src2/creaImageIOGimmickView.cpp

   1 #include <creaImageIOGimmickView.h>
   2 #include <creaImageIOSystem.h>
   3 #include "boost/filesystem.hpp"
   4
   5 namespace fs = boost::filesystem;
   6
   7 namespace creaImageIO
   8 {
   9
  10         ///Class used to represent the actual state of the image selected and to perform comparisons on its values
  11   class ImageExtent
  12   {
  13   public:
  14     ImageExtent(const std::string& x, const std::string& y, const std::string& z, const std::string& t)
  15         {
  16                  sscanf(x.c_str(),"%d",&mExtent[0]);
  17                  sscanf(y.c_str(),"%d",&mExtent[1]);
  18                  sscanf(z.c_str(),"%d",&mExtent[2]);
  19                  sscanf(t.c_str(),"%d",&mExtent[3]);
  20                  if(x==""){mExtent[0]=1;}
  21              if(y==""){mExtent[1]=1;}
  22              if(z==""){mExtent[2]=1;}
  23                  if(t==""){mExtent[3]=1;}
  24
  25                  if (mExtent[3]>1) mDim=4;
  26                  else if (mExtent[2]>1) mDim=3;
  27              else if (mExtent[1]>1) mDim=2;
  28              else if (mExtent[0]>1) mDim=1;
  29                  else mDim=0;
  30         }
  31
  32
  33         ///Clears the extent
  34     void Clear() { mExtent[0] = mExtent[1] = mExtent[2] = mExtent[3] = 1; }
  35
  36         ///Returns true if the two extents are compatible
  37     bool IsCompatible( const ImageExtent& );
  38
  39         ///Adds the extent passed as a parameter to the current extent
  40     void Add ( const ImageExtent& );
  41
  42         ///Returns the ieth position of the extent
  43     int Get(int i) { return mExtent[i]; }
  44
  45         ///Returns the dimension of the current image
  46     void SetDimension(int dim) { mDim=dim; }
  47
  48         ///Returns the dimension of the current image
  49     int GetDimension() { return mDim; }
  50
  51   private:
  52     int mExtent[4];
  53     int mDim;
  54   };
  55
  56   //======================================================================
  57
  58   //======================================================================
  59   // CTor
  60   GimmickView::GimmickView(boost::shared_ptr<Gimmick> gimmick, int threads)
  61     : mGimmick(gimmick),
  62           mReader(threads)
  63   {
  64     GimmickDebugMessage(1,"GimmickView::GimmickView"
  65                         <<std::endl);
  66         // Anciently started the threads ...
  67     // Threads now automatically start at first image request
  68     //mReader.Start();
  69
  70   }
  71   //======================================================================
  72
  73   //======================================================================
  74   /// Destructor
  75   GimmickView::~GimmickView()
  76   {
  77     GimmickDebugMessage(1,"GimmickView::~GimmickView"
  78                         <<std::endl);
  79   }
  80    //======================================================================
  81
  82   //======================================================================
  83   /// Initializes the view :
  84   /// Creates the TreeViews for all the TreeHandler of the Controller
  85   ///
  86   void GimmickView::Initialize()
  87   {
  88         mReaderStarted=false;
  89   }
  90   //======================================================================
  91
  92   //======================================================================
  93   /// Finalize
  94   void GimmickView::Finalize()
  95   {
  96   }
  97
  98   //======================================================================
  99
 100   //======================================================================
 101   /// Create the tree views
 102   void GimmickView::CreateTreeViews()
 103   {
 104     GimmickMessage(2,"Creating the tree views"<<std::endl);
 105     Gimmick::TreeHandlerMapType::const_iterator i;
 106     for (i = mGimmick->GetTreeHandlerMap().begin();
 107          i!= mGimmick->GetTreeHandlerMap().end();
 108          ++i)
 109       {
 110         this->CreateTreeView(i->second);
 111       }
 112   }
 113
 114   /// Create a tree view with a given name
 115   void GimmickView::CreateSingleTreeView(std::string &i_name)
 116   {
 117         this->CreateTreeView(mGimmick->GetTreeHandlerMap()[i_name]);
 118
 119   }
 120
 121
 122   //======================================================================
 123
 124   //======================================================================
 125   /// Updates the TreeView of given name from level l to bottom
 126   /// (calls the virtual method TreeView::Update())
 127   void GimmickView::UpdateTreeViewLevel(const std::string& t, int l)
 128   {
 129     TreeViewMapType::iterator i;
 130     i = GetTreeViewMap().find(t);
 131     if ( i == GetTreeViewMap().end() )
 132       {
 133         GimmickError("INTERNAL ERROR : GimmickView::UpdateTreeView : '"
 134                      <<t<<"' is not in TreeViewMap");
 135       }
 136     i->second->UpdateLevel(l);
 137   }
 138
 139   //======================================================================
 140   /// Clears the status and begins a new selection process
 141   void GimmickView::ResetExtent()
 142   {
 143           if(mImageExtent!=0)
 144           {
 145                   mImageExtent.reset();
 146           }
 147           valid=true;
 148   }
 149
 150   //======================================================================
 151
 152   //======================================================================
 153   bool ImageExtent::IsCompatible(const ImageExtent& ie)
