src/gdcmPixelConvert.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmPixelConvert.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/10/14 22:35:02 $
   7   Version:   $Revision: 1.13 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 //////////////////   TEMPORARY NOTE
  20 // look for "fixMem" and convert that to a member of this class
  21 // Removing the prefix fixMem and dealing with allocations should do the trick
  22 //
  23 // grep PIXELCONVERT everywhere and clean up !
  24
  25 #include "gdcmDebug.h"
  26 #include "gdcmPixelConvert.h"
  27
  28 namespace gdcm
  29 {
  30
  31 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  32
  33 // For JPEG 2000, body in file gdcmJpeg2000.cxx
  34 bool gdcm_read_JPEG2000_file (FILE* fp, void* image_buffer);
  35
  36 // For JPEG 8 Bits, body in file gdcmJpeg8.cxx
  37 bool gdcm_read_JPEG_file8    (FILE* fp, void* image_buffer);
  38
  39 // For JPEG 12 Bits, body in file gdcmJpeg12.cxx
  40 bool gdcm_read_JPEG_file12   (FILE* fp, void* image_buffer);
  41
  42 // For JPEG 16 Bits, body in file gdcmJpeg16.cxx
  43 // Beware this is misleading there is no 16bits DCT algorithm, only
  44 // jpeg lossless compression exist in 16bits.
  45 bool gdcm_read_JPEG_file16   (FILE* fp, void* image_buffer);
  46
  47
  48 //-----------------------------------------------------------------------------
  49 // Constructor / Destructor
  50 PixelConvert::PixelConvert()
  51 {
  52    RGB = 0;
  53    RGBSize = 0;
  54    Decompressed = 0;
  55    DecompressedSize = 0;
  56 }
  57
  58 void PixelConvert::Squeeze()
  59 {
  60    if ( RGB ) {
  61       delete [] RGB;
  62    }
  63    if ( Decompressed ) {
  64       delete [] Decompressed;
  65    }
  66 }
  67
  68 PixelConvert::~PixelConvert()
  69 {
  70    Squeeze();
  71 }
  72
  73 void PixelConvert::AllocateRGB()
  74 {
  75   if ( RGB ) {
  76      delete [] RGB;
  77   }
  78   RGB = new uint8_t[RGBSize];
  79 }
  80
  81 void PixelConvert::AllocateDecompressed()
  82 {
  83   if ( Decompressed ) {
  84      delete [] Decompressed;
  85   }
  86   Decompressed = new uint8_t[ DecompressedSize ];
  87 }
  88
  89 /**
  90  * \brief Read from file a 12 bits per pixel image and uncompress it
  91  *        into a 16 bits per pixel image.
  92  */
  93 void PixelConvert::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits(
  94                   uint8_t* pixelZone,
  95                   FILE* filePtr)
  96                throw ( FormatError )
  97 {
  98    int nbPixels = XSize * YSize;
  99    uint16_t* destination = (uint16_t*)pixelZone;
 100
 101    for( int p = 0; p < nbPixels; p += 2 )
 102    {
 103       uint8_t b0, b1, b2;
 104       size_t ItemRead;
 105
 106       ItemRead = fread( &b0, 1, 1, filePtr);
 107       if ( ItemRead != 1 )
 108       {
 109          throw FormatError( "File::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits()",
 110                                 "Unfound first block" );
 111       }
 112
 113       ItemRead = fread( &b1, 1, 1, filePtr);
 114       if ( ItemRead != 1 )
 115       {
 116          throw FormatError( "File::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits()",
 117                                 "Unfound second block" );
 118       }
 119
 120       ItemRead = fread( &b2, 1, 1, filePtr);
 121       if ( ItemRead != 1 )
 122       {
 123          throw FormatError( "File::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits()",
 124                                 "Unfound second block" );
 125       }
 126
 127       // Two steps are necessary to please VC++
 128       //
 129       // 2 pixels 12bit =     [0xABCDEF]
 130       // 2 pixels 16bit = [0x0ABD] + [0x0FCE]
 131       //                     A                     B                 D
 132       *destination++ =  ((b0 >> 4) << 8) + ((b0 & 0x0f) << 4) + (b1 & 0x0f);
 133       //                     F                     C                 E
 134       *destination++ =  ((b2 & 0x0f) << 8) + ((b1 >> 4) << 4) + (b2 >> 4);
 135
 136       /// \todo JPR Troubles expected on Big-Endian processors ?
