src/gdcmObject.cxx

   1 // gdcmObject.cxx
   2 //-----------------------------------------------------------------------------
   3 #include "gdcmObject.h"
   4 #include "gdcmUtil.h"
   5
   6 //-----------------------------------------------------------------------------
   7 // Constructor / Destructor
   8 /**
   9  * \ingroup gdcmObject
  10  * \brief  Constructor
  11  * @param  begin  iterator on the first Header Entry (i.e Dicom Element)
  12  *                related to this 'Object'
  13  * @param  end  iterator on the last Header Entry
  14  *              (i.e Dicom Element) related to this 'Object'
  15  * @param ptagHT pointer to the HTable (gdcmObject needs it
  16  *               to build the gdcmHeaderEntries)
  17  * @param plistEntries pointer to the chained List (gdcmObject needs it
  18  *               to build the gdcmHeaderEntries)
  19  */
  20 gdcmObject::gdcmObject(ListTag::iterator begin, ListTag::iterator end,
  21               TagHeaderEntryHT *ptagHT, ListTag *plistEntries) {
  22    beginObj = begin;
  23    endObj   = end;
  24    this->ptagHT = ptagHT;
  25    this->plistEntries = plistEntries;
  26    if(begin==end)
  27       dbg.Verbose(0, "gdcmObject::gdcmObject empty list");
  28 }
  29
  30 /**
  31  * \ingroup gdcmObject
  32  * \brief   Canonical destructor.
  33  */
  34 gdcmObject::~gdcmObject(void) {
  35 }
  36
  37 //-----------------------------------------------------------------------------
  38 // Print
  39 /**
  40  * \ingroup gdcmObject
  41  * \brief   Prints the Object
  42  * @return
  43  */
  44 void gdcmObject::Print(std::ostream &os) {
  45    if(printLevel>=0) {
  46       ListTag::iterator i;
  47       //for(ListTag::iterator i=beginObj;i!=endObj;++i) // JPR
  48       for(i=beginObj;;++i) {
  49          (*i)->SetPrintLevel(printLevel);
  50          (*i)->Print(os);
  51          if (i == endObj) break;
  52       }
  53    }
  54 }
  55
  56 //-----------------------------------------------------------------------------
  57 // Public
  58 /**
  59  * \ingroup gdcmObject
  60  * \brief   Get the value of an Header Entries (i.e Dicom Element) by number
  61  * @return
  62  */
  63 std::string gdcmObject::GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element) {
  64    //for(ListTag::iterator i=beginObj;i!=endObj;++i) // JPR
  65    for(ListTag::iterator i=beginObj;;++i) {
  66       if ( (*i)->GetGroup()==group && (*i)->GetElement()==element)
  67          return (*i)->GetValue();
  68       if (i == endObj) break;
  69    }
  70    return GDCM_UNFOUND;
  71 }
  72
  73 /**
  74  * \ingroup gdcmObject
  75  * \brief   Get the value of an Header Entries (i.e Dicom Element) by name
  76  * @param   name : name of the searched element.
  77  * @return
  78  */
  79 std::string gdcmObject::GetEntryByName(TagName name)  {
  80    gdcmDict *PubDict=gdcmGlobal::GetDicts()->GetDefaultPubDict();
  81    gdcmDictEntry *dictEntry = (*PubDict).GetDictEntryByName(name);
  82
  83    if( dictEntry == NULL)
  84       return GDCM_UNFOUND;
  85    return GetEntryByNumber(dictEntry->GetGroup(),dictEntry->GetElement());
  86 }
  87
  88 /**
  89  * \ingroup gdcmParser
  90  * \brief   Sets Entry (Dicom Element) value of an element,
  91  *          specified by it's tag (Group, Number)
  92  *          and the length, too ...
  93  *          If the Element is not found, it's just created !
  94  * \warning we suppose, right now, the element belongs to a Public Group
  95  *          (NOT a shadow one)
  96  * @param   val string value to set
  97  * @param   group Group of the searched tag.
  98  * @param   element Element of the searched tag.
  99  * @return  true if element was found or created successfully
 100  */
 101  bool gdcmObject::SetEntryByNumber(std::string val,guint16 group,
 102                                                    guint16 element) {
 103
 104    gdcmHeaderEntry *a;
 105    for(ListTag::iterator i=beginObj;;++i) {
 106       if ( (*i)->GetGroup() == 0xfffe && (*i)->GetElement() == 0xe000 )
 107          continue;
 108       if ( group   < (*i)->GetGroup() ||
 109            (group == (*i)->GetGroup() && element < (*i)->GetElement()) ){
 110          // instead of ReplaceOrCreateByNumber
 111          // that is a method of gdcmParser :-(
 112          gdcmHeaderEntry *Entry;
 113          TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
 114          if ( ! ptagHT->count(key)) {
 115            // we assume a Public Dictionnary *is* loaded
 116            gdcmDict *PubDict         = gdcmGlobal::GetDicts()->GetDefaultPubDict();
 117            // if the invoqued (group,elem) doesn't exist inside the Dictionary
 118            // we create a VirtualDictEntry
 119            gdcmDictEntry *DictEntry  = PubDict->GetDictEntryByNumber(group, element);
 120            if (DictEntry == NULL) {
 121               DictEntry=gdcmGlobal::GetDicts()->NewVirtualDictEntry(group,element,"UN","??","??");
 122            }
 123            // we assume the constructor didn't fail
 124            Entry = new gdcmHeaderEntry(DictEntry);
 125            // ----
 126            // TODO
 127            // ----
 128            // better we don't assume too much !
