tools/clitkImageConvert.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef CLITKIMAGECONVERT_CXX
  19 #define CLITKIMAGECONVERT_CXX
  20 /**
  21    -------------------------------------------------
  22    * @file   clitkImageConvert.cxx
  23    * @author David Sarrut <david.sarrut@creatis.insa-lyon.fr>
  24    * @date   03 Jul 2006 10:28:32
  25    -------------------------------------------------*/
  26
  27 // clitk include
  28 #include "clitkImageConvert_ggo.h"
  29 #include "clitkIO.h"
  30 #include "clitkImageCommon.h"
  31 #include "clitkImageConvertGenericFilter.h"
  32
  33 //-------------------------------------------------------------------=
  34 int main(int argc, char * argv[])
  35 {
  36
  37   // init command line
  38   GGO(clitkImageConvert, args_info);
  39   CLITK_INIT;
  40
  41   // Get list of filenames
  42   std::vector<std::string> l;
  43   unsigned int nCmdLineInputs = args_info.inputs_num;
  44   std::string output;
  45   if(args_info.output_given)
  46     output = args_info.output_arg;
  47   else if(nCmdLineInputs--)
  48     output = args_info.inputs[nCmdLineInputs];
  49   else {
  50     std::cerr << "Error, you should give the --output option or one image filename on the commande line." << std::endl;
  51     exit(0);
  52   }
  53
  54   if(args_info.input_given) {
  55     l.push_back(args_info.input_arg);
  56   }
  57   if(nCmdLineInputs==1) {
  58     l.push_back(args_info.inputs[0]);
  59   }
  60   if (l.size() < 1) {
  61     std::cerr << "Error, you should give the --input option or one image filename on the commande line." << std::endl;
  62     exit(0);
  63   }
  64
  65   // Create filter
  66   clitk::ImageConvertGenericFilter::Pointer filter = clitk::ImageConvertGenericFilter::New();
  67   filter->SetInputFilenames(l);
  68   filter->SetIOVerbose(args_info.verbose_flag);
  69   filter->SetOutputFilename(output);
  70   filter->SetVV(args_info.vv_flag);
  71   filter->SetNoNiiMeta(args_info.noniimeta_flag);
  72   filter->SetCorrectNegativeSpacingFlag(args_info.correct_flag);
  73   filter->EnableWriteCompression(args_info.compression_flag);
  74   if (args_info.type_given) filter->SetOutputPixelType(args_info.type_arg);
  75
  76   // Go !
  77   CLITK_TRY_CATCH_EXIT(filter->Update());
  78
  79   // this is the end my friend
  80   return 0;
  81 }
  82 //-------------------------------------------------------------------=
  83
  84 #endif /* end #define CLITKIMAGECONVERT_CXX */