 137    }
 138 }
 139
 140 /**
 141  * \brief     Try to deal with RLE 16 Bits.
 142  *            We assume the RLE has allready been parsed and loaded in
 143  *            Uncompressed (through \ref ReadAndDecompressJPEGFile ).
 144  *            We here need to make 16 Bits Pixels from Low Byte and
 145  *            High Byte 'Planes'...(for what it may mean)
 146  * @return    Boolean
 147  */
 148 bool PixelConvert::UncompressRLE16BitsFromRLE8Bits(
 149                        int NumberOfFrames,
 150                        uint8_t* fixMemUncompressed )
 151 {
 152    size_t PixelNumber = XSize * YSize;
 153    size_t fixMemUncompressedSize = XSize * YSize * NumberOfFrames;
 154
 155    // We assumed Uncompressed contains the decoded RLE pixels but as
 156    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
 157    // per pixel we cannot work in place within Uncompressed and hence
 158    // we copy Uncompressed in a safe place, say OldUncompressed.
 159
 160    uint8_t* OldUncompressed = new uint8_t[ fixMemUncompressedSize * 2 ];
 161    memmove( OldUncompressed, fixMemUncompressed, fixMemUncompressedSize * 2);
 162
 163    uint8_t* x = fixMemUncompressed;
 164    uint8_t* a = OldUncompressed;
 165    uint8_t* b = a + PixelNumber;
 166
 167    for ( int i = 0; i < NumberOfFrames; i++ )
 168    {
 169       for ( unsigned int j = 0; j < PixelNumber; j++ )
 170       {
 171          *(x++) = *(a++);
 172          *(x++) = *(b++);
 173       }
 174    }
 175
 176    delete[] OldUncompressed;
 177
 178    /// \todo check that operator new []didn't fail, and sometimes return false
 179    return true;
 180 }
 181
 182 /**
 183  * \brief Implementation of the RLE decoding algorithm for uncompressing
 184  *        a RLE fragment. [refer to PS 3.5-2003, section G.3.2 p 86]
 185  */
 186 bool PixelConvert::ReadAndUncompressRLEFragment( uint8_t* decodedZone,
 187                                                long fragmentSize,
 188                                                long uncompressedSegmentSize,
 189                                                FILE* fp )
 190 {
 191    int8_t count;
 192    long numberOfOutputBytes = 0;
 193    long numberOfReadBytes = 0;
 194
 195    while( numberOfOutputBytes < uncompressedSegmentSize )
 196    {
 197       fread( &count, 1, 1, fp );
 198       numberOfReadBytes += 1;
 199       if ( count >= 0 )
 200       // Note: count <= 127 comparison is always true due to limited range
 201       //       of data type int8_t [since the maximum of an exact width
 202       //       signed integer of width N is 2^(N-1) - 1, which for int8_t
 203       //       is 127].
