src/gdcmRLEFramesInfo.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmRLEFramesInfo.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/02 10:02:18 $
   7   Version:   $Revision: 1.13 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmRLEFramesInfo.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 namespace gdcm
  23 {
  24 //-------------------------------------------------------------------------
  25 // Constructor / Destructor
  26 RLEFramesInfo::~RLEFramesInfo()
  27 {
  28    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  29    {
  30       delete (*it);
  31    }
  32    Frames.clear();
  33 }
  34
  35 //-----------------------------------------------------------------------------
  36 // Public
  37 void RLEFramesInfo::AddFrame(RLEFrame *frame)
  38 {
  39    Frames.push_back(frame);
  40 }
  41
  42 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetFirstFrame()
  43 {
  44    ItFrames = Frames.begin();
  45    if (ItFrames != Frames.end())
  46       return  *ItFrames;
  47    return NULL;
  48 }
  49
  50 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetNextFrame()
  51 {
  52    gdcmAssertMacro (ItFrames != Frames.end());
  53
  54    ++ItFrames;
  55    if (ItFrames != Frames.end())
  56       return  *ItFrames;
  57    return NULL;
  58 }
  59
  60 /**
  61  * \brief     Reads from disk the Pixel Data of 'Run Length Encoded'
  62  *            Dicom encapsulated file and decompress it.
  63  * @param     fp already open File Pointer
  64  *            at which the pixel data should be copied
  65  * @param raw raw
  66  * @param xSize x Size
  67  * @param ySize y Size
  68  * @param BitsAllocated Bits allocated
  69  * @return    Boolean
  70  */
  71 bool RLEFramesInfo::DecompressRLEFile( std::ifstream *fp , uint8_t *raw,
  72                                        int xSize, int ySize, int zSize,
  73                                        int bitsAllocated )
  74 {
  75    uint8_t *subRaw = raw;
  76    long rawSegmentSize = xSize * ySize;
  77
  78    // Loop on the frame[s]
  79    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  80    {
  81       subRaw = (*it)->ReadAndDecompressRLEFrame( subRaw, rawSegmentSize, fp);
  82    }
  83
  84    if ( bitsAllocated == 16 )
  85    {
  86       // Try to deal with RLE 16 Bits
  87       ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits( raw, xSize, ySize, zSize );
  88    }
  89
  90    return true;
  91 }
  92
  93 /**
  94  * \brief  We assume Raw contains the decoded RLE pixels but as
  95  *         8 bits per pixel. We convert those pixels to 16 bits
  96  *         per pixel.
  97  * @param raw raw
  98  * @param xSize x Size
  99  * @param ySize y Size
 100  * @param numberOfFrames number of frames
 101  * @return    Boolean always true
 102  */
 103 bool RLEFramesInfo::ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits(uint8_t *raw, int xSize,
 104                                                  int ySize, int numberOfFrames)
 105 {
 106    size_t pixelNumber = xSize * ySize;
 107    size_t rawSize = xSize * ySize * numberOfFrames;
 108
 109    // We assumed Raw contains the decoded RLE pixels but as
 110    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
 111    // per pixel we cannot work in place within Raw and hence
 112    // we copy it in a safe place, say copyRaw.
 113
 114    uint8_t *copyRaw = new uint8_t[rawSize * 2];
 115    memmove( copyRaw, raw, rawSize * 2 );
 116
 117    uint8_t *x = raw;
 118    uint8_t *a = copyRaw;
 119    uint8_t *b = a + pixelNumber;
 120
 121    for ( int i = 0; i < numberOfFrames; i++ )
 122    {
 123       for ( unsigned int j = 0; j < pixelNumber; j++ )
 124       {
 125          *(x++) = *(b++);
 126          *(x++) = *(a++);
 127       }
 128    }
 129    delete[] copyRaw;
 130
 131    /// \todo check that operator new [] didn't fail, and sometimes return false
 132
 133    return true;
 134 }
 135
 136 //-----------------------------------------------------------------------------
 137 // Protected
 138
 139 //-----------------------------------------------------------------------------
 140 // Private
 141
 142 //-----------------------------------------------------------------------------
 143 // Print
 144 /**
 145  * \brief        Print self.
 146  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
 147  * @param os     Stream to print to.
 148  */
 149 void RLEFramesInfo::Print( std::ostream &os, std::string indent )
 150 {
 151    os << std::endl;
 152    os << indent
 153       << "----------------- RLE frames --------------------------------"
 154       << std::endl;
 155    os << indent
 156       << "Total number of Frames : " << Frames.size()
 157       << std::endl;
 158    int frameNumber = 0;
 159    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
 160    {
 161       os << indent
 162          << "   frame number :" << frameNumber++
 163          << std::endl;
 164       (*it)->Print( os, indent + "   " );
 165    }
 166 }
 167
 168 //-----------------------------------------------------------------------------
 169 } // end namespace gdcm