = "Short String";             // At most 16 chars
  85         (*vr)["SL"] = "Signed Long";              // Exactly 4 bytes
  86         (*vr)["SQ"] = "Sequence of Items";        // Not Applicable
  87         (*vr)["SS"] = "Signed Short";             // Exactly 2 bytes
  88         (*vr)["ST"] = "Short Text";               // At most 1024 chars
  89         (*vr)["TM"] = "Time";                     // At most 16 bytes
  90         (*vr)["UI"] = "Unique Identifier";        // At most 64 bytes
  91         (*vr)["UL"] = "Unsigned Long ";           // Exactly 4 bytes
  92         (*vr)["UN"] = "Unknown";                  // Any length of bytes
  93         (*vr)["US"] = "Unsigned Short ";          // Exactly 2 bytes
  94         (*vr)["UT"] = "Unlimited Text";           // At most 2^32 -1 chars
  95    dicom_vr = vr;
  96 }
  97
  98 /**
  99  * \ingroup gdcmHeader
 100  * \brief   Discover what the swap code is (among little endian, big endian,
 101  *          bad little endian, bad big endian).
 102  *
 103  */
 104 void gdcmHeader::CheckSwap()
 105 {
 106         // The only guaranted way of finding the swap code is to find a
 107         // group tag since we know it's length has to be of four bytes i.e.
 108         // 0x00000004. Finding the swap code in then straigthforward. Trouble
 109         // occurs when we can't find such group...
 110         guint32  s;
 111         guint32  x=4;  // x : pour ntohs
 112         bool net2host; // true when HostByteOrder is the same as NetworkByteOrder
 113
 114         int lgrLue;
 115         char * entCur;
 116         char deb[HEADER_LENGTH_TO_READ];
 117
 118         // First, compare HostByteOrder and NetworkByteOrder in order to
 119         // determine if we shall need to swap bytes (i.e. the Endian type).
 120         if (x==ntohs(x))
 121                 net2host = true;
 122         else
 123                 net2host = false;
 124
 125         // The easiest case is the one of a DICOM header, since it possesses a
 126         // file preamble where it suffice to look for the string "DICM".
 127         lgrLue = fread(deb, 1, HEADER_LENGTH_TO_READ, fp);
 128
 129         entCur = deb + 128;
 130         if(memcmp(entCur, "DICM", (size_t)4) == 0) {
 131                 filetype = TrueDicom;
 132                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "looks like DICOM Version3");
 133         } else {
 134                 filetype = Unknown;
 135                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:", "not a DICOM Version3 file");
 136         }
 137
 138         if(filetype == TrueDicom) {
 139                 // Next, determine the value representation (VR). Let's skip to the
 140                 // first element (0002, 0000) and check there if we find "UL", in
 141                 // which case we (almost) know it is explicit VR.
 142                 // WARNING: if it happens to be implicit VR then what we will read
 143                 // is the length of the group. If this ascii representation of this
 144                 // length happens to be "UL" then we shall believe it is explicit VR.
 145                 // FIXME: in order to fix the above warning, we could read the next
 146                 // element value (or a couple of elements values) in order to make
 147                 // sure we are not commiting a big mistake.
 148                 // We need to skip :
 149                 // * the 128 bytes of File Preamble (often padded with zeroes),
 150                 // * the 4 bytes of "DICM" string,
 151                 // * the 4 bytes of the first tag (0002, 0000),
 152                 // i.e. a total of  136 bytes.
 153                 entCur = deb + 136;
 154                 if(memcmp(entCur, "UL", (size_t)2) == 0) {
 155                         filetype = ExplicitVR;
 156                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 157                                     "explicit Value Representation");
 158                 } else {
 159                         filetype = ImplicitVR;
 160                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 161                                     "not an explicit Value Representation");
 162                 }
 163
 164                 if (net2host) {
 165                         sw = 4321;
 166                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 167                                        "HostByteOrder != NetworkByteOrder");
 168                 } else {
 169                         sw = 0;
 170                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 171                                        "HostByteOrder = NetworkByteOrder");
 172                 }
 173
 174                 // Position the file position indicator at first tag (i.e.
 175                 // after the file preamble and the "DICM" string).
 176                 rewind(fp);
 177                 fseek (fp, 132L, SEEK_SET);
 178                 return;
 179         } // End of TrueDicom
 180
 181         // Alas, this is not a DicomV3 file and whatever happens there is no file
 182         // preamble. We can reset the file position indicator to where the data
 183         // is (i.e. the beginning of the file).
 184         rewind(fp);
 185
 186         // Our next best chance would be to be considering a 'clean' ACR/NEMA file.
 187         // By clean we mean that the length of the first tag is written down.
 188         // If this is the case and since the length of the first group HAS to be
 189         // four (bytes), then determining the proper swap code is straightforward.
 190
 191         entCur = deb + 4;
 192         s = str2num(entCur, guint32);
 193
 194         switch (s) {
 195         case 0x00040000 :
 196                 sw = 3412;
 197                 filetype = ACR;
 198                 return;
 199         case 0x04000000 :
 200                 sw = 4321;
 201                 filetype = ACR;
 202                 return;
 203         case 0x00000400 :
 204                 sw = 2143;
 205                 filetype = ACR;
 206                 return;
 207         case 0x00000004 :
 208                 sw = 0;
 209                 filetype = ACR;
 210                 return;
 211         default :
 212                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::CheckSwap:",
 213                                "ACR/NEMA unfound swap info (time to raise bets)");
 214         }
 215
 216         // We are out of luck. It is not a DicomV3 nor a 'clean' ACR/NEMA file.