 204       {
 205          fread( decodedZone, count + 1, 1, fp);
 206          numberOfReadBytes += count + 1;
 207          decodedZone         += count + 1;
 208          numberOfOutputBytes += count + 1;
 209       }
 210       else
 211       {
 212          if ( ( count <= -1 ) && ( count >= -127 ) )
 213          {
 214             int8_t newByte;
 215             fread( &newByte, 1, 1, fp);
 216             numberOfReadBytes += 1;
 217             for( int i = 0; i < -count + 1; i++ )
 218             {
 219                decodedZone[i] = newByte;
 220             }
 221             decodedZone         += -count + 1;
 222             numberOfOutputBytes += -count + 1;
 223          }
 224       }
 225       // if count = 128 output nothing
 226
 227       if ( numberOfReadBytes > fragmentSize )
 228       {
 229          dbg.Verbose(0, "File::gdcm_read_RLE_fragment: we read more "
 230                         "bytes than the segment size.");
 231          return false;
 232       }
 233    }
 234    return true;
 235 }
 236
 237 /**
 238  * \brief     Reads from disk the Pixel Data of 'Run Length Encoded'
 239  *            Dicom encapsulated file and uncompress it.
 240  * @param     fp already open File Pointer
 241  * @param     image_buffer destination Address (in caller's memory space)
 242  *            at which the pixel data should be copied
 243  * @return    Boolean
 244  */
 245 bool PixelConvert::ReadAndDecompressRLEFile(
 246                           void* image_buffer,
 247                           FILE* fp )
 248 {
 249    uint8_t* im = (uint8_t*)image_buffer;
 250    long uncompressedSegmentSize = XSize * YSize;
 251
 252    // Loop on the frame[s]
 253    for( RLEFramesInfo::RLEFrameList::iterator
 254         it  = RLEInfo->Frames.begin();
 255         it != RLEInfo->Frames.end();
 256       ++it )
 257    {
 258       // Loop on the fragments
 259       for( int k = 1; k <= (*it)->NumberFragments; k++ )
 260       {
 261          fseek( fp, (*it)->Offset[k] ,SEEK_SET );
 262          (void)PixelConvert::ReadAndUncompressRLEFragment(
 263                                  (uint8_t*) im, (*it)->Length[k],
 264                                  uncompressedSegmentSize, fp );
 265          im += uncompressedSegmentSize;
 266       }
 267    }
 268
 269    if ( BitsAllocated == 16 )
 270    {
 271       // Try to deal with RLE 16 Bits
 272       (void)UncompressRLE16BitsFromRLE8Bits( ZSize,
 273                                              (uint8_t*) image_buffer);
 274    }
 275
 276    return true;
 277 }
 278
 279 /**
 280  * \brief   Swap the bytes, according to swap code.
 281  * \warning not end user intended
 282  * @param   im area to deal with
 283  */
 284 void PixelConvert::SwapZone( uint8_t* im )
 285 {
 286    unsigned int i;
 287
 288    if( BitsAllocated == 16 )
 289    {
 290       uint16_t* im16 = (uint16_t*)im;
 291       switch( SwapCode )
 292       {
 293          case 0:
 294          case 12:
 295          case 1234:
 296             break;
 297          case 21:
 298          case 3412:
 299          case 2143:
 300          case 4321:
 301             for( i = 0; i < DecompressedSize / 2; i++ )
 302             {
 303                im16[i]= (im16[i] >> 8) | (im16[i] << 8 );
 304             }
 305             break;
 306          default:
 307             dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::SwapZone: SwapCode value "
 308                             "(16 bits) not allowed." );
 309       }
 310    }
 311    else if( BitsAllocated == 32 )
 312    {
 313       uint32_t s32;
 314       uint16_t fort, faible;
 315       uint32_t* im32 = (uint32_t*)im;
 316       switch ( SwapCode )
 317       {
 318          case 0:
 319          case 1234:
 320             break;
 321          case 4321:
 322             for( i = 0; i < DecompressedSize / 4; i++ )
 323             {
 324                faible  = im32[i] & 0x0000ffff;  // 4321
 325                fort    = im32[i] >> 16;
 326                fort    = ( fort >> 8   ) | ( fort << 8 );
 327                faible  = ( faible >> 8 ) | ( faible << 8);
 328                s32     = faible;