 154   {
 155           bool compatible=true;
 156           ImageExtent * extent= (ImageExtent*)&ie;
 157           if((*extent).Get(0)!=Get(0)
 158                  || (*extent).Get(1)!=Get(1))
 159           {
 160                   compatible=false;
 161           }
 162           return compatible;
 163   }
 164
 165   //======================================================================
 166
 167   //======================================================================
 168   void ImageExtent::Add(const ImageExtent& ie)
 169   {
 170           ImageExtent * extent= (ImageExtent*)&ie;
 171           mExtent[2]+=(*extent).Get(2);
 172           if(mExtent[2]>1)
 173           {
 174           SetDimension(3);
 175           }
 176   }
 177
 178   //======================================================================
 179   /// No selected image
 180   bool GimmickView::NoValidateSelected ()
 181   {
 182         GimmickDebugMessage(2,"Validating selected"<<std::endl);
 183         std::string mMessage;
 184         mMessage="Cannot have 0 images selected!";
 185         valid=false;
 186         modifyValidationSignal(valid);
 187         SetMessage(mMessage);
 188         return valid;
 189   }
 190
 191   //======================================================================
 192   ///Validates the dimension compliance of the images with the maximum and
 193   ///minimum given, and between their sizes
 194   bool GimmickView::ValidateSelected (tree::Node* sel, int min_dim, int max_dim)
 195   {
 196         GimmickDebugMessage(2,"Validating selected"<<std::endl);
 197         std::string mMessage;
 198
 199         if(sel==0)
 200         {
 201                 mMessage="Cannot have 0 images selected!";
 202                 valid=false;
 203         }
 204         else
 205         {
 206                 boost::shared_ptr<ImageExtent> ie=boost::shared_ptr<ImageExtent>(new ImageExtent((*sel).GetAttribute("D0028_0010"),
 207                                                                         (*sel).GetAttribute("D0028_0011"),
 208                                                                         (*sel).GetAttribute("D0028_0012"),
 209                                                                         ""));
 210         if(mImageExtent==0)
 211         {
 212                 mImageExtent=ie;
 213                 if((mImageExtent->Get(min_dim-1)<2)||(mImageExtent->Get(max_dim)>1))
 214                 {
 215                         valid=false;
 216                 }
 217                 else
 218                 {
 219                         std::stringstream out;
 220                         out << mImageExtent->GetDimension() << "D image " << mImageExtent->Get(0) << "x"<< mImageExtent->Get(1) << "x"<< mImageExtent->Get(2) <<" selected";
 221                         mMessage = out.str();
 222                         mImageExtent->SetDimension(2);
 223                         valid=true;
 224                 }
 225         }
 226         else
 227         {
 228                 if(mImageExtent->IsCompatible(*ie))
 229                 {
 230                         if(mImageExtent->GetDimension()==max_dim && mImageExtent->Get(max_dim)>2)
 231                         {
 232                                 std::stringstream out;
 233                                 out<<"Cannot add this image to selection : would result in a "<<mImageExtent->GetDimension()+1<<"D image!";
 234                                 mMessage=out.str();
 235                                 valid=false;
 236                         }
 237                         else if(max_dim<3)
 238                         {
 239                                 std::stringstream out;
 240                                 out<<"Selecting "<<mImageExtent->GetDimension()<<"D images is not allowed !";
 241                                 mMessage=out.str();
 242                                 valid=false;
 243                         }
 244                         else if(min_dim==3 && (ie->Get(2)+mImageExtent->Get(2))<2)
 245                         {
 246                                 std::stringstream out;
 247                                 out << "Cannot build the selection as it would result in a ";
 248                                 out << mImageExtent->GetDimension();
 249                                 out << "D image, and the minimum is ";
 250                                 out << min_dim;
 251                                 out << "D!";
 252                                 mMessage=out.str();
 253                                 valid=false;
 254                         }
 255                         else
 256                         {
 257                                 mImageExtent->Add(*ie);
 258                                 std::stringstream out;
 259                                 out << mImageExtent->GetDimension() << "D image " << mImageExtent->Get(0) << "x"<< mImageExtent->Get(1) << "x"<< mImageExtent->Get(2) <<" selected";
 260                                 mMessage = out.str();
 261                         }
 262                 }
 263                 else
 264                 {
 265                         mMessage="The selected images are not compatible.";
 266                         valid=false;
 267                 }
 268           }
 269         }
 270
 271         modifyValidationSignal(valid);
 272         SetMessage(mMessage);
 273         return valid;
 274   }
 275
 276   //======================================================================
