src2/creaImageIOSQLiteTreeHandler.cpp

   1 #include <creaImageIOSQLiteTreeHandler.h>
   2 #include <creaImageIOSystem.h>
   3
   4 #include "CppSQLite3.h"
   5
   6 #include <sys/stat.h>
   7
   8 //#include <creaImageIOSQLiteTreeHandlerStructure.h>
   9
  10 //#include <creaImageIOUtilities.h>
  11
  12 //#include <icons/database.xpm>
  13
  14 #include <deque>
  15
  16 #include "wx/wx.h"
  17 #include <wx/dir.h>
  18 #include <wx/filename.h>
  19
  20
  21 //#include <icons/close.xpm>
  22
  23 #include <creaWx.h>
  24 using namespace crea;
  25
  26 #include <boost/filesystem.hpp>
  27 #include <boost/algorithm/string/replace.hpp>
  28
  29 namespace creaImageIO
  30 {
  31   using namespace tree;
  32
  33
  34   //=============================================================
  35   SQLiteTreeHandler::SQLiteTreeHandler(const std::string& filename)
  36     : mFileName(filename)
  37   {
  38     mDB = new CppSQLite3DB;
  39     GimmickMessage(1,"SQLite version : "
  40                    <<std::string(mDB->SQLiteVersion())<< std::endl);
  41   }
  42   //=============================================================
  43
  44   //=============================================================
  45   SQLiteTreeHandler::~SQLiteTreeHandler()
  46   {
  47     delete mDB;
  48   }
  49   //=============================================================
  50
  51
  52   //=============================================================
  53   //  void SQLiteTreeHandler::Print() const
  54   //  {
  55     /*
  56     std::cout << "-> '"<<GetName()<< "' - '"
  57               << GetFileName()<<"'"<<std::endl;
  58     ChildrenListType::const_iterator i;
  59     for (i=GetChildrenList().begin(); i!=GetChildrenList().end(); i++)
  60       {
  61         (*i)->Print();
  62       }
  63     */
  64   //  }
  65   //=============================================================
  66
  67   //=====================================================================
  68   /*
  69   bool SQLiteTreeHandler::LocationIsValid()
  70   {
  71     // TO DO
  72     return true;
  73   }
  74   */
  75   //=====================================================================
  76
  77
  78   //=====================================================================
  79   bool SQLiteTreeHandler::Open(bool writable)
  80   {
  81     //    std::cout << "***> SQLiteTreeHandler::Open('"<<GetFileName()<<"')"<<std::endl;
  82     SetWritable(writable);
  83     return DBOpen();
  84   }
  85
  86   //=====================================================================
  87   bool SQLiteTreeHandler::Create(bool writable)
  88   {
  89     //    std::cout << "***> SQLiteTreeHandler::New('"<<GetFileName()<<"')"<<std::endl;
  90     SetWritable(writable);
  91     return DBCreate();
  92   }
  93   //=====================================================================
  94
  95
  96   //=====================================================================
  97   bool SQLiteTreeHandler::Close()
  98   {
  99     return true;
 100   }
 101   //=====================================================================
 102
 103
 104   //=====================================================================
 105   bool SQLiteTreeHandler::Destroy()
 106   {
 107     return false;
 108   }
 109   //=====================================================================
 110
 111   //=====================================================================
 112   unsigned int SQLiteTreeHandler::GetNumberOfChildren(tree::Node* n)
 113   {
 114     return 0;
 115   }
 116   //=====================================================================
 117
 118   //=====================================================================
 119   int SQLiteTreeHandler::LoadChildren(tree::Node* parent, int maxlevel)
 120   {
 121     if (parent==0) parent = GetTree().GetTree();
 122     return DBLoadChildren(parent,maxlevel);
 123   }
 124   //=====================================================================
 125
 126
 127
 128
 129   //=====================================================================
 130   void SQLiteTreeHandler::UnLoad(tree::Node* n)
 131   {
 132   }
 133   //=====================================================================
 134
 135
 136   //=====================================================================
 137   int SQLiteTreeHandler::AddBranch( const AttributeMapType& attr )
 138   {
 139     tree::Node* parent = DBGetParent(attr);
 140     DBGraftToParent(parent,attr);
 141     return (parent->GetLevel()+1);
 142   }
 143   //=====================================================================
 144
 145
 146   //=====================================================================
 147    bool SQLiteTreeHandler::Remove(tree::Node* node)
 148    {
 149    DBRecursiveRemoveNode(node);
 150
 151     //    std::cout << "DELETE"<<std::endl;
 152     if (node->GetParent())
 153       {
 154         node->GetParent()->RemoveChildrenFromList(node);
 155       }
 156     delete node;
 157     //    std::cout << "DELETE OK"<<std::endl;
 158     return true;
 159    }
 160
 161     //========================================================================
 162
 163
 164
 165   //=====================================================================
 166
 167   //=====================================================================
 168   /// Sets an attribute of a Node
 169   bool SQLiteTreeHandler::SetAttribute(tree::Node* n,
 170                                        const std::string& key,
 171                                        const std::string& value)
 172   {
 173     if (n==0) n=GetTree().GetTree();
 174     return DBSetAttribute(n,key,value);
 175   }
 176   //=====================================================================
 177
 178
 179
 180
 181
 182
 183
 184
 185
 186
 187
 188
 189
 190   //=====================================================================
 191   // SQLite DB specific methods