 329                im32[i] = ( s32 << 16 ) | fort;
 330             }
 331             break;
 332          case 2143:
 333             for( i = 0; i < DecompressedSize / 4; i++ )
 334             {
 335                faible  = im32[i] & 0x0000ffff;   // 2143
 336                fort    = im32[i] >> 16;
 337                fort    = ( fort >> 8 ) | ( fort << 8 );
 338                faible  = ( faible >> 8) | ( faible << 8);
 339                s32     = fort;
 340                im32[i] = ( s32 << 16 ) | faible;
 341             }
 342             break;
 343          case 3412:
 344             for( i = 0; i < DecompressedSize / 4; i++ )
 345             {
 346                faible  = im32[i] & 0x0000ffff; // 3412
 347                fort    = im32[i] >> 16;
 348                s32     = faible;
 349                im32[i] = ( s32 << 16 ) | fort;
 350             }
 351             break;
 352          default:
 353             dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::SwapZone: SwapCode value "
 354                             "(32 bits) not allowed." );
 355       }
 356    }
 357 }
 358
 359 /**
 360  * \brief Deal with endianity i.e. re-arange bytes inside the integer
 361  */
 362 void PixelConvert::ReorderEndianity( uint8_t* pixelZone )
 363 {
 364    if ( BitsAllocated != 8 )
 365    {
 366       SwapZone( pixelZone );
 367    }
 368
 369    // Special kludge in order to deal with xmedcon broken images:
 370    if (  ( BitsAllocated == 16 )
 371        && ( BitsStored < BitsAllocated )
 372        && ( ! PixelSign ) )
 373    {
 374       int l = (int)( DecompressedSize / ( BitsAllocated / 8 ) );
 375       uint16_t *deb = (uint16_t *)pixelZone;
 376       for(int i = 0; i<l; i++)
 377       {
 378          if( *deb == 0xffff )
 379          {
 380            *deb = 0;
 381          }
 382          deb++;
 383       }
 384    }
 385 }
 386
 387 /**
 388  * \brief     Reads from disk the Pixel Data of JPEG Dicom encapsulated
 389  &            file and uncompress it.
 390  * @param     fp already open File Pointer
 391  * @param     destination Where decompressed fragments should end up
 392  * @return    Boolean
 393  */
 394 bool PixelConvert::ReadAndDecompressJPEGFile(
 395                           uint8_t* destination,
 396                           FILE* fp )
 397 {
 398    // Loop on the fragment[s]
 399    for( JPEGFragmentsInfo::JPEGFragmentsList::iterator
 400         it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
 401         it != JPEGInfo->Fragments.end();
 402       ++it )
 403    {
 404       fseek( fp, (*it)->Offset, SEEK_SET );
 405
 406       if ( IsJPEG2000 )
 407       {
 408          if ( ! gdcm_read_JPEG2000_file( fp, destination ) )
 409          {
 410             return false;
 411          }
 412       }
 413       else if ( BitsStored == 8)
 414       {
 415          // JPEG Lossy : call to IJG 6b
 416          if ( ! gdcm_read_JPEG_file8( fp, destination ) )
 417          {
 418             return false;
 419          }
 420       }
 421       else if ( BitsStored == 12)
 422       {
 423          // Reading Fragment pixels
 424          if ( ! gdcm_read_JPEG_file12 ( fp, destination ) )
 425          {
 426             return false;
 427          }
 428       }
 429       else if ( BitsStored == 16)
 430       {
 431          // Reading Fragment pixels
 432          if ( ! gdcm_read_JPEG_file16 ( fp, destination ) )
 433          {
 434             return false;
 435          }
 436          //assert( IsJPEGLossless );
 437       }
 438       else
 439       {
 440          // other JPEG lossy not supported
 441          dbg.Error(" File::ReadAndDecompressJPEGFile: unknown jpeg lossy "
 442                    " compression ");
 443          return false;
 444       }
 445
 446       // Advance to next free location in destination
 447       // for next fragment decompression (if any)
 448       int length = XSize * YSize * SamplesPerPixel;
 449       int numberBytes = BitsAllocated / 8;
 450
 451       destination += length * numberBytes;
 452    }
 453    return true;
 454 }
 455
 456 /**
 457  * \brief  Re-arrange the bits within the bytes.
