tools/clitkMedianTemporalDimensionGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkMedianTemporalDimensionGenericFilter_h
  19 #define clitkMedianTemporalDimensionGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkMedianTemporalDimensionGenericFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkImageCommon.h"
  34 #include "clitkMedianTemporalDimension_ggo.h"
  35
  36 //itk include
  37 #include "itkLightObject.h"
  38
  39 namespace clitk
  40 {
  41
  42   template<class args_info_type>
  43   class ITK_EXPORT MedianTemporalDimensionGenericFilter : public itk::LightObject
  44   {
  45   public:
  46     //----------------------------------------
  47     // ITK
  48     //----------------------------------------
  49     typedef MedianTemporalDimensionGenericFilter                   Self;
  50     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  51     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  52     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  53
  54     // Method for creation through the object factory
  55     itkNewMacro(Self);
  56
  57     // Run-time type information (and related methods)
  58     itkTypeMacro( MedianTemporalDimensionGenericFilter, LightObject );
  59
  60
  61     //----------------------------------------
  62     // Typedefs
  63     //----------------------------------------
  64
  65
  66     //----------------------------------------
  67     // Set & Get
  68     //----------------------------------------
  69     void SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  70     {
  71       m_ArgsInfo=a;
  72       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  73       m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg[0];
  74     }
  75
  76
  77     //----------------------------------------
  78     // Update
  79     //----------------------------------------
  80     void Update();
  81
  82   protected:
  83
  84     //----------------------------------------
  85     // Constructor & Destructor
  86     //----------------------------------------
  87     MedianTemporalDimensionGenericFilter();
  88     ~MedianTemporalDimensionGenericFilter() {};
  89
  90
  91     //----------------------------------------
  92     // Templated members
  93     //----------------------------------------
  94     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(const std::string PixelType, const int Components);
  95     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
  96
  97
  98     //----------------------------------------
  99     // Data members
 100     //----------------------------------------
 101     args_info_type m_ArgsInfo;
 102     bool m_Verbose;
 103     std::string m_InputFileName;
 104
 105   };
 106
 107
 108 } // end namespace clitk
 109
 110 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 111 #include "clitkMedianTemporalDimensionGenericFilter.txx"
 112 #endif
 113
 114 #endif // #define clitkMedianTemporalDimensionGenericFilter_h