tools/clitkSignalMeanPositionFilter.h

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   3   Program:   clitk
   4   Module:    $RCSfile: clitkSignalMeanPositionFilter.h,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2010/01/06 13:31:56 $
   7   Version:   $Revision: 1.1 $
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   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
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  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18
  19 #ifndef CLITKSIGNALMEANPOSITIONFILTER_H
  20 #define CLITKSIGNALMEANPOSITIONFILTER_H
  21
  22 #include "clitkSignalMeanPositionTracking_ggo.h"
  23 #include "clitkSignal.h"
  24 #include "clitkEllipse.h"
  25 #include "itkVector.h"
  26
  27 namespace clitk {
  28
  29   //---------------------------------------------------------------------
  30   class SignalMeanPositionFilter {
  31   public:
  32     typedef itk::Vector<double,2> Vector2d;
  33
  34     void SetParameters(gengetopt_args_info_clitkSignalMeanPositionTracking & args_info);
  35     void Update();
  36
  37   protected:
  38     gengetopt_args_info_clitkSignalMeanPositionTracking args_info;
  39     clitk::Signal mInput;
  40     clitk::Signal mAugmentedInputX;
  41     clitk::Signal mAugmentedInputY;
  42     int mAugmentationDelay;
  43     int mMaxIteration;
  44     double mEta;
  45     bool mEtaIsSet;
  46     bool mOutputFilenameIsSet;
  47     bool mOutputResidualFilenameIsSet;
  48     bool mOutputAugmentedFilenameIsSet;
  49     std::string mOutputFilename;
  50     std::string mOutputResidualFilename;
  51     std::string mOutputAugmentedFilename;
  52     bool mVerbose;
  53     bool mVerboseIteration;
  54     bool mIsAdaptiveMethod;
  55     std::vector<double> mCurrentResidual;
  56     int mWindowLength;
  57     std::vector<Vector2d> mCenters;
  58
  59     void FitEllipse(clitk::Ellipse & An);
  60     void AdaptiveFitEllipse(clitk::Ellipse & An);
  61
  62     void ComputeAugmentedSpace(const clitk::Signal & input,
  63                                clitk::Signal & outputX,
  64                                clitk::Signal & outputY,
  65                                unsigned int delay);
  66   };
  67   //---------------------------------------------------------------------
  68
  69 } // end namespace
  70
  71 #endif