src/gdcmSQItem.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmSQItem.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/10/28 03:10:58 $
   7   Version:   $Revision: 1.33 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmSQItem.h"
  20 #include "gdcmSeqEntry.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23 #include "gdcmGlobal.h"
  24 #include "gdcmUtil.h"
  25 #include "gdcmDebug.h"
  26 #include <fstream>
  27
  28 namespace gdcm
  29 {
  30 //-----------------------------------------------------------------------------
  31 // Constructor / Destructor
  32 /**
  33  * \ingroup SQItem
  34  * \brief   Constructor from a given SQItem
  35  */
  36 SQItem::SQItem(int depthLevel )
  37           : DocEntrySet( )
  38 {
  39    SQDepthLevel = depthLevel;
  40 }
  41
  42 /**
  43  * \brief   Canonical destructor.
  44  */
  45 SQItem::~SQItem()
  46 {
  47    for(ListDocEntry::iterator cc = DocEntries.begin();
  48                              cc != DocEntries.end();
  49                              ++cc)
  50    {
  51       delete *cc;
  52    }
  53    DocEntries.clear();
  54 }
  55
  56 //-----------------------------------------------------------------------------
  57 // Print
  58 /*
  59  * \brief   canonical Printer
  60  */
  61  void SQItem::Print(std::ostream& os)
  62  {
  63    std::ostringstream s;
  64
  65    if (SQDepthLevel > 0)
  66    {
  67       for (int i = 0; i < SQDepthLevel; ++i)
  68       {
  69          s << "   | " ;
  70       }
  71    }
  72    //std::cout << s.str() << " --- SQItem number " << SQItemNumber  << std::endl;
  73    for (ListDocEntry::iterator i  = DocEntries.begin();
  74                                i != DocEntries.end();
  75                              ++i)
  76    {
  77       DocEntry* Entry = *i;
  78       bool PrintEndLine = true;
  79
  80       os << s.str();
  81       Entry->SetPrintLevel(2);
  82       Entry->Print(os);
  83       if ( SeqEntry* seqEntry = dynamic_cast<SeqEntry*>(Entry) )
  84       {
  85          (void)seqEntry;  //not used
  86          PrintEndLine = false;
  87       }
  88       if (PrintEndLine)
  89       {
  90          os << std::endl;
  91       }
  92    }
  93 }
  94
  95 /*
  96  * \ingroup SQItem
  97  * \brief   canonical Writer
  98  */
  99 void SQItem::Write(std::ofstream* fp, FileType filetype)
 100 {
 101    uint16_t item[4] = { 0xfffe, 0xe000, 0xffff, 0xffff };
 102    uint16_t itemt[4]= { 0xfffe, 0xe00d, 0xffff, 0xffff };
 103
 104     //we force the writting of an 'Item' Start Element
 105     // because we want to write the Item as a 'no Length' item
 106    fp->write((char*)&item[0],8);  // fffe e000 ffff ffff
 107
 108    for (ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 109                               i != DocEntries.end();
 110                              ++i)
 111    {
 112       // we skip delimitors (start and end one) because
 113       // we force them as 'no length'
 114       if ( (*i)->GetGroup() == 0xfffe )
 115       {
 116          continue;
 117       }
 118
 119       // Fix in order to make some MR PHILIPS images e-film readable
 120       // see gdcmData/gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm:
 121       // we just *always* ignore spurious fffe|0000 tag !
 122       if ( (*i)->GetGroup() == 0xfffe && (*i)->GetElement() == 0x0000 )
 123       {
 124          break; // FIXME : continue; ?!?
 125       }
 126
 127       (*i)->Write(fp, filetype);
 128    }
 129
 130     //we force the writting of an 'Item Delimitation' item
 131     // because we wrote the Item as a 'no Length' item
 132    fp->write((char*)&itemt[0],8);  // fffe e000 ffff ffff
 133
 134 }
 135
 136 //-----------------------------------------------------------------------------
 137 // Public
 138 /**
 139  * \brief   adds any Entry (Dicom Element) to the Sequence Item
 140  */
 141 bool SQItem::AddEntry(DocEntry* entry)
 142 {
 143    DocEntries.push_back(entry);
 144    //TODO : check if it worked
 145    return true;
 146 }
 147
 148 /**
 149  * \brief   Sets Entry (Dicom Element) value of an element,
 150  *          specified by it's tag (Group, Number)
 151  *          and the length, too ...  inside a SQ Item
 152  *          If the Element is not found, it's just created !
