tools/clitkWriteDicomSeriesGenericFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkWriteDicomSeriesGenericFilter_h
  19 #define clitkWriteDicomSeriesGenericFilter_h
  20
  21 /* =================================================
  22  * @file   clitkWriteDicomSeriesGenericFilter.h
  23  * @author
  24  * @date
  25  *
  26  * @brief
  27  *
  28  ===================================================*/
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  30
  31 // clitk include
  32 #include "clitkIO.h"
  33 #include "clitkImageCommon.h"
  34 #include "clitkWriteDicomSeries_ggo.h"
  35
  36 //itk include
  37 #include "itkLightObject.h"
  38 #include "itkGDCMImageIO.h"
  39 #include "itkMetaDataDictionary.h"
  40 #include "itkGDCMSeriesFileNames.h"
  41 #include "itkImageSeriesReader.h"
  42 #include "itkImageSeriesWriter.h"
  43 #include <vector>
  44 #include <itksys/SystemTools.hxx>
  45
  46 namespace clitk
  47 {
  48   template<class args_info_type>
  49   class ITK_EXPORT WriteDicomSeriesGenericFilter : public itk::LightObject
  50   {
  51   public:
  52     //----------------------------------------
  53     // ITK
  54     //----------------------------------------
  55     typedef WriteDicomSeriesGenericFilter                   Self;
  56     typedef itk::LightObject                   Superclass;
  57     typedef itk::SmartPointer<Self>            Pointer;
  58     typedef itk::SmartPointer<const Self>      ConstPointer;
  59
  60     // Method for creation through the object factory
  61     itkNewMacro(Self);
  62
  63     // Run-time type information (and related methods)
  64     itkTypeMacro( WriteDicomSeriesGenericFilter, LightObject );
  65
  66
  67     //----------------------------------------
  68     // Typedefs
  69     //----------------------------------------
  70
  71
  72     //----------------------------------------
  73     // Set & Get
  74     //----------------------------------------
  75     void SetArgsInfo(const args_info_type & a)
  76     {
  77       m_ArgsInfo=a;
  78       m_Verbose=m_ArgsInfo.verbose_flag;
  79       m_InputFileName=m_ArgsInfo.input_arg;
  80     }
  81
  82
  83     //----------------------------------------
  84     // Update
  85     //----------------------------------------
  86     void Update();
  87
  88   protected:
  89
  90     //----------------------------------------
  91     // Constructor & Destructor
  92     //----------------------------------------
  93     WriteDicomSeriesGenericFilter();
  94     ~WriteDicomSeriesGenericFilter() {};
  95
  96
  97     //----------------------------------------
  98     // Templated members
  99     //----------------------------------------
 100     template <unsigned int Dimension>  void UpdateWithDim(std::string PixelType);
 101     template <unsigned int Dimension, class PixelType>  void UpdateWithDimAndPixelType();
 102
 103
 104     //----------------------------------------
 105     // Data members
 106     //----------------------------------------
 107     args_info_type m_ArgsInfo;
 108     bool m_Verbose;
 109     std::string m_InputFileName;
 110
 111   };
 112
 113
 114 } // end namespace clitk
 115
 116 #ifndef ITK_MANUAL_INSTANTIATION
 117 #include "clitkWriteDicomSeriesGenericFilter.txx"
 118 #endif
 119
 120 #endif // #define clitkWriteDicomSeriesGenericFilter_h