src2/creaImageIOGimmickView.cpp

   1 #include <creaImageIOGimmickView.h>
   2 #include <creaImageIOSystem.h>
   3
   4 #include "boost/filesystem.hpp"
   5
   6 namespace fs = boost::filesystem;
   7
   8 namespace creaImageIO
   9 {
  10
  11         ///Class used to represent the actual state of the image selected and to perform comparisons on its values
  12   class ImageExtent
  13   {
  14   public:
  15     ImageExtent(const std::string& x, const std::string& y, const std::string& z, const std::string& t)
  16         {
  17                  sscanf(x.c_str(),"%d",&mExtent[0]);
  18                  sscanf(y.c_str(),"%d",&mExtent[1]);
  19                  sscanf(z.c_str(),"%d",&mExtent[2]);
  20                  sscanf(t.c_str(),"%d",&mExtent[3]);
  21                  if(x==""){mExtent[0]=1;}
  22              if(y==""){mExtent[1]=1;}
  23              if(z==""){mExtent[2]=1;}
  24                  if(t==""){mExtent[3]=1;}
  25
  26                  if (mExtent[3]>1) mDim=4;
  27                  else if (mExtent[2]>1) mDim=3;
  28              else if (mExtent[1]>1) mDim=2;
  29              else if (mExtent[0]>1) mDim=1;
  30                  else mDim=0;
  31         }
  32
  33
  34         ///Clears the extent
  35     void Clear() { mExtent[0] = mExtent[1] = mExtent[2] = mExtent[3] = 1; }
  36
  37         ///Returns true if the two extents are compatible
  38     bool IsCompatible( const ImageExtent& );
  39
  40         ///Adds the extent passed as a parameter to the current extent
  41     void Add ( const ImageExtent& );
  42
  43         ///Returns the ieth position of the extent
  44     int Get(int i) { return mExtent[i]; }
  45
  46         ///Returns the dimension of the current image
  47     void SetDimension(int dim) { mDim=dim; }
  48
  49         ///Returns the dimension of the current image
  50     int GetDimension() { return mDim; }
  51
  52   private:
  53     int mExtent[4];
  54     int mDim;
  55   };
  56
  57   //======================================================================
  58
  59   //======================================================================
  60   // CTor
  61   GimmickView::GimmickView(Gimmick* gimmick, int threads)
  62     : mGimmick(gimmick),
  63           mReader(threads)
  64   {
  65     GimmickDebugMessage(1,"GimmickView::GimmickView"
  66                         <<std::endl);
  67         // Anciently started the threads ...
  68     // Threads now automatically start at first image request
  69     //mReader.Start();
  70
  71   }
  72   //======================================================================
  73
  74   //======================================================================
  75   /// Destructor
  76   GimmickView::~GimmickView()
  77   {
  78     GimmickDebugMessage(1,"GimmickView::~GimmickView"
  79                         <<std::endl);
  80   }
  81    //======================================================================
  82
  83   //======================================================================
  84   /// Initializes the view :
  85   /// Creates the TreeViews for all the TreeHandler of the Controller
  86   ///
  87   void GimmickView::Initialize()
  88   {
  89         mImageExtent=0;
  90         mReaderStarted=false;
  91   }
  92   //======================================================================
  93
  94   //======================================================================
  95   /// Finalize
  96   void GimmickView::Finalize()
  97   {
  98   }
  99
 100   //======================================================================
 101
 102   //======================================================================
 103   /// Create the tree views
 104   void GimmickView::CreateTreeViews()
 105   {
 106     GimmickMessage(2,"Creating the tree views"<<std::endl);
 107     Gimmick::TreeHandlerMapType::const_iterator i;
 108     for (i = mGimmick->GetTreeHandlerMap().begin();
 109          i!= mGimmick->GetTreeHandlerMap().end();
 110          ++i)
 111       {
 112         this->CreateTreeView(i->second);
 113       }
 114   }
 115   //======================================================================
 116
 117   //======================================================================
 118   /// Updates the TreeView of given name from level l to bottom
 119   /// (calls the virtual method TreeView::Update())
 120   void GimmickView::UpdateTreeViewLevel(const std::string& t, int l)
 121   {
 122     TreeViewMapType::iterator i;
 123     i = GetTreeViewMap().find(t);
 124     if ( i == GetTreeViewMap().end() )
 125       {
 126         GimmickError("INTERNAL ERROR : GimmickView::UpdateTreeView : '"
 127                      <<t<<"' is not in TreeViewMap");
 128       }
 129     i->second->UpdateLevel(l);
 130   }
 131   //======================================================================
 132   /// Clears the status and begins a new selection process
 133   void GimmickView::ResetExtent()
 134   {
 135           if(mImageExtent!=0)
 136           {
 137           mImageExtent=0;
 138           }
 139           valid=true;
 140   }
 141
 142
 143   //======================================================================
 144
 145   //======================================================================
 146   bool ImageExtent::IsCompatible(const ImageExtent& ie)
 147   {
 148           bool compatible=true;
 149           ImageExtent * extent= (ImageExtent*)&ie;
 150           if((*extent).Get(0)!=Get(0)
 151                  || (*extent).Get(1)!=Get(1))
 152           {
 153                   compatible=false;
 154           }
 155           return compatible;
 156   }
 157
 158   //======================================================================
 159
