src2/creaImageIOGimmickView.cpp

   1 #include <creaImageIOGimmickView.h>
   2 #include <creaImageIOSystem.h>
   3
   4 #include "boost/filesystem.hpp"
   5
   6 namespace fs = boost::filesystem;
   7
   8 namespace creaImageIO
   9 {
  10
  11         ///Class used to represent the actual state of the image selected and to perform comparisons on its values
  12   class ImageExtent
  13   {
  14   public:
  15     ImageExtent(const std::string& x, const std::string& y, const std::string& z, const std::string& t)
  16         {
  17                  sscanf(x.c_str(),"%d",&mExtent[0]);
  18                  sscanf(y.c_str(),"%d",&mExtent[1]);
  19                  sscanf(z.c_str(),"%d",&mExtent[2]);
  20                  sscanf(t.c_str(),"%d",&mExtent[3]);
  21                  if(x==""){mExtent[0]=1;}
  22              if(y==""){mExtent[1]=1;}
  23              if(z==""){mExtent[2]=1;}
  24                  if(t==""){mExtent[3]=1;}
  25
  26                  if (mExtent[3]>1) mDim=4;
  27                  else if (mExtent[2]>1) mDim=3;
  28              else if (mExtent[1]>1) mDim=2;
  29              else if (mExtent[0]>1) mDim=1;
  30                  else mDim=0;
  31         }
  32
  33
  34         ///Clears the extent
  35     void Clear() { mExtent[0] = mExtent[1] = mExtent[2] = mExtent[3] = 1; }
  36
  37         ///Returns true if the two extents are compatible
  38     bool IsCompatible( const ImageExtent& );
  39
  40         ///Adds the extent passed as a parameter to the current extent
  41     void Add ( const ImageExtent& );
  42
  43         ///Returns the ieth position of the extent
  44     int Get(int i) { return mExtent[i]; }
  45
  46         ///Returns the dimension of the current image
  47     void SetDimension(int dim) { mDim=dim; }
  48
  49         ///Returns the dimension of the current image
  50     int GetDimension() { return mDim; }
  51
  52   private:
  53     int mExtent[4];
  54     int mDim;
  55   };
  56
  57   //======================================================================
  58
  59   //======================================================================
  60   // CTor
  61   GimmickView::GimmickView(Gimmick* gimmick, int threads)
  62     : mGimmick(gimmick),
  63           mReader(threads)
  64   {
  65     GimmickDebugMessage(1,"GimmickView::GimmickView"
  66                         <<std::endl);
  67         // Anciently started the threads ...
  68     // Threads now automatically start at first image request
  69     //mReader.Start();
  70
  71   }
  72   //======================================================================
  73
  74   //======================================================================
  75   /// Destructor
  76   GimmickView::~GimmickView()
  77   {
  78     GimmickDebugMessage(1,"GimmickView::~GimmickView"
  79                         <<std::endl);
  80   }
  81    //======================================================================
  82
  83   //======================================================================
  84   /// Initializes the view :
  85   /// Creates the TreeViews for all the TreeHandler of the Controller
  86   ///
  87   void GimmickView::Initialize()
  88   {
  89         mImageExtent=0;
  90         mReaderStarted=false;
  91   }
  92   //======================================================================
  93
  94   //======================================================================
  95   /// Finalize
  96   void GimmickView::Finalize()
  97   {
  98   }
  99
 100   //======================================================================
 101
 102   //======================================================================
 103   /// Create the tree views
 104   void GimmickView::CreateTreeViews()
 105   {
 106     GimmickMessage(2,"Creating the tree views"<<std::endl);
 107     Gimmick::TreeHandlerMapType::const_iterator i;
 108     for (i = mGimmick->GetTreeHandlerMap().begin();
 109          i!= mGimmick->GetTreeHandlerMap().end();
 110          ++i)
 111       {
