vtk/vtkgdcmViewer2.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer2.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/08/30 15:13:10 $
   7   Version:   $Revision: 1.5 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
  19 // used in order to:
  20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
  21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
  22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
  23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
  24 //
  25 // Usage:
  26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
  27 //    given as command line arguments,
  28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
  29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
  30 //
  31 //----------------------------------------------------------------------------
  32 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  33 #include <vtkImageViewer2.h>
  34 #include <vtkStructuredPoints.h>
  35 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
  36 #include <vtkCommand.h>
  37 #include <vtkRenderer.h>
  38 #include <vtkImageMapToColors.h>
  39 #include <vtkLookupTable.h>
  40
  41 #include "vtkGdcmReader.h"
  42 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
  43
  44 #ifndef vtkFloatingPointType
  45 #define vtkFloatingPointType float
  46 #endif
  47
  48 //----------------------------------------------------------------------------
  49 // Callback for the interaction
  50 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
  51 {
  52 public:
  53    virtual char const *GetClassName() const
  54    {
  55       return "vtkgdcmObserver";
  56    }
  57    static vtkgdcmObserver *New()
  58    {
  59       return new vtkgdcmObserver;
  60    }
  61    vtkgdcmObserver()
  62    {
  63       this->ImageViewer = NULL;
  64    }
  65    virtual void Execute(vtkObject *, unsigned long event, void* )
  66    {
  67       if ( this->ImageViewer )
  68       {
  69          if ( event == vtkCommand::CharEvent )
  70          {
  71             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
  72             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
  73             ImageViewer->SetZSlice( slice );
  74             ImageViewer->GetRenderer()->ResetCameraClippingRange();
  75             ImageViewer->Render();
  76          }
  77       }
  78    }
  79    vtkImageViewer2 *ImageViewer;
  80 };
  81
  82
  83 int main(int argc, char *argv[])
  84 {
  85    if( argc < 2 )
  86       return 0;
  87
  88    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  89    reader->AllowLookupTableOff();
  90
  91    if( argc == 2 )
  92       reader->SetFileName( argv[1] );
  93    else
  94       for(int i=1; i< argc; i++)
  95          reader->AddFileName( argv[i] );
  96
  97 // TODO : allow user to choose Load Mode
  98    reader->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOWSEQ);
  99    reader->Update();
 100
 101    //print debug info:
 102    reader->GetOutput()->Print( cout );
 103
 104    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
 105
 106    vtkImageViewer2 *viewer = vtkImageViewer2::New();
 107
 108    if( reader->GetLookupTable() )
 109    {
 110       //convert to color:
 111       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
 112       map->SetInput (reader->GetOutput());
 113       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
 114       map->SetOutputFormatToRGB();
 115       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
 116       map->Delete();
 117    }
 118    else
 119    {
 120       vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 121       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 122       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 123
 124       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
 125    }
 126    viewer->SetupInteractor (iren);
 127
 128    //vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 129    //viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 130    //viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 131
 132    // Here is where we setup the observer,
 133    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
 134    obs->ImageViewer = viewer;
 135    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
 136    obs->Delete();
 137
 138    //viewer->Render();
 139    iren->Initialize();
 140    iren->Start();
 141
 142    //if you wish you can export dicom to a vtk file
 143    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
 144    writer->SetInput( reader->GetOutput());
 145    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
 146    writer->SetFileTypeToBinary();
 147    //writer->Write();
 148
 149    reader->Delete();
 150    iren->Delete();
 151    viewer->Delete();
 152    writer->Delete();
 153
 154    return 0;
 155 }