tools/clitkElastixTransformToMatrix.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18
  19 // clitk
  20 #include "clitkElastixTransformToMatrix_ggo.h"
  21 #include "clitkAffineTransformGenericFilter.h"
  22
  23 //--------------------------------------------------------------------
  24 int main(int argc, char * argv[])
  25 {
  26
  27   // Init command line
  28   GGO(clitkElastixTransformToMatrix, args_info);
  29   CLITK_INIT;
  30
  31   // Use static fct of AffineTransformGenericFilter
  32   typedef clitk::AffineTransformGenericFilter<args_info_clitkElastixTransformToMatrix> FilterType;
  33   std::vector<std::string> l;
  34   l.push_back(args_info.input_arg);
  35   itk::Matrix<double, 4, 4> m =
  36     FilterType::createMatrixFromElastixFile<3, int>(l, args_info.verbose_flag);
  37
  38   // Print matrix
  39   std::ofstream os;
  40   clitk::openFileForWriting(os, args_info.output_arg);
  41   for(unsigned int i=0; i<4; i++) {
  42     for(unsigned int j=0; j<4; j++)
  43       os << m[i][j] << " ";
  44     os << std::endl;
  45   }
  46   os.close();
  47
  48   return EXIT_SUCCESS;
  49 }// end main
  50
  51 //--------------------------------------------------------------------