tools/clitkVFInterpolateGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef CLITKIMAGERESAMPLEGENERICFILTER_H
  19 #define CLITKIMAGERESAMPLEGENERICFILTER_H
  20 /**
  21  -------------------------------------------------------------------
  22  * @file   clitkVFInterpolateGenericFilter.h
  23  * @author David Sarrut <David.Sarrut@creatis.insa-lyon.fr>
  24  * @date   23 Feb 2008 08:37:53
  25
  26  * @brief
  27  -------------------------------------------------------------------*/
  28
  29 // clitk include
  30 #include "clitkCommon.h"
  31 #include "clitkImageCommon.h"
  32 #include "clitkImageToImageGenericFilter.h"
  33
  34 // itk include
  35 #include "itkImage.h"
  36 #include "itkVectorImage.h"
  37 #include "itkFixedArray.h"
  38 #include "itkImageFileReader.h"
  39 #include "itkImageSeriesReader.h"
  40 #include "itkImageFileWriter.h"
  41 #include "itkRecursiveGaussianImageFilter.h"
  42 #include "itkInterpolateImageFilter.h"
  43 #include "itkAffineTransform.h"
  44 #include "itkVectorNearestNeighborInterpolateImageFunction.h"
  45 #include "itkVectorLinearInterpolateImageFunction.h"
  46 #include "itkBSplineInterpolateImageFunction.h"
  47 #include "itkBSplineInterpolateImageFunctionWithLUT.h"
  48 #include "itkCommand.h"
  49
  50 namespace clitk {
  51
  52   //--------------------------------------------------------------------
  53   class VFInterpolateGenericFilter:
  54     public clitk::ImageToImageGenericFilter<VFInterpolateGenericFilter> {
  55
  56   public:
  57     // constructor
  58     VFInterpolateGenericFilter();
  59
  60     // Types
  61     typedef VFInterpolateGenericFilter       Self;
  62     typedef itk::SmartPointer<Self>       Pointer;
  63     typedef itk::SmartPointer<const Self> ConstPointer;
  64
  65     // New
  66     itkNewMacro(Self);
  67
  68     void SetInputFilename1(const std::string& file) { mInputFilename1 = file; }
  69     void SetInputFilename2(const std::string& file) { mInputFilename2 = file; }
  70     void SetInterpolationName(const std::string & inter);
  71     void SetDistance(double distance) { mDistance = distance; }
  72     void SetBSplineOrder(int o) { mBSplineOrder = o; }
  73     void SetBLUTSampling(int b) { mSamplingFactors.resize(1); mSamplingFactors[0] = b; }
  74
  75    //--------------------------------------------------------------------
  76     // Main function called each time the filter is updated
  77     template<class InputImageType>
  78     void UpdateWithInputImageType();
  79
  80   protected:
  81     template<unsigned int Dim> void InitializeImageType();
  82     //--------------------------------------------------------------------
  83     std::string mInputFilename1, mInputFilename2;
  84     std::string mInterpolatorName;
  85     int mBSplineOrder;
  86     std::vector<int> mSamplingFactors;
  87     double mDistance;
  88
  89     //--------------------------------------------------------------------
  90     template<unsigned int Dim, class PixelType, unsigned int DimCompo>
  91     void Update_WithDimAndPixelTypeAndComponent();
  92     template<class ImageType>
  93     typename ImageType::Pointer ComputeImage(typename ImageType::Pointer inputImage1, typename ImageType::Pointer inputImage2);
  94
  95   }; // end class VFInterpolateGenericFilter
  96   //--------------------------------------------------------------------
  97
  98 } // end namespace
  99 //--------------------------------------------------------------------
 100
 101 #endif /* end #define CLITKIMAGERESAMPLEGENERICFILTER_H */
 102