tools/clitkImage2DicomDoseGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkImage2DicomDoseGenericFilter_h
  19 #define clitkImage2DicomDoseGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkImage2DicomDoseGenericFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkImageCommon.h"
  34 #include "clitkImage2DicomDose_ggo.h"
  35
  36 //itk include
  37 #include "itkLightObject.h"
  38 #include "itkGDCMImageIO.h"
  39 #include "itkMetaDataDictionary.h"
  40 #include "itkGDCMSeriesFileNames.h"
  41 #include "itkImageSeriesReader.h"
  42 #include "itkImageSeriesWriter.h"
  43 #include "itkImageFileReader.h"
  44 #include "itkImageFileWriter.h"
  45 #include <vector>
  46 #include <itksys/SystemTools.hxx>
  47
  48 namespace clitk
  49 {
  50   template<class args_info_type>
  51   class ITK_EXPORT Image2DicomDoseGenericFilter : public itk::LightObject
  52   {
  53
  54   public:
  55     //----------------------------------------
  56     // ITK
  57     //----------------------------------------
  58     typedef Image2DicomDoseGenericFilter   Self;
  59     typedef itk::LightObject                          Superclass;
  60     typedef itk::SmartPointer<Self>                   Pointer;
  61     typedef itk::SmartPointer<const Self>             ConstPointer;
  62
  63     // Method for creation through the object factory
  64     itkNewMacro(Self);
  65
  66     // Run-time type information (and related methods)
  67     itkTypeMacro( Image2DicomDoseGenericFilter, LightObject );
  68
  69     //methods
  70     //----------------------------------------
  71     // Set & Get
  72     //----------------------------------------
  73     void SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  74     {
  75       m_ArgsInfo=a;
  76       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  77       m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg;
  78     }
  79
  80     //----------------------------------------
  81     // Update
  82     //----------------------------------------
  83     void Update();
  84
  85   protected:
  86     //----------------------------------------
  87     // Constructor & Destructor
  88     //----------------------------------------
  89     Image2DicomDoseGenericFilter();
  90     ~Image2DicomDoseGenericFilter() {};
  91
  92     //----------------------------------------
  93     // Templated members
  94     //----------------------------------------
  95     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
  96     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
  97
  98
  99     gdcm::File * mDCMFile;
 100
 101     //----------------------------------------
 102     // Data members
 103     //----------------------------------------
 104     args_info_type m_ArgsInfo;
 105     bool m_Verbose;
 106     std::string m_InputFileName;
 107
 108   };
 109
 110   //Usefull functions
 111   void CopyDictionary (itk::MetaDataDictionary &fromDict, itk::MetaDataDictionary &toDict);
 112   template <typename T> std::string NumberToString ( T Number );
 113
 114 } // end namespace clitk
 115
 116 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 117 #include "clitkImage2DicomDoseGenericFilter.txx"
 118 #endif
 119
 120 #endif // #define clitkImage2DicomDoseGenericFilter_h