src2/creaImageIOSQLiteTreeHandler.cpp

   1 #include <creaImageIOSQLiteTreeHandler.h>
   2 #include <creaImageIOSystem.h>
   3
   4 #include "CppSQLite3.h"
   5
   6 #include <sys/stat.h>
   7
   8 //#include <creaImageIOSQLiteTreeHandlerStructure.h>
   9
  10 //#include <creaImageIOUtilities.h>
  11
  12 //#include <icons/database.xpm>
  13
  14 #include <deque>
  15
  16 #include "wx/wx.h"
  17 #include <wx/dir.h>
  18 #include <wx/filename.h>
  19
  20
  21 //#include <icons/close.xpm>
  22
  23 #include <creaWx.h>
  24 using namespace crea;
  25
  26 #include <boost/filesystem.hpp>
  27 #include <boost/algorithm/string/replace.hpp>
  28
  29 namespace creaImageIO
  30 {
  31   using namespace tree;
  32
  33
  34   //=============================================================
  35   SQLiteTreeHandler::SQLiteTreeHandler(const std::string& filename)
  36     : mFileName(filename)
  37   {
  38     mDB = new CppSQLite3DB;
  39     GimmickMessage(1,"SQLite version : "
  40                    <<std::string(mDB->SQLiteVersion())<< std::endl);
  41   }
  42   //=============================================================
  43
  44   //=============================================================
  45   SQLiteTreeHandler::~SQLiteTreeHandler()
  46   {
  47     delete mDB;
  48   }
  49   //=============================================================
  50
  51
  52   //=============================================================
  53   //  void SQLiteTreeHandler::Print() const
  54   //  {
  55     /*
  56     std::cout << "-> '"<<GetName()<< "' - '"
  57               << GetFileName()<<"'"<<std::endl;
  58     ChildrenListType::const_iterator i;
  59     for (i=GetChildrenList().begin(); i!=GetChildrenList().end(); i++)
  60       {
  61         (*i)->Print();
  62       }
  63     */
  64   //  }
  65   //=============================================================
  66
  67   //=====================================================================
  68   /*
  69   bool SQLiteTreeHandler::LocationIsValid()
  70   {
  71     // TO DO
  72     return true;
  73   }
  74   */
  75   //=====================================================================
  76
  77
  78   //=====================================================================
  79   bool SQLiteTreeHandler::Open(bool writable)
  80   {
  81     //    std::cout << "***> SQLiteTreeHandler::Open('"<<GetFileName()<<"')"<<std::endl;
  82     SetWritable(writable);
  83     return DBOpen();
  84   }
  85
  86   //=====================================================================
  87   bool SQLiteTreeHandler::Create(bool writable)
  88   {
  89     //    std::cout << "***> SQLiteTreeHandler::New('"<<GetFileName()<<"')"<<std::endl;
  90     SetWritable(writable);
  91     return DBCreate();
  92   }
  93   //=====================================================================
  94
  95
  96   //=====================================================================
  97   bool SQLiteTreeHandler::Close()
  98   {
  99     return true;
 100   }
 101   //=====================================================================
 102
 103
 104   //=====================================================================
 105   bool SQLiteTreeHandler::Destroy()
 106   {
 107     return false;
 108   }
 109
 110   //=====================================================================
 111
 112   //=====================================================================
 113   int SQLiteTreeHandler::LoadChildren(tree::Node* parent, int maxlevel)
 114   {
 115     if (parent==0) parent = GetTree().GetTree();
 116     return DBLoadChildren(parent,maxlevel);
 117   }
 118   //=====================================================================
 119
 120
 121
 122
 123   //=====================================================================
 124   void SQLiteTreeHandler::UnLoad(tree::Node* n)
 125   {
 126   }
 127   //=====================================================================
 128
 129
 130   //=====================================================================
 131   int SQLiteTreeHandler::AddBranch( const AttributeMapType& attr )
 132   {
 133     tree::Node* parent = DBGetParent(attr);
 134     DBGraftToParent(parent,attr);
 135     return (parent->GetLevel()+1);
 136   }
 137   //=====================================================================
 138
 139
 140   //=====================================================================
 141    bool SQLiteTreeHandler::Remove(tree::Node* node)
 142    {
 143    DBRecursiveRemoveNode(node);
 144
 145     //    std::cout << "DELETE"<<std::endl;
 146     if (node->GetParent())
 147       {
 148         node->GetParent()->RemoveChildrenFromList(node);
 149       }
 150     delete node;
 151     //    std::cout << "DELETE OK"<<std::endl;
 152     return true;
 153    }
 154
 155     //========================================================================
 156
 157
 158
 159   //=====================================================================
 160
 161   //=====================================================================
 162   /// Sets an attribute of a Node
 163   bool SQLiteTreeHandler::SetAttribute(tree::Node* n,
 164                                        const std::string& key,
 165                                        const std::string& value)
 166   {
 167     if (n==0) n=GetTree().GetTree();
 168     return DBSetAttribute(n,key,value);
 169   }
 170   //=====================================================================
 171
 172
 173
 174
 175
 176
 177
 178
 179
 180
 181
 182
 183
 184   //=====================================================================
 185   // SQLite DB specific methods
 186   //=====================================================================
 187
 188
 189
 190
 191   //=====================================================================
