tools/clitkVFConvertGenericFilter.txx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkVFConvertGenericFilter_txx
  19 #define clitkVFConvertGenericFilter_txx
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkVFConvertGenericFilter.txx
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
  29
  30
  31 namespace clitk
  32 {
  33
  34   //-------------------------------------------------------------------
  35   // Update with the number of dimensions
  36   //-------------------------------------------------------------------
  37   template<unsigned int Dimension>
  38   void
  39   VFConvertGenericFilter::UpdateWithDim(std::string PixelType, unsigned int Components)
  40   {
  41     if (m_Verbose) std::cout << "Image was detected to be "<<Dimension<<"D with "<< Components <<" components of "<< PixelType<<"..."<<std::endl;
  42
  43     if (Components==2)
  44       {
  45         if (PixelType == "double"){
  46           if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D with "<< Components <<" components of double..." << std::endl;
  47           UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<double, 2> >();
  48         }
  49         else {
  50           if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D with "<< Components <<" components of float..." << std::endl;
  51           UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<float, 2> >();
  52         }
  53       }
  54     else if (Components==3)
  55       {
  56         if (PixelType == "double"){
  57           if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D with "<< Components <<" components of double..." << std::endl;
  58           UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<double, 3> >();
  59         }
  60         else {
  61           if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D with "<< Components <<" components of float..." << std::endl;
  62           UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<float, 3> >();
  63         }
  64       }
  65     else if (Components==4)
  66       {
  67         if (PixelType == "double"){
  68           if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D with "<< Components <<" components of double..." << std::endl;
  69           UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<double, 4> >();
  70         }
  71         else {
  72           if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D with "<< Components <<" components of float..." << std::endl;
  73           UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<float, 4> >();
  74         }
  75       }
  76     else std::cerr<<"Only 2,3 and 4 components!"<<std::endl;
  77   }
  78
  79
  80   //-------------------------------------------------------------------
  81   // Update with the number of dimensions and the pixeltype
  82   //-------------------------------------------------------------------
  83   template <unsigned int Dimension, class  PixelType>
  84   void
  85   VFConvertGenericFilter::UpdateWithDimAndPixelType()
  86   {
  87
  88     // ImageTypes
  89     typedef itk::Image<PixelType, Dimension> InputImageType;
  90     typedef itk::Image<PixelType, Dimension> OutputImageType;
  91
  92     // Read the input
  93     typedef itk::ImageFileReader<InputImageType> InputReaderType;
  94     typename InputReaderType::Pointer reader = InputReaderType::New();
  95     reader->SetFileName( m_InputFileName);
  96     reader->Update();
  97     typename InputImageType::Pointer input= reader->GetOutput();
  98
  99     // Output
 100     typedef itk::ImageFileWriter<OutputImageType> WriterType;
 101     typename WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
 102     writer->SetFileName(m_ArgsInfo.output_arg);
 103     writer->SetInput(input);
 104     writer->Update();
 105
 106   }
 107
 108
 109 }//end clitk
 110
 111 #endif //#define clitkVFConvertGenericFilter_txx