src/gdcmSQItem.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmSQItem.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/03 12:47:23 $
   7   Version:   $Revision: 1.72 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmSQItem.h"
  20 #include "gdcmSeqEntry.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23 #include "gdcmGlobal.h"
  24 #include "gdcmDictSet.h"
  25 #include "gdcmUtil.h"
  26 #include "gdcmDebug.h"
  27
  28 #include <fstream>
  29
  30 namespace gdcm
  31 {
  32 //-----------------------------------------------------------------------------
  33 // Constructor / Destructor
  34 /**
  35  * \brief   Constructor from a given SQItem
  36  */
  37 SQItem::SQItem(int depthLevel )
  38           : DocEntrySet( )
  39 {
  40    SQDepthLevel = depthLevel;
  41    SQItemNumber = 0;
  42 }
  43
  44 /**
  45  * \brief   Canonical destructor.
  46  */
  47 SQItem::~SQItem()
  48 {
  49    ClearEntry();
  50 }
  51
  52 //-----------------------------------------------------------------------------
  53 // Public
  54 /*
  55  * \brief   canonical Writer
  56  * @param fp     file pointer to an already open file.
  57  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  58  */
  59 void SQItem::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
  60 {
  61    int j;
  62    uint16_t item[4] = { 0xfffe, 0xe000, 0xffff, 0xffff };
  63    uint16_t itemt[4]= { 0xfffe, 0xe00d, 0xffff, 0xffff };
  64
  65     //we force the writting of an 'Item' Start Element
  66     // because we want to write the Item as a 'no Length' item
  67    for(j=0;j<4;++j)
  68    {
  69       binary_write( *fp, item[j]);  // fffe e000 ffff ffff
  70    }
  71
  72    for (ListDocEntry::iterator it = DocEntries.begin();
  73                                it != DocEntries.end();
  74                              ++it)
  75    {
  76       // we skip delimitors (start and end one) because
  77       // we force them as 'no length'
  78       if ( (*it)->GetGroup() == 0xfffe )
  79       {
  80          continue;
  81       }
  82
  83       // Fix in order to make some MR PHILIPS images e-film readable
  84       // see gdcmData/gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm:
  85       // we just *always* ignore spurious fffe|0000 tag !
  86       if ( (*it)->GetGroup() == 0xfffe && (*it)->GetElement() == 0x0000 )
  87       {
  88          break; // FIXME : continue; ?!?
  89       }
  90
  91       (*it)->WriteContent(fp, filetype);
  92    }
  93
  94     //we force the writting of an 'Item Delimitation' item
  95     // because we wrote the Item as a 'no Length' item
  96    for(j=0;j<4;++j)
  97    {
  98       binary_write( *fp, itemt[j]);  // fffe e000 ffff ffff
  99    }
 100 }
 101
 102 /**
 103  * \brief   Inserts *in the right place* any Entry (Dicom Element)
 104  *          into the Sequence Item
 105  * @param entry Entry to add
 106  */
 107 bool SQItem::AddEntry(DocEntry *entry)
 108 {
 109    if (DocEntries.empty() )
 110    {
 111       DocEntries.push_back(entry);
 112       return true;
 113    }
 114
 115    ListDocEntry::iterator insertSpot;
 116    ListDocEntry::iterator it = DocEntries.end();
 117    do
 118    {
 119       it--;
 120
 121       if ( (*it)->IsItemDelimitor() )
 122       {
 123          continue;
 124       }
 125       if ( (*it)->GetGroup() < entry->GetGroup() )
 126          break;
 127       else
 128          if ( (*it)->GetGroup() == entry->GetGroup() &&
 129               (*it)->GetElement() < entry->GetElement() )
 130             break;
 131    } while (it != DocEntries.begin() );
 132
 133    insertSpot = it++;
 134    insertSpot++; // ?!?
 135    DocEntries.insert(insertSpot, entry);
 136    return true;
 137 }
 138
 139 /**
 140  * \brief   Clear the std::list from given entry AND delete the entry.
 141  * @param   entryToRemove Entry to remove AND delete.
 142  * @return true if the entry was found and removed; false otherwise
 143  */
 144 bool SQItem::RemoveEntry( DocEntry *entryToRemove )
 145 {
 146    for(ListDocEntry::iterator it = DocEntries.begin();
 147                               it != DocEntries.end();
 148                             ++it)
 149    {
 150       if ( *it == entryToRemove )
 151       {
 152          DocEntries.erase(it);
 153          gdcmWarningMacro( "One element erased: " << entryToRemove->GetKey() );
 154          delete entryToRemove;
 155          return true;
 156       }
 157    }
 158    gdcmWarningMacro( "Entry not found: " << entryToRemove->GetKey() );
 159    return false ;
 160 }
 161
 162 /**
 163  * \brief   Clear the std::list from given entry BUT keep the entry.