 217         // It is time for despaired wild guesses. So, let's assume this file
 218         // happens to be 'dirty' ACR/NEMA, i.e. the length of the group is
 219         // not present. Then the only info we have is the net2host one.
 220         if (! net2host )
 221                 sw = 0;
 222         else
 223                 sw = 4321;
 224         return;
 225 }
 226
 227 void gdcmHeader::SwitchSwapToBigEndian(void) {
 228         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::SwitchSwapToBigEndian",
 229                        "Switching to BigEndian mode.");
 230         if ( sw == 0    ) {
 231                 sw = 4321;
 232                 return;
 233         }
 234         if ( sw == 4321 ) {
 235                 sw = 0;
 236                 return;
 237         }
 238         if ( sw == 3412 ) {
 239                 sw = 2143;
 240                 return;
 241         }
 242         if ( sw == 2143 )
 243                 sw = 3412;
 244 }
 245
 246 void gdcmHeader::GetPixels(size_t lgrTotale, void* _Pixels) {
 247         size_t pixelsOffset;
 248         pixelsOffset = GetPixelOffset();
 249         fseek(fp, pixelsOffset, SEEK_SET);
 250         fread(_Pixels, 1, lgrTotale, fp);
 251 }
 252
 253
 254
 255 /**
 256  * \ingroup   gdcmHeader
 257  * \brief     Find the value representation of the current tag.
 258  */
 259 void gdcmHeader::FindVR( ElValue *ElVal) {
 260         if (filetype != ExplicitVR)
 261                 return;
 262
 263         char VR[3];
 264         string vr;
 265         int lgrLue;
 266         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 267         // Warning: we believe this is explicit VR (Value Representation) because
 268         // we used a heuristic that found "UL" in the first tag. Alas this
 269         // doesn't guarantee that all the tags will be in explicit VR. In some
 270         // cases (see e-film filtered files) one finds implicit VR tags mixed
 271         // within an explicit VR file. Hence we make sure the present tag
 272         // is in explicit VR and try to fix things if it happens not to be
 273         // the case.
 274         bool RealExplicit = true;
 275
 276         lgrLue=fread (&VR, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 277         VR[2]=0;
 278         vr = string(VR);
 279
 280         // Assume we are reading a falsely explicit VR file i.e. we reached
 281         // a tag where we expect reading a VR but are in fact we read the
 282         // first to bytes of the length. Then we will interogate (through find)
 283         // the dicom_vr dictionary with oddities like "\004\0" which crashes
 284         // both GCC and VC++ implementations of the STL map. Hence when the
 285         // expected VR read happens to be non-ascii characters we consider
 286         // we hit falsely explicit VR tag.
 287
 288         if ( (!isalpha(VR[0])) && (!isalpha(VR[1])) )
 289                 RealExplicit = false;
 290
 291         // CLEANME searching the dicom_vr at each occurence is expensive.
 292         // PostPone this test in an optional integrity check at the end
 293         // of parsing or only in debug mode.
 294         if ( RealExplicit && !dicom_vr->count(vr) )
 295                 RealExplicit = false;
 296
 297         if ( RealExplicit ) {
 298                 if ( ElVal->IsVrUnknown() ) {
 299                         // When not a dictionary entry, we can safely overwrite the vr.
 300                         ElVal->SetVR(vr);
 301                         return;
 302                 }
 303                 if ( ElVal->GetVR() == vr ) {
 304                         // The vr we just read and the dictionary agree. Nothing to do.
 305                         return;
 306                 }
 307                 // The vr present in the file and the dictionary disagree. We assume
 308                 // the file writer knew best and use the vr of the file. Since it would
 309                 // be unwise to overwrite the vr of a dictionary (since it would
 310                 // compromise it's next user), we need to clone the actual DictEntry
 311                 // and change the vr for the read one.
 312                 gdcmDictEntry* NewTag = new gdcmDictEntry(ElVal->GetGroup(),
 313                                            ElVal->GetElement(),
 314                                            vr,
 315                                            "FIXME",
 316                                            ElVal->GetName());
 317                 ElVal->SetDictEntry(NewTag);
 318                 return;
 319         }
 320
 321         // We thought this was explicit VR, but we end up with an
 322         // implicit VR tag. Let's backtrack.
 323         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindVR:", "Falsely explicit vr file");
 324         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 325         // When this element is known in the dictionary we shall use, e.g. for
 326         // the semantics (see  the usage of IsAnInteger), the vr proposed by the
 327         // dictionary entry. Still we have to flag the element as implicit since
 328         // we know now our assumption on expliciteness is not furfilled.
 329         // avoid  .
 330         if ( ElVal->IsVrUnknown() )
 331                 ElVal->SetVR("Implicit");
 332         ElVal->SetImplicitVr();
 333 }
 334
 335 /**
 336  * \ingroup gdcmHeader
 337  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 338  *          and if it corresponds to a ImplicitVRLittleEndian one.
 339  *
 340  * @return  True when ImplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 341  */
 342 bool gdcmHeader::IsImplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 343         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 344         if ( !Element )
 345                 return false;
 346         LoadElementValueSafe(Element);
 347         string Transfer = Element->GetValue();
 348         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2" )
 349                 return true;
 350         return false;
 351 }
 352
 353 /**
 354  * \ingroup gdcmHeader
 355  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 356  *          and if it corresponds to a ExplicitVRLittleEndian one.
 357  *
 358  * @return  True when ExplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 359  */
 360 bool gdcmHeader::IsExplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 361         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 362         if ( !Element )
 363                 return false;
 364         LoadElementValueSafe(Element);
 365         string Transfer = Element->GetValue();
 366         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.1" )
 367                 return true;
 368         return false;
 369 }
 370
 371 /**
 372  * \ingroup gdcmHeader
 373  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 374  *          and if it corresponds to a DeflatedExplicitVRLittleEndian one.