 458  * @param  pixelZone zone
 459  * @return Boolean
 460  */
 461 bool PixelConvert::ReArrangeBits( uint8_t* pixelZone )
 462      throw ( FormatError )
 463 {
 464    if ( BitsStored != BitsAllocated )
 465    {
 466       int l = (int)( DecompressedSize / ( BitsAllocated / 8 ) );
 467       if ( BitsAllocated == 16 )
 468       {
 469          uint16_t mask = 0xffff;
 470          mask = mask >> ( BitsAllocated - BitsStored );
 471          uint16_t* deb = (uint16_t*)pixelZone;
 472          for(int i = 0; i<l; i++)
 473          {
 474             *deb = (*deb >> (BitsStored - HighBitPosition - 1)) & mask;
 475             deb++;
 476          }
 477       }
 478       else if ( BitsAllocated == 32 )
 479       {
 480          uint32_t mask = 0xffffffff;
 481          mask = mask >> ( BitsAllocated - BitsStored );
 482          uint32_t* deb = (uint32_t*)pixelZone;
 483          for(int i = 0; i<l; i++)
 484          {
 485             *deb = (*deb >> (BitsStored - HighBitPosition - 1)) & mask;
 486             deb++;
 487          }
 488       }
 489       else
 490       {
 491          dbg.Verbose(0, "PixelConvert::ReArrangeBits: weird image");
 492          throw FormatError( "File::ReArrangeBits()",
 493                                 "weird image !?" );
 494       }
 495    }
 496    return true;
 497 }
 498
 499 /**
 500  * \brief   Convert (Y plane, cB plane, cR plane) to RGB pixels
 501  * \warning Works on all the frames at a time
 502  */
 503 void PixelConvert::ConvertYcBcRPlanesToRGBPixels( uint8_t* destination )
 504 {
 505    uint8_t* oldPixelZone = new uint8_t[ DecompressedSize ];
 506    memmove( oldPixelZone, destination, DecompressedSize );
 507
 508    // to see the tricks about YBR_FULL, YBR_FULL_422,
 509    // YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT have a look at :
 510    // ftp://medical.nema.org/medical/dicom/final/sup61_ft.pdf
 511    // and be *very* affraid
 512    //
 513    int l        = XSize * YSize;
 514    int nbFrames = ZSize;
 515
 516    uint8_t* a = oldPixelZone;
 517    uint8_t* b = oldPixelZone + l;
 518    uint8_t* c = oldPixelZone + l + l;
 519    double R, G, B;
 520
 521    /// \todo : Replace by the 'well known' integer computation
 522    ///         counterpart. Refer to
 523    ///            http://lestourtereaux.free.fr/papers/data/yuvrgb.pdf
 524    ///         for code optimisation.
