tools/clitkImage2DicomRTStruct.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:         vv http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3   Main authors :   XX XX XX
   4
   5   Authors belongs to:
   6   - University of LYON           http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center    http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory      http://www.creatis.insa-lyon.fr
   9
  10   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  12   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  13
  14   It is distributed under dual licence
  15   - BSD       http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php
  16   - CeCILL-B  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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  18   =========================================================================*/
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  20 // clitk
  21 #include "clitkImage2DicomRTStructFilter.h"
  22 #include "clitkImage2DicomRTStruct_ggo.h"
  23
  24 //--------------------------------------------------------------------
  25 int main(int argc, char * argv[]) {
  26
  27   // Init command line
  28   GGO(clitkImage2DicomRTStruct, args_info);
  29
  30   // Set initial 3D image filenames
  31   std::vector<std::string> filenames;
  32   for(unsigned int i=0; i< args_info.input_given; i++)
  33     filenames.push_back(args_info.input_arg[i]);
  34
  35   // Create a filter to convert image into dicomRTStruct and write to disk
  36   typedef float PixelType;
  37   clitk::Image2DicomRTStructFilter<PixelType> filter;
  38   filter.SetVerboseFlag(args_info.verbose_flag);
  39   filter.SetInputFilenames(filenames);
  40   filter.SetDicomFolder(args_info.dicom_arg);
  41   filter.SetStructureSetFilename(args_info.rtstruct_arg);
  42   filter.SetOutputFilename(args_info.output_arg);
  43   filter.SetROIType(args_info.roitype_arg);
  44   filter.SetThresholdValue(args_info.threshold_arg);
  45   filter.SetSkipInitialStructuresFlag(args_info.skip_flag);
  46   filter.Update();
  47
  48   // This is the end my friend
  49   return 0;
  50 }
  51 //--------------------------------------------------------------------