 112         this->CreateTreeView(i->second, mGimmick->GetTimestampDatabase());
 113       }
 114   }
 115
 116   /// Create a tree view with a given name
 117   void GimmickView::CreateSingleTreeView(std::string &i_name)
 118   {
 119                 this->CreateTreeView(mGimmick->GetTreeHandlerMap()[i_name],
 120                         mGimmick->GetTimestampDatabase());
 121
 122   }
 123
 124
 125   //======================================================================
 126
 127   //======================================================================
 128   /// Updates the TreeView of given name from level l to bottom
 129   /// (calls the virtual method TreeView::Update())
 130   void GimmickView::UpdateTreeViewLevel(const std::string& t, int l)
 131   {
 132     TreeViewMapType::iterator i;
 133     i = GetTreeViewMap().find(t);
 134     if ( i == GetTreeViewMap().end() )
 135       {
 136         GimmickError("INTERNAL ERROR : GimmickView::UpdateTreeView : '"
 137                      <<t<<"' is not in TreeViewMap");
 138       }
 139     i->second->UpdateLevel(l);
 140   }
 141   //======================================================================
 142   /// Clears the status and begins a new selection process
 143   void GimmickView::ResetExtent()
 144   {
 145           if(mImageExtent!=0)
 146           {
 147           mImageExtent=0;
 148           }
 149           valid=true;
 150   }
 151
 152
 153   //======================================================================
 154
 155   //======================================================================
 156   bool ImageExtent::IsCompatible(const ImageExtent& ie)
 157   {
 158           bool compatible=true;
 159           ImageExtent * extent= (ImageExtent*)&ie;
 160           if((*extent).Get(0)!=Get(0)
 161                  || (*extent).Get(1)!=Get(1))
 162           {
 163                   compatible=false;
 164           }
 165           return compatible;
 166   }
 167
 168   //======================================================================
 169
 170   //======================================================================
 171   void ImageExtent::Add(const ImageExtent& ie)
 172   {
 173           ImageExtent * extent= (ImageExtent*)&ie;
 174           mExtent[2]+=(*extent).Get(2);
 175           if(mExtent[2]>1)
 176           {
 177           SetDimension(3);
 178           }
 179   }
 180
 181   //======================================================================
 182   ///Validates the dimension compliance of the images with the maximum and
 183   ///minimum given, and between their sizes
 184   bool GimmickView::ValidateSelected (tree::Node* sel, int min_dim, int max_dim)
 185   {
 186         GimmickDebugMessage(2,"Validating selected"<<std::endl);
 187         std::string mMessage;
 188
 189         if(sel==0)
 190         {
 191                 mMessage="Cannot have 0 images selected!";
 192                 valid=false;
 193         }
 194         else
 195         {
 196         ImageExtent* ie=new ImageExtent((*sel).GetAttribute("D0028_0010"),
 197                                                  (*sel).GetAttribute("D0028_0011"),
 198                                                                          (*sel).GetAttribute("D0028_0012"),
 199                                                                          "");
 200         if(mImageExtent==0)
 201         {
 202                 mImageExtent=ie;
 203                 if((mImageExtent->Get(min_dim-1)<2)||(mImageExtent->Get(max_dim)>1))
 204                 {
 205                         valid=false;
 206                 }
 207                 else
 208                 {
 209                         std::stringstream out;
 210                         out << mImageExtent->GetDimension() << "D image " << mImageExtent->Get(0) << "x"<< mImageExtent->Get(1) << "x"<< mImageExtent->Get(2) <<" selected";
 211                 mMessage = out.str();
 212                         mImageExtent->SetDimension(2);
 213                         valid=true;
