src/gdcmRLEFramesInfo.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmRLEFramesInfo.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/31 06:17:22 $
   7   Version:   $Revision: 1.10 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmRLEFramesInfo.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21
  22 namespace gdcm
  23 {
  24
  25 RLEFramesInfo::~RLEFramesInfo()
  26 {
  27    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  28    {
  29       delete (*it);
  30    }
  31    Frames.clear();
  32 }
  33
  34 /**
  35  * \brief        Print self.
  36  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
  37  * @param os     Stream to print to.
  38  */
  39 void RLEFramesInfo::Print( std::ostream &os, std::string indent )
  40 {
  41    os << std::endl;
  42    os << indent
  43       << "----------------- RLE frames --------------------------------"
  44       << std::endl;
  45    os << indent
  46       << "Total number of Frames : " << Frames.size()
  47       << std::endl;
  48    int frameNumber = 0;
  49    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  50    {
  51       os << indent
  52          << "   frame number :" << frameNumber++
  53          << std::endl;
  54       (*it)->Print( os, indent + "   " );
  55    }
  56 }
  57
  58 void RLEFramesInfo::AddFrame(RLEFrame *frame)
  59 {
  60    Frames.push_back(frame);
  61 }
  62
  63 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetFirstFrame()
  64 {
  65    ItFrames = Frames.begin();
  66    if (ItFrames != Frames.end())
  67       return  *ItFrames;
  68    return NULL;
  69 }
  70
  71 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetNextFrame()
  72 {
  73    gdcmAssertMacro (ItFrames != Frames.end());
  74
  75    ++ItFrames;
  76    if (ItFrames != Frames.end())
  77       return  *ItFrames;
  78    return NULL;
  79 }
  80
  81 /**
  82  * \brief     Reads from disk the Pixel Data of 'Run Length Encoded'
  83  *            Dicom encapsulated file and decompress it.
  84  * @param     fp already open File Pointer
  85  *            at which the pixel data should be copied
  86  * @return    Boolean
  87  */
  88 bool RLEFramesInfo::DecompressRLEFile( std::ifstream *fp , uint8_t *raw, int xSize, int ySize, int zSize, int bitsAllocated )
  89 {
  90    uint8_t *subRaw = raw;
  91    long rawSegmentSize = xSize * ySize;
  92
  93    // Loop on the frame[s]
  94    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  95    {
  96       subRaw = (*it)->ReadAndDecompressRLEFrame( subRaw, rawSegmentSize, fp);
  97    }
  98
  99    if ( bitsAllocated == 16 )
 100    {
 101       // Try to deal with RLE 16 Bits
 102       ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits( raw, xSize, ySize, zSize );
 103    }
 104
 105    return true;
 106 }
 107
 108 /**
 109  * \brief     Try to deal with RLE 16 Bits.
 110  *            We assume the RLE has already been parsed and loaded in
 111  *            Raw (through \ref ReadAndDecompressJPEGFile ).
 112  *            We here need to make 16 Bits Pixels from Low Byte and
 113  *            High Byte 'Planes'...(for what it may mean)
 114  * @return    Boolean
 115  */
 116 bool RLEFramesInfo::ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits( uint8_t* raw, int xSize,
 117                                              int ySize,int numberOfFrames  )
 118 {
 119    size_t pixelNumber = xSize * ySize;
 120    size_t rawSize = xSize * ySize * numberOfFrames;
 121
 122    // We assumed Raw contains the decoded RLE pixels but as
 123    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
 124    // per pixel we cannot work in place within Raw and hence
 125    // we copy it in a safe place, say copyRaw.
 126
 127    uint8_t* copyRaw = new uint8_t[rawSize * 2];
 128    memmove( copyRaw, raw, rawSize * 2 );
 129
 130    uint8_t* x = raw;
 131    uint8_t* a = copyRaw;
 132    uint8_t* b = a + pixelNumber;
 133
 134    for ( int i = 0; i < numberOfFrames; i++ )
 135    {
 136       for ( unsigned int j = 0; j < pixelNumber; j++ )
 137       {
 138          *(x++) = *(b++);
 139          *(x++) = *(a++);
 140       }
 141    }
 142
 143    delete[] copyRaw;
 144
 145    /// \todo check that operator new []didn't fail, and sometimes return false
 146    return true;
 147 }
 148
 149
 150 } // end namespace gdcm