 160   //======================================================================
 161   void ImageExtent::Add(const ImageExtent& ie)
 162   {
 163           ImageExtent * extent= (ImageExtent*)&ie;
 164           mExtent[2]+=(*extent).Get(2);
 165           SetDimension(3);
 166   }
 167
 168   //======================================================================
 169   ///Validates the dimension compliance of the images with the maximum and
 170   ///minimum given, and between their sizes
 171   bool GimmickView::ValidateSelected (tree::Node* sel, int min_dim, int max_dim)
 172   {
 173         GimmickDebugMessage(2,"Validating selected"<<std::endl);
 174         std::string mMessage;
 175
 176         if(sel==0)
 177         {
 178                 mMessage="Cannot have 0 images selected!";
 179                 valid=false;
 180         }
 181         else
 182         {
 183         ImageExtent* ie=new ImageExtent((*sel).GetAttribute("D0028_0010"),
 184                                                  (*sel).GetAttribute("D0028_0011"),
 185                                                                          (*sel).GetAttribute("D0028_0012"),
 186                                                                          "");
 187         if(mImageExtent==0)
 188         {
 189                 mImageExtent=ie;
 190                 if((mImageExtent->Get(min_dim-1)<2)||(mImageExtent->Get(max_dim)>1))
 191                 {
 192                         valid=false;
 193                 }
 194                 else
 195                 {
 196                         std::stringstream out;
 197                         out << mImageExtent->GetDimension() << "D image " << mImageExtent->Get(0) << "x"<< mImageExtent->Get(1) << "x"<< mImageExtent->Get(2) <<" selected";
 198                 mMessage = out.str();
 199                         mImageExtent->SetDimension(2);
 200                         valid=true;
 201                 }
 202         }
 203         else
 204         {
 205                 if(mImageExtent->IsCompatible(*ie))
 206                 {
 207                         if(mImageExtent->GetDimension()==max_dim && mImageExtent->Get(max_dim)>2)
 208                         {
 209                                 std::stringstream out;
 210                                 out<<"Cannot add this image to selection : would result in a "<<mImageExtent->GetDimension()+1<<"D image!";
 211                                 mMessage=out.str();
 212                                 valid=false;
 213                         }
 214                         else if(max_dim<3)
 215                         {
 216                                 std::stringstream out;
 217                                 out<<"Selecting "<<mImageExtent->GetDimension()<<"D images is not allowed !";
 218                                 mMessage=out.str();
 219                                 valid=false;
 220                         }
 221                         else if(min_dim==3 && (ie->Get(2)+mImageExtent->Get(2))<2)
 222                         {
 223                                 std::stringstream out;
 224                                 out << "Cannot build the selection as it would result in a ";
 225                                 out << mImageExtent->GetDimension();
 226                                 out << "D image, and the minimum is ";
 227                                 out << min_dim;
 228                                 out << "D!";
 229                                 mMessage=out.str();
 230                                 valid=false;
 231                         }
 232                         else
 233                         {
 234             mImageExtent->Add(*ie);
 235                         std::stringstream out;
 236                         out << mImageExtent->GetDimension() << "D image " << mImageExtent->Get(0) << "x"<< mImageExtent->Get(1) << "x"<< mImageExtent->Get(2) <<" selected";
 237                 mMessage = out.str();
 238                         }
 239
 240                 }
 241                 else
 242                 {
 243                         mMessage="The selected images are not compatible.";
 244                         valid=false;
 245                 }
 246         }
 247         }
 248
 249
 250         mValidationSignal(valid);
 251         SetMessage(mMessage);
 252         return valid;
 253   }
 254
 255 //======================================================================
 256
 257    //======================================================================
 258   ///Reads Images (Non Threaded)
 259   void GimmickView::ReadImagesNotThreaded(std::vector<vtkImageData*>& s,std::vector<std::string> im, int dimension)
 260   {
 261
 262         // Create the output data
 263         if (im.size()==1)
 264       {
 265
 266                 // Only one image : give it
 267                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 268                 GimmickDebugMessage(3, "State Check: Full Filename: "
 269                                                 <<im.front()
 270                                                 <<std::endl);
 271                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(im.front()));
 272                 s.push_back( out );
 273       }
 274
 275     else if (im.size()>1)
 276       {
 277         vtkImageData* first = mReader.GetImage( im.front());
 278         if (dimension==2)
 279           {
 280             // n2D to 3D
 281             vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 282             out->CopyStructure(first);
 283             out->SetScalarType(first->GetScalarType());
 284             int ext[6];
 285             first->GetExtent(ext);
 286             ext[5] = im.size();
 287             out->SetExtent(ext);
 288             // LG : TODO : Z Spacing  ?