 192   char* format_sql(const std::string& s)
 193   {
 194     return sqlite3_mprintf("%q",s.c_str());
 195   }
 196   //=====================================================================
 197
 198   //  sqlite3_exec(db, zSQL, 0, 0, 0);
 199   //  sqlite3_free(zSQL);
 200   //    char* CHAIN = format_sql(QUER);         \
 201 //  sqlite3_free(CHAIN);                                \
 202
 203   //=====================================================================
 204 #define QUERYDB(QUER,RES)                                               \
 205     try                                                                 \
 206       {                                                                 \
 207         GimmickMessage(2,"SQL query: '"<<QUER<<"'"<<std::endl);         \
 208         RES = mDB->execQuery(QUER.c_str());                             \
 209       }                                                                 \
 210     catch (CppSQLite3Exception& e)                                      \
 211       {                                                                 \
 212         GimmickError("SQLite query '"<<QUER<<"' : "                     \
 213                      << e.errorCode() << ":"                            \
 214                      << e.errorMessage() );                             \
 215       }                                                                 \
 216
 217   //=====================================================================
 218
 219   //=====================================================================
 220 #define UPDATEDB(UP)                                                    \
 221   try                                                                   \
 222     {                                                                   \
 223       GimmickMessage(2,"SQL update: '"<<UP<<"'"<<std::endl);            \
 224       mDB->execDML(UP.c_str());                                         \
 225     }                                                                   \
 226   catch (CppSQLite3Exception& e)                                        \
 227     {                                                                   \
 228       GimmickError("SQLite update '"<<UP<<"' Error : "                  \
 229                    << e.errorCode() << ":"                              \
 230                    << e.errorMessage() );                               \
 231     }
 232   //=====================================================================
 233
 234
 235   //=====================================================================
 236   bool SQLiteTreeHandler::DBOpen()
 237   {
 238     GimmickMessage(1,"Opening SQLite database '"<<GetFileName()
 239                    <<"' ... "<<std::endl);
 240     // OPENING FILE
 241     if (!boost::filesystem::exists(GetFileName()))
 242       {
 243         return false;
 244       }
 245
 246     try
 247       {
 248         mDB->open(GetFileName().c_str());
 249       }
 250     catch (CppSQLite3Exception& e)
 251       {
 252         GimmickError("Opening '"<<GetFileName()<<"' : "
 253                      << e.errorCode() << ":"
 254                      << e.errorMessage());
 255         return false;
 256       }
 257     // IMPORT TREE DESCRIPTION (AND TEST DB VALIDITY)
 258     if (!DBImportTreeDescription())
 259       {
 260         return false;
 261       }
 262
 263     GimmickDebugMessage(1,"Opening SQLite database '"<<GetFileName()
 264                    <<"' ... OK"<<std::endl);
 265     return true;
 266   }
 267   //=====================================================================
 268
 269   //=====================================================================
 270   bool SQLiteTreeHandler::DBCreate()
 271   {
 272     GimmickMessage(1,"Creating SQLite database '"<<GetFileName()
 273                    <<"' ... "<<std::endl);
 274
 275     if (boost::filesystem::exists(GetFileName()))
 276       {
 277         GimmickError(GetFileName()<<"' : "
 278                      << "file already exists");
 279         return false;
 280       }
 281
 282     // OPENING
 283     try
 284       {
 285         mDB->open(GetFileName().c_str());
 286       }
 287     catch (CppSQLite3Exception& e)
 288       {
 289         GimmickError(e.errorCode() << ":"
 290                      << e.errorMessage() <<std::endl);
 291         return false;
 292       }
 293
 294
 295     // CREATING TABLES
 296
 297     std::string command;
 298     // Create LEVELS table
 299     command = "create table LEVELS\n";
 300     command += "( Name text )\n";
 301     UPDATEDB(command);
 302
 303     // Iterate the Levels
 304     for (int l=0; l<GetTree().GetNumberOfLevels(); ++l)
 305       {
 306         command = "INSERT INTO LEVELS (Name) VALUES ('";
 307         command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
 308         command += "')";
 309         UPDATEDB(command);
 310
 311         // Create table of level (for level>0, i.e. not Root)
 312         if (l>=0)
 313           {
 314             command = "CREATE TABLE ";
 315             command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
 316             command += "\n(\nID INTEGER PRIMARY KEY";
 317             if (l>1)
 318               {
 319                 command += ",\nPARENT_ID int not null";
 320               }
 321             SQLAppendAttributesDefinition(l,command);
 322             if (l>1)
 323               {
 324                 command += ",\nconstraint FK_PARENT foreign key (PARENT_ID) references ";
 325                 command += GetTree().GetLevelDescriptor(l-1).GetName();
 326                 command += "(ID) on delete restrict on update restrict";
 327               }
 328             command += "\n)";
 329             UPDATEDB(command);
 330
 331
 332             // Add Attribute 'ID' to Description
 333             GetTree().GetDescriptor().Add