 192   //=====================================================================
 193
 194
 195
 196
 197   //=====================================================================
 198   char* format_sql(const std::string& s)
 199   {
 200     return sqlite3_mprintf("%q",s.c_str());
 201   }
 202   //=====================================================================
 203
 204   //  sqlite3_exec(db, zSQL, 0, 0, 0);
 205   //  sqlite3_free(zSQL);
 206   //    char* CHAIN = format_sql(QUER);         \
 207 //  sqlite3_free(CHAIN);                                \
 208
 209   //=====================================================================
 210 #define QUERYDB(QUER,RES)                                               \
 211     try                                                                 \
 212       {                                                                 \
 213         GimmickMessage(2,"SQL query: '"<<QUER<<"'"<<std::endl);         \
 214         RES = mDB->execQuery(QUER.c_str());                             \
 215       }                                                                 \
 216     catch (CppSQLite3Exception& e)                                      \
 217       {                                                                 \
 218         GimmickError("SQLite query '"<<QUER<<"' : "                     \
 219                      << e.errorCode() << ":"                            \
 220                      << e.errorMessage() );                             \
 221       }                                                                 \
 222
 223   //=====================================================================
 224
 225   //=====================================================================
 226 #define UPDATEDB(UP)                                                    \
 227   try                                                                   \
 228     {                                                                   \
 229       GimmickMessage(2,"SQL update: '"<<UP<<"'"<<std::endl);            \
 230       mDB->execDML(UP.c_str());                                         \
 231     }                                                                   \
 232   catch (CppSQLite3Exception& e)                                        \
 233     {                                                                   \
 234       GimmickError("SQLite update '"<<UP<<"' Error : "                  \
 235                    << e.errorCode() << ":"                              \
 236                    << e.errorMessage() );                               \
 237     }
 238   //=====================================================================
 239
 240
 241   //=====================================================================
 242   bool SQLiteTreeHandler::DBOpen()
 243   {
 244     GimmickMessage(1,"Opening SQLite database '"<<GetFileName()
 245                    <<"' ... "<<std::endl);
 246     // OPENING FILE
 247     if (!boost::filesystem::exists(GetFileName()))
 248       {
 249         return false;
 250       }
 251
 252     try
 253       {
 254         mDB->open(GetFileName().c_str());
 255       }
 256     catch (CppSQLite3Exception& e)
 257       {
 258         GimmickError("Opening '"<<GetFileName()<<"' : "
 259                      << e.errorCode() << ":"
 260                      << e.errorMessage());
 261         return false;
 262       }
 263     // IMPORT TREE DESCRIPTION (AND TEST DB VALIDITY)
 264     if (!DBImportTreeDescription())
 265       {
 266         return false;
 267       }
 268
 269     GimmickDebugMessage(1,"Opening SQLite database '"<<GetFileName()
 270                    <<"' ... OK"<<std::endl);
 271     return true;
 272   }
 273   //=====================================================================
 274
 275   //=====================================================================
 276   bool SQLiteTreeHandler::DBCreate()
 277   {
 278     GimmickMessage(1,"Creating SQLite database '"<<GetFileName()
 279                    <<"' ... "<<std::endl);
 280
 281     if (boost::filesystem::exists(GetFileName()))
 282       {
 283         GimmickError(GetFileName()<<"' : "
 284                      << "file already exists");
 285         return false;
 286       }
 287
 288     // OPENING
 289     try
 290       {
 291         mDB->open(GetFileName().c_str());
 292       }
 293     catch (CppSQLite3Exception& e)
 294       {
 295         GimmickError(e.errorCode() << ":"
 296                      << e.errorMessage() <<std::endl);
 297         return false;
 298       }
 299
 300
 301     // CREATING TABLES
 302
 303     std::string command;
 304     // Create LEVELS table
 305     command = "create table LEVELS\n";
 306     command += "( Name text )\n";
 307     UPDATEDB(command);
 308
 309     // Iterate the Levels
 310     for (int l=0; l<GetTree().GetNumberOfLevels(); ++l)
 311       {
 312         command = "INSERT INTO LEVELS (Name) VALUES ('";
 313         command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
 314         command += "')";
 315         UPDATEDB(command);
 316
 317         // Create table of level (for level>0, i.e. not Root)
 318         if (l>=0)
 319           {
 320             command = "CREATE TABLE ";
 321             command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
 322             command += "\n(\nID INTEGER PRIMARY KEY";
 323             if (l>1)
 324               {
 325                 command += ",\nPARENT_ID int not null";
 326               }
 327             SQLAppendAttributesDefinition(l,command);
 328             if (l>1)
 329               {
 330                 command += ",\nconstraint FK_PARENT foreign key (PARENT_ID) references ";
 331                 command += GetTree().GetLevelDescriptor(l-1).GetName();
 332                 command += "(ID) on delete restrict on update restrict";
 333               }
 334             command += "\n)";
 335             UPDATEDB(command);
 336
 337
