tools/clitkImageStatisticsGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkImageStatisticsGenericFilter_h
  19 #define clitkImageStatisticsGenericFilter_h
  20
  21 // clitk include
  22 #include "clitkIO.h"
  23 #include "clitkCommon.h"
  24 #include "clitkImageCommon.h"
  25 #include "clitkImageStatistics_ggo.h"
  26
  27 //itk include
  28 #include "itkLightObject.h"
  29 #include "itkLabelStatisticsImageFilter.h"
  30
  31 namespace clitk
  32 {
  33
  34   class ITK_EXPORT ImageStatisticsGenericFilter : public itk::LightObject
  35   {
  36   public:
  37     //----------------------------------------
  38     // ITK
  39     //----------------------------------------
  40     typedef ImageStatisticsGenericFilter                   Self;
  41     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  42     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  43     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  44
  45     // Method for creation through the object factory
  46     itkNewMacro(Self);
  47
  48     // Run-time type information (and related methods)
  49     itkTypeMacro( ImageStatisticsGenericFilter, LightObject );
  50
  51
  52     //----------------------------------------
  53     // Typedefs
  54     //----------------------------------------
  55
  56
  57     //----------------------------------------
  58     // Set & Get
  59     //----------------------------------------
  60     void SetArgsInfo(const args_info_clitkImageStatistics & a)
  61     {
  62       m_ArgsInfo=a;
  63       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  64       m_Localize=m_ArgsInfo.localize_flag;
  65
  66       if(m_ArgsInfo.input_given)
  67         m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg[0];
  68       else if(m_ArgsInfo.inputs_num>0)
  69         m_InputFileName=m_ArgsInfo.inputs[0];
  70       else {
  71         std::cerr << "You must give an input file name" << std::endl;
  72         exit(1);
  73       }
  74     }
  75
  76
  77     //----------------------------------------
  78     // Update
  79     //----------------------------------------
  80     void Update();
  81
  82   protected:
  83
  84     //----------------------------------------
  85     // Constructor & Destructor
  86     //----------------------------------------
  87     ImageStatisticsGenericFilter();
  88     ~ImageStatisticsGenericFilter() {};
  89
  90
  91     //----------------------------------------
  92     // Templated members
  93     //----------------------------------------
  94     template <unsigned int Dimension, unsigned int Components>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
  95     template <unsigned int Dimension, class PixelType, unsigned int Components>  void UpdateWithDimAndPixelType();
  96
  97
  98     //----------------------------------------
  99     // Data members
 100     //----------------------------------------
 101     args_info_clitkImageStatistics m_ArgsInfo;
 102     bool m_Verbose, m_Localize;
 103     std::string m_InputFileName;
 104
 105   };
 106
 107
 108 } // end namespace clitk
 109
 110 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 111 #include "clitkImageStatisticsGenericFilter.txx"
 112 #endif
 113
 114 #endif // #define clitkImageStatisticsGenericFilter_h