 334               (AttributeDescriptor( "ID",
 335                                     "Database Identifier",
 336                                     0,0,
 337                                     AttributeDescriptor::PRIVATE
 338                                     ),l);
 339
 340             if (l>1)
 341               {
 342                 // Add Attribute 'PARENT_ID' to Description
 343                 GetTree().GetDescriptor().Add
 344                   (AttributeDescriptor( "PARENT_ID",
 345                                         "Database Parent Identifier",
 346                                         0,0,
 347                                         AttributeDescriptor::PRIVATE
 348                                         ),l);
 349               }
 350
 351           }
 352
 353         // Create table *_ATTRIBUTES
 354
 355         command = "CREATE TABLE ";
 356         command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
 357         command += "_Attributes\n(\n";
 358         command += "Key text,\n";
 359         command += "Name text,\n";
 360         command += "DicomGroup int,\n";
 361         command += "DicomElement int,\n";
 362         command += "Flags int\n";
 363         command += "\n)";
 364         UPDATEDB(command);
 365
 366
 367         // Fill the table *_ATTRIBUTES
 368         LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator i;
 369         for (i  = GetTree().GetAttributeDescriptorList(l).begin();
 370              i != GetTree().GetAttributeDescriptorList(l).end();
 371              ++i)
 372           {
 373
 374             std::stringstream insert;
 375             insert << "INSERT INTO "
 376                    << GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName()
 377                    << "_Attributes (Key,Name,DicomGroup,DicomElement,Flags) "
 378                    << "VALUES ('"
 379                    << i->GetKey() << "','"
 380                    << i->GetName() << "',"
 381                    << i->GetGroup() << ","
 382                    << i->GetElement() << ","
 383                    << i->GetFlags() << ");";
 384
 385             UPDATEDB(insert.str());
 386           }
 387
 388       } // For l=0...
 389
 390     // Initialize the root attributes
 391     GetTree().InitializeAttributeMap();
 392     // Insert the root in the level 0 table
 393     DBInsert(GetTree().GetTree());
 394
 395
 396     GetTree().SetChildrenLoaded(true);
 397     GimmickMessage(1,"Creating SQLite database '"<<GetFileName()
 398                    <<"' ... OK"<<std::endl);
 399     return true;
 400   }
 401   //=====================================================================
 402
 403   //=====================================================================
 404   void SQLiteTreeHandler::SQLAppendAttributesDefinition(int level,
 405                                                         std::string& s)
 406   {
 407     LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator i;
 408     for (i  = GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).begin();
 409          i != GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).end();
 410          ++i)
 411       {
 412         //      if (i->second.flags==1) continue;
 413         s += ",\n";
 414         s += i->GetKey();
 415         s += " text";
 416       }
 417   }
 418   //=====================================================================
 419
 420
 421   //=====================================================================
 422   bool SQLiteTreeHandler::DBImportTreeDescription()
 423   {
 424     GimmickMessage(1,"Importing tree description from database ..."
 425                    <<std::endl);
 426
 427     // Test table 'LEVELS' existence
 428     if ( ! mDB->tableExists("LEVELS") )
 429       {
 430         GimmickMessage(1,"!! ERROR : Table 'LEVELS' does not exist"
 431                        <<std::endl);
 432         return false;
 433       }
 434
 435     tree::Descriptor& desc = GetTree().GetDescriptor();
 436     // clears the existing one
 437     desc.Clear();
 438
 439     int nblevel = 0;
 440     std::string query = "SELECT * FROM LEVELS";
 441     CppSQLite3Query q;
 442     QUERYDB(query,q);
 443
 444     while (!q.eof())
 445       {
 446         std::string name = q.getStringField(0);
 447         GimmickMessage(2," * Importing level '"<<name<<"'"<<std::endl);
 448         desc.Add(LevelDescriptor(name));
 449         nblevel++;
 450         q.nextRow();
 451       }
 452
 453     for (int level = 0; level < nblevel; ++level )
 454       {
 455         std::string table = GetTree().GetLevelDescriptor(level).GetName();
 456         table += "_Attributes";
 457         // Test table 'LEVELS' existence
 458         if ( ! mDB->tableExists(table.c_str()) )
 459           {
 460             GimmickMessage(1,"!! ERROR : Table '"<<table<<"' does not exist"
 461                            <<std::endl);
 462             return false;
 463           }
 464
 465         std::string query = "SELECT * FROM ";
 466         query += table;
 467         CppSQLite3Query q;
 468         QUERYDB(query,q);
 469
 470         GimmickMessage(2," * Level '"
 471                        <<GetTree().GetLevelDescriptor(level).GetName()
 472                        <<"'"<<std::endl);
 473
 474         // Test that ID and PARENT_ID mandatory attributes exist
 475         bool ID_found = false;
 476         bool PARENT_ID_found = false;
 477         if (level==0) ID_found = true;
 478         if (level<=1) PARENT_ID_found = true;
 479
 480         while (!q.eof())
 481           {
 482             std::string key(q.getStringField(0));
 483             std::string name(q.getStringField(1));
 484             GimmickMessage(2,"  - Importing attribute '"<<key<<"' '"<<name
 485                            <<"'"<<std::endl);
 486             desc.Add
 487               (AttributeDescriptor( key, // Key
