src/gdcmHeader.h

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmHeader.h,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/06/28 09:30:58 $
   7   Version:   $Revision: 1.78 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.htm for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #ifndef GDCMHEADER_H
  20 #define GDCMHEADER_H
  21
  22 #include "gdcmCommon.h"
  23 #include "gdcmDocument.h"
  24 //-----------------------------------------------------------------------------
  25 /**
  26  * \brief
  27  * The purpose of an instance of gdcmHeader is to act as a container of
  28  * all the DICOM elements and their corresponding values (and
  29  * additionaly the corresponding DICOM dictionary entry) of the header
  30  * of a DICOM file.
  31  *
  32  * The typical usage of instances of class gdcmHeader is to classify a set of
  33  * dicom files according to header information e.g. to create a file hierarchy
  34  * reflecting the Patient/Study/Serie informations, or extracting a given
  35  * SerieId. Accessing the content (image[s] or volume[s]) is beyond the
  36  * functionality of this class and belongs to gdmcFile.
  37  * \note  The various entries of the explicit value representation (VR) shall
  38  *        be managed within a dictionary which is shared by all gdcmHeader
  39  *        instances.
  40  * \note  The gdcmHeader::Set*Tag* family members cannot be defined as
  41  *        protected due to Swig limitations for as Has_a dependency between
  42  *        gdcmFile and gdcmHeader.
  43  */
  44
  45 //-----------------------------------------------------------------------------
  46 // Dicom Part 3.3 Compliant
  47 enum ModalityType {
  48    Unknow,
  49    AU,       // Voice Audio
  50    AS,       // Angioscopy
  51    BI,       // Biomagnetic Imaging
  52    CF,       // Cinefluorography
  53    CP,       // Culposcopy
  54    CR,       // Computed Radiography
  55    CS,       // Cystoscopy
  56    CT,       // Computed Tomography
  57    DD,       // Duplex Dopler
  58    DF,       // Digital Fluoroscopy
  59    DG,       // Diaphanography
  60    DM,       // Digital Microscopy
  61    DS,       // Digital Substraction Angiography
  62    DX,       // Digital Radiography
  63    ECG,      // Echocardiography
  64    EPS,      // Basic Cardiac EP
  65    ES,       // Endoscopy
  66    FA,       // Fluorescein Angiography
  67    FS,       // Fundoscopy
  68    HC,       // Hard Copy
  69    HD,       // Hemodynamic
  70    LP,       // Laparoscopy
  71    LS,       // Laser Surface Scan
  72    MA,       // Magnetic Resonance Angiography
  73    MR,       // Magnetic Resonance
  74    NM,       // Nuclear Medicine
  75    OT,       // Other
  76    PT,       // Positron Emission Tomography
  77    RF,       // Radio Fluoroscopy
  78    RG,       // Radiographic Imaging
  79    RTDOSE,   // Radiotherapy Dose
  80    RTIMAGE,  // Radiotherapy Image
  81    RTPLAN,   // Radiotherapy Plan
  82    RTSTRUCT, // Radiotherapy Structure Set
  83    SM,       // Microscopic Imaging
  84    ST,       // Single-photon Emission Computed Tomography
  85    TG,       // Thermography
  86    US,       // Ultrasound
  87    VF,       // Videofluorography
  88    XA,       // X-Ray Angiography
  89    XC        // Photographic Imaging
  90 };
  91 //-----------------------------------------------------------------------------
  92
  93 class GDCM_EXPORT gdcmHeader : public gdcmDocument
  94 {
  95 protected:
  96    /// \brief In some cases (e.g. for some ACR-NEMA images) the Header Entry Element
  97    /// Number of the 'Pixel Element' is *not* found at 0x0010. In order to
  98    /// make things easier the parser shall store the proper value in
  99    /// NumPixel to provide a unique access facility. See also the constructor
 100    /// \ref gdcmHeader::gdcmHeader
 101    guint16 NumPixel;
 102    /// \brief In some cases (e.g. for some ACR-NEMA images) the header entry for
 103    /// the group of pixels is *not* found at 0x7fe0. In order to
 104    /// make things easier the parser shall store the proper value in
 105    /// GrPixel to provide a unique access facility. See also the constructor
 106    /// \ref gdcmHeader::gdcmHeader
 107    guint16 GrPixel;
 108
 109 public:
 110    gdcmHeader(bool exception_on_error = false);
 111    gdcmHeader(std::string const & filename,
 112               bool  exception_on_error = false,
 113               bool  enable_sequences   = false,
 114               bool  skip_shadow        = false);
 115
 116    virtual ~gdcmHeader();
 117
 118    // Standard values and informations contained in the header
 119    virtual bool IsReadable();
 120
 121    // Some heuristic based accessors, end user intended
 122    int GetBitsStored();
 123    int GetBitsAllocated();
 124    int GetSamplesPerPixel();
 125    int GetPlanarConfiguration();
 126    int GetPixelSize();
 127
 128    std::string GetPixelType();
 129    size_t GetPixelOffset();
 130    size_t GetPixelAreaLength();
 131
 132    //Some image informations needed for third package imaging library
 133    int GetXSize();
 134    int GetYSize();
 135    int GetZSize();
 136
 137    float GetXSpacing();
 138    float GetYSpacing();
 139    float GetZSpacing();
 140    //void GetSpacing(float &x, float &y, float &z);
 141
 142    // Useful for rescaling graylevel:
 143    float GetRescaleIntercept();
 144    float GetRescaleSlope();
 145
 146    int GetNumberOfScalarComponents();
 147    int GetNumberOfScalarComponentsRaw();
 148
 149    // This is usefull for strategy of ordering study / series
 150    // Marking them as deprecated since I believe this is achieve in the
 151    // gdcmDocument operator<
 152    //std::string GetStudyUID();
 153    //std::string GetSeriesUID();
 154    //std::string GetClassUID();
 155    //std::string GetInstanceUID();
 156
 157    int GetImageNumber();
 158    ModalityType GetModality();
 159
 160    /**
 161     * change GetXImagePosition -> GetXOrigin in order not to confuse reader
 162     * -# GetXOrigin can return default value (=0) if it was not ImagePosition
 163     * -# Image Position is different in dicomV3 <> ACR NEMA -> better use generic
 164     * name
 165     */
 166    float GetXOrigin();
 167    float GetYOrigin();
 168    float GetZOrigin();
 169    //void GetOrigin(float &x, float &y, float &z);
 170
 171    bool   HasLUT();
 172    int    GetLUTNbits();
 173    unsigned char * GetLUTRGBA();
 174
 175    std::string GetTransfertSyntaxName();
 176
 177    /// Accessor to \ref gdcmHeader::GrPixel
 178    guint16 GetGrPixel()  {return GrPixel;}
 179
 180    /// Accessor to \ref gdcmHeader::NumPixel
 181    guint16 GetNumPixel() {return NumPixel;}
 182
 183    /// Read (used in gdcmFile)
 184    void SetImageDataSize(size_t expectedSize);
 185
 186 protected:
 187    bool AnonymizeHeader();
 188    void GetImageOrientationPatient( float* iop );
 189
 190 private:
 191   friend class gdcmSerieHeader;
 192 };
 193
 194 //-----------------------------------------------------------------------------
 195 #endif