 375  *
 376  * @return  True when DeflatedExplicitVRLittleEndian found. False in all other cases.
 377  */
 378 bool gdcmHeader::IsDeflatedExplicitVRLittleEndianTransferSyntax(void) {
 379         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 380         if ( !Element )
 381                 return false;
 382         LoadElementValueSafe(Element);
 383         string Transfer = Element->GetValue();
 384         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.1.99" )
 385                 return true;
 386         return false;
 387 }
 388
 389
 390 /**
 391  * \ingroup gdcmHeader
 392  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 393  *          and if it corresponds to a Explicit VR Big Endian one.
 394  *
 395  * @return  True when big endian found. False in all other cases.
 396  */
 397 bool gdcmHeader::IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax(void) {
 398         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 399         if ( !Element )
 400                 return false;
 401         LoadElementValueSafe(Element);
 402         string Transfer = Element->GetValue();
 403         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.2" )
 404                 return true;
 405         return false;
 406 }
 407
 408
 409 /**
 410  * \ingroup gdcmHeader
 411  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 412  *          and if it corresponds to a JPEGBaseLineProcess1 one.
 413  *
 414  * @return  True when JPEGBaseLineProcess1found. False in all other cases.
 415  */
 416 bool gdcmHeader::IsJPEGBaseLineProcess1TransferSyntax(void) {
 417         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 418         if ( !Element )
 419                 return false;
 420         LoadElementValueSafe(Element);
 421         string Transfer = Element->GetValue();
 422         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.50" )
 423                 return true;
 424         return false;
 425 }
 426
 427 /**
 428  * \ingroup gdcmHeader
 429  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 430  *          and if it corresponds to a JPEGExtendedProcess2-4 one.
 431  *
 432  * @return  True when JPEGExtendedProcess2-4 found. False in all other cases.
 433  */
 434 bool gdcmHeader::IsJPEGExtendedProcess2_4TransferSyntax(void) {
 435         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 436         if ( !Element )
 437                 return false;
 438         LoadElementValueSafe(Element);
 439         string Transfer = Element->GetValue();
 440         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.51" )
 441                 return true;
 442         return false;
 443 }
 444
 445
 446 /**
 447  * \ingroup gdcmHeader
 448  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 449  *          and if it corresponds to a JPEGExtendeProcess3-5 one.
 450  *
 451  * @return  True when JPEGExtendedProcess3-5 found. False in all other cases.
 452  */
 453 bool gdcmHeader::IsJPEGExtendedProcess3_5TransferSyntax(void) {
 454         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 455         if ( !Element )
 456                 return false;
 457         LoadElementValueSafe(Element);
 458         string Transfer = Element->GetValue();
 459         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.52" )
 460                 return true;
 461         return false;
 462 }
 463
 464 /**
 465  * \ingroup gdcmHeader
 466  * \brief   Determines if the Transfer Syntax was allready encountered
 467  *          and if it corresponds to a JPEGSpectralSelectionProcess6-8 one.
 468  *
 469  * @return  True when JPEGSpectralSelectionProcess6-8 found. False in all other cases.
 470  */
 471 bool gdcmHeader::IsJPEGSpectralSelectionProcess6_8TransferSyntax(void) {
 472         ElValue* Element = PubElVals.GetElementByNumber(0x0002, 0x0010);
 473         if ( !Element )
 474                 return false;
 475         LoadElementValueSafe(Element);
 476         string Transfer = Element->GetValue();
 477         if ( Transfer == "1.2.840.10008.1.2.4.53" )
 478                 return true;
 479         return false;
 480 }
 481
 482 //
 483 // Euhhhhhhh
 484 // Il y en a encore DIX-SEPT, comme ça.
 485 // Il faudrait trouver qq chose + rusé ...
 486 //
 487 // --> probablement TOUS les supprimer (Eric dixit)
 488 //
 489
 490
 491 void gdcmHeader::FixFoundLength(ElValue * ElVal, guint32 FoundLength) {
 492         // Heuristic: a final fix.
 493         if ( FoundLength == 0xffffffff)
 494                 FoundLength = 0;
 495         ElVal->SetLength(FoundLength);
 496 }
 497
 498 guint32 gdcmHeader::FindLengthOB(void) {
 499         // See PS 3.5-2001, section A.4 p. 49 on encapsulation of encoded pixel data.
 500         guint16 g;
 501         guint16 n;
 502         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 503         bool FoundSequenceDelimiter = false;
 504         guint32 TotalLength = 0;
 505         guint32 ItemLength;
 506
 507         while ( ! FoundSequenceDelimiter) {
 508                 g = ReadInt16();
 509                 n = ReadInt16();
 510                 if (errno == 1)
 511                         return 0;
 512                 TotalLength += 4;  // We even have to decount the group and element
 513                 if ( g != 0xfffe ) {
 514                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindLengthOB: ",
 515                                     "wrong group for an item sequence.");
 516                         errno = 1;
 517                         return 0;
 518                 }
 519                 if ( n == 0xe0dd )
 520                         FoundSequenceDelimiter = true;
 521                 else if ( n != 0xe000) {
 522                         dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::FindLengthOB: ",
 523                                     "wrong element for an item sequence.");
 524                         errno = 1;
 525                         return 0;
 526                 }
 527                 ItemLength = ReadInt32();
 528                 TotalLength += ItemLength + 4;  // We add 4 bytes since we just read
 529                                                 // the ItemLength with ReadInt32
 530                 SkipBytes(ItemLength);
 531         }
 532         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 533         return TotalLength;
 534 }
 535
 536 void gdcmHeader::FindLength(ElValue * ElVal) {
 537         guint16 element = ElVal->GetElement();
 538         string  vr      = ElVal->GetVR();
 539         guint16 length16;
 540
 541         if ( (filetype == ExplicitVR) && ! ElVal->IsImplicitVr() ) {
 542
 543                 if ( (vr=="OB") || (vr=="OW") || (vr=="SQ") || (vr=="UN") ) {
 544                         // The following reserved two bytes (see PS 3.5-2001, section
 545                         // 7.1.2 Data element structure with explicit vr p27) must be
 546                         // skipped before proceeding on reading the length on 4 bytes.