 488                                     name, // Name
 489                                     q.getIntField(2), // Group
 490                                     q.getIntField(3), // Element
 491                                     q.getIntField(4) // Flags
 492                                     ),level);
 493             if ( key == "ID" )
 494               {
 495                 ID_found = true;
 496               }
 497             if ( key == "PARENT_ID" )
 498               {
 499                 PARENT_ID_found = true;
 500               }
 501             q.nextRow();
 502           }
 503
 504         if ( ! (ID_found || PARENT_ID_found ) )
 505           {
 506             GimmickMessage(1,"!! ERROR : Table '"<<table
 507                            <<"' does not contain mandatory attribute ID or PARENT_ID"
 508                            <<std::endl);
 509             return false;
 510
 511           }
 512       }
 513
 514
 515     // Create the attributes table for Root (i.e. Tree)
 516     LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator a;
 517     for (a = GetTree().GetAttributeDescriptorList(0).begin();
 518          a!= GetTree().GetAttributeDescriptorList(0).end();
 519          ++a)
 520       {
 521         /*
 522         std::string v;
 523         AttributeMapType::const_iterator i = attr.find(a->GetKey());
 524         if ( i != attr.end() )
 525           {
 526             v = i->second;
 527           }
 528         */
 529         GetTree().UnsafeSetAttribute( a->GetKey(), "" );
 530       }
 531
 532     // Reading Root attributes
 533     // Query DB
 534     query = "SELECT * FROM ";
 535     query += GetTree().GetLevelDescriptor(0).GetName();
 536     QUERYDB(query,q);
 537
 538     for (int fld = 0; fld < q.numFields(); fld++)
 539       {
 540         GetTree().UnsafeSetAttribute(q.fieldName(fld),
 541                                      q.getStringField(fld));
 542       }
 543
 544     GimmickMessage(1,"Importing tree description from database ... OK"
 545                    <<std::endl);
 546     return true;
 547   }
 548   //=====================================================================
 549
 550
 551
 552
 553
 554
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 556
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 560
 561
 562
 563
 564
 565
 566   //========================================================================
 567   ///
 568   std::string& SQLformat(std::string& str)
 569   {
 570     // quote must be doubled
 571     boost::algorithm::replace_all(str,"'","''");
 572     // Found strange strings which contained NULL char INSIDE string
 573     int i,size=str.size();
 574     for (i=0;i<size;++i)
 575       {
 576         if (str[i]==0)
 577           {
 578             str = str.substr(0,i);
 579             break;
 580           }
 581       }
 582     //    if (i<str.size())
 583     return str;
 584   }
 585   //========================================================================
 586
 587   //=====================================================================
 588   void SQLiteTreeHandler::SQLAppendAttributesValues(tree::Node* n,
 589                                                     std::string& str)
 590   {
 591     GimmickMessage(4,"SQLAppendAttributesValues"<<std::endl);
 592     std::string atts="";
 593     std::string values="";
 594     tree::Node::AttributeMapType::iterator i;
 595     for (i =  n->GetAttributeMap().begin();
 596          i != n->GetAttributeMap().end();
 597          i++)
 598       {
 599         if (i->first=="ID")
 600           {
 601             continue;
 602           }
 603         //      std::cout << "("<<i->first<<","<<i->second<<")"<<std::endl;
 604         atts += "'" + i->first + "'";
 605         values += "'" + SQLformat(i->second) + "'";
 606         atts += ",";
 607         values += ",";
 608         GimmickMessage(4,"'"<<i->first<<"' = '"<<i->second<<"'"<<std::endl);
 609       }
 610     atts[atts.size()-1]=' ';
 611     values[values.size()-1]=' ';
 612
 613     str = "("+atts+") VALUES ("+values+")";
 614     GimmickMessage(4,"Result = '"<<str<<"'"<<std::endl);
 615   }
 616   //=====================================================================
 617
 618   //=====================================================================
 619   tree::Node* SQLiteTreeHandler::DBGetParent( const AttributeMapType& attr)
 620   {
 621     Node* parent = GetTree().GetTree();
 622     bool go_down;
 623     do
 624       {
 625         go_down = false;
 626         // Load the children of the current parent
 627         DBLoadChildren(parent);
 628         // Iterate the children
 629         tree::Node::ChildrenListType::const_iterator i;
 630         for (i = parent->GetChildrenList().begin();
 631              i!= parent->GetChildrenList().end();
 632              ++i)
 633           {
 634             if ( (*i)->Matches( attr ) )
 635               {
 636                 go_down = true;
 637                 parent = *i;
 638                 break;
 639               }
 640           }
 641       }
 642     while (go_down);
 643     return parent;
 644   }
 645   //=====================================================================
 646
 647
 648   //=====================================================================
 649   int SQLiteTreeHandler::DBLoadChildren(tree::Node* node,
 650                                         int numberoflevels)
 651   {
 652     if (node->GetLevel()+1 >= node->GetTree()->GetNumberOfLevels() )
 653       return 0;
 654
 655     GimmickMessage(2,"Loading children of '"<<node->GetLabel()
 656                    <<"'"<<std::endl);
 657
 658     int nbloaded = 0;
 659     // If children loaded we do not have to do it but we need to recurse
 660     // in order to load the children's children if necessary, and so on...
