src/gdcmPixelConvert.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmPixelConvert.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/10/08 08:56:48 $
   7   Version:   $Revision: 1.2 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 //////////////////   TEMPORARY NOT
  20 // look for "fixMem" and convert that to a member of this class
  21 // Removing the prefix fixMem and dealing with allocations should do the trick
  22 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  23
  24 #include "gdcmDebug.h"
  25 #include "gdcmPixelConvert.h"
  26
  27
  28 //-----------------------------------------------------------------------------
  29 // Constructor / Destructor
  30 gdcmPixelConvert::gdcmPixelConvert()
  31 {
  32    RGB = 0;
  33    RGBSize = 0;
  34    Uncompressed = 0;
  35    UncompressedSize = 0;
  36 }
  37
  38 void gdcmPixelConvert::Squeeze()
  39 {
  40    if ( RGB ) {
  41       delete [] RGB;
  42    }
  43    if ( Uncompressed ) {
  44       delete [] Uncompressed;
  45    }
  46 }
  47
  48 gdcmPixelConvert::~gdcmPixelConvert()
  49 {
  50    Squeeze();
  51 }
  52
  53 void gdcmPixelConvert::AllocateRGB()
  54 {
  55   if ( RGB ) {
  56      delete [] RGB;
  57   }
  58   RGB = new uint8_t[RGBSize];
  59 }
  60
  61 void gdcmPixelConvert::AllocateUncompressed()
  62 {
  63   if ( Uncompressed ) {
  64      delete [] Uncompressed;
  65   }
  66   Uncompressed = new uint8_t[ UncompressedSize ];
  67 }
  68
  69 /**
  70  * \brief Read from file a 12 bits per pixel image and uncompress it
  71  *        into a 16 bits per pixel image.
  72  */
  73 bool gdcmPixelConvert::ReadAndUncompress12Bits( FILE* filePointer,
  74                                                 size_t uncompressedSize,
  75                                                 size_t PixelNumber )
  76 {
  77    SetUncompressedSize( uncompressedSize );
  78    AllocateUncompressed();
  79
  80    uint16_t* pdestination = (uint16_t*)Uncompressed;
  81
  82    for(int p = 0; p < PixelNumber; p += 2 )
  83    {
  84       // 2 pixels 12bit =     [0xABCDEF]
  85       // 2 pixels 16bit = [0x0ABD] + [0x0FCE]
  86       uint8_t b0, b1, b2;
  87       size_t ItemRead;
  88       ItemRead = fread( &b0, 1, 1, filePointer);
  89       if ( ItemRead != 1 )
  90       {
  91          return false;
  92       }
  93       ItemRead = fread( &b1, 1, 1, filePointer);
  94       if ( ItemRead != 1 )
  95       {
  96          return false;
  97       }
  98       ItemRead = fread( &b2, 1, 1, filePointer);
  99       if ( ItemRead != 1 )
 100       {
 101          return false;
 102       }
 103
 104       //Two steps are necessary to please VC++
 105       *pdestination++ =  ((b0 >> 4) << 8) + ((b0 & 0x0f) << 4) + (b1 & 0x0f);
 106       //                     A                     B                 D
 107       *pdestination++ =  ((b2 & 0x0f) << 8) + ((b1 >> 4) << 4) + (b2 >> 4);
 108       //                     F                     C                 E
 109
 110       /// \todo JPR Troubles expected on Big-Endian processors ?
 111    }
 112    return true;
 113 }
 114
 115 /**
 116  * \brief Read from file an uncompressed image.
 117  */
 118 bool gdcmPixelConvert::ReadUncompressed( FILE* filePointer,
 119                                          size_t uncompressedSize,
 120                                          size_t expectedSize )
 121 {
 122    if ( expectedSize > uncompressedSize )
 123    {
 124       dbg.Verbose(0, "gdcmPixelConvert::ReadUncompressed: expectedSize"
 125                      "is bigger than it should");
 126       return false;
 127    }
 128    SetUncompressedSize( uncompressedSize );
 129    AllocateUncompressed();
 130    size_t ItemRead = fread( (void*)Uncompressed, expectedSize, 1, filePointer);
 131    if ( ItemRead != 1 )
 132    {
 133       return false;
 134    }
 135    return true;
 136 }
 137
 138 /**
 139  * \brief  Convert a Gray plane and ( Lut R, Lut G, Lut B ) into an
 140  *         RGB plane.
 141  * @return True on success.
 142  */
 143 bool gdcmPixelConvert::ConvertGrayAndLutToRGB( uint8_t *lutRGBA )
 144
 145 {
 146    /// We assume Uncompressed contains the decompressed gray plane
 147    /// and build the RGB image.
 148    SetRGBSize( UncompressedSize );
 149    AllocateRGB();
 150
 151 //aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
 152 //AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 153 //COPY HERE THE CODE OF GetImageDataIntoVector
 154
 155    /// \todo check that operator new []didn't fail, and sometimes return false
 156    return true;
 157 }
 158
 159 /**
 160  * \brief     Try to deal with RLE 16 Bits.
 161  *            We assume the RLE has allready been parsed and loaded in
 162  *            Uncompressed (through \ref ReadAndUncompressRLE8Bits ).
 163  *            We here need to make 16 Bits Pixels from Low Byte and
 164  *            High Byte 'Planes'...(for what it may mean)
 165  * @return    Boolean
 166  */
 167 uint8_t* gdcmPixelConvert::UncompressRLE16BitsFromRLE8Bits(
 168                        int XSize,
 169                        int YSize,
 170                        int NumberOfFrames,
 171                        uint8_t* fixMemUncompressed )
 172 {
 173    size_t PixelNumber = XSize * YSize;
 174    size_t fixMemUncompressedSize = XSize * YSize * NumberOfFrames;
 175
 176    // We assumed Uncompressed contains the decoded RLE pixels but as
 177    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
 178    // per pixel we cannot work in place within Uncompressed.
 179    // Here is how we handle things:
 180    // - First  stage: copy Uncompressed in a safe place, say OldUncompressed
 181    // - Second stage: reallocate Uncompressed with the needed space
 182    // - Third  stage: expand from OldUncompressed to Uncompressed
 183    // - Fourth stage: clean up OldUncompressed
 184
 185    /// First stage:
 186    uint8_t* OldUncompressed = new uint8_t[ fixMemUncompressedSize * 2 ];
 187    memmove( OldUncompressed, fixMemUncompressed, fixMemUncompressedSize * 2);
 188
 189    /// Second stage:
 190    //fixMem SetUncompressedSize( 2 * UncompressedSize );
 191    //fixMem AllocateUncompressed();
 192    uint8_t* fixMemNewUncompressed = new uint8_t[fixMemUncompressedSize * 2];
 193
 194    /// Third stage:
 195    uint8_t* x = fixMemNewUncompressed;
 196    uint8_t* a = OldUncompressed;
 197    uint8_t* b = a + PixelNumber;
 198
 199    for ( int i = 0; i < NumberOfFrames; i++ )
 200    {
 201       for ( int j = 0; j < PixelNumber; j++ )
 202       {
 203          *(x++) = *(a++);
 204          *(x++) = *(b++);
 205       }
 206    }
 207
 208    // Fourth stage:
 209    delete[] OldUncompressed;
 210
 211    /// \todo check that operator new []didn't fail, and sometimes return false
 212    return fixMemNewUncompressed;
 213 }