 525
 526    for ( int i = 0; i < nbFrames; i++ )
 527    {
 528       for ( int j = 0; j < l; j++ )
 529       {
 530          R = 1.164 *(*a-16) + 1.596 *(*c -128) + 0.5;
 531          G = 1.164 *(*a-16) - 0.813 *(*c -128) - 0.392 *(*b -128) + 0.5;
 532          B = 1.164 *(*a-16) + 2.017 *(*b -128) + 0.5;
 533
 534          if (R < 0.0)   R = 0.0;
 535          if (G < 0.0)   G = 0.0;
 536          if (B < 0.0)   B = 0.0;
 537          if (R > 255.0) R = 255.0;
 538          if (G > 255.0) G = 255.0;
 539          if (B > 255.0) B = 255.0;
 540
 541          *(destination++) = (uint8_t)R;
 542          *(destination++) = (uint8_t)G;
 543          *(destination++) = (uint8_t)B;
 544          a++;
 545          b++;
 546          c++;
 547       }
 548    }
 549    delete[] oldPixelZone;
 550 }
 551
 552 /**
 553  * \brief   Convert (Red plane, Green plane, Blue plane) to RGB pixels
 554  * \warning Works on all the frames at a time
 555  */
 556 void PixelConvert::ConvertRGBPlanesToRGBPixels( uint8_t* destination )
 557 {
 558    uint8_t* oldPixelZone = new uint8_t[ DecompressedSize ];
 559    memmove( oldPixelZone, destination, DecompressedSize );
 560
 561    int l = XSize * YSize * ZSize;
 562
 563    uint8_t* a = oldPixelZone;
 564    uint8_t* b = oldPixelZone + l;
 565    uint8_t* c = oldPixelZone + l + l;
 566
 567    for (int j = 0; j < l; j++)
 568    {
 569       *(destination++) = *(a++);
 570       *(destination++) = *(b++);
 571       *(destination++) = *(c++);
 572    }
 573    delete[] oldPixelZone;
 574 }
 575
 576 bool PixelConvert::ReadAndDecompressPixelData( void* destination, FILE* fp )
 577 {
 578    //////////////////////////////////////////////////
 579    //// First stage: get our hands on the Pixel Data.
 580    if ( !fp )
 581    {
 582      dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::ReadAndDecompressPixelData: "
 583                      "unavailable file pointer." );
 584       return false;
 585    }
 586
 587    if ( fseek(fp, PixelOffset, SEEK_SET) == -1 )
 588    {
 589      dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::ReadAndDecompressPixelData: "
 590                      "unable to find PixelOffset in file." );
 591       return false;
 592    }
 593
 594    //////////////////////////////////////////////////
 595    //// Second stage: read from disk dans uncompress.
 596    if ( BitsAllocated == 12 )
 597    {
 598       ReadAndDecompress12BitsTo16Bits( (uint8_t*)destination, fp);
 599    }
 600    else if ( IsUncompressed )
 601    {
 602       size_t ItemRead = fread( destination, PixelDataLength, 1, fp);
 603       if ( ItemRead != 1 )
 604       {
 605          dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::ReadAndDecompressPixelData: "
 606                          "reading of uncompressed pixel data failed." );
 607          return false;
 608       }
 609    }
 610    else if ( IsRLELossless )
 611    {
 612       if ( ! ReadAndDecompressRLEFile( destination, fp ) )
 613       {
 614          dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::ReadAndDecompressPixelData: "
 615                          "RLE decompressor failed." );
 616          return false;
 617       }
 618    }
 619    else
 620    {
 621       // Default case concerns JPEG family
 622       if ( ! ReadAndDecompressJPEGFile( (uint8_t*)destination, fp ) )
 623       {
 624          dbg.Verbose( 0, "PixelConvert::ReadAndDecompressPixelData: "
 625                          "JPEG decompressor failed." );
 626          return false;
 627       }
 628    }
 629
 630    ////////////////////////////////////////////
 631    //// Third stage: twigle the bytes and bits.
 632    ReorderEndianity( (uint8_t*) destination );
 633    ReArrangeBits( (uint8_t*) destination );
 634
 635    return true;
 636 }
 637
 638 bool PixelConvert::HandleColor( uint8_t* destination )
 639 {
 640    //////////////////////////////////
 641    // Deal with the color decoding i.e. handle:
 642    //   - R, G, B planes (as opposed to RGB pixels)
 643    //   - YBR (various) encodings.
 644    //   - LUT[s] (or "PALETTE COLOR").