 661     if (node->GetChildrenLoaded())
 662       {
 663         // Iterate the children
 664         tree::Node::ChildrenListType::iterator i;
 665         for (i = node->GetChildrenList().begin();
 666              i!= node->GetChildrenList().end();
 667              ++i)
 668           {
 669             nbloaded += DBLoadChildren(*i,numberoflevels-1);
 670           }
 671         return nbloaded;
 672       }
 673
 674     /// If children not loaded : do it and recurse
 675
 676     // Query DB
 677     int level = node->GetLevel();
 678     std::string query = "SELECT * FROM ";
 679
 680     query += GetTree().GetLevelDescriptor(level+1).GetName();
 681     if (level>0)
 682       {
 683         query += " WHERE PARENT_ID='" + node->UnsafeGetAttribute("ID")
 684           + "'";
 685       }
 686     CppSQLite3Query q;
 687     QUERYDB(query,q);
 688
 689     while (!q.eof())
 690       {
 691         nbloaded++;
 692         Node* n = new Node(node);
 693         for (int fld = 0; fld < q.numFields(); fld++)
 694           {
 695             n->UnsafeSetAttribute(q.fieldName(fld),q.getStringField(fld));
 696           }
 697         /*
 698         // Index
 699         TypeId ti;
 700         ti.type = type;
 701         ti.id = n->GetFieldValue("ID");
 702         mTypeIdToNodeMap[ti] = n;
 703         */
 704         // recurse
 705         if ( numberoflevels != 1 )
 706           {
 707             //  msw[2].Pause();
 708             nbloaded += DBLoadChildren(n, numberoflevels-1);
 709             //      msw[2].Resume();
 710           }
 711         // next entry in db
 712         q.nextRow();
 713       }
 714
 715     node->SetChildrenLoaded(true);
 716
 717     //    msw[2].Pause();
 718     return nbloaded;
 719   }
 720   //=====================================================================
 721
 722   //======================================================================
 723   void SQLiteTreeHandler::DBInsert(tree::Node* n)
 724   {
 725     GimmickMessage(2,"Inserting in DB '"<<n->GetLabel()
 726                    <<"'"<<std::endl);
 727     std::string val;
 728     SQLAppendAttributesValues(n,val);
 729     std::string insert("INSERT INTO ");
 730     insert += GetTree().GetLevelDescriptor(n->GetLevel()).GetName();
 731     insert += " " + val + ";";
 732
 733     UPDATEDB(insert);
 734
 735     // Store DB id of newly created node;
 736     long lastrow = mDB->lastRowId();
 737     std::stringstream ri;
 738     ri << mDB->lastRowId();
 739     n->SetAttribute("ID",ri.str());
 740   }
 741   //======================================================================
 742
 743   //======================================================================
 744   /// Graft the branch defined by the attributes to the parent
 745   void SQLiteTreeHandler::DBGraftToParent( tree::Node* parent,
 746                                             const AttributeMapType& attr)
 747   {
 748     GimmickMessage(2,"Grafting to parent '"<<parent->GetLabel()
 749                    <<"'"<<std::endl);
 750
 751     for (int level = parent->GetLevel()+1;
 752          level < GetTree().GetNumberOfLevels();
 753          level++)
 754       {
 755         // Create Node
 756         tree::Node* child = new tree::Node(parent,attr);
 757
 758         // Set PARENT_ID if necessary
 759         if ( parent->GetLevel()>0 )
 760           child->SetAttribute("PARENT_ID",parent->GetAttribute("ID"));
 761
 762         // Insert in DB
 763         DBInsert(child);
 764         /*
 765         std::string val;
 766         SQLAppendAttributesValues(child,val);
 767         std::string insert("INSERT INTO ");
 768         insert += GetTree().GetLevelDescriptor(child->GetLevel()).GetName();
 769         insert += " " + val + ";";
 770         UPDATEDB(insert);
 771
 772         // Store DB id of newly created node;
 773         long lastrow = mDB->lastRowId();
 774         std::stringstream ri;
 775         ri << mDB->lastRowId();
 776         child->SetAttribute("ID",ri.str());
 777         */
 778         // Down one level
 779         parent = child;
 780
 781         /*
 782         // Insert in TypeId map
 783         TypeId ti;
 784         ti.type = node->GetType();
 785         ti.id = node_id;
 786         mTypeIdToNodeMap[ti] = node;
 787         //    std::cout << "== Insert TypeId ("<<ti.type<<","<<ti.id<<")"<<std::endl;
 788         //
 789         msw[2].Pause();
 790
 791         if (node->GetType()==Node::Patient) summary.added_patients++;
 792         if (node->GetType()==Node::Study) summary.added_studies++;
 793         if (node->GetType()==Node::Series) summary.added_series++;
 794         if (node->GetType()==Node::Image) summary.added_images++;
 795         */
 796       }
 797   }
 798   //======================================================================
 799
 800
 801   //=====================================================================
 802   /// Sets an attribute of a Node
 803   bool SQLiteTreeHandler::DBSetAttribute(tree::Node* n,
 804                                          const std::string& key,
 805                                          const std::string& value)
 806   {
 807     GimmickMessage(3,"Setting Attribute of '"<<n->GetLabel()<<
 808                    "' "<<key<<"='"<<value<<"'"<<std::endl);
 809
