tools/clitkWarpImage.ggo

   1 #File clitkWarpImage.ggo
   2 package "clitkWarpImage"
   3 version "1.0"
   4 purpose "Warp an image. Output will have the extent (origin+ spacing*size) of the input."
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   6 option "config"         -       "Config file"                     string        no
   7 option "verbose"        v       "Verbose"                         flag          off
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   9 section "I/O"
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  11 option "input"          i       "Input image filename"            string        yes
  12 option "output"         o       "Output image filename"           string        yes
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  14 defgroup "DVFoption" groupdesc="an option of this group is required" required
  15 groupoption "vf"                -       "Vector field filename"           string                yes group="DVFoption"
  16 groupoption "coeff"   - "B-Spline coefficients filename"     string    yes group="DVFoption"
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  19 section "Options"
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  21 option "forward"                f       "Use forward warping (only linear interp)"      flag            off
  22 option "spacing"                s       "The output spacing: 0=like the VF, 1= like the input image (interpolation of the VF prior to warp)"    int             no      default="0"
  23 option "pad"                    -       "Edge padding value" float  no  default="0.0"
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  26 section "Interpolation: for image intensity and prior resampling of DVF"
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  28 option "interp"         -       "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"      int     no  default="1"
  29 option "interpOrder"    -       "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                        int     no  default="3"
  30 option "interpSF"       -       "Sampling factor if BLUT"                               int     no  default="20"
  31 option "interpVF"       -       "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"      int     no  default="1"
  32 option "interpVFOrder"  -       "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                        int     no  default="3"
  33 option "interpVFSF"     -       "Sampling factor if BLUT"                               int     no  default="20"