src/gdcmSQItem.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmSQItem.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/11 00:21:48 $
   7   Version:   $Revision: 1.50 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmSQItem.h"
  20 #include "gdcmSeqEntry.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23 #include "gdcmGlobal.h"
  24 #include "gdcmDictSet.h"
  25 #include "gdcmUtil.h"
  26 #include "gdcmDebug.h"
  27
  28 #include <fstream>
  29
  30 namespace gdcm
  31 {
  32 //-----------------------------------------------------------------------------
  33 // Constructor / Destructor
  34 /**
  35  * \ingroup SQItem
  36  * \brief   Constructor from a given SQItem
  37  */
  38 SQItem::SQItem(int depthLevel )
  39           : DocEntrySet( )
  40 {
  41    SQDepthLevel = depthLevel;
  42 }
  43
  44 /**
  45  * \brief   Canonical destructor.
  46  */
  47 SQItem::~SQItem()
  48 {
  49    for(ListDocEntry::iterator cc = DocEntries.begin();
  50                              cc != DocEntries.end();
  51                              ++cc)
  52    {
  53       delete *cc;
  54    }
  55    DocEntries.clear();
  56 }
  57
  58 //-----------------------------------------------------------------------------
  59 // Print
  60 /*
  61  * \brief   canonical Printer
  62  */
  63 void SQItem::Print(std::ostream &os)
  64 {
  65    std::ostringstream s;
  66
  67    if (SQDepthLevel > 0)
  68    {
  69       for (int i = 0; i < SQDepthLevel; ++i)
  70       {
  71          s << "   | " ;
  72       }
  73    }
  74    //std::cout << s.str() << " --- SQItem number " << SQItemNumber  << std::endl;
  75    for (ListDocEntry::iterator i  = DocEntries.begin();
  76                                i != DocEntries.end();
  77                              ++i)
  78    {
  79       DocEntry *Entry = *i;
  80       bool PrintEndLine = true;
  81
  82       os << s.str();
  83       Entry->SetPrintLevel(PrintLevel);
  84       Entry->Print(os);
  85       if ( SeqEntry *seqEntry = dynamic_cast<SeqEntry*>(Entry) )
  86       {
  87          (void)seqEntry;  //not used
  88          PrintEndLine = false;
  89       }
  90       if (PrintEndLine)
  91       {
  92          os << std::endl;
  93       }
  94    }
  95 }
  96
  97 /*
  98  * \ingroup SQItem
  99  * \brief   canonical Writer
 100  */
 101 void SQItem::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 102 {
 103    int j;
 104    uint16_t item[4] = { 0xfffe, 0xe000, 0xffff, 0xffff };
 105    uint16_t itemt[4]= { 0xfffe, 0xe00d, 0xffff, 0xffff };
 106
 107     //we force the writting of an 'Item' Start Element
 108     // because we want to write the Item as a 'no Length' item
 109    for(j=0;j<4;++j)
 110    {
 111       binary_write( *fp, item[j]);  // fffe e000 ffff ffff
 112    }
 113
 114    for (ListDocEntry::iterator it = DocEntries.begin();
 115                               it != DocEntries.end();
 116                              ++it)
 117    {
 118       // we skip delimitors (start and end one) because
 119       // we force them as 'no length'
 120       if ( (*it)->GetGroup() == 0xfffe )
 121       {
 122          continue;
 123       }
 124
 125       // Fix in order to make some MR PHILIPS images e-film readable
 126       // see gdcmData/gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm:
 127       // we just *always* ignore spurious fffe|0000 tag !
 128       if ( (*it)->GetGroup() == 0xfffe && (*it)->GetElement() == 0x0000 )
 129       {
 130          break; // FIXME : continue; ?!?
 131       }
 132
 133       (*it)->WriteContent(fp, filetype);
 134    }
 135
 136     //we force the writting of an 'Item Delimitation' item
 137     // because we wrote the Item as a 'no Length' item
 138    for(j=0;j<4;++j)
 139    {
 140       binary_write( *fp, itemt[j]);  // fffe e000 ffff ffff
 141    }
 142
 143 }
 144
 145 //-----------------------------------------------------------------------------
 146 // Public
 147 /**
 148  * \brief   adds any Entry (Dicom Element) to the Sequence Item
 149  */
 150 bool SQItem::AddEntry(DocEntry *entry)
 151 {
 152    DocEntries.push_back(entry);
 153    //TODO : check if it worked
 154    return true;
 155 }
 156
 157 /**
 158  * \brief   Sets Entry (Dicom Element) value of an element,
 159  *          specified by it's tag (Group, Number)
 160  *          and the length, too ...  inside a SQ Item
 161  *          If the Element is not found, it's just created !
 162  * \warning we suppose, right now, the element belongs to a Public Group
 163  *          (NOT a shadow one)
 164  * @param   val string value to set
 165  * @param   group Group number of the searched tag.
 166  * @param   elem Element number of the searched tag.
