tools/clitkSignalApparentMotionTracking.ggo

   1 #File clitkSignalApparentMotionTrackingFilter.ggo
   2 package "clitkSignalMeanPositionTracking"
   3 version "1.0"
   4 purpose "See Ruan 2008, compute mean position from a signal"
   5
   6 option "config"         -       "Config file"                            string         no
   7 option "input"          i       "Input trajectory filename"              string         yes
   8 option "ref"            r       "Input reference trajectory filename"    string         yes
   9
  10 option "refsampling"    -       "Sampling between ref samples"           double         yes
  11 option "inputsampling"  -       "Sampling between input samples"         double         yes
  12
  13 option "refphase"       p       "Input phase file"                       string         yes
  14 option "delay"          d       "Delay for augmented space"              int            no default="5"
  15 option "windowLength"   L       "Sliding window length for ellipse fit"  int            no default="25"
  16 option "nbiso"          n       "Number of iso phase"                     int           no default="4"
  17
  18 option "output"         o       "Output phase (debug)"    string        no
  19
  20
  21
  22
  23 option "eta"            e       "Convergence param (auto if not given)"           double no
  24 option "iter"           -       "Max # of iterations"             int no default="100"
  25 option "t"              t       "DEBUG"                           int no default="1000"
  26
  27 option "phase"          -       "Input phase file for validation"         string        no
  28 option "delta"          -       "Input learn delta phase file"            string        no
  29
  30
  31 section "Output"
  32 option "residual"       -       "Output optimisation residual filemane"   string        no
  33 option "augmented"      a       "Output augmented signal filemane"        string        no
  34
  35 section "Verbose"
  36 option "verbose"                v       "Verbose"                         flag          off
  37 option "verbose_iteration"      -       "Verbose each iteration"          flag          off
  38