tools/clitkAffineTransform.ggo

   1 #File clitkAffineTransform.ggo
   2 package "clitkAffineTransform"
   3 version "1.0"
   4 purpose "Resample with or without affine transform of 2D, 3D, 4D images or vector fields"
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   6 option "config"         -       "Config file"                     string        no
   7 option "verbose"        v       "Verbose"                         flag          off
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   9 section "I/O"
  10 option "input"          i       "Input image filename"            string        yes
  11 option "output"         o       "Output image filename"           string        yes
  12 option "like"           l       "Resample output this image (size, spacing,origin)"     string  no
  13 option "transform_grid" -       "Apply affine transform to input grid for output's"     flag    off
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  15 section "Options"
  16 option "size"           -       "New output size if different from input"       int     no      multiple
  17 option "spacing"        -       "New output spacing if different from input"    double  no      multiple
  18 option "origin"         -       "New output origin if different from input"     double  no      multiple
  19 option "matrix"         m       "Affine matrix (homogene) filename"             string  no
  20 option "rotate"         r       "Rotation to apply (radians)"                   double  no      multiple
  21 option "translate"      t       "Translation to apply (mm)"                     double  no      multiple
  22 option "pad"            -       "Edge padding value"                            double  no      default="0.0"
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  24 section "Interpolation"
  25 option "interp"         -       "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"      int     no  default="1"
  26 option "interpOrder"    -       "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                        int     no  default="3"
  27 option "interpSF"       -       "Sampling factor if BLUT"                               int     no  default="20"
  28 option "interpVF"       -       "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"      int     no  default="1"
  29 option "interpVFOrder"  -       "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                        int     no  default="3"
  30 option "interpVFSF"     -       "Sampling factor if BLUT"                               int     no  default="20"
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