 338             // Add Attribute 'ID' to Description
 339             GetTree().GetLevelDescriptor(l).Add
 340               (AttributeDescriptor( "ID",
 341                                     "Database Identifier",
 342                                     0,0,
 343                                     AttributeDescriptor::PRIVATE
 344                                     ));
 345
 346             if (l>1)
 347               {
 348                 // Add Attribute 'PARENT_ID' to Description
 349                 GetTree().GetLevelDescriptor(l).Add
 350                   (AttributeDescriptor( "PARENT_ID",
 351                                         "Database Parent Identifier",
 352                                         0,0,
 353                                         AttributeDescriptor::PRIVATE
 354                                         ));
 355               }
 356
 357           }
 358
 359         // Create table *_ATTRIBUTES
 360
 361         command = "CREATE TABLE ";
 362         command += GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName();
 363         command += "_Attributes\n(\n";
 364         command += "Key text,\n";
 365         command += "Name text,\n";
 366         command += "DicomGroup int,\n";
 367         command += "DicomElement int,\n";
 368         command += "Flags int\n";
 369         command += "\n)";
 370         UPDATEDB(command);
 371
 372
 373         // Fill the table *_ATTRIBUTES
 374         LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator i;
 375         for (i  = GetTree().GetAttributeDescriptorList(l).begin();
 376              i != GetTree().GetAttributeDescriptorList(l).end();
 377              ++i)
 378           {
 379
 380             std::stringstream insert;
 381             insert << "INSERT INTO "
 382                    << GetTree().GetLevelDescriptor(l).GetName()
 383                    << "_Attributes (Key,Name,DicomGroup,DicomElement,Flags) "
 384                    << "VALUES ('"
 385                    << i->GetKey() << "','"
 386                    << i->GetName() << "',"
 387                    << i->GetGroup() << ","
 388                    << i->GetElement() << ","
 389                    << i->GetFlags() << ");";
 390
 391             UPDATEDB(insert.str());
 392           }
 393
 394       } // For l=0...
 395
 396     // Initialize the root attributes
 397     GetTree().InitializeAttributeMap();
 398     // Insert the root in the level 0 table
 399     DBInsert(GetTree().GetTree());
 400
 401
 402     GetTree().SetChildrenLoaded(true);
 403     GimmickMessage(1,"Creating SQLite database '"<<GetFileName()
 404                    <<"' ... OK"<<std::endl);
 405     return true;
 406   }
 407   //=====================================================================
 408
 409   //=====================================================================
 410   void SQLiteTreeHandler::SQLAppendAttributesDefinition(int level,
 411                                                         std::string& s)
 412   {
 413     LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator i;
 414     for (i  = GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).begin();
 415          i != GetTree().GetAttributeDescriptorList(level).end();
 416          ++i)
 417       {
 418         //      if (i->second.flags==1) continue;
 419         s += ",\n";
 420         s += i->GetKey();
 421         s += " text";
 422       }
 423   }
 424   //=====================================================================
 425
 426
 427   //=====================================================================
 428   bool SQLiteTreeHandler::DBImportTreeDescription()
 429   {
 430     GimmickMessage(1,"Importing tree description from database ..."
 431                    <<std::endl);
 432
 433     // Test table 'LEVELS' existence
 434     if ( ! mDB->tableExists("LEVELS") )
 435       {
 436         GimmickMessage(1,"!! ERROR : Table 'LEVELS' does not exist"
 437                        <<std::endl);
 438         return false;
 439       }
 440
 441     tree::Descriptor& desc = GetTree().GetDescriptor();
 442     // clears the existing one
 443     desc.GetLevelDescriptorList().clear();
 444
 445     int nblevel = 0;
 446     std::string query = "SELECT * FROM LEVELS";
 447     CppSQLite3Query q;
 448     QUERYDB(query,q);
 449
 450     while (!q.eof())
 451       {
 452         std::string name = q.getStringField(0);
 453         GimmickMessage(2," * Importing level '"<<name<<"'"<<std::endl);
 454         desc.GetLevelDescriptorList().push_back(LevelDescriptor(name));
 455         nblevel++;
 456         q.nextRow();
 457       }
 458
 459     for (int level = 0; level < nblevel; ++level )
 460       {
 461         std::string table = GetTree().GetLevelDescriptor(level).GetName();
 462         table += "_Attributes";
 463         // Test table 'LEVELS' existence
 464         if ( ! mDB->tableExists(table.c_str()) )
 465           {
 466             GimmickMessage(1,"!! ERROR : Table '"<<table<<"' does not exist"
 467                            <<std::endl);
 468             return false;
 469           }
 470
 471         std::string query = "SELECT * FROM ";
 472         query += table;
 473         CppSQLite3Query q;
 474         QUERYDB(query,q);
 475
 476         GimmickMessage(2," * Level '"
 477                        <<GetTree().GetLevelDescriptor(level).GetName()
 478                        <<"'"<<std::endl);
 479
 480         // Test that ID and PARENT_ID mandatory attributes exist
 481         bool ID_found = false;
 482         bool PARENT_ID_found = false;
 483         if (level==0) ID_found = true;
 484         if (level<=1) PARENT_ID_found = true;
 485
 486         while (!q.eof())
 487           {
 488             std::string key(q.getStringField(0));
 489             std::string name(q.getStringField(1));
 490             GimmickMessage(2,"  - Importing attribute '"<<key<<"' '"<<name
 491                            <<"'"<<std::endl);
 492             desc.GetLevelDescriptor(level).Add