 547                         fseek(fp, 2L, SEEK_CUR);
 548                         guint32 length32 = ReadInt32();
 549                         if ( (vr == "OB") && (length32 == 0xffffffff) ) {
 550                                 ElVal->SetLength(FindLengthOB());
 551                                 return;
 552                         }
 553                         FixFoundLength(ElVal, length32);
 554                         return;
 555                 }
 556
 557                 // Length is encoded on 2 bytes.
 558                 length16 = ReadInt16();
 559
 560                 // We can tell the current file is encoded in big endian (like
 561                 // Data/US-RGB-8-epicard) when we find the "Transfer Syntax" tag
 562                 // and it's value is the one of the encoding of a big endian file.
 563                 // In order to deal with such big endian encoded files, we have
 564                 // (at least) two strategies:
 565                 // * when we load the "Transfer Syntax" tag with value of big endian
 566                 //   encoding, we raise the proper flags. Then we wait for the end
 567                 //   of the META group (0x0002) among which is "Transfer Syntax",
 568                 //   before switching the swap code to big endian. We have to postpone
 569                 //   the switching of the swap code since the META group is fully encoded
 570                 //   in little endian, and big endian coding only starts at the next
 571                 //   group. The corresponding code can be hard to analyse and adds
 572                 //   many additional unnecessary tests for regular tags.
 573                 // * the second strategy consists in waiting for trouble, that shall appear
 574                 //   when we find the first group with big endian encoding. This is
 575                 //   easy to detect since the length of a "Group Length" tag (the
 576                 //   ones with zero as element number) has to be of 4 (0x0004). When we
 577                 //   encouter 1024 (0x0400) chances are the encoding changed and we
 578                 //   found a group with big endian encoding.
 579                 // We shall use this second strategy. In order make sure that we
 580                 // can interpret the presence of an apparently big endian encoded
 581                 // length of a "Group Length" without committing a big mistake, we
 582                 // add an additional check: we look in the allready parsed elements
 583                 // for the presence of a "Transfer Syntax" whose value has to be "big
 584                 // endian encoding". When this is the case, chances are we got our
 585                 // hands on a big endian encoded file: we switch the swap code to
 586                 // big endian and proceed...
 587                 if ( (element  == 0x000) && (length16 == 0x0400) ) {
 588                         if ( ! IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax() ) {
 589                                 dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::FindLength", "not explicit VR");
 590                                 errno = 1;
 591                                 return;
 592                         }
 593                         length16 = 4;
 594                         SwitchSwapToBigEndian();
 595                         // Restore the unproperly loaded values i.e. the group, the element
 596                         // and the dictionary entry depending on them.
 597                         guint16 CorrectGroup   = SwapShort(ElVal->GetGroup());
 598                         guint16 CorrectElem    = SwapShort(ElVal->GetElement());
 599                         gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByKey(CorrectGroup, CorrectElem);
 600                         if (!NewTag) {
 601                                 // This correct tag is not in the dictionary. Create a new one.
 602                                 NewTag = new gdcmDictEntry(CorrectGroup, CorrectElem);
 603                         }
 604                         // FIXME this can create a memory leaks on the old entry that be
 605                         // left unreferenced.
 606                         ElVal->SetDictEntry(NewTag);
 607                 }
 608
 609                 // Heuristic: well some files are really ill-formed.
 610                 if ( length16 == 0xffff) {
 611                         length16 = 0;
 612                         dbg.Verbose(0, "gdcmHeader::FindLength",
 613                                     "Erroneous element length fixed.");
 614                 }
 615                 FixFoundLength(ElVal, (guint32)length16);
 616                 return;
 617         }
 618
 619         // Either implicit VR or a non DICOM conformal (see not below) explicit
 620         // VR that ommited the VR of (at least) this element. Farts happen.
 621         // [Note: according to the part 5, PS 3.5-2001, section 7.1 p25
 622         // on Data elements "Implicit and Explicit VR Data Elements shall
 623         // not coexist in a Data Set and Data Sets nested within it".]
 624         // Length is on 4 bytes.
 625         FixFoundLength(ElVal, ReadInt32());
 626 }
 627
 628 /**
 629  * \ingroup gdcmHeader
 630  * \brief   Swaps back the bytes of 4-byte long integer accordingly to
 631  *          processor order.
 632  *
 633  * @return  The suggested integer.
 634  */
 635 guint32 gdcmHeader::SwapLong(guint32 a) {
 636         // FIXME: il pourrait y avoir un pb pour les entiers negatifs ...
