src/gdcmRLEFramesInfo.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmRLEFramesInfo.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/01 13:00:16 $
   7   Version:   $Revision: 1.12 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmRLEFramesInfo.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 namespace gdcm
  23 {
  24 //-------------------------------------------------------------------------
  25 // Constructor / Destructor
  26 RLEFramesInfo::~RLEFramesInfo()
  27 {
  28    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  29    {
  30       delete (*it);
  31    }
  32    Frames.clear();
  33 }
  34
  35 //-----------------------------------------------------------------------------
  36 // Public
  37 void RLEFramesInfo::AddFrame(RLEFrame *frame)
  38 {
  39    Frames.push_back(frame);
  40 }
  41
  42 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetFirstFrame()
  43 {
  44    ItFrames = Frames.begin();
  45    if (ItFrames != Frames.end())
  46       return  *ItFrames;
  47    return NULL;
  48 }
  49
  50 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetNextFrame()
  51 {
  52    gdcmAssertMacro (ItFrames != Frames.end());
  53
  54    ++ItFrames;
  55    if (ItFrames != Frames.end())
  56       return  *ItFrames;
  57    return NULL;
  58 }
  59
  60 /**
  61  * \brief     Reads from disk the Pixel Data of 'Run Length Encoded'
  62  *            Dicom encapsulated file and decompress it.
  63  * @param     fp already open File Pointer
  64  *            at which the pixel data should be copied
  65  * @return    Boolean
  66  */
  67 bool RLEFramesInfo::DecompressRLEFile( std::ifstream *fp , uint8_t *raw, int xSize, int ySize, int zSize, int bitsAllocated )
  68 {
  69    uint8_t *subRaw = raw;
  70    long rawSegmentSize = xSize * ySize;
  71
  72    // Loop on the frame[s]
  73    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  74    {
  75       subRaw = (*it)->ReadAndDecompressRLEFrame( subRaw, rawSegmentSize, fp);
  76    }
  77
  78    if ( bitsAllocated == 16 )
  79    {
  80       // Try to deal with RLE 16 Bits
  81       ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits( raw, xSize, ySize, zSize );
  82    }
  83
  84    return true;
  85 }
  86
  87 /**
  88  * \brief  We assume Raw contains the decoded RLE pixels but as
  89  *         8 bits per pixel. We convert those pixels to 16 bits
  90  *         per pixel.
  91  * @param raw raw
  92  * @param xSize x Size
  93  * @param ySize y Size
  94  * @param numberOfFrames number of frames
  95  * @return    Boolean always true
  96  */
  97 bool RLEFramesInfo::ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits( uint8_t* raw, int xSize,
  98                                              int ySize,int numberOfFrames  )
  99 {
 100    size_t pixelNumber = xSize * ySize;
 101    size_t rawSize = xSize * ySize * numberOfFrames;
 102
 103    // We assumed Raw contains the decoded RLE pixels but as
 104    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
 105    // per pixel we cannot work in place within Raw and hence
 106    // we copy it in a safe place, say copyRaw.
 107
 108    uint8_t* copyRaw = new uint8_t[rawSize * 2];
 109    memmove( copyRaw, raw, rawSize * 2 );
 110
 111    uint8_t* x = raw;
 112    uint8_t* a = copyRaw;
 113    uint8_t* b = a + pixelNumber;
 114
 115    for ( int i = 0; i < numberOfFrames; i++ )
 116    {
 117       for ( unsigned int j = 0; j < pixelNumber; j++ )
 118       {
 119          *(x++) = *(b++);
 120          *(x++) = *(a++);
 121       }
 122    }
 123    delete[] copyRaw;
 124
 125    /// \todo check that operator new []didn't fail, and sometimes return false
 126
 127    return true;
 128 }
 129
 130 //-----------------------------------------------------------------------------
 131 // Protected
 132
 133 //-----------------------------------------------------------------------------
 134 // Private
 135
 136 //-----------------------------------------------------------------------------
 137 // Print
 138 /**
 139  * \brief        Print self.
 140  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
 141  * @param os     Stream to print to.
 142  */
 143 void RLEFramesInfo::Print( std::ostream &os, std::string indent )
 144 {
 145    os << std::endl;
 146    os << indent
 147       << "----------------- RLE frames --------------------------------"
 148       << std::endl;
 149    os << indent
 150       << "Total number of Frames : " << Frames.size()
 151       << std::endl;
 152    int frameNumber = 0;
 153    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
 154    {
 155       os << indent
 156          << "   frame number :" << frameNumber++
 157          << std::endl;
 158       (*it)->Print( os, indent + "   " );
 159    }
 160 }
 161
 162 //-----------------------------------------------------------------------------
 163 } // end namespace gdcm