]> Creatis software - clitk.git/blob - tools/clitkAffineTransform.ggo
Update Landmark coordinates with transformation matrix
[clitk.git] / tools / clitkAffineTransform.ggo
1 #File clitkAffineTransform.ggo
2 package "clitkAffineTransform"
3 version "1.0"
4 purpose "Resample with or without affine transform of 2D, 3D, 4D images or vector fields"
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6 option "config"         - "Config file"                   string        no
7 option "verbose"        v "Verbose"                       flag          off
8
9 section "I/O"
10 option "input"          i "Input image filename"                                          string yes
11 option "output"         o "Output image filename"                                         string yes
12 option "like"           l "Resample output this image (size, spacing, origin, direction)" string no
13 option "transform_grid" - "Apply affine transform to input grid for output's"             flag   off
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15 section "Options"
16 option "size"           - "New output size if different from input"     int     no      multiple
17 option "spacing"        - "New output spacing if different from input"  double  no      multiple
18 option "spacinglike"    - "New output spacing like this image"          string  no
19 option "origin"         - "New output origin if different from input"   double  no      multiple
20 option "matrix"         m "Affine matrix (homogene) filename"           string  no
21 option "elastix"        e "Read EulerTransform from elastix output file (combine if multiple)"  string  no
22 option "rotate"         r "Rotation to apply (radians)"                 double  no      multiple
23 option "translate"      t "Translation to apply (mm)"                   double  no      multiple
24 option "pad"            - "Edge padding value"                          double  no      default="0.0"
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26 section "Interpolation"
27 option "interp"         - "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"    int     no  default="1"
28 option "interpOrder"    - "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                      int     no  default="3"
29 option "interpSF"       - "Sampling factor if BLUT"                             int     no  default="20"
30 option "interpVF"       - "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"    int     no  default="1"
31 option "interpVFOrder"  - "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                      int     no  default="3"
32 option "interpVFSF"     - "Sampling factor if BLUT"                             int     no  default="20"
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