 277   void GimmickView::modifyValidationSignal(bool ivalid)
 278   {
 279           mValidationSignal(ivalid);
 280   }
 281
 282    //======================================================================
 283   ///Reads Images (Non Threaded)
 284 void GimmickView::ReadImagesNotThreaded(std::vector<vtkImageData*>& s, std::vector<std::string> im, int dimension)
 285 {
 286         // Create the output data
 287         if (im.size()==1)
 288         {
 289                 // Only one image : give it
 290                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 291                 GimmickDebugMessage(3, "State Check: Full Filename: "
 292                                         <<im.front()
 293                                         <<std::endl);
 294                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(im.front()));
 295                 s.push_back( out );
 296         }
 297         else if (im.size()>1) // Test inutile ? JPR
 298         {
 299                 vtkImageData* first = mReader.GetImage( im.front());
 300                 if (dimension == 2)
 301                 {
 302                  // n3D
 303                     std::vector<std::string>::iterator it;
 304                         for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 305                         {
 306                                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 307                                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(*it));
 308                                 s.push_back(out);
 309                         }
 310                 }
 311                 else
 312                 {
 313                         // n2D to 3D
 314                         vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 315                         out->CopyStructure(first);
 316                         out->SetScalarType(first->GetScalarType());
 317                         int ext[6];
 318                         //first->GetExtent(ext);  // JPR
 319                         first->GetWholeExtent(ext);
 320 std::cout <<"in GimmickView::ReadImagesNotThreaded GetWholeExtent ext =";
 321 for (int jjj=0;jjj<6;jjj++)
 322         std:cout << "   [" << jjj << "]=" << ext[jjj];
 323 std::cout << endl;
 324
 325                         if(ext[5] == 0)
 326                         {
 327                                 ext[5] = im.size()-1;
 328                         }
 329                         else
 330                         {
 331                                 ext[5] = ext[5] * im.size()-1; // to deal with multiframes - JPR
 332                         }
 333                         out->SetExtent(ext);
 334                         // LG : TODO : Z Spacing  ?
 335
 336                         out->AllocateScalars();
 337
 338                         //first->Print(std::cout);
 339                         //          out->Print(std::cout);
 340
 341                         int dim[3];
 342                         first->GetDimensions(dim);
 343                         unsigned long imsize = dim[0] * dim[1];
 344                         imsize = imsize * dim[2] ;  // deal with multiframes// JPR
 345 //EED 03-11-2009
 346                         imsize = imsize * first->GetScalarSize();
 347
 348                         int slice = 0;
 349                         std::vector<std::string>::iterator it;
 350                         for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 351                         {
 352
 353                         vtkImageData* cur = mReader.GetImage( (*it));
 354                 //      void* src = cur->GetScalarPointer(0,0,0);
 355                 //      void* dst = out->GetScalarPointer(0,0,slice);
 356                         memcpy(out->GetScalarPointer(0,0,slice),cur->GetScalarPointer(0,0,0),imsize);
 357
 358                         slice++;
 359                         }
 360                         s.push_back(out);
 361                 }
 362         }
 363 }
 364   //======================================================================
 365
 366 void GimmickView::ReadImagesNotThreadedInVector(std::vector<vtkImageData*>& s, std::vector<std::string> im, int dimension)
 367 {
 368         // Create the output data
 369         if (im.size()==1)
 370         {
 371                 // Only one image : give it
 372                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 373                 GimmickDebugMessage(3, "State Check: Full Filename: "
 374                                                 <<im.front()
 375                                                 <<std::endl);
 376                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(im.front()));
 377                 s.push_back( out );
 378         }
 379         else if (im.size()>1) // Test inutile ? JPR
 380         {
 381                 vtkImageData* first = mReader.GetImage( im.front());
 382                 if (dimension == 2)
 383                 {
 384                  // n3D
 385                   std::vector<std::string>::iterator it;
 386                         for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 387                         {
 388                                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 389                                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(*it));
 390                                 s.push_back(out);
 391                         }
 392                 }
 393                 else
 394                 {
 395                         // n2D to 3D // NO!
