tools/clitkSumGenericFilter.txx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkSumGenericFilter_txx
  19 #define clitkSumGenericFilter_txx
  20
  21 // itk include
  22 #include <itkSumProjectionImageFilter.h>
  23 #include <clitkCommon.h>
  24
  25 namespace clitk
  26 {
  27
  28 //--------------------------------------------------------------------
  29 template<class args_info_type>
  30 SumGenericFilter<args_info_type>::SumGenericFilter():
  31   ImageToImageGenericFilter<Self>("Sum")
  32 {
  33   InitializeImageType<3>();
  34   InitializeImageType<4>();
  35 }
  36 //--------------------------------------------------------------------
  37
  38
  39 //--------------------------------------------------------------------
  40 template<class args_info_type>
  41 template<unsigned int Dim>
  42 void SumGenericFilter<args_info_type>::InitializeImageType()
  43 {
  44   ADD_DEFAULT_IMAGE_TYPES(Dim);
  45 }
  46 //--------------------------------------------------------------------
  47
  48
  49 //--------------------------------------------------------------------
  50 template<class args_info_type>
  51 void SumGenericFilter<args_info_type>::SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  52 {
  53   mArgsInfo=a;
  54   this->SetIOVerbose(mArgsInfo.verbose_flag);
  55   if (mArgsInfo.imagetypes_flag) this->PrintAvailableImageTypes();
  56
  57   if (mArgsInfo.input_given) {
  58     this->SetInputFilename(mArgsInfo.input_arg);
  59   }
  60   if (mArgsInfo.output_given) {
  61     this->SetOutputFilename(mArgsInfo.output_arg);
  62   }
  63 }
  64 //--------------------------------------------------------------------
  65
  66 //--------------------------------------------------------------------
  67 // Update with the number of dimensions and the pixeltype
  68 //--------------------------------------------------------------------
  69 template<class args_info_type>
  70 template<class InputImageType>
  71 void
  72 SumGenericFilter<args_info_type>::UpdateWithInputImageType()
  73 {
  74
  75   // Reading input
  76   typename InputImageType::Pointer input = this->template GetInput<InputImageType>(0);
  77
  78   // Main filter
  79   typedef typename InputImageType::PixelType PixelType;
  80   const int Dim = InputImageType::ImageDimension;
  81   typedef itk::Image<PixelType,Dim> ImageType;
  82   typedef itk::Image<PixelType,Dim-1> OutputImageType;
  83
  84   // Filter
  85   typedef itk::SumProjectionImageFilter<ImageType,OutputImageType> FilterType;
  86   typename FilterType::Pointer filter = FilterType::New();
  87   filter->SetProjectionDimension(mArgsInfo.dimension_arg);
  88   filter->SetInput(input);
  89   filter->Update();
  90   this->template SetNextOutput<OutputImageType>(filter->GetOutput());
  91 }
  92 //--------------------------------------------------------------------
  93
  94
  95 }//end clitk
  96
  97 #endif //#define clitkSumGenericFilter_txx