 810     n->SetAttribute(key,value);
 811     std::string sql = "UPDATE ";
 812     sql += GetTree().GetLevelDescriptor(n->GetLevel()).GetName();
 813     sql += " SET ";
 814     sql += key;
 815     sql += "='";
 816     sql += value;
 817     sql += "' WHERE ID=";
 818     sql += n->GetAttribute("ID");
 819     //    sql += " LIMIT 1";
 820     UPDATEDB(sql);
 821   }
 822   //=====================================================================
 823
 824
 825   //=====================================================================
 826   void SQLiteTreeHandler::DBRecursiveRemoveNode(Node* node)
 827   {
 828
 829     std::string query = "DELETE FROM ";
 830
 831     query += GetTree().GetLevelDescriptor(node->GetLevel()).GetName();
 832     query += " WHERE ID='"+ node->GetAttribute("ID") + "';";
 833
 834     UPDATEDB(query);
 835         GimmickDebugMessage(2,
 836                             " Deleting '"
 837                                 <<node->GetLabel()<<"' with ID '"
 838                             <<node->GetAttribute("ID")
 839                             <<"' in level "<< GetTree().GetLevelDescriptor(node->GetLevel()).GetName()
 840                             <<std::endl);
 841
 842     Node::ChildrenListType::iterator i;
 843     for (i  = node->GetChildrenList().begin();
 844          i != node->GetChildrenList().end();
 845          i++)
 846       {
 847         DBRecursiveRemoveNode((*i));
 848       }
 849   }
 850
 851   //=====================================================================
 852
 853   //=====================================================================
 854   unsigned int SQLiteTreeHandler::GetNumberOfChildren(tree::Node* n)
 855   {
 856           // Query DB
 857         int nb=0;
 858     int level = n->GetLevel();
 859         if(GetTree().GetNumberOfLevels()!=(level+1))
 860         {
 861         std::string query = "SELECT * FROM ";
 862     query += GetTree().GetLevelDescriptor(level+1).GetName();
 863     if (level>0)
 864       {
 865         query += " WHERE PARENT_ID='" + n->UnsafeGetAttribute("ID")
 866           + "'";
 867       }
 868
 869     CppSQLite3Query q;
 870     QUERYDB(query,q);
 871
 872
 873                 while (!q.eof())
 874                 {
 875                         nb++;
 876                         q.nextRow();
 877                 }
 878         }
 879     return nb;
 880   }
 881
 882   /*
 883   //=====================================================================
 884   bool SQLiteTreeHandler::DBInsert(Node* alien_node,
 885                                    UpdateSummary& summary)
 886   {
 887     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::Insert('"<<alien_node->GetLabel()
 888     //        <<"')"<<std::endl;
 889
 890     //    if (!ChildrenLoaded()) DBLoadChildren(this,Node::Database);
 891
 892     // Find parent
 893     Node* parent;
 894     std::string parent_id;
 895     parent = DBGetOrCreateParent(alien_node,parent_id,summary);
 896
 897     // Insert
 898     DBRecursiveGetOrCreateNode(alien_node,parent,parent_id,summary);
 899    return true;
 900   }
 901   //=====================================================================
 902
 903
 904   //=====================================================================
 905   Node* SQLiteTreeHandler::DBGetOrCreateParent(Node* alien_node,
 906                                                 std::string& parent_id,
 907                                                 UpdateSummary& summary)
 908   {
 909     //    std::cout << "DBGetOrCreateParent '" << alien_node->GetLabel()<<"'"
 910     //        << std::endl;
 911     // Load the patients if not already done
 912     DBLoadChildren(this,Node::Patient);
 913
 914     parent_id = "";
 915     Node* parent = this;
 916
 917     // The chain of ancestors
 918     std::deque<Node*> chain;
 919     Node* cur = alien_node->GetParent();
 920     for (int type=Node::Patient;
 921          type<alien_node->GetType();++type)
 922       {
 923         chain.push_front(cur);
 924         cur = cur->GetParent();
 925       }
 926
 927     // create the nodes if do not exist
 928     std::deque<Node*>::iterator i;
 929     for (i=chain.begin();i!=chain.end();++i)
 930       {
 931         //      std::cout << " cur = '"<<(*i)->GetLabel()<<"'"<<std::endl;
 932         //      std::string cur_id = DBGetNodeId(*i,parent_id);
 933         //      if (cur_id.size()==0)
 934         //        {
 935         // Node does not exist : create it
 936         std::string cur_id;
 937         parent = DBGetOrCreateNode(*i,
 938                                         parent,
 939                                         parent_id,
 940                                         cur_id,
 941                                         summary
 942                                         );
 943         DBLoadChildren(parent,parent->GetType()+1);
 944
 945         parent_id = cur_id;
 946       }
 947     return parent;
 948   }
 949   //=====================================================================
 950
 951
 952
 953   //=====================================================================
 954   void SQLiteTreeHandler::DBRecursiveGetOrCreateNode(Node* alien_node,
 955                                                       Node* parent,
