]> Creatis software - gdcm.git/blob - vtk/vtkgdcmViewer.cxx
no message
[gdcm.git] / vtk / vtkgdcmViewer.cxx
1 /*=========================================================================
2                                                                                 
3   Program:   gdcm
4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer.cxx,v $
5   Language:  C++
6   Date:      $Date: 2011/03/29 07:36:02 $
7   Version:   $Revision: 1.33 $
8                                                                                 
9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
12                                                                                 
13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
16                                                                                 
17 =========================================================================*/
18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
19 // used in order to:
20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
24 //
25 // Usage:
26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
27 //    given as command line arguments,
28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
30 // 
31 //----------------------------------------------------------------------------
32 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
33 #include <vtkImageViewer.h>
34 #include <vtkStructuredPoints.h>
35 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
36 #include <vtkCommand.h>
37 #include <vtkRenderer.h>
38 #include <vtkImageMapToColors.h>
39 #include <vtkLookupTable.h>
40
41 #include "vtkGdcmReader.h"
42 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
43 #ifndef vtkFloatingPointType
44 #define vtkFloatingPointType float
45 #endif
46
47 //----------------------------------------------------------------------------
48 // Callback for the interaction
49 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
50 {
51 public:
52    virtual char const *GetClassName() const 
53    { 
54       return "vtkgdcmObserver";
55    }
56    static vtkgdcmObserver *New() 
57    { 
58       return new vtkgdcmObserver; 
59    }
60    vtkgdcmObserver()
61    {
62       this->ImageViewer = NULL;
63    }
64    virtual void Execute(vtkObject *, unsigned long event, void* )
65    {
66       if ( this->ImageViewer )
67       {
68          if ( event == vtkCommand::CharEvent )
69          {
70             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
71             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
72             ImageViewer->SetZSlice( slice );
73             ImageViewer->Render();
74          }
75       }
76    }
77    vtkImageViewer *ImageViewer;
78 };
79
80
81 int main(int argc, char *argv[])
82 {
83    if( argc < 2 )
84       return 0;
85   
86    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
87    reader->AllowLookupTableOff();
88
89    if( argc == 2 )
90       reader->SetFileName( argv[1] );
91    else
92       for(int i=1; i< argc; i++)
93          reader->AddFileName( argv[i] );
94
95 // TODO : allow user to choose Load Mode
96    reader->SetLoadMode(GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ);  
97    reader->Update();
98
99
100
101 std::cout << "[0][0]==========" <<
102 reader->GetOutput()->GetScalarComponentAsFloat(0,0,0,0) <<
103 "===================="
104 << std::endl;
105 std::cout << "[127][127]==========" <<
106 reader->GetOutput()->GetScalarComponentAsFloat(0,127,0,0) <<
107 "===================="
108 << std::endl;
109
110
111    //print debug info:
112    reader->GetOutput()->Print( cout );
113
114    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
115
116    vtkImageViewer *viewer = vtkImageViewer::New();
117
118    if( reader->GetLookupTable() )
119    {
120       //convert to color:
121       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
122       map->SetInput (reader->GetOutput());
123       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
124       map->SetOutputFormatToRGB();
125       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
126       map->Delete();
127    }
128    else
129    {
130    
131    // For a single medical image, it would be more efficient to use
132    // 0028|1050 [DS] [Window Center]
133    // 0028|1051 [DS] [Window Width]
134    // but vtkgdcmReader doesn't know about them :-(
135
136       vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
137       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
138       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
139
140       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
141    }
142    viewer->SetupInteractor (iren);
143   
144    //vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
145    //viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
146    //viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
147
148    // Here is where we setup the observer, 
149    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
150    obs->ImageViewer = viewer;
151    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
152    obs->Delete();
153
154    //viewer->Render();
155    iren->Initialize();
156    iren->Start();
157
158    //if you wish you can export dicom to a vtk file
159    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
160    writer->SetInput( reader->GetOutput());
161    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
162    writer->SetFileTypeToBinary();
163    //writer->Write();
164    
165 std::cout << "==========" << std::endl;
166    
167 std::cout << "==========" <<
168 reader->GetOutput()->GetScalarComponentAsFloat(0,0,0,0) <<
169 "===================="
170 << std::endl;
171      
172    
173
174    reader->Delete();
175    iren->Delete();
176    viewer->Delete();
177    writer->Delete();
178
179    return 0;
180 }