 396                         // n *2D + T in a vector :
 397
 398                         std::vector<std::string>::iterator it;
 399                         for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 400                         {
 401                                 vtkImageData* out = mReader.GetImage( (*it));
 402                                 s.push_back(out);
 403                         }
 404                 }
 405         }
 406 }
 407   //======================================================================
 408
 409   //======================================================================
 410   ///Requests the reading of an image
 411   void GimmickView::RequestReading(tree::Node* n,
 412           int prio, int selection_index, boost::shared_ptr<ImagePointerHolder> p)
 413   {
 414           if(!mReaderStarted)
 415           {
 416                 mReader.Start();
 417                 mReaderStarted=true;
 418           }
 419     ImageEventType t(n,selection_index);
 420         t.pointerHolder = p;
 421     mImageEventMap[n->GetAttribute("FullFileName")] = t;
 422     mReader.Request(this,n->GetAttribute("FullFileName"),prio);
 423   }
 424   //======================================================================
 425
 426   //======================================================================
 427   void GimmickView::
 428   OnMultiThreadImageReaderEvent(const std::string& filename,
 429                                 MultiThreadImageReaderUser::EventType e,
 430                                 vtkImageData* image)
 431   {
 432     GimmickDebugMessage(7,
 433                         "MultiThreadImageReader event : "<<e<<std::endl);
 434         if (e==ImageLoaded)
 435         {
 436                 if (filename.size()==0)
 437                 {
 438                   //What to do in this case?
 439                   /*
 440                         GimmickDebugMessage(5,
 441                                         "Pushing unknown image in queue"
 442                                         <<std::endl);
 443                         mImageEventQueue.push_back(ImageEventType(image));*/
 444                         return;
 445                 }
 446                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 447 //JCP 22-06-2009, test mImageEventMap.size() > 0
 448                 if(mImageEventMap.size()>0){
 449                         i = mImageEventMap.find(filename);
 450                         if (i!=mImageEventMap.end())
 451                         {
 452                                 GimmickDebugMessage(5,
 453                                                 "Putting image of file '"<<filename<<"' on pointer"
 454                                                 <<std::endl);
 455                                 ImageEventType ie(i->second);
 456                                 ie.image = image;
 457                                 ie.pointerHolder->Set(ie.image);
 458                                 //mImageEventMap.erase(i);
 459                         }
 460                 }
 461         }
 462         else if (e==Error)
 463         {
 464                 std::string mess="ERROR: MultiThreadImageReader: Cannot read image in file ";
 465                 mess+=filename;
 466                 mess+="\n";
 467                 GimmickMessage(1,mess);
 468                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 469                 i = mImageEventMap.find(filename);
 470                 if (i!=mImageEventMap.end())
 471                 {
 472                 ImageEventType ie(i->second);
 473                 ie.image = image;
 474                 ie.pointerHolder->Set(GetDefaultImage());
 475                 //mImageEventMap.erase(i);
 476                 }
 477         }
 478
 479         else if (e==ImageUnloaded)
 480         {
 481                 std::string mess="Unloaded image in file ";
 482                 mess+=filename;
 483                 mess+="\n";
 484                 GimmickMessage(1,mess);
 485                                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 486                 i = mImageEventMap.find(filename);
 487                 if (i!=mImageEventMap.end())
 488                 {
 489                 ImageEventType ie(i->second);
 490                 ie.image = image;
 491                 ie.pointerHolder->Set(GetDefaultImage());
 492                 //mImageEventMap.erase(i);
 493                 }
 494         }
 495   }
 496
 497   //====================================================================
 498
 499   //====================================================================
 500   void GimmickView::ConnectValidationObserver(ValidationCallbackType callback)
 501   {
 502     mValidationSignal.connect(callback);
 503   }
 504
 505 } // EO namespace creaImageIO
 506