src/gdcmRLEFrame.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmRLEFrame.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/31 06:17:22 $
   7   Version:   $Revision: 1.4 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmRLEFrame.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 namespace gdcm
  23 {
  24
  25 /**
  26  * \brief        Print self.
  27  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
  28  * @param os     Stream to print to.
  29  */
  30 void RLEFrame::Print( std::ostream &os, std::string indent )
  31 {
  32    os << indent
  33       << "--- fragments"
  34       << std::endl;
  35    for ( unsigned int i = 0; i < NumberOfFragments; i++ )
  36    {
  37       os << indent
  38          << "   offset : " <<  Offset[i]
  39          << "   length : " <<  Length[i]
  40          << std::endl;
  41    }
  42 }
  43
  44 void RLEFrame::SetOffset(unsigned int id,long offset)
  45 {
  46    gdcmAssertMacro(id<15);
  47    Offset[id] = offset;
  48 }
  49
  50 long RLEFrame::GetOffset(unsigned int id)
  51 {
  52    gdcmAssertMacro(id<15);
  53    return Offset[id];
  54 }
  55
  56 void RLEFrame::SetLength(unsigned int id,long length)
  57 {
  58    gdcmAssertMacro(id<15);
  59    Length[id] = length;
  60 }
  61
  62 long RLEFrame::GetLength(unsigned int id)
  63 {
  64    gdcmAssertMacro(id<15);
  65    return Length[id];
  66 }
  67
  68 uint8_t *RLEFrame::ReadAndDecompressRLEFrame( uint8_t *subRaw,
  69                                           long rawSegmentSize,
  70                                           std::ifstream *fp )
  71 {
  72    // Loop on the fragments
  73    for( unsigned int k = 1; k <= NumberOfFragments; k++ )
  74    {
  75       // First thing need to reset file to proper position:
  76       fp->seekg(Offset[k], std::ios::beg);
  77       ReadAndDecompressRLEFragment(subRaw, Length[k],
  78                                    rawSegmentSize, fp);
  79       subRaw += rawSegmentSize;
  80    }
  81
  82    return subRaw;
  83 }
  84
  85 /**
  86  * \brief Implementation of the RLE decoding algorithm for decompressing
  87  *        a RLE fragment. [refer to PS 3.5-2003, section G.3.2 p 86]
  88  * @param subRaw Sub region of \ref Raw where the decoded fragment
  89  *        should be placed.
  90  * @param fragmentSize The length of the binary fragment as found on the disk.
  91  * @param RawSegmentSize The expected length of the fragment ONCE
  92  *        Raw.
  93  * @param fp File Pointer: on entry the position should be the one of
  94  *        the fragment to be decoded.
  95  */
  96 bool RLEFrame::ReadAndDecompressRLEFragment( uint8_t *subRaw,
  97                                              long fragmentSize,
  98                                              long rawSegmentSize,
  99                                              std::ifstream *fp )
 100 {
 101    int8_t count;
 102    long numberOfOutputBytes = 0;
 103    long numberOfReadBytes = 0;
 104
 105
 106    while( numberOfOutputBytes < rawSegmentSize )
 107    {
 108       fp->read( (char*)&count, 1 );
 109       numberOfReadBytes += 1;
 110       if ( count >= 0 )
 111       // Note: count <= 127 comparison is always true due to limited range
 112       //       of data type int8_t [since the maximum of an exact width
 113       //       signed integer of width N is 2^(N-1) - 1, which for int8_t
 114       //       is 127].
 115       {
 116          fp->read( (char*)subRaw, count + 1);
 117          numberOfReadBytes   += count + 1;
 118          subRaw     += count + 1;
 119          numberOfOutputBytes += count + 1;
 120       }
 121       else
 122       {
 123          if ( count <= -1 && count >= -127 )
 124          {
 125             int8_t newByte;
 126             fp->read( (char*)&newByte, 1);
 127             numberOfReadBytes += 1;
 128             for( int i = 0; i < -count + 1; i++ )
 129             {
 130                subRaw[i] = newByte;
 131             }
 132             subRaw     += -count + 1;
 133             numberOfOutputBytes += -count + 1;
 134          }
 135       }
 136       // if count = 128 output nothing
 137
 138       if ( numberOfReadBytes > fragmentSize )
 139       {
 140          gdcmVerboseMacro( "Read more bytes than the segment size.");
 141          return false;
 142       }
 143    }
 144    return true;
 145 }
 146
 147
 148 } // end namespace gdcm
 149