tools/clitkDicomRT_ROI.cxx

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   2   Program:         vv http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3   Main authors :   XX XX XX
   4
   5   Authors belongs to:
   6   - University of LYON           http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center    http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory      http://www.creatis.insa-lyon.fr
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  10   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  12   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
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  15   - BSD       http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php
  16   - CeCILL-B  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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  18   =========================================================================*/
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  20 #include "clitkDicomRT_ROI.h"
  21 #include <vtkSmartPointer.h>
  22 #include <vtkAppendPolyData.h>
  23
  24 //--------------------------------------------------------------------
  25 clitk::DicomRT_ROI::DicomRT_ROI() {
  26   mName = "NoName";
  27   mNumber = -1;
  28   mColor.resize(3);
  29   mColor[0] = mColor[1] = mColor[2] = 0;
  30   mMeshIsUpToDate = false;
  31 }
  32 //--------------------------------------------------------------------
  33
  34
  35 //--------------------------------------------------------------------
  36 clitk::DicomRT_ROI::~DicomRT_ROI() {
  37
  38 }
  39 //--------------------------------------------------------------------
  40
  41
  42 //--------------------------------------------------------------------
  43 int clitk::DicomRT_ROI::GetROINumber() const {
  44   return mNumber;
  45 }
  46 //--------------------------------------------------------------------
  47
  48
  49 //--------------------------------------------------------------------
  50 const std::string & clitk::DicomRT_ROI::GetName() const {
  51   return mName;
  52 }
  53 //--------------------------------------------------------------------
  54
  55
  56 //--------------------------------------------------------------------
  57 const std::vector<double> & clitk::DicomRT_ROI::GetDisplayColor() const {
  58   return mColor;
  59 }
  60 //--------------------------------------------------------------------
  61
  62
  63
  64 //--------------------------------------------------------------------
  65 void clitk::DicomRT_ROI::Print(std::ostream & os) const {
  66   os << "ROI " << mNumber << "\t" << mName
  67      << "\t(" << mColor[0] << " " << mColor[1] << " " << mColor[2] << ")"
  68      << "\t Contours = " << mListOfContours.size() << std::endl;
  69 }
  70 //--------------------------------------------------------------------
  71
  72
  73 //--------------------------------------------------------------------
  74 void clitk::DicomRT_ROI::Read(std::map<int, std::string> & rois, gdcm::SQItem * item) {
  75
  76   // ROI number [Referenced ROI Number]
  77   mNumber = atoi(item->GetEntryValue(0x3006,0x0084).c_str());
  78
  79   // Retrieve ROI Name
  80   mName = rois[mNumber];
  81
  82   // ROI Color [ROI Display Color]
  83   mColor = clitk::parse_string<double>(item->GetEntryValue(0x3006,0x002a),'\\');
  84
  85   // Read contours [Contour Sequence]
  86   gdcm::SeqEntry * contours=item->GetSeqEntry(0x3006,0x0040);
  87   for(gdcm::SQItem* j=contours->GetFirstSQItem();j!=0;j=contours->GetNextSQItem()) {
  88     DicomRT_Contour * c = new DicomRT_Contour;
  89     bool b = c->Read(j);
  90     if (b) mListOfContours.push_back(c);
  91   }
  92 }
  93 //--------------------------------------------------------------------
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  95
  96 //--------------------------------------------------------------------
  97 vtkPolyData * clitk::DicomRT_ROI::GetMesh() {
  98   if (!mMeshIsUpToDate) {
  99     ComputeMesh();
 100   }
 101   return mMesh;
 102 }
 103 //--------------------------------------------------------------------
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 105
 106 //--------------------------------------------------------------------
 107 void clitk::DicomRT_ROI::ComputeMesh() {
 108   vtkAppendPolyData * append = vtkAppendPolyData::New();
 109   for(unsigned int i=0; i<mListOfContours.size(); i++) {
 110     append->AddInput(mListOfContours[i]->GetMesh());
 111   }
 112   append->Update();
 113   mMesh = append->GetOutput();
 114   mMeshIsUpToDate = true;
 115 }
 116 //--------------------------------------------------------------------
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