 289
 290             out->AllocateScalars();
 291
 292             //first->Print(std::cout);
 293             //      out->Print(std::cout);
 294
 295             int dim[3];
 296             first->GetDimensions(dim);
 297             unsigned long imsize =
 298               ( (unsigned long)first->GetScalarPointer(0,1,0)
 299                 - (unsigned long)first->GetScalarPointer(0,0,0))
 300               *dim[1];
 301
 302             int slice = 0;
 303                 std::vector<std::string>::iterator it;
 304            for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 305               {
 306                 //std::cout << "copying slice "<<slice <<std::endl;
 307                           vtkImageData* cur = mReader.GetImage( (*it));
 308
 309                 void* src = cur->GetScalarPointer(0,0,0);
 310                 void* dst = out->GetScalarPointer(0,0,slice);
 311                 //              std::cout << "src="<<src<<std::endl;
 312                 //              std::cout << "dst="<<dst<<std::endl;
 313                 //              std::cout << "siz="<<imsize<<std::endl;
 314                 memcpy(dst,src,imsize);
 315
 316                 slice++;
 317               }
 318             s.push_back(out);
 319           }
 320         else
 321           {
 322             // n3D
 323                   std::vector<std::string>::iterator it;
 324             for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 325               {
 326                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 327                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(*it));
 328                 s.push_back(out);
 329               }
 330           }
 331       }
 332
 333   }
 334   //======================================================================
 335
 336   //======================================================================
 337   ///Requests the reading of an image
 338   void GimmickView::RequestReading(tree::Node* n,
 339                                    int prio, int selection_index, ImagePointerHolder *p)
 340   {
 341           if(!mReaderStarted)
 342           {
 343                 mReader.Start();
 344                 mReaderStarted=true;
 345           }
 346     ImageEventType t(n,selection_index, p);
 347     mImageEventMap[n->GetAttribute("FullFileName")] = t;
 348     mReader.Request(this,n->GetAttribute("FullFileName"),prio);
 349   }
 350   //======================================================================
 351
 352   //======================================================================
 353   void GimmickView::
 354   OnMultiThreadImageReaderEvent(const std::string& filename,
 355                                 MultiThreadImageReaderUser::EventType e,
 356                                 vtkImageData* image)
 357   {
 358     GimmickDebugMessage(7,
 359                         "MultiThreadImageReader event : "<<e<<std::endl);
 360         if (e==ImageLoaded)
 361         {
 362     if (filename.size()==0)
 363       {
 364                   //What to do in this case?
 365                   /*
 366                 GimmickDebugMessage(5,
 367                                         "Pushing unknown image in queue"
 368                                         <<std::endl);
 369                 mImageEventQueue.push_back(ImageEventType(image));*/
 370                 return;
 371       }
 372     ImageEventTypeMap::iterator i;
 373     i = mImageEventMap.find(filename);
 374     if (i!=mImageEventMap.end())
 375       {
 376                 GimmickDebugMessage(5,
 377                                         "Putting image of file '"<<filename<<"' on pointer"
 378                                         <<std::endl);
 379                 ImageEventType ie(i->second);
 380                 ie.image = image;
 381                 ie.pointerHolder->Set(ie.image);
 382                 //mImageEventMap.erase(i);
 383       }
 384         }
 385         else if (e==Error)
 386         {
 387                 std::string mess="ERROR: MultiThreadImageReader: Cannot read image in file ";
 388                 mess+=filename;
 389                 mess+="\n";
 390                 GimmickMessage(1,mess);
 391                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 392                 i = mImageEventMap.find(filename);
 393                 if (i!=mImageEventMap.end())
 394                 {
 395                 ImageEventType ie(i->second);
 396                 ie.image = image;
 397                 ie.pointerHolder->Set(GetDefaultImage());
 398                 //mImageEventMap.erase(i);
 399                 }
 400         }
 401
 402         else if (e==ImageUnloaded)
 403         {
 404                 std::string mess="Unloaded image in file ";
 405                 mess+=filename;
 406                 mess+="\n";
 407                 GimmickMessage(1,mess);
 408                                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 409                 i = mImageEventMap.find(filename);
 410                 if (i!=mImageEventMap.end())
 411                 {
 412                 ImageEventType ie(i->second);
 413                 ie.image = image;
 414                 ie.pointerHolder->Set(GetDefaultImage());
 415                 //mImageEventMap.erase(i);
 416                 }
 417
 418         }
 419   }
 420
 421   //====================================================================
 422
 423   //====================================================================
 424   void GimmickView::ConnectValidationObserver(ValidationCallbackType callback)
 425   {
 426     mValidationSignal.connect(callback);
 427   }
 428
 429
 430 } // EO namespace creaImageIO
 431
 432