 956                                                       const std::string& parent_id,
 957                                                       UpdateSummary& summary)
 958   {
 959     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::RecursiveGetOrCreateNode('"
 960     //        <<alien_node->GetLabel()
 961     //        <<"','"<<parent<<"','"<<parent_id<<"')"<<std::endl;
 962     if (parent != 0)
 963       {
 964         //      std::cout << " -- Parent = '"<<parent->GetLabel()<<"'"<<std::endl;
 965       }
 966     std::string new_id;
 967     Node* new_node = DBGetOrCreateNode(alien_node,
 968                                                  parent,
 969                                                  parent_id,
 970                                                  new_id,
 971                                                  summary);
 972     Node::ChildrenListType::iterator i;
 973     for (i  = alien_node->GetChildrenList().begin();
 974          i != alien_node->GetChildrenList().end();
 975          i++)
 976       {
 977         DBRecursiveGetOrCreateNode((*i),new_node,new_id,summary);
 978       }
 979   }
 980   //=====================================================================
 981
 982
 983   //=====================================================================
 984   Node* SQLiteTreeHandler::DBGetOrCreateNode(Node* alien_node,
 985                                                    Node* internal_parent,
 986                                                    std::string parent_id,
 987                                                    std::string& node_id,
 988                                                    UpdateSummary& summary)
 989   {
 990     //   std::cout << "DBGetOrCreateNode('"<<alien_node->GetLabel()<<"','"
 991     //        << internal_parent << "','"<< parent_id<<"')"<<std::endl;
 992     if (internal_parent != 0)
 993       {
 994         //      std::cout << " -- Parent = '"<<internal_parent->GetLabel()<<"'"<<std::endl;
 995       }
 996     // Node Exists ? return it
 997     // First try among children of internal parent
 998     Node* node = GetChildrenLike(internal_parent,alien_node);
 999     if (node>0)
1000       {
1001         node_id = node->UnsafeGetFieldValue("ID");
1002         return node;
1003       }
1004     // Second : try in DB
1005
1006     // Does not exist : Create new one
1007     node = new Node(alien_node->GetType(),this,internal_parent);
1008     node->SetChildrenLoaded(true);
1009     // Copy fields values from alien
1010     Node::FieldValueMapType::iterator i,j;
1011     for (i =  node->GetFieldValueMap().begin();
1012          i != node->GetFieldValueMap().end();
1013          i++)
1014       {
1015         j = alien_node->GetFieldValueMap().find(i->first);
1016         if (j != alien_node->GetFieldValueMap().end() )
1017           {
1018             i->second = j->second;
1019           }
1020       }
1021
1022     msw[2].Resume();
1023     if (node->GetType()!=Node::Patient)
1024       node->SetFieldValue("PARENT_ID",parent_id);
1025
1026     // Insert in DB
1027     std::string val;
1028     BuildSQLFieldsValues(node,val);
1029     std::string insert("INSERT INTO ");
1030     insert += std::string(SQLiteTreeHandlerStructure::Table(node->GetType()))
1031       + " " + val + ";";
1032     //    std::cout << "** SQL = '"<<insert<<"'"<<std::endl;
1033     UPDATEDB(insert);
1034     //    std::cout << "** SQL OK"<<std::endl;
1035
1036     // Store DB id of newly created node;
1037     long lastrow = mDB->lastRowId();
1038     std::stringstream ri;
1039     ri << mDB->lastRowId();
1040     node_id = ri.str();
1041     //    std::cout << "LastRowId='"<<mDB->lastRowId()<<"' vs '"<<created_id<<"'"<<std::endl;
1042
1043     node->SetFieldValue("ID",node_id);
1044     // Insert in TypeId map
1045     TypeId ti;
1046     ti.type = node->GetType();
1047     ti.id = node_id;
1048     mTypeIdToNodeMap[ti] = node;
1049     //    std::cout << "== Insert TypeId ("<<ti.type<<","<<ti.id<<")"<<std::endl;
1050     //
1051     msw[2].Pause();
1052
1053     if (node->GetType()==Node::Patient) summary.added_patients++;
1054     if (node->GetType()==Node::Study) summary.added_studies++;
1055     if (node->GetType()==Node::Series) summary.added_series++;
1056     if (node->GetType()==Node::Image) summary.added_images++;
1057
1058     return node;
1059   }
1060   //=====================================================================
1061
1062   //=====================================================================
1063   Node* SQLiteTreeHandler::GetChildrenLike(Node* parent,
1064                                             Node* alien_node)
1065   {
1066     Node::ChildrenListType::iterator i;
1067     for (i  = parent->GetChildrenList().begin();
1068          i != parent->GetChildrenList().end();
1069          i++)
1070       {
1071         Node::Type type = alien_node->GetType();
1072         bool ok = true;
1073         for (int j=0;
1074              j<SQLiteTreeHandlerStructure::NbQueryFields(type);
1075              j++)
1076           {
1077             if (
1078                 alien_node->GetFieldValue(SQLiteTreeHandlerStructure::
1079                                     QueryField(type,j).key )   !=
1080                 (*i)->GetFieldValue(SQLiteTreeHandlerStructure::
1081                                     QueryField(type,j).key ) )