 637         switch (sw) {
 638         case    0 :
 639                 break;
 640         case 4321 :
 641                 a=(   ((a<<24) & 0xff000000) | ((a<<8)  & 0x00ff0000)    |
 642                       ((a>>8)  & 0x0000ff00) | ((a>>24) & 0x000000ff) );
 643                 break;
 644
 645         case 3412 :
 646                 a=(   ((a<<16) & 0xffff0000) | ((a>>16) & 0x0000ffff) );
 647                 break;
 648
 649         case 2143 :
 650                 a=(    ((a<<8) & 0xff00ff00) | ((a>>8) & 0x00ff00ff)  );
 651                 break;
 652         default :
 653                 dbg.Error(" gdcmHeader::SwapLong : unset swap code");
 654                 a=0;
 655         }
 656         return(a);
 657 }
 658
 659 /**
 660  * \ingroup gdcmHeader
 661  * \brief   Swaps the bytes so they agree with the processor order
 662  * @return  The properly swaped 16 bits integer.
 663  */
 664 guint16 gdcmHeader::SwapShort(guint16 a) {
 665         if ( (sw==4321)  || (sw==2143) )
 666                 a =(((a<<8) & 0x0ff00) | ((a>>8)&0x00ff));
 667         return (a);
 668 }
 669
 670 void gdcmHeader::SkipBytes(guint32 NBytes) {
 671         //FIXME don't dump the returned value
 672         (void)fseek(fp, (long)NBytes, SEEK_CUR);
 673 }
 674
 675 void gdcmHeader::SkipElementValue(ElValue * ElVal) {
 676         SkipBytes(ElVal->GetLength());
 677 }
 678
 679 void gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue(long NewSize) {
 680         if (NewSize < 0)
 681                 return;
 682         if ((guint32)NewSize >= (guint32)0xffffffff) {
 683                 MaxSizeLoadElementValue = 0xffffffff;
 684                 return;
 685         }
 686         MaxSizeLoadElementValue = NewSize;
 687 }
 688
 689 /**
 690  * \ingroup       gdcmHeader
 691  * \brief         Loads the element content if it's length is not bigger
 692  *                than the value specified with
 693  *                gdcmHeader::SetMaxSizeLoadElementValue()
 694  */
 695 void gdcmHeader::LoadElementValue(ElValue * ElVal) {
 696         size_t item_read;
 697         guint16 group  = ElVal->GetGroup();
 698         guint16 elem   = ElVal->GetElement();
 699         string  vr     = ElVal->GetVR();
 700         guint32 length = ElVal->GetLength();
 701         bool SkipLoad  = false;
 702
 703         fseek(fp, (long)ElVal->GetOffset(), SEEK_SET);
 704
 705         // Sequences not treated yet !
 706         //
 707         // Ne faudrait-il pas au contraire trouver immediatement
 708         // une maniere 'propre' de traiter les sequences (vr = SQ)
 709         // car commencer par les ignorer risque de conduire a qq chose
 710         // qui pourrait ne pas etre generalisable
 711         //
 712         if( vr == "SQ" )
 713                 SkipLoad = true;
 714
 715         // Heuristic : a sequence "contains" a set of tags (called items). It looks
 716         // like the last tag of a sequence (the one that terminates the sequence)
 717         // has a group of 0xfffe (with a dummy length).
 718         if( group == 0xfffe )
 719                 SkipLoad = true;
 720
 721         // The group length doesn't represent data to be loaded in memory, since
 722         // each element of the group shall be loaded individualy.
 723         if( elem == 0 )
 724                 //SkipLoad = true;              // modif sauvage JPR
 725                                                                 // On charge la longueur du groupe
 726                                                                 // quand l'element 0x0000 est présent !
 727
 728         if ( SkipLoad ) {
 729                           // FIXME the following skip is not necessary
 730                 SkipElementValue(ElVal);
 731                 ElVal->SetLength(0);
 732                 ElVal->SetValue("gdcm::Skipped");
 733                 return;
 734         }
 735
 736         // When the length is zero things are easy:
 737         if ( length == 0 ) {
 738                 ElVal->SetValue("");
 739                 return;
 740         }
 741
 742         // The elements whose length is bigger than the specified upper bound
 743         // are not loaded. Instead we leave a short notice of the offset of
 744         // the element content and it's length.
 745         if (length > MaxSizeLoadElementValue) {
 746                 ostringstream s;
 747                 s << "gdcm::NotLoaded.";
 748                 s << " Address:" << (long)ElVal->GetOffset();
 749                 s << " Length:"  << ElVal->GetLength();
 750                 ElVal->SetValue(s.str());
 751                 return;
 752         }
 753
 754         // When an integer is expected, read and convert the following two or
 755         // four bytes properly i.e. as an integer as opposed to a string.
 756         if ( IsAnInteger(ElVal) ) {
 757                 guint32 NewInt;
 758                 if( length == 2 ) {
 759                         NewInt = ReadInt16();
 760                 } else if( length == 4 ) {
 761                         NewInt = ReadInt32();
 762                 } else
 763                         dbg.Error(true, "LoadElementValue: Inconsistency when reading Int.");
 764
 765                 //FIXME: make the following an util fonction
 766                 ostringstream s;
 767                 s << NewInt;
 768                 ElVal->SetValue(s.str());
 769                 return;
 770         }
 771
 772         // FIXME The exact size should be length if we move to strings or whatever
 773         char* NewValue = (char*)malloc(length+1);
 774         if( !NewValue) {
 775                 dbg.Verbose(1, "LoadElementValue: Failed to allocate NewValue");
 776                 return;
 777         }
 778         NewValue[length]= 0;
 779
 780         item_read = fread(NewValue, (size_t)length, (size_t)1, fp);
 781         if ( item_read != 1 ) {
 782                 free(NewValue);
 783                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::LoadElementValue","unread element value");
 784                 ElVal->SetValue("gdcm::UnRead");
 785                 return;
 786         }
 787         ElVal->SetValue(NewValue);
 788 }
 789
 790 /**
 791  * \ingroup       gdcmHeader
 792  * \brief         Loads the element while preserving the current
 793  *                underlying file position indicator as opposed to
 794  *                to LoadElementValue that modifies it.
