vtk/vtkgdcmViewer.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/08/28 09:41:39 $
   7   Version:   $Revision: 1.30 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
  19 // used in order to:
  20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
  21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
  22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
  23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
  24 //
  25 // Usage:
  26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
  27 //    given as command line arguments,
  28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
  29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
  30 //
  31 //----------------------------------------------------------------------------
  32 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  33 #include <vtkImageViewer.h>
  34 #include <vtkStructuredPoints.h>
  35 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
  36 #include <vtkCommand.h>
  37 #include <vtkRenderer.h>
  38 #include <vtkImageMapToColors.h>
  39 #include <vtkLookupTable.h>
  40
  41 #include "vtkGdcmReader.h"
  42 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
  43 #ifndef vtkFloatingPointType
  44 #define vtkFloatingPointType float
  45 #endif
  46
  47 //----------------------------------------------------------------------------
  48 // Callback for the interaction
  49 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
  50 {
  51 public:
  52    virtual char const *GetClassName() const
  53    {
  54       return "vtkgdcmObserver";
  55    }
  56    static vtkgdcmObserver *New()
  57    {
  58       return new vtkgdcmObserver;
  59    }
  60    vtkgdcmObserver()
  61    {
  62       this->ImageViewer = NULL;
  63    }
  64    virtual void Execute(vtkObject *, unsigned long event, void* )
  65    {
  66       if ( this->ImageViewer )
  67       {
  68          if ( event == vtkCommand::CharEvent )
  69          {
  70 #if (VTK_MAJOR_VERSION >= 5)
  71             int max = ImageViewer->GetSliceMax();
  72             int slice = (ImageViewer->GetSlice() + 1 ) % ++max;
  73             ImageViewer->SetSlice( slice );
  74 #else
  75             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
  76             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
  77             ImageViewer->SetZSlice( slice );
  78 #endif
  79 #if !( (VTK_MAJOR_VERSION >= 5) || ( VTK_MAJOR_VERSION == 4 && VTK_MINOR_VERSION >= 5 ) )
  80          // This used to be a bug in version VTK 4.4 and earlier
  81             ImageViewer->GetRenderer()->ResetCameraClippingRange();
  82 #endif
  83             ImageViewer->Render();
  84          }
  85       }
  86    }
  87    vtkImageViewer *ImageViewer;
  88 };
  89
  90
  91 int main(int argc, char *argv[])
  92 {
  93    if( argc < 2 )
  94       return 0;
  95
  96    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  97    reader->AllowLookupTableOff();
  98
  99    if( argc == 2 )
 100       reader->SetFileName( argv[1] );
 101    else
 102       for(int i=1; i< argc; i++)
 103          reader->AddFileName( argv[i] );
 104
 105 // TODO : allow user to choose Load Mode
 106    reader->SetLoadMode(GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ);
 107    reader->Update();
 108
 109    //print debug info:
 110    reader->GetOutput()->Print( cout );
 111
 112    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
 113
 114    vtkImageViewer *viewer = vtkImageViewer::New();
 115
 116    if( reader->GetLookupTable() )
 117    {
 118       //convert to color:
 119       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
 120       map->SetInput (reader->GetOutput());
 121       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
 122       map->SetOutputFormatToRGB();
 123       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
 124       map->Delete();
 125    }
 126    else
 127    {
 128
 129    // For a single medical image, it would be more efficient to use
 130    // 0028|1050 [DS] [Window Center]
 131    // 0028|1051 [DS] [Window Width]
 132    // but vtkgdcmReader doesn't know about them :-(
 133
 134       vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 135       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 136       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 137
 138       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
 139    }
 140    viewer->SetupInteractor (iren);
 141
 142    //vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 143    //viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 144    //viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 145
 146    // Here is where we setup the observer,
 147    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
 148    obs->ImageViewer = viewer;
 149    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
 150    obs->Delete();
 151
 152    //viewer->Render();
 153    iren->Initialize();
 154    iren->Start();
 155
 156    //if you wish you can export dicom to a vtk file
 157    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
 158    writer->SetInput( reader->GetOutput());
 159    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
 160    writer->SetFileTypeToBinary();
 161    //writer->Write();
 162
 163    reader->Delete();
 164    iren->Delete();
 165    viewer->Delete();
 166    writer->Delete();
 167
 168    return 0;
 169 }