]> Creatis software - clitk.git/blob - tools/clitkElastixTransformToMatrix.cxx
Update Landmark coordinates with transformation matrix
[clitk.git] / tools / clitkElastixTransformToMatrix.cxx
1 /*=========================================================================
2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
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4   Authors belong to:
5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
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9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
12
13   It is distributed under dual licence
14
15   - BSD        See included LICENSE.txt file
16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
17 ===========================================================================**/
18
19 // clitk
20 #include "clitkElastixTransformToMatrix_ggo.h"
21 #include "clitkAffineTransformGenericFilter.h"
22 #include "clitkElastix.h"
23 #include "clitkMatrix.h"
24
25 //--------------------------------------------------------------------
26 int main(int argc, char * argv[])
27 {
28
29   // Init command line
30   GGO(clitkElastixTransformToMatrix, args_info);
31   CLITK_INIT;
32
33   // Use static fct of AffineTransformGenericFilter
34   std::string filename(args_info.input_arg);
35   itk::Matrix<double, 4, 4> m = clitk::createMatrixFromElastixFile<3>(filename,
36                                                                       args_info.verbose_flag);
37
38   // Print matrix
39   std::ofstream os;
40   clitk::openFileForWriting(os, args_info.output_arg);
41   os << clitk::Get4x4MatrixDoubleAsString(m, 16);
42   os.close();
43
44   return EXIT_SUCCESS;
45 }// end main
46
47 //--------------------------------------------------------------------