 153  * \warning we suppose, right now, the element belongs to a Public Group
 154  *          (NOT a shadow one)
 155  * @param   val string value to set
 156  * @param   group Group number of the searched tag.
 157  * @param   element Element number of the searched tag.
 158  * @return  true if element was found or created successfully
 159  */
 160
 161 bool SQItem::SetEntryByNumber(std::string const & val, uint16_t group,
 162                               uint16_t element)
 163 {
 164    for(ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 165                               i != DocEntries.end();
 166                             ++i)
 167    {
 168       if ( (*i)->GetGroup() == 0xfffe && (*i)->GetElement() == 0xe000 )
 169       {
 170          continue;
 171       }
 172
 173       if (  ( group   < (*i)->GetGroup() )
 174           ||( group == (*i)->GetGroup() && element < (*i)->GetElement()) )
 175       {
 176          // instead of ReplaceOrCreateByNumber
 177          // that is a method of Document :-(
 178          ValEntry* entry = 0;
 179          TagKey key = DictEntry::TranslateToKey(group, element);
 180
 181          if ( ! PtagHT->count(key))
 182          {
 183             // we assume a Public Dictionnary *is* loaded
 184             Dict *pubDict = Global::GetDicts()->GetDefaultPubDict();
 185             // if the invoked (group,elem) doesn't exist inside the Dictionary
 186             // we create a VirtualDictEntry
 187             DictEntry *dictEntry = pubDict->GetDictEntryByNumber(group, element);
 188             if (dictEntry == NULL)
 189             {
 190                dictEntry =
 191                   Global::GetDicts()->NewVirtualDictEntry(group, element,
 192                                                           "UN", "??", "??");
 193             }
 194             // we assume the constructor didn't fail
 195             entry = new ValEntry(dictEntry);
 196             /// \todo
 197             /// ----
 198             /// better we don't assume too much !
 199             /// SQItem is now used to describe any DICOMDIR related object
 200          }
 201          else
 202          {
 203             DocEntry* foundEntry = PtagHT->find(key)->second;
 204             entry = dynamic_cast<ValEntry*>(foundEntry);
 205             if (!entry)
 206             {
 207                dbg.Verbose(0, "SQItem::SetEntryByNumber: docEntries"
 208                               " contains non ValEntry occurences");
 209             }
 210          }
 211          if (entry)
 212          {
 213             entry->SetValue(val);
 214          }
 215          entry->SetLength(val.length());
 216          DocEntries.insert(i,entry);
 217
 218          return true;
 219       }
 220       if (group == (*i)->GetGroup() && element == (*i)->GetElement() )
 221       {
 222          if ( ValEntry* entry = dynamic_cast<ValEntry*>(*i) )
 223          {
 224             entry->SetValue(val);
 225          }
 226          (*i)->SetLength(val.length());
 227          return true;
 228       }
 229    }
 230    return false;
 231 }
 232 //-----------------------------------------------------------------------------
 233 // Protected
 234
 235
 236 /**
 237  * \brief   Gets a Dicom Element inside a SQ Item Entry, by number
 238  * @return
 239  */
 240 DocEntry* SQItem::GetDocEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element)
 241 {
 242    for(ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 243                               i != DocEntries.end(); ++i)
 244    {
 245       if ( (*i)->GetGroup() == group && (*i)->GetElement() == element )
 246       {
 247          return *i;
 248       }
 249    }
 250    return 0;
 251 }
 252
 253 /**
 254  * \brief   Get the value of a Dicom Element inside a SQ Item Entry, by number
 255  * @return
 256  */
 257
 258 std::string SQItem::GetEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element)
 259 {
 260    for(ListDocEntry::iterator i = DocEntries.begin();
 261                               i != DocEntries.end(); ++i)
 262    {
 263       if ( (*i)->GetGroup() == group && (*i)->GetElement() == element)
 264       {
 265          return ((ValEntry *)(*i))->GetValue();   //FIXME
 266       }
 267    }
 268    return GDCM_UNFOUND;
 269 }
 270 //-----------------------------------------------------------------------------
 271 // Private
 272
 273
 274 //-----------------------------------------------------------------------------
 275
 276 } // end namespace gdcm