 164  * @param   entryToRemove Entry to remove.
 165  * @return true if the entry was found and removed; false otherwise
 166  */
 167 bool SQItem::RemoveEntryNoDestroy(DocEntry *entryToRemove)
 168 {
 169    for(ListDocEntry::iterator it =  DocEntries.begin();
 170                               it != DocEntries.end();
 171                             ++it)
 172    {
 173       if ( *it == entryToRemove )
 174       {
 175          DocEntries.erase(it);
 176          gdcmWarningMacro( "One element removed, no destroyed: "
 177                             << entryToRemove->GetKey() );
 178          return true;
 179       }
 180    }
 181
 182    gdcmWarningMacro( "Entry not found:" << entryToRemove->GetKey() );
 183    return false ;
 184 }
 185
 186 /**
 187  * \brief  Remove all entry in the Sequence Item
 188  */
 189 void SQItem::ClearEntry()
 190 {
 191    for(ListDocEntry::iterator cc = DocEntries.begin();
 192                               cc != DocEntries.end();
 193                             ++cc)
 194    {
 195       delete *cc;
 196    }
 197    DocEntries.clear();
 198 }
 199
 200 /**
 201  * \brief   Get the first Dicom entry while visiting the SQItem
 202  * \return  The first DocEntry if found, otherwhise 0
 203  */
 204 DocEntry *SQItem::GetFirstEntry()
 205 {
 206    ItDocEntries = DocEntries.begin();
 207    if ( ItDocEntries != DocEntries.end() )
 208       return *ItDocEntries;
 209    return 0;
 210 }
 211
 212 /**
 213  * \brief   Get the next Dicom entry while visiting the SQItem
 214  * \return  The next DocEntry if found, otherwhise NULL
 215  */
 216 DocEntry *SQItem::GetNextEntry()
 217 {
 218    ++ItDocEntries;
 219    if ( ItDocEntries != DocEntries.end() )
 220       return  *ItDocEntries;
 221    return NULL;
 222 }
 223
 224 /**
 225  * \brief   Gets a Dicom Element inside a SQ Item Entry
 226  * @param   group   Group number of the Entry
 227  * @param   elem  Element number of the Entry
 228  * @return Entry whose (group,elem) was passed. 0 if not found
 229  */
 230 DocEntry *SQItem::GetDocEntry(uint16_t group, uint16_t elem)
 231 {
 232    for(ListDocEntry::iterator i =  DocEntries.begin();
 233                               i != DocEntries.end();
 234                             ++i)
 235    {
 236       if ( (*i)->GetGroup() == group && (*i)->GetElement() == elem )
 237          return *i;
 238    }
 239    return NULL;
 240 }
 241
 242 //-----------------------------------------------------------------------------
 243 // Protected
 244
 245 //-----------------------------------------------------------------------------
 246 // Private
 247
 248 //-----------------------------------------------------------------------------
 249 // Print
 250 /*
 251  * \brief   canonical Printer
 252  * @param os     Stream to print to.
 253  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
 254  */
 255 void SQItem::Print(std::ostream &os, std::string const &)
 256 {
 257    std::ostringstream s;
 258
 259    if (SQDepthLevel > 0)
 260    {
 261       for (int i = 0; i < SQDepthLevel; ++i)
 262       {
 263          s << "   | " ;
 264       }
 265    }
 266    os << s.str() << " --- SQItem number " << SQItemNumber  << std::endl;
 267    for (ListDocEntry::iterator i  = DocEntries.begin();
 268                                i != DocEntries.end();
 269                              ++i)
 270    {
 271       DocEntry *Entry = *i;
 272       bool PrintEndLine = true;
 273
 274       os << s.str();
 275       Entry->SetPrintLevel(PrintLevel);
 276       Entry->Print(os);
 277       if ( dynamic_cast<SeqEntry*>(Entry) )
 278       {
 279          PrintEndLine = false;
 280       }
 281       if (PrintEndLine)
 282       {
 283          os << std::endl;
 284       }
 285    }
 286 }
 287
 288 //-----------------------------------------------------------------------------
 289 } // end namespace gdcm