 493               (AttributeDescriptor( key, // Key
 494                                     name, // Name
 495                                     q.getIntField(2), // Group
 496                                     q.getIntField(3), // Element
 497                                     q.getIntField(4) // Flags
 498                                     ));
 499             if ( key == "ID" )
 500               {
 501                 ID_found = true;
 502               }
 503             if ( key == "PARENT_ID" )
 504               {
 505                 PARENT_ID_found = true;
 506               }
 507             q.nextRow();
 508           }
 509
 510         if ( ! (ID_found || PARENT_ID_found ) )
 511           {
 512             GimmickMessage(1,"!! ERROR : Table '"<<table
 513                            <<"' does not contain mandatory attribute ID or PARENT_ID"
 514                            <<std::endl);
 515             return false;
 516
 517           }
 518       }
 519
 520
 521     // Create the attributes table for Root (i.e. Tree)
 522     LevelDescriptor::AttributeDescriptorListType::const_iterator a;
 523     for (a = GetTree().GetAttributeDescriptorList(0).begin();
 524          a!= GetTree().GetAttributeDescriptorList(0).end();
 525          ++a)
 526       {
 527         /*
 528         std::string v;
 529         AttributeMapType::const_iterator i = attr.find(a->GetKey());
 530         if ( i != attr.end() )
 531           {
 532             v = i->second;
 533           }
 534         */
 535         GetTree().UnsafeSetAttribute( a->GetKey(), "" );
 536       }
 537
 538     // Reading Root attributes
 539     // Query DB
 540     query = "SELECT * FROM ";
 541     query += GetTree().GetLevelDescriptor(0).GetName();
 542     QUERYDB(query,q);
 543
 544     for (int fld = 0; fld < q.numFields(); fld++)
 545       {
 546         GetTree().UnsafeSetAttribute(q.fieldName(fld),
 547                                      q.getStringField(fld));
 548       }
 549
 550     GimmickMessage(1,"Importing tree description from database ... OK"
 551                    <<std::endl);
 552     return true;
 553   }
 554   //=====================================================================
 555
 556
 557
 558
 559
 560
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 562
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 564
 565
 566
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 568
 569
 570
 571
 572   //========================================================================
 573   ///
 574   std::string& SQLformat(std::string& str)
 575   {
 576     // quote must be doubled
 577     boost::algorithm::replace_all(str,"'","''");
 578     // Found strange strings which contained NULL char INSIDE string
 579     int i,size=str.size();
 580     for (i=0;i<size;++i)
 581       {
 582         if (str[i]==0)
 583           {
 584             str = str.substr(0,i);
 585             break;
 586           }
 587       }
 588     //    if (i<str.size())
 589     return str;
 590   }
 591   //========================================================================
 592
 593   //=====================================================================
 594   void SQLiteTreeHandler::SQLAppendAttributesValues(tree::Node* n,
 595                                                     std::string& str)
 596   {
 597     GimmickMessage(4,"SQLAppendAttributesValues"<<std::endl);
 598     std::string atts="";
 599     std::string values="";
 600     tree::Node::AttributeMapType::iterator i;
 601     for (i =  n->GetAttributeMap().begin();
 602          i != n->GetAttributeMap().end();
 603          i++)
 604       {
 605         if (i->first=="ID")
 606           {
 607             continue;
 608           }
 609         //      std::cout << "("<<i->first<<","<<i->second<<")"<<std::endl;
 610         atts += "'" + i->first + "'";
 611         values += "'" + SQLformat(i->second) + "'";
 612         atts += ",";
 613         values += ",";
 614         GimmickMessage(4,"'"<<i->first<<"' = '"<<i->second<<"'"<<std::endl);
 615       }
 616     atts[atts.size()-1]=' ';
 617     values[values.size()-1]=' ';
 618
 619     str = "("+atts+") VALUES ("+values+")";
 620     GimmickMessage(4,"Result = '"<<str<<"'"<<std::endl);
 621   }
 622   //=====================================================================
 623
 624   //=====================================================================
 625   tree::Node* SQLiteTreeHandler::DBGetParent( const AttributeMapType& attr)
 626   {
 627     Node* parent = GetTree().GetTree();
 628     bool go_down;
 629     do
 630       {
 631         go_down = false;
 632         // Load the children of the current parent
 633         DBLoadChildren(parent);
 634         // Iterate the children
 635         tree::Node::ChildrenListType::const_iterator i;
 636         for (i = parent->GetChildrenList().begin();
 637              i!= parent->GetChildrenList().end();
 638              ++i)
 639           {
 640             if ( (*i)->Matches( attr ) )
 641               {
 642                 go_down = true;
 643                 parent = *i;
 644                 break;
 645               }
 646           }
 647       }
 648     while (go_down);
 649     return parent;
 650   }
 651   //=====================================================================
 652
 653
 654   //=====================================================================
 655   int SQLiteTreeHandler::DBLoadChildren(tree::Node* node,
 656                                         int numberoflevels)
 657   {
 658     if (node->GetLevel()+1 >= node->GetTree()->GetNumberOfLevels() )
 659       return 0;
 660
 661     GimmickMessage(2,"Loading children of '"<<node->GetLabel()
 662                    <<"'"<<std::endl);
 663
 664     int nbloaded = 0;
 665     // If children loaded we do not have to do it but we need to recurse
 666     // in order to load the children's children if necessary, and so on...