 645    //
 646    // The classification in the color decoding schema is based on the blending
 647    // of two Dicom tags values:
 648    // * "Photometric Interpretation" for which we have the cases:
 649    //  - [Photo A] MONOCHROME[1|2] pictures,
 650    //  - [Photo B] RGB or YBR_FULL_422 (which acts as RGB),
 651    //  - [Photo C] YBR_* (with the above exception of YBR_FULL_422)
 652    //  - [Photo D] "PALETTE COLOR" which indicates the presence of LUT[s].
 653    // * "Planar Configuration" for which we have the cases:
 654    //  - [Planar 0] 0 then Pixels are already RGB
 655    //  - [Planar 1] 1 then we have 3 planes : R, G, B,
 656    //  - [Planar 2] 2 then we have 1 gray Plane and 3 LUTs
 657    //
 658    // Now in theory, one could expect some coherence when blending the above
 659    // cases. For example we should not encounter files belonging at the
 660    // time to case [Planar 0] and case [Photo D].
 661    // Alas, this was only theory ! Because in practice some odd (read ill
 662    // formated Dicom) files (e.g. gdcmData/US-PAL-8-10x-echo.dcm) we encounter:
 663    //     - "Planar Configuration" = 0,
 664    //     - "Photometric Interpretation" = "PALETTE COLOR".
 665    // Hence gdcm shall use the folowing "heuristic" in order to be tolerant
 666    // towards Dicom-non-conformance files:
 667    //   << whatever the "Planar Configuration" value might be, a
 668    //      "Photometric Interpretation" set to "PALETTE COLOR" forces
 669    //      a LUT intervention >>
 670    //
 671    // Now we are left with the following handling of the cases:
 672    // - [Planar 0] OR  [Photo A] no color decoding (since respectively
 673    //       Pixels are already RGB and monochrome pictures have no color :),
 674    // - [Planar 1] AND [Photo B] handled with ConvertRGBPlanesToRGBPixels()
 675    // - [Planar 1] AND [Photo C] handled with ConvertYcBcRPlanesToRGBPixels()
 676    // - [Planar 2] OR  [Photo D] requires LUT intervention.
 677
 678    if (   IsMonochrome
 679        || ( PlanarConfiguration == 2 )
 680        || IsPaletteColor )
 681    {
 682       // [Planar 2] OR  [Photo D]: LUT intervention done outside
 683       return false;
 684    }
 685
 686    if ( PlanarConfiguration == 1 )
 687    {
 688       if ( IsYBRFull )
 689       {
 690          // [Planar 1] AND [Photo C] (remember YBR_FULL_422 acts as RGB)
 691          ConvertYcBcRPlanesToRGBPixels( (uint8_t*)destination );
 692       }
 693       else
 694       {
 695          // [Planar 1] AND [Photo C]
 696          ConvertRGBPlanesToRGBPixels( (uint8_t*)destination );
 697       }
 698    }
 699
 700    // When planarConf is 0, pixels are allready in RGB
 701    return true;
 702 }
 703
 704 void PixelConvert::ComputeDecompressedImageDataSize()
 705 {
 706    int bitsAllocated;
 707    // Number of "Bits Allocated" is fixed to 16 when it's 12, since
 708    // in this case we will expand the image to 16 bits (see
 709    //    \ref ReadAndDecompress12BitsTo16Bits() )
 710    if (  BitsAllocated == 12 )
 711    {
 712       bitsAllocated = 16;
 713    }
 714
 715    DecompressedSize = XSize * YSize * ZSize
 716                     * ( bitsAllocated / 8 )
 717                     * SamplesPerPixel;
 718 }
 719
 720 } // end namespace gdcm
 721
 722 // NOTES on File internal calls
 723 // User
 724 // ---> GetImageData
 725 //     ---> GetImageDataIntoVector
 726 //        |---> GetImageDataIntoVectorRaw
 727 //        | lut intervention
 728 // User
 729 // ---> GetImageDataRaw
 730 //     ---> GetImageDataIntoVectorRaw