 795  * @param ElVal   Element whose value shall be loaded.
 796  * @return
 797  */
 798 void gdcmHeader::LoadElementValueSafe(ElValue * ElVal) {
 799         long PositionOnEntry = ftell(fp);
 800         LoadElementValue(ElVal);
 801         fseek(fp, PositionOnEntry, SEEK_SET);
 802 }
 803
 804
 805 guint16 gdcmHeader::ReadInt16(void) {
 806         guint16 g;
 807         size_t item_read;
 808         item_read = fread (&g, (size_t)2,(size_t)1, fp);
 809         errno = 0;
 810         if ( item_read != 1 ) {
 811                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ReadInt16", " File read error");
 812                 errno = 1;
 813                 return 0;
 814         }
 815         g = SwapShort(g);
 816         return g;
 817 }
 818
 819 guint32 gdcmHeader::ReadInt32(void) {
 820         guint32 g;
 821         size_t item_read;
 822         item_read = fread (&g, (size_t)4,(size_t)1, fp);
 823         errno = 0;
 824         if ( item_read != 1 ) {
 825                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ReadInt32", " File read error");
 826                 errno = 1;
 827                 return 0;
 828         }
 829         g = SwapLong(g);
 830         return g;
 831 }
 832
 833 /**
 834  * \ingroup gdcmHeader
 835  * \brief   Build a new Element Value from all the low level arguments.
 836  *          Check for existence of dictionary entry, and build
 837  *          a default one when absent.
 838  * @param   Group group   of the underlying DictEntry
 839  * @param   Elem  element of the underlying DictEntry
 840  */
 841 ElValue* gdcmHeader::NewElValueByKey(guint16 Group, guint16 Elem) {
 842         // Find out if the tag we encountered is in the dictionaries:
 843         gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByKey(Group, Elem);
 844         if (!NewTag)
 845                 NewTag = new gdcmDictEntry(Group, Elem);
 846
 847         ElValue* NewElVal = new ElValue(NewTag);
 848         if (!NewElVal) {
 849                 dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::NewElValueByKey",
 850                             "failed to allocate ElValue");
 851                 return (ElValue*)0;
 852         }
 853    return NewElVal;
 854 }
 855
 856 /**
 857  * \ingroup gdcmHeader
 858  * \brief   Build a new Element Value from all the low level arguments.
 859  *          Check for existence of dictionary entry, and build
 860  *          a default one when absent.
 861  * @param   Name    Name of the underlying DictEntry
 862  */
 863 ElValue* gdcmHeader::NewElValueByName(string Name) {
 864
 865    gdcmDictEntry * NewTag = GetDictEntryByName(Name);
 866    if (!NewTag)
 867       NewTag = new gdcmDictEntry(0xffff, 0xffff, "LO", "Unknown", Name);
 868
 869    ElValue* NewElVal = new ElValue(NewTag);
 870    if (!NewElVal) {
 871       dbg.Verbose(1, "gdcmHeader::ObtainElValueByName",
 872                   "failed to allocate ElValue");
 873       return (ElValue*)0;
 874    }
 875    return NewElVal;
 876 }
 877
 878
 879 /**
 880  * \ingroup gdcmHeader
 881  * \brief   Read the next tag without loading it's value
 882  * @return  On succes the newly created ElValue, NULL on failure.
 883  */
 884
 885 ElValue * gdcmHeader::ReadNextElement(void) {
 886         guint16 g;
 887         guint16 n;
 888         ElValue * NewElVal;
 889
 890         g = ReadInt16();
 891         n = ReadInt16();
 892         if (errno == 1)
 893                 // We reached the EOF (or an error occured) and header parsing
 894                 // has to be considered as finished.
 895                 return (ElValue *)0;
 896
 897         NewElVal = NewElValueByKey(g, n);
 898         FindVR(NewElVal);
 899         FindLength(NewElVal);
 900         if (errno == 1)
 901                 // Call it quits
 902                 return (ElValue *)0;
 903         NewElVal->SetOffset(ftell(fp));
 904         return NewElVal;
 905 }
 906
 907 bool gdcmHeader::IsAnInteger(ElValue * ElVal) {
 908         guint16 group   = ElVal->GetGroup();
 909         guint16 element = ElVal->GetElement();
 910         string  vr      = ElVal->GetVR();
 911         guint32 length  = ElVal->GetLength();
 912
 913         // When we have some semantics on the element we just read, and if we
 914         // a priori know we are dealing with an integer, then we shall be
 915         // able to swap it's element value properly.
 916         if ( element == 0 )  {  // This is the group length of the group
 917                 if (length == 4)
 918                         return true;
 919                 else
 920                         dbg.Error("gdcmHeader::IsAnInteger",
 921                                   "Erroneous Group Length element length.");
 922         }
 923
 924         if ( group % 2 != 0 )
 925                 // We only have some semantics on documented elements, which are
 926                 // the even ones.
 927                 return false;
 928
 929         if ( (length != 4) && ( length != 2) )
 930                 // Swapping only make sense on integers which are 2 or 4 bytes long.
 931                 return false;
 932
 933         if ( (vr == "UL") || (vr == "US") || (vr == "SL") || (vr == "SS") )
 934                 return true;
 935
 936         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0005) )
 937                 // The "Image Dimensions" tag is retained from ACR/NEMA and contains
 938                 // the number of dimensions of the contained object (1 for Signal,
 939                 // 2 for Image, 3 for Volume, 4 for Sequence).