1082               {
1083                 ok = false;
1084                 break;
1085               }
1086           }
1087         if (ok)
1088           {
1089             return (*i);
1090           }
1091       }
1092     return 0;
1093   }
1094   //=====================================================================
1095
1096   //=====================================================================
1097   std::string SQLiteTreeHandler::DBGetNodeId(Node* node,
1098                                               const std::string& parent_id)
1099   {
1100     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::DBGetNodeId('"<<node->GetLabel()
1101     //        <<"','"<<parent_id<<"')"
1102     //        <<std::endl;
1103     msw[2].Resume();
1104     int type = node->GetType();
1105
1106     std::string table = SQLiteTreeHandlerStructure::Table(type);
1107     std::string where = "WHERE ";
1108
1109     if (type!=Node::Patient)
1110       {
1111         where += "PARENT_ID='" + parent_id
1112           //node->GetFieldValue("PARENT_ID")
1113           + "' AND ";
1114       }
1115
1116     for (int i=0;i<SQLiteTreeHandlerStructure::NbQueryFields(type);i++)
1117       {
1118         where += SQLiteTreeHandlerStructure::QueryField(type,i).key + "='"
1119           + node->GetFieldValue(SQLiteTreeHandlerStructure::QueryField(type,i).key) + "' ";
1120         if (i<SQLiteTreeHandlerStructure::NbQueryFields(type)-1)
1121           where += "AND ";
1122     }
1123
1124     std::string query = "SELECT ID FROM " + table + " " + where + ";";
1125     //    std::cout << "** SQL = '"<<query<<"'"<<std::endl;
1126     CppSQLite3Query q;
1127     QUERYDB(query,q);
1128
1129     if (!q.eof())
1130       {
1131
1132         //      std::cout << " - Node exists " << std::endl;
1133         std::string id = q.getStringField(0);
1134         //      std::cout << " id = '"<<id<<"'"<<std::endl;
1135         msw[2].Pause();
1136         return id;
1137       }
1138     msw[2].Pause();
1139     return "";
1140   }
1141   //=====================================================================
1142
1143
1144
1145   //=====================================================================
1146   Node* SQLiteTreeHandler::GetNodeFromTypeId(Node::Type type,
1147                                        const std::string& id)
1148   {
1149     //    std::cout << "GetNodeFromTypeId("<<type<<","<<id<<")"<<std::endl;
1150
1151     TypeId ti;
1152     ti.type = type;
1153     ti.id = id;
1154
1155     TypeIdToNodeMapType::iterator i = mTypeIdToNodeMap.find(ti);
1156     if (i == mTypeIdToNodeMap.end())
1157       {
1158
1159             std::cout << "Internal error : mTypeIdToNodeMap does not contain key"
1160                       << std::endl;
1161             creaError("Internal error : mTypeIdToNodeMap does not contain key");
1162             // }
1163       }
1164
1165     //    std::cout << " ** Node = "<<i->second<<std::endl;
1166     return i->second;
1167   }
1168
1169   //=====================================================================
1170
1171   //=====================================================================
1172   bool SQLiteTreeHandler::Remove(Node* node)
1173   {
1174
1175     //DBRecursiveRemoveNode(node);
1176
1177     //    std::cout << "DELETE"<<std::endl;
1178     if (node->GetParent())
1179       {
1180         node->GetParent()->RemoveChildrenFromList(node);
1181       }
1182     delete node;
1183     //    std::cout << "DELETE OK"<<std::endl;
1184     return true;
1185   }
1186
1187
1188   //========================================================================
1189
1190   //=====================================================================
1191   void SQLiteTreeHandler::DBRecursiveRemoveNode(Node* node)
1192   {
1193     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::DBRecursiveRemoveNode('"
1194     //        <<node->GetLabel()<<"')"<<std::endl;
1195
1196     std::string query = "DELETE FROM ";
1197     query += SQLiteTreeHandlerStructure::Table(node->GetType());
1198     query += " WHERE ID='"+ node->GetFieldValue("ID") + "';";
1199
1200     UPDATEDB(query);
1201
1202     Node::ChildrenListType::iterator i;
1203     for (i  = node->GetChildrenList().begin();
1204          i != node->GetChildrenList().end();
1205          i++)
1206       {
1207         DBRecursiveRemoveNode((*i));
1208       }
1209   }
1210
1211   //=====================================================================
1212
1213   //=====================================================================
1214   int SQLiteTreeHandler::DBQueryNumberOfChildren(Node* node)
1215   {
1216     std::string query = "SELECT COUNT (ID) FROM ";
1217     query += SQLiteTreeHandlerStructure::Table(node->GetType()+1);
1218     if (node->GetType() != Node::Database)
1219       {
1220         query += " WHERE PARENT_ID='"+ node->GetFieldValue("ID")+"'";
1221       }
1222     query  += ";";
1223
1224     //   std::cout << "**SQL = "<< query << std::endl;
1225
1226     CppSQLite3Query q;
1227     QUERYDB(query,q);
1228
1229      //    std::cout << "**RES = "<< q.getIntField(0) <<std::endl;
1230
1231     return q.getIntField(0);
1232   }
1233   //=====================================================================
1234
1235
1236
1237 */
1238
1239
1240
1241 } // namespace creaImageIO