 667     if (node->GetChildrenLoaded())
 668       {
 669         // Iterate the children
 670         tree::Node::ChildrenListType::iterator i;
 671         for (i = node->GetChildrenList().begin();
 672              i!= node->GetChildrenList().end();
 673              ++i)
 674           {
 675             nbloaded += DBLoadChildren(*i,numberoflevels-1);
 676           }
 677         return nbloaded;
 678       }
 679
 680     /// If children not loaded : do it and recurse
 681
 682     // Query DB
 683     int level = node->GetLevel();
 684     std::string query = "SELECT * FROM ";
 685     query += GetTree().GetLevelDescriptor(level+1).GetName();
 686     if (level>0)
 687       {
 688         query += " WHERE PARENT_ID='" + node->UnsafeGetAttribute("ID")
 689           + "'";
 690       }
 691     CppSQLite3Query q;
 692     QUERYDB(query,q);
 693
 694     while (!q.eof())
 695       {
 696         nbloaded++;
 697         Node* n = new Node(node);
 698         for (int fld = 0; fld < q.numFields(); fld++)
 699           {
 700             n->UnsafeSetAttribute(q.fieldName(fld),q.getStringField(fld));
 701           }
 702         /*
 703         // Index
 704         TypeId ti;
 705         ti.type = type;
 706         ti.id = n->GetFieldValue("ID");
 707         mTypeIdToNodeMap[ti] = n;
 708         */
 709         // recurse
 710         if ( numberoflevels != 1 )
 711           {
 712             //  msw[2].Pause();
 713             nbloaded += DBLoadChildren(n, numberoflevels-1);
 714             //      msw[2].Resume();
 715           }
 716         // next entry in db
 717         q.nextRow();
 718       }
 719
 720     node->SetChildrenLoaded(true);
 721
 722     //    msw[2].Pause();
 723     return nbloaded;
 724   }
 725   //=====================================================================
 726
 727   //======================================================================
 728   void SQLiteTreeHandler::DBInsert(tree::Node* n)
 729   {
 730     GimmickMessage(2,"Inserting in DB '"<<n->GetLabel()
 731                    <<"'"<<std::endl);
 732     std::string val;
 733     SQLAppendAttributesValues(n,val);
 734     std::string insert("INSERT INTO ");
 735     insert += GetTree().GetLevelDescriptor(n->GetLevel()).GetName();
 736     insert += " " + val + ";";
 737
 738     UPDATEDB(insert);
 739
 740     // Store DB id of newly created node;
 741     long lastrow = mDB->lastRowId();
 742     std::stringstream ri;
 743     ri << mDB->lastRowId();
 744     n->SetAttribute("ID",ri.str());
 745   }
 746   //======================================================================
 747
 748   //======================================================================
 749   /// Graft the branch defined by the attributes to the parent
 750   void SQLiteTreeHandler::DBGraftToParent( tree::Node* parent,
 751                                             const AttributeMapType& attr)
 752   {
 753     GimmickMessage(2,"Grafting to parent '"<<parent->GetLabel()
 754                    <<"'"<<std::endl);
 755
 756     for (int level = parent->GetLevel()+1;
 757          level < GetTree().GetNumberOfLevels();
 758          level++)
 759       {
 760         // Create Node
 761         tree::Node* child = new tree::Node(parent,attr);
 762
 763         // Set PARENT_ID if necessary
 764         if ( parent->GetLevel()>0 )
 765           child->SetAttribute("PARENT_ID",parent->GetAttribute("ID"));
 766
 767         // Insert in DB
 768         DBInsert(child);
 769         /*
 770         std::string val;
 771         SQLAppendAttributesValues(child,val);
 772         std::string insert("INSERT INTO ");
 773         insert += GetTree().GetLevelDescriptor(child->GetLevel()).GetName();
 774         insert += " " + val + ";";
 775         UPDATEDB(insert);
 776
 777         // Store DB id of newly created node;
 778         long lastrow = mDB->lastRowId();
 779         std::stringstream ri;
 780         ri << mDB->lastRowId();
 781         child->SetAttribute("ID",ri.str());
 782         */
 783         // Down one level
 784         parent = child;
 785
 786         /*
 787         // Insert in TypeId map
 788         TypeId ti;
 789         ti.type = node->GetType();
 790         ti.id = node_id;
 791         mTypeIdToNodeMap[ti] = node;
 792         //    std::cout << "== Insert TypeId ("<<ti.type<<","<<ti.id<<")"<<std::endl;
 793         //
 794         msw[2].Pause();
 795
 796         if (node->GetType()==Node::Patient) summary.added_patients++;
 797         if (node->GetType()==Node::Study) summary.added_studies++;
 798         if (node->GetType()==Node::Series) summary.added_series++;
 799         if (node->GetType()==Node::Image) summary.added_images++;
 800         */
 801       }
 802   }
 803   //======================================================================
 804
 805
 806   //=====================================================================
 807   /// Sets an attribute of a Node
 808   bool SQLiteTreeHandler::DBSetAttribute(tree::Node* n,
 809                                          const std::string& key,