 214                 }
 215         }
 216         else
 217         {
 218                 if(mImageExtent->IsCompatible(*ie))
 219                 {
 220                         if(mImageExtent->GetDimension()==max_dim && mImageExtent->Get(max_dim)>2)
 221                         {
 222                                 std::stringstream out;
 223                                 out<<"Cannot add this image to selection : would result in a "<<mImageExtent->GetDimension()+1<<"D image!";
 224                                 mMessage=out.str();
 225                                 valid=false;
 226                         }
 227                         else if(max_dim<3)
 228                         {
 229                                 std::stringstream out;
 230                                 out<<"Selecting "<<mImageExtent->GetDimension()<<"D images is not allowed !";
 231                                 mMessage=out.str();
 232                                 valid=false;
 233                         }
 234                         else if(min_dim==3 && (ie->Get(2)+mImageExtent->Get(2))<2)
 235                         {
 236                                 std::stringstream out;
 237                                 out << "Cannot build the selection as it would result in a ";
 238                                 out << mImageExtent->GetDimension();
 239                                 out << "D image, and the minimum is ";
 240                                 out << min_dim;
 241                                 out << "D!";
 242                                 mMessage=out.str();
 243                                 valid=false;
 244                         }
 245                         else
 246                         {
 247             mImageExtent->Add(*ie);
 248                         std::stringstream out;
 249                         out << mImageExtent->GetDimension() << "D image " << mImageExtent->Get(0) << "x"<< mImageExtent->Get(1) << "x"<< mImageExtent->Get(2) <<" selected";
 250                 mMessage = out.str();
 251                         }
 252
 253                 }
 254                 else
 255                 {
 256                         mMessage="The selected images are not compatible.";
 257                         valid=false;
 258                 }
 259         }
 260         }
 261
 262
 263         modifyValidationSignal(valid);
 264         SetMessage(mMessage);
 265         return valid;
 266   }
 267
 268   //======================================================================
 269   void GimmickView::modifyValidationSignal(bool ivalid)
 270   {
 271           mValidationSignal(ivalid);
 272   }
 273
 274
 275    //======================================================================
 276   ///Reads Images (Non Threaded)
 277   void GimmickView::ReadImagesNotThreaded(std::vector<vtkImageData*>& s,std::vector<std::string> im, int dimension)
 278   {
 279
 280         // Create the output data
 281         if (im.size()==1)
 282       {
 283
 284                 // Only one image : give it
 285                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 286                 GimmickDebugMessage(3, "State Check: Full Filename: "
 287                                                 <<im.front()
 288                                                 <<std::endl);
 289                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(im.front()));
 290                 s.push_back( out );
 291       }
 292
 293     else if (im.size()>1)
 294       {
 295         vtkImageData* first = mReader.GetImage( im.front());
 296         if (dimension==2)
 297           {
 298             // n2D to 3D
 299             vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 300             out->CopyStructure(first);
 301             out->SetScalarType(first->GetScalarType());
 302             int ext[6];
 303             first->GetExtent(ext);
 304             ext[5] = im.size();
 305             out->SetExtent(ext);
 306             // LG : TODO : Z Spacing  ?