 940                 return true;
 941
 942         if ( (group == 0x0028) && (element == 0x0200) )
 943                 // This tag is retained from ACR/NEMA
 944                 return true;
 945
 946         return false;
 947 }
 948
 949 /**
 950  * \ingroup gdcmHeader
 951  * \brief   Recover the offset (from the beginning of the file) of the pixels.
 952  */
 953 size_t gdcmHeader::GetPixelOffset(void) {
 954         // If this file complies with the norm we should encounter the
 955         // "Image Location" tag (0x0028,  0x0200). This tag contains the
 956         // the group that contains the pixel data (hence the "Pixel Data"
 957         // is found by indirection through the "Image Location").
 958         // Inside the group pointed by "Image Location" the searched element
 959         // is conventionally the element 0x0010 (when the norm is respected).
 960         //    When the "Image Location" is absent we default to group 0x7fe0.
 961         guint16 grPixel;
 962         guint16 numPixel;
 963         string ImageLocation = GetPubElValByName("Image Location");
 964         if ( ImageLocation == "gdcm::Unfound" ) {
 965                 grPixel = 0x7fe0;
 966         } else {
 967                 grPixel = (guint16) atoi( ImageLocation.c_str() );
 968         }
 969         if (grPixel != 0x7fe0)
 970                 // FIXME is this still necessary ?
 971                 // Now, this looks like an old dirty fix for Philips imager
 972                 numPixel = 0x1010;
 973         else
 974                 numPixel = 0x0010;
 975         ElValue* PixelElement = PubElVals.GetElementByNumber(grPixel, numPixel);
 976         if (PixelElement)
 977                 return PixelElement->GetOffset();
 978         else
 979                 return 0;
 980 }
 981
 982 /**
 983  * \ingroup gdcmHeader
 984  * \brief   Searches both the public and the shadow dictionary (when they
 985  *          exist) for the presence of the DictEntry with given
 986  *          group and element. The public dictionary has precedence on the
 987  *          shadow one.
 988  * @param   group   group of the searched DictEntry
 989  * @param   element element of the searched DictEntry
 990  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
 991  */
 992 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByKey(guint16 group, guint16 element) {
 993         gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
 994         if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
 995                 dbg.Verbose(0, "FIXME in gdcmHeader::GetDictEntry",
 996                      "we SHOULD have a default dictionary");
 997         }
 998         if (RefPubDict) {
 999                 found = RefPubDict->GetTagByKey(group, element);
1000                 if (found)
1001                         return found;
1002         }
1003         if (RefShaDict) {
1004                 found = RefShaDict->GetTagByKey(group, element);
1005                 if (found)
1006                         return found;
1007         }
1008         return found;
1009 }
1010
1011 /**
1012  * \ingroup gdcmHeader
1013  * \brief   Searches both the public and the shadow dictionary (when they
1014  *          exist) for the presence of the DictEntry with given name.
1015  *          The public dictionary has precedence on the shadow one.
1016  * @earam   Name name of the searched DictEntry
1017  * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
1018  */
1019 gdcmDictEntry * gdcmHeader::GetDictEntryByName(string Name) {
1020         gdcmDictEntry * found = (gdcmDictEntry*)0;
1021         if (!RefPubDict && !RefShaDict) {
1022                 dbg.Verbose(0, "FIXME in gdcmHeader::GetDictEntry",
1023                      "we SHOULD have a default dictionary");
1024         }
1025         if (RefPubDict) {
1026                 found = RefPubDict->GetTagByName(Name);
1027                 if (found)
1028                         return found;
1029         }
1030         if (RefShaDict) {
1031                 found = RefShaDict->GetTagByName(Name);
1032                 if (found)
1033                         return found;
1034         }
1035         return found;
1036 }
1037
1038 string gdcmHeader::GetPubElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1039         return PubElVals.GetElValueByNumber(group, element);
1040 }
1041
1042 string gdcmHeader::GetPubElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1043         ElValue* elem =  PubElVals.GetElementByNumber(group, element);
1044         if ( !elem )
1045                 return "gdcm::Unfound";
1046         return elem->GetVR();
1047 }
1048
1049 string gdcmHeader::GetPubElValByName(string TagName) {
1050         return PubElVals.GetElValueByName(TagName);
1051 }
1052
1053 string gdcmHeader::GetPubElValRepByName(string TagName) {
1054         ElValue* elem =  PubElVals.GetElementByName(TagName);
1055         if ( !elem )
1056                 return "gdcm::Unfound";
1057         return elem->GetVR();
1058 }
1059
1060 string gdcmHeader::GetShaElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1061         return ShaElVals.GetElValueByNumber(group, element);
1062 }
1063
1064 string gdcmHeader::GetShaElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1065         ElValue* elem =  ShaElVals.GetElementByNumber(group, element);
1066         if ( !elem )
1067                 return "gdcm::Unfound";
1068         return elem->GetVR();
1069 }
1070
1071 string gdcmHeader::GetShaElValByName(string TagName) {
1072         return ShaElVals.GetElValueByName(TagName);
1073 }
1074
1075 string gdcmHeader::GetShaElValRepByName(string TagName) {
1076         ElValue* elem =  ShaElVals.GetElementByName(TagName);
1077         if ( !elem )
1078                 return "gdcm::Unfound";
1079         return elem->GetVR();
1080 }
1081
1082 string gdcmHeader::GetElValByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1083         string pub = GetPubElValByNumber(group, element);
1084         if (pub.length())
1085                 return pub;
1086         return GetShaElValByNumber(group, element);
1087 }
1088
1089 string gdcmHeader::GetElValRepByNumber(guint16 group, guint16 element) {
1090         string pub = GetPubElValRepByNumber(group, element);
1091         if (pub.length())
1092                 return pub;
1093         return GetShaElValRepByNumber(group, element);
1094 }
1095
1096 string gdcmHeader::GetElValByName(string TagName) {
1097         string pub = GetPubElValByName(TagName);
1098         if (pub.length())
1099                 return pub;
1100         return GetShaElValByName(TagName);
1101 }
1102
1103 string gdcmHeader::GetElValRepByName(string TagName) {
1104         string pub = GetPubElValRepByName(TagName);
1105         if (pub.length())
1106                 return pub;
1107         return GetShaElValRepByName(TagName);
1108 }
1109
1110 /**
1111  * \ingroup gdcmHeader
1112  * \brief   Accesses an existing ElValue in the PubElVals of this instance
1113  *          through it's (group, element) and modifies it's content with
1114  *          the given value.
