tools/clitkMIPGenericFilter.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkMIPGenericFilter_cxx
  19 #define clitkMIPGenericFilter_cxx
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkMIPGenericFilter.cxx
  23  * @author Jef Vandemeulebroucke <jef@creatis.insa-lyon.fr>
  24  * @date   29 june 2009
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30 #include "clitkMIPGenericFilter.h"
  31
  32 // itk include
  33 #include <itkImage.h>
  34 #include <itkMaximumProjectionImageFilter.h>
  35
  36 #include <clitkCommon.h>
  37
  38 namespace clitk
  39 {
  40
  41 //--------------------------------------------------------------------
  42 MIPGenericFilter::MIPGenericFilter():
  43   ImageToImageGenericFilter<Self>("MIP")
  44 {
  45   InitializeImageType<3>();
  46   InitializeImageType<4>();
  47 }
  48 //--------------------------------------------------------------------
  49
  50
  51 //--------------------------------------------------------------------
  52 template<unsigned int Dim>
  53 void MIPGenericFilter::InitializeImageType()
  54 {
  55   ADD_DEFAULT_IMAGE_TYPES(Dim);
  56 }
  57 //--------------------------------------------------------------------
  58
  59
  60 //--------------------------------------------------------------------
  61 void MIPGenericFilter::SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  62 {
  63   mArgsInfo=a;
  64   SetIOVerbose(mArgsInfo.verbose_flag);
  65   if (mArgsInfo.imagetypes_given && mArgsInfo.imagetypes_flag)
  66     this->PrintAvailableImageTypes();
  67   if (mArgsInfo.input_given) {
  68     SetInputFilename(mArgsInfo.input_arg);
  69   }
  70   if (mArgsInfo.output_given) {
  71     SetOutputFilename(mArgsInfo.output_arg);
  72   }
  73 }
  74 //--------------------------------------------------------------------
  75
  76
  77 //--------------------------------------------------------------------
  78 // Update with the number of dimensions and the pixeltype
  79 //--------------------------------------------------------------------
  80 template<class InputImageType>
  81 void
  82 MIPGenericFilter::UpdateWithInputImageType()
  83 {
  84   typedef typename InputImageType::PixelType PixelType;
  85   const int Dim = InputImageType::ImageDimension;
  86   typedef itk::Image<PixelType,Dim> ImageType;
  87   typedef itk::Image<PixelType,Dim-1> OutputImageType;
  88   typedef itk::MaximumProjectionImageFilter<ImageType,OutputImageType> FilterType;
  89   typename FilterType::Pointer filter = FilterType::New();
  90   filter->SetProjectionDimension(mArgsInfo.dimension_arg);
  91   typename InputImageType::Pointer input = this->template GetInput<InputImageType>(0);
  92   filter->SetInput(input);
  93   filter->Update();
  94   this->template SetNextOutput<OutputImageType>(filter->GetOutput());
  95 }
  96 //--------------------------------------------------------------------
  97
  98
  99 }//end clitk
 100
 101 #endif  //#define clitkMIPGenericFilter_cxx