 810                                          const std::string& value)
 811   {
 812     GimmickMessage(3,"Setting Attribute of '"<<n->GetLabel()<<
 813                    "' "<<key<<"='"<<value<<"'"<<std::endl);
 814
 815     n->SetAttribute(key,value);
 816     std::string sql = "UPDATE ";
 817     sql += GetTree().GetLevelDescriptor(n->GetLevel()).GetName();
 818     sql += " SET ";
 819     sql += key;
 820     sql += "='";
 821     sql += value;
 822     sql += "' WHERE ID=";
 823     sql += n->GetAttribute("ID");
 824     //    sql += " LIMIT 1";
 825     UPDATEDB(sql);
 826   }
 827   //=====================================================================
 828
 829
 830   //=====================================================================
 831   void SQLiteTreeHandler::DBRecursiveRemoveNode(Node* node)
 832   {
 833
 834     std::string query = "DELETE FROM ";
 835
 836     query += GetTree().GetLevelDescriptor(node->GetLevel()).GetName();
 837     query += " WHERE ID='"+ node->GetAttribute("ID") + "';";
 838
 839     UPDATEDB(query);
 840         GimmickDebugMessage(2,
 841                             " Deleting '"
 842                                 <<node->GetLabel()<<"' with ID '"
 843                             <<node->GetAttribute("ID")
 844                             <<"' in level "<< GetTree().GetLevelDescriptor(node->GetLevel()).GetName()
 845                             <<std::endl);
 846
 847     Node::ChildrenListType::iterator i;
 848     for (i  = node->GetChildrenList().begin();
 849          i != node->GetChildrenList().end();
 850          i++)
 851       {
 852         DBRecursiveRemoveNode((*i));
 853       }
 854   }
 855
 856   /*
 857   //=====================================================================
 858   bool SQLiteTreeHandler::DBInsert(Node* alien_node,
 859                                    UpdateSummary& summary)
 860   {
 861     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::Insert('"<<alien_node->GetLabel()
 862     //        <<"')"<<std::endl;
 863
 864     //    if (!ChildrenLoaded()) DBLoadChildren(this,Node::Database);
 865
 866     // Find parent
 867     Node* parent;
 868     std::string parent_id;
 869     parent = DBGetOrCreateParent(alien_node,parent_id,summary);
 870
 871     // Insert
 872     DBRecursiveGetOrCreateNode(alien_node,parent,parent_id,summary);
 873    return true;
 874   }
 875   //=====================================================================
 876
 877
 878   //=====================================================================
 879   Node* SQLiteTreeHandler::DBGetOrCreateParent(Node* alien_node,
 880                                                 std::string& parent_id,
 881                                                 UpdateSummary& summary)
 882   {
 883     //    std::cout << "DBGetOrCreateParent '" << alien_node->GetLabel()<<"'"
 884     //        << std::endl;
 885     // Load the patients if not already done
 886     DBLoadChildren(this,Node::Patient);
 887
 888     parent_id = "";
 889     Node* parent = this;
 890
 891     // The chain of ancestors
 892     std::deque<Node*> chain;
 893     Node* cur = alien_node->GetParent();
 894     for (int type=Node::Patient;
 895          type<alien_node->GetType();++type)
 896       {
 897         chain.push_front(cur);
 898         cur = cur->GetParent();
 899       }
 900
 901     // create the nodes if do not exist
 902     std::deque<Node*>::iterator i;
 903     for (i=chain.begin();i!=chain.end();++i)
 904       {
 905         //      std::cout << " cur = '"<<(*i)->GetLabel()<<"'"<<std::endl;
 906         //      std::string cur_id = DBGetNodeId(*i,parent_id);
 907         //      if (cur_id.size()==0)
 908         //        {
 909         // Node does not exist : create it
 910         std::string cur_id;
 911         parent = DBGetOrCreateNode(*i,
 912                                         parent,
 913                                         parent_id,
 914                                         cur_id,
 915                                         summary
 916                                         );
 917         DBLoadChildren(parent,parent->GetType()+1);
 918
 919         parent_id = cur_id;
 920       }
 921     return parent;
 922   }
 923   //=====================================================================
 924
 925
 926
 927   //=====================================================================
 928   void SQLiteTreeHandler::DBRecursiveGetOrCreateNode(Node* alien_node,
 929                                                       Node* parent,
 930                                                       const std::string& parent_id,
 931                                                       UpdateSummary& summary)
 932   {
 933     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::RecursiveGetOrCreateNode('"
 934     //        <<alien_node->GetLabel()
 935     //        <<"','"<<parent<<"','"<<parent_id<<"')"<<std::endl;
 936     if (parent != 0)
 937       {
 938         //      std::cout << " -- Parent = '"<<parent->GetLabel()<<"'"<<std::endl;