 129            // in the next release, gdcmObject will be used
 130            // to describe any Header Entry ...
 131          } else {
 132             Entry = ptagHT->find(key)->second;
 133          }
 134          Entry->SetValue(val);
 135          Entry->SetLength(val.length());
 136          plistEntries->insert(i,Entry);
 137          return true;
 138       }
 139       if (group == (*i)->GetGroup() && element == (*i)->GetElement() ) {
 140          (*i)->SetValue(val);
 141          (*i)->SetLength(val.length());
 142          return true;
 143       }
 144    }
 145 }
 146 /**
 147  * \ingroup gdcmObject
 148  * \brief   Builds a hash table (multimap) containing
 149  *          pointers to all Header Entries (i.e Dicom Element)
 150  *          related to this 'object'
 151  * @return
 152  */
 153 TagHeaderEntryHT gdcmObject::GetEntry(void) {
 154    TagHeaderEntryHT HT;
 155    //for(ListTag::iterator i=beginObj;i!=endObj;++i) // JPR
 156    for(ListTag::iterator i=beginObj;;++i) {
 157       HT.insert( PairHT( (*i)->GetKey(),(*i)) );
 158       if (i == endObj) break;
 159    }
 160    return(HT);
 161 }
 162
 163 /**
 164  * \ingroup gdcmObject
 165  * \brief   Builds a Chained List containing
 166  *          pointers to all Header Entries (i.e Dicom Element)
 167  *          related to this 'object'
 168  * @return
 169  */
 170 ListTag gdcmObject::GetListEntry(void) {
 171    ListTag list;
 172    //for(ListTag::iterator i=beginObj;i!=endObj;++i) // JPR
 173    for(ListTag::iterator i=beginObj;;++i) {
 174       list.push_back(*i);
 175       if (i == endObj) break;
 176    }
 177    return(list);
 178 }
 179
 180
 181 //-----------------------------------------------------------------------------
 182 // Protected
 183 /*
 184  * \ingroup gdcmObject
 185  * \brief   add the 'Object' related Dicom Elements to the listEntries
 186  *          of a partially created DICOMDIR
 187  */
 188 void gdcmObject::FillObject(std::list<gdcmElement> elemList) {
 189    std::list<gdcmElement>::iterator it;
 190    guint16 tmpGr,tmpEl;
 191    gdcmDictEntry *dictEntry;
 192    gdcmHeaderEntry *entry;
 193
 194    debInsertion = this->fin();
 195    ++debInsertion;
 196    finInsertion=debInsertion;
 197
 198    for(it=elemList.begin();it!=elemList.end();++it)
 199    {
 200       tmpGr=it->group;
 201       tmpEl=it->elem;
 202       dictEntry=gdcmGlobal::GetDicts()->GetDefaultPubDict()->GetDictEntryByNumber(tmpGr,tmpEl);
 203       entry=new gdcmHeaderEntry(dictEntry);
 204       entry->SetOffset(0); // just to avoid missprinting //JPR
 205       entry->SetValue(it->value);
 206
 207       if(dictEntry->GetGroup()==0xfffe)
 208          {
 209             entry->SetLength(entry->GetValue().length());
 210          }
 211       else if( (dictEntry->GetVR()=="UL") || (dictEntry->GetVR()=="SL") )
 212          {
 213             entry->SetLength(4);
 214          }
 215       else if( (dictEntry->GetVR()=="US") || (dictEntry->GetVR()=="SS") )
 216          {
 217             entry->SetLength(2);
 218          }
 219       else if(dictEntry->GetVR()=="SQ")
 220          {
 221             entry->SetLength(0xffffffff);
 222          }
 223       else
 224          {
 225             entry->SetLength(entry->GetValue().length());
 226          }
 227       ptagHT->insert( PairHT(entry->GetKey(),entry) ); // add in the (multimap) H Table
 228       plistEntries->insert(debInsertion ,entry);       // en tete de liste des Patients
 229       ++finInsertion;
 230    }
 231
 232    i=fin();
 233    i++;
 234    j=debInsertion;
 235    j--;
 236 }
 237 //-----------------------------------------------------------------------------
 238 // Private
 239
 240 //-----------------------------------------------------------------------------