1115  * @param   content new value to substitute with
1116  * @param   group   group of the ElVal to modify
1117  * @param   element element of the ElVal to modify
1118  */
1119 int gdcmHeader::SetPubElValByNumber(string content, guint16 group,
1120                                     guint16 element)
1121 {
1122         //CLEANME TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
1123         //CLEANME PubElVals.tagHt[key]->SetValue(content);
1124         return (  PubElVals.SetElValueByNumber (content, group, element) );
1125 }
1126
1127 /**
1128  * \ingroup gdcmHeader
1129  * \brief   Accesses an existing ElValue in the PubElVals of this instance
1130  *          through tag name and modifies it's content with the given value.
1131  * @param   content new value to substitute with
1132  * @param   TagName name of the tag to be modified
1133  */
1134 int gdcmHeader::SetPubElValByName(string content, string TagName) {
1135         //CLEANME TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
1136         //CLEANME PubElVals.tagHt[key]->SetValue(content);
1137         return (  PubElVals.SetElValueByName (content, TagName) );
1138 }
1139
1140 /**
1141  * \ingroup gdcmHeader
1142  * \brief   Accesses an existing ElValue in the ShaElVals of this instance
1143  *          through it's (group, element) and modifies it's content with
1144  *          the given value.
1145  * @param   content new value to substitute with
1146  * @param   group   group of the ElVal to modify
1147  * @param   element element of the ElVal to modify
1148  */
1149 int gdcmHeader::SetShaElValByNumber(string content,
1150                                     guint16 group, guint16 element)
1151 {
1152         return (  ShaElVals.SetElValueByNumber (content, group, element) );
1153 }
1154
1155 /**
1156  * \ingroup gdcmHeader
1157  * \brief   Accesses an existing ElValue in the ShaElVals of this instance
1158  *          through tag name and modifies it's content with the given value.
1159  * @param   content new value to substitute with
1160  * @param   TagName name of the tag to be modified
1161  */
1162 int gdcmHeader::SetShaElValByName(string content, string TagName) {
1163         return (  ShaElVals.SetElValueByName (content, TagName) );
1164 }
1165
1166 /**
1167  * \ingroup gdcmHeader
1168  * \brief   Parses the header of the file but WITHOUT loading element values.
1169  */
1170 void gdcmHeader::ParseHeader(bool exception_on_error) throw(gdcmFormatError) {
1171         ElValue * newElValue = (ElValue *)0;
1172
1173         rewind(fp);
1174         CheckSwap();
1175         while ( (newElValue = ReadNextElement()) ) {
1176                 SkipElementValue(newElValue);
1177                 PubElVals.Add(newElValue);
1178         }
1179 }
1180
1181 /**
1182  * \ingroup gdcmHeader
1183  * \brief   Once the header is parsed add some gdcm convenience/helper elements
1184  *          in the ElValSet. For example add:
1185  *          - gdcmImageType which is an entry containing a short for the
1186  *            type of image and whose value ranges in
1187  *               I8   (unsigned 8 bit image)
1188  *               I16  (unsigned 8 bit image)
1189  *               IS16 (signed 8 bit image)
1190  *          - gdcmXsize, gdcmYsize, gdcmZsize whose values are respectively
1191  *            the ones of the official DICOM fields Rows, Columns and Planes.
1192  */
1193 void gdcmHeader::AddAndDefaultElements(void) {
1194         ElValue* NewEntry = (ElValue*)0;
1195
1196         NewEntry = NewElValueByName("gdcmXSize");
1197         NewEntry->SetValue(GetElValByName("Rows"));
1198         PubElVals.Add(NewEntry);
1199
1200         NewEntry = NewElValueByName("gdcmYSize");
1201         NewEntry->SetValue(GetElValByName("Columns"));
1202         PubElVals.Add(NewEntry);
1203
1204         NewEntry = NewElValueByName("gdcmZSize");
1205         NewEntry->SetValue(GetElValByName("Planes"));
1206         PubElVals.Add(NewEntry);
1207 }
1208
1209 /**
1210  * \ingroup gdcmHeader
1211  * \brief   Loads the element values of all the elements present in the
1212  *          public tag based hash table.
1213  */
1214 void gdcmHeader::LoadElements(void) {
1215         rewind(fp);
1216         TagElValueHT ht = PubElVals.GetTagHt();
1217         for (TagElValueHT::iterator tag = ht.begin(); tag != ht.end(); ++tag) {
1218                 LoadElementValue(tag->second);
1219                 }
1220 }
1221
1222 void gdcmHeader::PrintPubElVal(ostream & os) {
1223         PubElVals.Print(os);
1224 }
1225
1226 void gdcmHeader::PrintPubDict(ostream & os) {
1227         RefPubDict->Print(os);
1228 }