 939       }
 940     std::string new_id;
 941     Node* new_node = DBGetOrCreateNode(alien_node,
 942                                                  parent,
 943                                                  parent_id,
 944                                                  new_id,
 945                                                  summary);
 946     Node::ChildrenListType::iterator i;
 947     for (i  = alien_node->GetChildrenList().begin();
 948          i != alien_node->GetChildrenList().end();
 949          i++)
 950       {
 951         DBRecursiveGetOrCreateNode((*i),new_node,new_id,summary);
 952       }
 953   }
 954   //=====================================================================
 955
 956
 957   //=====================================================================
 958   Node* SQLiteTreeHandler::DBGetOrCreateNode(Node* alien_node,
 959                                                    Node* internal_parent,
 960                                                    std::string parent_id,
 961                                                    std::string& node_id,
 962                                                    UpdateSummary& summary)
 963   {
 964     //   std::cout << "DBGetOrCreateNode('"<<alien_node->GetLabel()<<"','"
 965     //        << internal_parent << "','"<< parent_id<<"')"<<std::endl;
 966     if (internal_parent != 0)
 967       {
 968         //      std::cout << " -- Parent = '"<<internal_parent->GetLabel()<<"'"<<std::endl;
 969       }
 970     // Node Exists ? return it
 971     // First try among children of internal parent
 972     Node* node = GetChildrenLike(internal_parent,alien_node);
 973     if (node>0)
 974       {
 975         node_id = node->UnsafeGetFieldValue("ID");
 976         return node;
 977       }
 978     // Second : try in DB
 979
 980     // Does not exist : Create new one
 981     node = new Node(alien_node->GetType(),this,internal_parent);
 982     node->SetChildrenLoaded(true);
 983     // Copy fields values from alien
 984     Node::FieldValueMapType::iterator i,j;
 985     for (i =  node->GetFieldValueMap().begin();
 986          i != node->GetFieldValueMap().end();
 987          i++)
 988       {
 989         j = alien_node->GetFieldValueMap().find(i->first);
 990         if (j != alien_node->GetFieldValueMap().end() )
 991           {
 992             i->second = j->second;
 993           }
 994       }
 995
 996     msw[2].Resume();
 997     if (node->GetType()!=Node::Patient)
 998       node->SetFieldValue("PARENT_ID",parent_id);
 999
1000     // Insert in DB
1001     std::string val;
1002     BuildSQLFieldsValues(node,val);
1003     std::string insert("INSERT INTO ");
1004     insert += std::string(SQLiteTreeHandlerStructure::Table(node->GetType()))
1005       + " " + val + ";";
1006     //    std::cout << "** SQL = '"<<insert<<"'"<<std::endl;
1007     UPDATEDB(insert);
1008     //    std::cout << "** SQL OK"<<std::endl;
1009
1010     // Store DB id of newly created node;
1011     long lastrow = mDB->lastRowId();
1012     std::stringstream ri;
1013     ri << mDB->lastRowId();
1014     node_id = ri.str();
1015     //    std::cout << "LastRowId='"<<mDB->lastRowId()<<"' vs '"<<created_id<<"'"<<std::endl;
1016
1017     node->SetFieldValue("ID",node_id);
1018     // Insert in TypeId map
1019     TypeId ti;
1020     ti.type = node->GetType();
1021     ti.id = node_id;
1022     mTypeIdToNodeMap[ti] = node;
1023     //    std::cout << "== Insert TypeId ("<<ti.type<<","<<ti.id<<")"<<std::endl;
1024     //
1025     msw[2].Pause();
1026
1027     if (node->GetType()==Node::Patient) summary.added_patients++;
1028     if (node->GetType()==Node::Study) summary.added_studies++;
1029     if (node->GetType()==Node::Series) summary.added_series++;
1030     if (node->GetType()==Node::Image) summary.added_images++;
1031
1032     return node;
1033   }
1034   //=====================================================================
1035
1036   //=====================================================================
1037   Node* SQLiteTreeHandler::GetChildrenLike(Node* parent,
1038                                             Node* alien_node)
1039   {
1040     Node::ChildrenListType::iterator i;
1041     for (i  = parent->GetChildrenList().begin();
1042          i != parent->GetChildrenList().end();
1043          i++)
1044       {
1045         Node::Type type = alien_node->GetType();
1046         bool ok = true;
1047         for (int j=0;
1048              j<SQLiteTreeHandlerStructure::NbQueryFields(type);
1049              j++)
1050           {
1051             if (
1052                 alien_node->GetFieldValue(SQLiteTreeHandlerStructure::
1053                                     QueryField(type,j).key )   !=
1054                 (*i)->GetFieldValue(SQLiteTreeHandlerStructure::
1055                                     QueryField(type,j).key ) )
1056               {
1057                 ok = false;
1058                 break;
1059               }
1060           }
1061         if (ok)
1062           {
1063             return (*i);
1064           }
1065       }
