src/gdcmRLE.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmRLE.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/10/06 22:31:31 $
   7   Version:   $Revision: 1.24 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include <stdio.h>
  20 #include "gdcmFile.h"
  21 #include <ctype.h>     // For isprint()
  22
  23 #define str2num(str, typeNum) *((typeNum *)(str))
  24
  25 //-----------------------------------------------------------------------------
  26 /**
  27  * \ingroup   gdcmFile
  28  * \brief     Reads a 'Run Length Encoded' Dicom encapsulated file
  29  * @param     fp already open File Pointer
  30  * @param     image_buffer destination Address (in caller's memory space)
  31  *            at which the pixel data should be copied
  32  * @return    Boolean
  33  */
  34 bool gdcmFile::gdcm_read_RLE_file (FILE* fp,void* image_buffer) {
  35    char * im = (char *)image_buffer;
  36    long uncompressedSegmentSize = Header->GetXSize() * Header->GetYSize();
  37
  38
  39    // Loop on the frame[s]
  40    for( gdcmRLEFramesInfo::RLEFrameList::iterator
  41         it  = Header->RLEInfo.Frames.begin();
  42         it != Header->RLEInfo.Frames.end();
  43       ++it )
  44    {
  45        std::cout << "...new frame...\n ";
  46       // Loop on the fragments
  47       for( unsigned int k = 1; k <= (*it)->NumberFragments; k++ )
  48       {
  49          fseek( fp, (*it)->Offset[k] ,SEEK_SET);
  50          gdcm_read_RLE_fragment( &im, (*it)->Length[k],
  51                                  uncompressedSegmentSize, fp );
  52       }
  53    }
  54
  55    if (Header->GetBitsAllocated()==16) { // try to deal with RLE 16 Bits
  56
  57       im = (char *)image_buffer;
  58          //  need to make 16 Bits Pixels from Low Byte and Hight Byte 'Planes'
  59
  60       int l = Header->GetXSize()*Header->GetYSize();
  61       int nbFrames = Header->GetZSize();
  62
  63       char * newDest = new char[l*nbFrames*2];
  64       char *x  = newDest;
  65       char * a = (char *)image_buffer;
  66       char * b = a + l;
  67
  68       for (int i=0;i<nbFrames;i++) {
  69          for (int j=0;j<l; j++) {
  70             *(x++) = *(a++);
  71             *(x++) = *(b++);
  72          }
  73       }
  74       memmove(image_buffer,newDest,ImageDataSize);
  75       delete[] newDest;
  76    }
  77
  78    return true;
  79 }
  80
  81
  82 // ----------------------------------------------------------------------------
  83 // RLE LossLess Fragment
  84 int gdcmFile::gdcm_read_RLE_fragment(char** areaToRead, long lengthToDecode,
  85                                      long uncompressedSegmentSize, FILE* fp) {
  86    (void)lengthToDecode; //FIXME
  87    int count;
  88    long numberOfOutputBytes=0;
  89    char n, car;
  90
  91    while( numberOfOutputBytes < uncompressedSegmentSize )
  92    {
  93       fread(&n,sizeof(char),1,fp);
  94       count=n;
  95       if (count >= 0 && count <= 127) {
  96          fread(*areaToRead,(count+1)*sizeof(char),1,fp);
  97          *areaToRead+=count+1;
  98          numberOfOutputBytes+=count+1;
  99       } else {
 100          if (count <= -1 && count >= -127) {
 101             fread(&car,sizeof(char),1,fp);
 102             for(int i=0; i<-count+1; i++) {
 103                (*areaToRead)[i]=car;
 104             }
 105             *areaToRead+=(-count+1);
 106             numberOfOutputBytes+=(-count+1);
 107          }
 108       }
 109       // if count = 128 output nothing (See : PS 3.5-2003 Page 86)
 110    }
 111    return 1;
 112 }
 113
 114 // ----------------------------------------------------------------------------