 167  * @return  true if element was found or created successfully
 168  */
 169
 170 bool SQItem::SetEntry(std::string const &val, uint16_t group,
 171                       uint16_t elem)
 172 {
 173    for(ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 174                               i != DocEntries.end();
 175                             ++i)
 176    {
 177       if ( (*i)->GetGroup() == 0xfffe && (*i)->GetElement() == 0xe000 )
 178       {
 179          continue;
 180       }
 181
 182       if (  ( group  < (*i)->GetGroup() )
 183           ||( group == (*i)->GetGroup() && elem < (*i)->GetElement()) )
 184       {
 185          // instead of ReplaceOrCreate
 186          // that is a method of Document :-(
 187          ValEntry* entry = 0;
 188          TagKey key = DictEntry::TranslateToKey(group, elem);
 189
 190          // we assume a Public Dictionnary *is* loaded
 191          Dict *pubDict = Global::GetDicts()->GetDefaultPubDict();
 192          // if the invoked (group,elem) doesn't exist inside the Dictionary
 193          // we create a VirtualDictEntry
 194          DictEntry *dictEntry = pubDict->GetDictEntry(group, elem);
 195          if (dictEntry == NULL)
 196          {
 197             dictEntry =
 198                Global::GetDicts()->NewVirtualDictEntry(group, elem,
 199                                                        "UN", GDCM_UNKNOWN,
 200                                                         GDCM_UNKNOWN);
 201          }
 202          // we assume the constructor didn't fail
 203          entry = new ValEntry(dictEntry);
 204          if (entry)
 205          {
 206             entry->SetValue(val);
 207          }
 208          DocEntries.insert(i,entry);
 209
 210          return true;
 211       }
 212       if (group == (*i)->GetGroup() && elem == (*i)->GetElement() )
 213       {
 214          if ( ValEntry* entry = dynamic_cast<ValEntry*>(*i) )
 215          {
 216             entry->SetValue(val);
 217          }
 218          return true;
 219       }
 220    }
 221    return false;
 222 }
 223
 224 /**
 225  * \brief   Clear the hash table from given entry AND delete the entry.
 226  * @param   entryToRemove Entry to remove AND delete.
 227  * \warning Some problems when using under Windows... prefer the use of
 228  *          Initialize / GetNext methods
 229  */
 230 bool SQItem::RemoveEntry( DocEntry* entryToRemove)
 231 {
 232    for(ListDocEntry::iterator it = DocEntries.begin();
 233        it != DocEntries.end();
 234        ++it)
 235    {
 236       if( *it == entryToRemove)
 237       {
 238          DocEntries.erase(it);
 239          gdcmVerboseMacro( "One element erased.");
 240          delete entryToRemove;
 241          return true;
 242       }
 243    }
 244    gdcmVerboseMacro( "Value not present.");
 245    return false ;
 246 }
 247
 248 /**
 249  * \brief   Clear the hash table from given entry BUT keep the entry.
 250  * @param   entryToRemove Entry to remove.
 251  */
 252 bool SQItem::RemoveEntryNoDestroy(DocEntry* entryToRemove)
 253 {
 254    for(ListDocEntry::iterator it = DocEntries.begin();
 255        it != DocEntries.end();
 256        ++it)
 257    {
 258       if( *it == entryToRemove)
 259       {
 260          DocEntries.erase(it);
 261          gdcmVerboseMacro( "One element erased.");
 262          return true;
 263       }
 264    }
 265
 266    gdcmVerboseMacro( "Value not present.");
 267    return false ;
 268 }
 269
 270 /**
 271  * \brief   Initialise the visit of the chained list
 272  */
 273 void SQItem::Initialize()
 274 {
 275    ItDocEntries = DocEntries.begin();
 276 }
 277
 278 /**
 279  * \brief   Get the next entry whil visiting the chained list
 280  * \return  The next DocEntry if found, otherwhise NULL
 281  */
 282 DocEntry *SQItem::GetNextEntry()
 283 {
 284    if (ItDocEntries != DocEntries.end())
 285    {
 286       DocEntry *tmp = *ItDocEntries;
 287       ++ItDocEntries;
 288
 289       return tmp;
 290    }
 291    else
 292    {
 293       return NULL;
 294    }
 295 }
 296
 297 //-----------------------------------------------------------------------------
 298 // Protected
 299 /**
 300  * \brief   Gets a Dicom Element inside a SQ Item Entry
 301  * @param   group   Group number of the Entry
 302  * @param   elem  Element number of the Entry
 303  * @return
 304  */
 305 DocEntry* SQItem::GetDocEntry(uint16_t group, uint16_t elem)
 306 {
 307    for(ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 308                               i != DocEntries.end(); ++i)
 309    {
 310       if ( (*i)->GetGroup() == group && (*i)->GetElement() == elem )
 311       {
 312          return *i;
 313       }
 314    }
 315    return 0;
 316 }
 317
 318 /**
 319  * \brief   Get the value of a Dicom Element inside a SQ Item Entry
 320  * @param   group   Group number of the Entry
 321  * @param   elem  Element number of the Entry
 322  * @return
 323  */
 324
 325 std::string SQItem::GetEntry(uint16_t group, uint16_t elem)
 326 {
 327    for(ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 328                               i != DocEntries.end(); ++i)
 329    {
 330       if ( (*i)->GetGroup() == group && (*i)->GetElement() == elem)
 331       {
 332          return ((ValEntry *)(*i))->GetValue();   //FIXME
 333       }
 334    }
 335    return GDCM_UNFOUND;
 336 }
 337 //-----------------------------------------------------------------------------
 338 // Private
 339
 340
 341 //-----------------------------------------------------------------------------
 342
 343 } // end namespace gdcm