 307
 308             out->AllocateScalars();
 309
 310             //first->Print(std::cout);
 311             //      out->Print(std::cout);
 312
 313             int dim[3];
 314             first->GetDimensions(dim);
 315             unsigned long imsize =
 316               ( (unsigned long)first->GetScalarPointer(0,1,0)
 317                 - (unsigned long)first->GetScalarPointer(0,0,0))
 318               *dim[1];
 319
 320             int slice = 0;
 321                 std::vector<std::string>::iterator it;
 322            for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 323               {
 324                 //std::cout << "copying slice "<<slice <<std::endl;
 325                           vtkImageData* cur = mReader.GetImage( (*it));
 326
 327                 void* src = cur->GetScalarPointer(0,0,0);
 328                 void* dst = out->GetScalarPointer(0,0,slice);
 329                 //              std::cout << "src="<<src<<std::endl;
 330                 //              std::cout << "dst="<<dst<<std::endl;
 331                 //              std::cout << "siz="<<imsize<<std::endl;
 332                 memcpy(dst,src,imsize);
 333
 334                 slice++;
 335               }
 336             s.push_back(out);
 337           }
 338         else
 339           {
 340             // n3D
 341                   std::vector<std::string>::iterator it;
 342             for (it=im.begin(); it!=im.end(); ++it)
 343               {
 344                 vtkImageData* out = vtkImageData::New();
 345                 out->ShallowCopy(mReader.GetImage(*it));
 346                 s.push_back(out);
 347               }
 348           }
 349       }
 350
 351   }
 352   //======================================================================
 353
 354   //======================================================================
 355   ///Requests the reading of an image
 356   void GimmickView::RequestReading(tree::Node* n,
 357                                    int prio, int selection_index, ImagePointerHolder *p)
 358   {
 359           if(!mReaderStarted)
 360           {
 361                 mReader.Start();
 362                 mReaderStarted=true;
 363           }
 364     ImageEventType t(n,selection_index, p);
 365     mImageEventMap[n->GetAttribute("FullFileName")] = t;
 366     mReader.Request(this,n->GetAttribute("FullFileName"),prio);
 367   }
 368   //======================================================================
 369
 370   //======================================================================
 371   void GimmickView::
 372   OnMultiThreadImageReaderEvent(const std::string& filename,
 373                                 MultiThreadImageReaderUser::EventType e,
 374                                 vtkImageData* image)
 375   {
 376     GimmickDebugMessage(7,
 377                         "MultiThreadImageReader event : "<<e<<std::endl);
 378         if (e==ImageLoaded)
 379         {
 380     if (filename.size()==0)
 381       {
 382                   //What to do in this case?
 383                   /*
 384                 GimmickDebugMessage(5,
 385                                         "Pushing unknown image in queue"
 386                                         <<std::endl);
 387                 mImageEventQueue.push_back(ImageEventType(image));*/
 388                 return;
 389       }
 390     ImageEventTypeMap::iterator i;
 391     i = mImageEventMap.find(filename);
 392     if (i!=mImageEventMap.end())
 393       {
 394                 GimmickDebugMessage(5,
 395                                         "Putting image of file '"<<filename<<"' on pointer"
 396                                         <<std::endl);
 397                 ImageEventType ie(i->second);
 398                 ie.image = image;
 399                 ie.pointerHolder->Set(ie.image);
 400                 //mImageEventMap.erase(i);
 401       }
 402         }
 403         else if (e==Error)
 404         {
 405                 std::string mess="ERROR: MultiThreadImageReader: Cannot read image in file ";
 406                 mess+=filename;
 407                 mess+="\n";
 408                 GimmickMessage(1,mess);
 409                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 410                 i = mImageEventMap.find(filename);
 411                 if (i!=mImageEventMap.end())
 412                 {
 413                 ImageEventType ie(i->second);
 414                 ie.image = image;
 415                 ie.pointerHolder->Set(GetDefaultImage());
 416                 //mImageEventMap.erase(i);
 417                 }
 418         }
 419
 420         else if (e==ImageUnloaded)
 421         {
 422                 std::string mess="Unloaded image in file ";
 423                 mess+=filename;
 424                 mess+="\n";
 425                 GimmickMessage(1,mess);
 426                                 ImageEventTypeMap::iterator i;
 427                 i = mImageEventMap.find(filename);
 428                 if (i!=mImageEventMap.end())
 429                 {
 430                 ImageEventType ie(i->second);
 431                 ie.image = image;
 432                 ie.pointerHolder->Set(GetDefaultImage());
 433                 //mImageEventMap.erase(i);
 434                 }
 435
 436         }
 437   }
 438
 439   //====================================================================
 440
 441   //====================================================================
 442   void GimmickView::ConnectValidationObserver(ValidationCallbackType callback)
 443   {
 444     mValidationSignal.connect(callback);
 445   }
 446
 447
 448 } // EO namespace creaImageIO
 449
 450