tools/clitkElastixTransformToMatrix.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18
  19 // clitk
  20 #include "clitkElastixTransformToMatrix_ggo.h"
  21 #include "clitkAffineTransformGenericFilter.h"
  22 #include "clitkElastix.h"
  23
  24 //--------------------------------------------------------------------
  25 int main(int argc, char * argv[])
  26 {
  27
  28   // Init command line
  29   GGO(clitkElastixTransformToMatrix, args_info);
  30   CLITK_INIT;
  31
  32   // Use static fct of AffineTransformGenericFilter
  33   std::vector<std::string> l;
  34   l.push_back(args_info.input_arg);
  35   itk::Matrix<double, 4, 4> m = clitk::createMatrixFromElastixFile<3>(l, args_info.verbose_flag);
  36
  37   // Print matrix
  38   std::ofstream os;
  39   clitk::openFileForWriting(os, args_info.output_arg);
  40   for(unsigned int i=0; i<4; i++) {
  41     for(unsigned int j=0; j<4; j++)
  42       os << m[i][j] << " ";
  43     os << std::endl;
  44   }
  45   os.close();
  46
  47   return EXIT_SUCCESS;
  48 }// end main
  49
  50 //--------------------------------------------------------------------