1066     return 0;
1067   }
1068   //=====================================================================
1069
1070   //=====================================================================
1071   std::string SQLiteTreeHandler::DBGetNodeId(Node* node,
1072                                               const std::string& parent_id)
1073   {
1074     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::DBGetNodeId('"<<node->GetLabel()
1075     //        <<"','"<<parent_id<<"')"
1076     //        <<std::endl;
1077     msw[2].Resume();
1078     int type = node->GetType();
1079
1080     std::string table = SQLiteTreeHandlerStructure::Table(type);
1081     std::string where = "WHERE ";
1082
1083     if (type!=Node::Patient)
1084       {
1085         where += "PARENT_ID='" + parent_id
1086           //node->GetFieldValue("PARENT_ID")
1087           + "' AND ";
1088       }
1089
1090     for (int i=0;i<SQLiteTreeHandlerStructure::NbQueryFields(type);i++)
1091       {
1092         where += SQLiteTreeHandlerStructure::QueryField(type,i).key + "='"
1093           + node->GetFieldValue(SQLiteTreeHandlerStructure::QueryField(type,i).key) + "' ";
1094         if (i<SQLiteTreeHandlerStructure::NbQueryFields(type)-1)
1095           where += "AND ";
1096     }
1097
1098     std::string query = "SELECT ID FROM " + table + " " + where + ";";
1099     //    std::cout << "** SQL = '"<<query<<"'"<<std::endl;
1100     CppSQLite3Query q;
1101     QUERYDB(query,q);
1102
1103     if (!q.eof())
1104       {
1105
1106         //      std::cout << " - Node exists " << std::endl;
1107         std::string id = q.getStringField(0);
1108         //      std::cout << " id = '"<<id<<"'"<<std::endl;
1109         msw[2].Pause();
1110         return id;
1111       }
1112     msw[2].Pause();
1113     return "";
1114   }
1115   //=====================================================================
1116
1117
1118
1119   //=====================================================================
1120   Node* SQLiteTreeHandler::GetNodeFromTypeId(Node::Type type,
1121                                        const std::string& id)
1122   {
1123     //    std::cout << "GetNodeFromTypeId("<<type<<","<<id<<")"<<std::endl;
1124
1125     TypeId ti;
1126     ti.type = type;
1127     ti.id = id;
1128
1129     TypeIdToNodeMapType::iterator i = mTypeIdToNodeMap.find(ti);
1130     if (i == mTypeIdToNodeMap.end())
1131       {
1132
1133             std::cout << "Internal error : mTypeIdToNodeMap does not contain key"
1134                       << std::endl;
1135             creaError("Internal error : mTypeIdToNodeMap does not contain key");
1136             // }
1137       }
1138
1139     //    std::cout << " ** Node = "<<i->second<<std::endl;
1140     return i->second;
1141   }
1142
1143   //=====================================================================
1144
1145   //=====================================================================
1146   bool SQLiteTreeHandler::Remove(Node* node)
1147   {
1148
1149     //DBRecursiveRemoveNode(node);
1150
1151     //    std::cout << "DELETE"<<std::endl;
1152     if (node->GetParent())
1153       {
1154         node->GetParent()->RemoveChildrenFromList(node);
1155       }
1156     delete node;
1157     //    std::cout << "DELETE OK"<<std::endl;
1158     return true;
1159   }
1160
1161
1162   //========================================================================
1163
1164   //=====================================================================
1165   void SQLiteTreeHandler::DBRecursiveRemoveNode(Node* node)
1166   {
1167     //    std::cout << "SQLiteTreeHandler::DBRecursiveRemoveNode('"
1168     //        <<node->GetLabel()<<"')"<<std::endl;
1169
1170     std::string query = "DELETE FROM ";
1171     query += SQLiteTreeHandlerStructure::Table(node->GetType());
1172     query += " WHERE ID='"+ node->GetFieldValue("ID") + "';";
1173
1174     UPDATEDB(query);
1175
1176     Node::ChildrenListType::iterator i;
1177     for (i  = node->GetChildrenList().begin();
1178          i != node->GetChildrenList().end();
1179          i++)
1180       {
1181         DBRecursiveRemoveNode((*i));
1182       }
1183   }
1184
1185   //=====================================================================
1186
1187   //=====================================================================
1188   int SQLiteTreeHandler::DBQueryNumberOfChildren(Node* node)
1189   {
1190     std::string query = "SELECT COUNT (ID) FROM ";
1191     query += SQLiteTreeHandlerStructure::Table(node->GetType()+1);
1192     if (node->GetType() != Node::Database)
1193       {
1194         query += " WHERE PARENT_ID='"+ node->GetFieldValue("ID")+"'";
1195       }
1196     query  += ";";
1197
1198     //   std::cout << "**SQL = "<< query << std::endl;
1199
1200     CppSQLite3Query q;
1201     QUERYDB(query,q);
1202
1203      //    std::cout << "**RES = "<< q.getIntField(0) <<std::endl;
1204
1205     return q.getIntField(0);
1206   }
1207   //=====================================================================
1208
1209
1210
1211 */
1212
1213
1214
1215 } // namespace creaImageIO