]> Creatis software - gdcm.git/blob - vtk/vtkGdcmReader.h
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[gdcm.git] / vtk / vtkGdcmReader.h
1 /*=========================================================================
2                                                                                 
3   Program:   gdcm
4   Module:    $RCSfile: vtkGdcmReader.h,v $
5   Language:  C++
6   Date:      $Date: 2006/03/29 11:23:43 $
7   Version:   $Revision: 1.31 $
8                                                                                 
9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
12                                                                                 
13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
16                                                                                 
17 =========================================================================*/
18                                                                                 
19 #ifndef __vtkGdcmReader_h
20 #define __vtkGdcmReader_h
21
22 #include "gdcmCommon.h" // To avoid warnings concerning the std
23 #include "gdcmFile.h"
24
25 #include <vtkImageReader.h>
26 #include <list>
27 #include <string>
28 #include <vector>
29
30 typedef void (*VOID_FUNCTION_PUINT8_PFILE_POINTER)(uint8_t *, gdcm::File *);
31
32 //-----------------------------------------------------------------------------
33 class vtkLookupTable;
34
35 //-----------------------------------------------------------------------------
36 class VTK_EXPORT vtkGdcmReader : public vtkImageReader
37 {
38 public:
39    static vtkGdcmReader *New();
40    vtkTypeRevisionMacro(vtkGdcmReader, vtkImageReader);
41    void PrintSelf(ostream& os, vtkIndent indent);
42
43    virtual void RemoveAllFileName(void);
44    virtual void AddFileName(const char *name);
45    virtual void SetFileName(const char *name);
46
47    //BTX
48    void SetCoherentFileList( std::vector<gdcm::File* > *cfl) {
49                                                       CoherentFileList = cfl; }    
50    //ETX
51
52    vtkSetMacro(AllowLightChecking, bool);
53    vtkGetMacro(AllowLightChecking, bool);
54    vtkBooleanMacro(AllowLightChecking, bool);
55
56    //BTX
57    void SetUserFunction (VOID_FUNCTION_PUINT8_PFILE_POINTER userFunc )
58                         { UserFunction = userFunc; } 
59    //ETX
60   
61    // Description:
62    // If this flag is set and the DICOM reader encounters a dicom file with 
63    // lookup table the data will be kept as unsigned chars and a lookuptable 
64    // will be exported and accessible through GetLookupTable() 
65    vtkSetMacro(AllowLookupTable, bool);
66    vtkGetMacro(AllowLookupTable, bool);
67    vtkBooleanMacro(AllowLookupTable, bool);
68
69    vtkGetObjectMacro(LookupTable, vtkLookupTable);
70
71 // FIXME : HOW to doxygen a VTK macro?
72 /*
73  * \ brief Sets the LoadMode as a boolean string. 
74  *        gdcm.LD_NOSEQ, gdcm.LD_NOSHADOW, gdcm.LD_NOSHADOWSEQ... 
75  *        (nothing more, right now)
76  *        WARNING : before using NO_SHADOW, be sure *all* your files
77  *        contain accurate values in the 0x0000 element (if any) 
78  *        of *each* Shadow Group. The parser will fail if the size is wrong !
79  * @param   mode Load mode to be used    
80  */
81    vtkSetMacro(LoadMode, int);
82    vtkGetMacro(LoadMode, int);
83    vtkBooleanMacro(LoadMode, int);
84
85 protected:
86    vtkGdcmReader();
87    ~vtkGdcmReader();
88
89    virtual void ExecuteInformation();
90    virtual void ExecuteData(vtkDataObject *output);
91
92    //virtual void BuildData(vtkDataObject *output); // for VTK5.0
93    virtual void BuildFileListFromPattern();
94    virtual void LoadFileInformation();
95    virtual void UpdateFileInformation();
96    //BTX
97    virtual void GetFileInformation(gdcm::File *file);
98    virtual bool TestFileInformation(gdcm::File *file);
99    //ETX
100
101 private:
102    void RemoveAllInternalFileName(void);
103    void AddInternalFileName(const char *name);
104    void RemoveAllInternalFile(void);
105
106    //BTX
107    void IncrementProgress(const unsigned long updateProgressTarget,
108                           unsigned long &updateProgressCount);
109    /*void LoadImageInMemory(std::string fileName, unsigned char *dest,
110                           const unsigned long updateProgressTarget,
111                           unsigned long &updateProgressCount);*/
112
113    void LoadImageInMemory(gdcm::File *f, unsigned char *dest,
114                           const unsigned long updateProgressTarget,
115                           unsigned long &updateProgressCount);
116    //ETX
117
118 // Variables
119    //BTX
120    typedef std::vector<gdcm::File *> gdcmFileList;
121    //ETX
122
123    vtkLookupTable *LookupTable;
124    vtkTimeStamp fileTime;
125
126    bool AllowLookupTable;
127    bool AllowLightChecking;
128
129    //BTX
130    // Number of columns of the image/volume to be loaded
131    int NumColumns;
132    // Number of lines of the image/volume to be loaded
133    int NumLines;
134    // Number of lines of the image/volume to be loaded
135    int NumPlanes;
136    // Total number of planes (or images) of the stack to be build.
137    int TotalNumberOfPlanes;
138    // Number of scalar components of the image to be loaded (1=monochrome 3=rgb)
139    int NumComponents;
140    // Type of the image[s]: 8/16/32 bits, signed/unsigned:
141    std::string ImageType;
142    // Pixel size (in number of bytes):
143    size_t PixelSize;
144    // List of filenames to be read in order to build a stack of images
145    // or volume. The order in the list shall be the order of the images.
146    std::list<std::string> FileNameList;
147    gdcmFileList *CoherentFileList;
148    bool OwnFile;
149
150    // List of filenames created in ExecuteInformation and used in
151    // ExecuteData.
152    // If FileNameList isn't empty, InternalFileNameList is a copy of
153    //    FileNameList
154    // Otherwise, InternalFileNameList correspond to the list of 
155    //    files patterned
156    std::list<std::string> InternalFileNameList;
157    gdcmFileList InternalFileList;
158    //bool Execution;  // For VTK5.0
159   
160    //ETX
161
162    /// \brief Bit string integer (each one considered as a boolean)
163    ///        Bit 0 : Skip Sequences,    if possible
164    ///        Bit 1 : Skip Shadow Groups if possible
165    ///        Bit 2 : Skip Sequences inside a Shadow Group, if possible
166    ///        Probabely (?), some more to add
167    int LoadMode;
168
169    /// Pointer to a user suplied function to allow modification of pixel order
170    VOID_FUNCTION_PUINT8_PFILE_POINTER UserFunction;
171
172 };
173
174 //-----------------------------------------------------------------------------
175 #endif
176