vtk/vtkgdcmViewer2.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer2.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2009/04/18 14:42:51 $
   7   Version:   $Revision: 1.16 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
  19 // used in order to:
  20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
  21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
  22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
  23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
  24 //
  25 // Usage:
  26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
  27 //    given as command line arguments,
  28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
  29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
  30 //  * if the last 'filename' == "o", overlays (group 60xx)  are loaded.
  31 //  * just a test!
  32 //
  33 //----------------------------------------------------------------------------
  34 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  35 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
  36 #include "vtkImageColorViewer.h"
  37 #else
  38 #include <vtkImageViewer2.h>
  39 #endif
  40 #include <vtkStructuredPoints.h>
  41 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
  42 #include <vtkPNGWriter.h>
  43 #include <vtkWindowToImageFilter.h>
  44 #include <vtkRenderWindow.h>
  45 #include <vtkCommand.h>
  46 #include <vtkRenderer.h>
  47 #include <vtkImageMapToColors.h>
  48 #include <vtkLookupTable.h>
  49
  50 #include "vtkGdcmReader.h"
  51 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
  52 #ifndef vtkFloatingPointType
  53 #define vtkFloatingPointType float
  54 #endif
  55
  56 //----------------------------------------------------------------------------
  57 // Callback for the interaction
  58 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
  59 {
  60 public:
  61    virtual char const *GetClassName() const
  62    {
  63       return "vtkgdcmObserver";
  64    }
  65    static vtkgdcmObserver *New()
  66    {
  67       return new vtkgdcmObserver;
  68    }
  69    vtkgdcmObserver()
  70    {
  71       this->ImageViewer = NULL;
  72    }
  73    virtual void Execute(vtkObject *caller, unsigned long event, void* /*callData*/ )
  74    {
  75       if ( this->ImageViewer )
  76       {
  77          vtkRenderWindowInteractor * rwi = vtkRenderWindowInteractor::SafeDownCast( caller );
  78          char keycode = 0;
  79          if( rwi ) keycode = rwi->GetKeyCode();
  80          if ( event == vtkCommand::CharEvent && keycode != 's' )
  81          {
  82 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
  83             int max = ImageViewer->GetSliceMax();
  84             int slice = (ImageViewer->GetSlice() + 1 ) % ++max;
  85             ImageViewer->SetSlice( slice );
  86 #else
  87             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
  88             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
  89             ImageViewer->SetZSlice( slice );
  90 #endif
  91 #if !( (VTK_MAJOR_VERSION >= 5) || ( VTK_MAJOR_VERSION == 4 && VTK_MINOR_VERSION >= 5 ) )
  92          // This used to be a bug in version VTK 4.4 and earlier
  93             ImageViewer->GetRenderer()->ResetCameraClippingRange();
  94 #endif
  95             ImageViewer->Render();
  96          }
  97          else if ( keycode == 's' )
  98          {
  99            vtkPNGWriter * writer = vtkPNGWriter::New();
 100            vtkWindowToImageFilter * w2i = vtkWindowToImageFilter::New();
 101            w2i->SetInput( rwi->GetRenderWindow() );
 102            writer->SetInput( w2i->GetOutput() );
 103            writer->SetFileName( "snapshot.png" );
 104            writer->Write();
 105            //std::cerr << "Screenshort saved to snapshot.png" << std::endl;
 106          }
 107       }
 108    }
 109 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
 110    vtkImageColorViewer *ImageViewer;
 111 #else
 112    vtkImageViewer2 *ImageViewer;
 113 #endif
 114 };
 115
 116
 117 int main(int argc, char *argv[])
 118 {
 119    if( argc < 2 )
 120       return 0;
 121
 122    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
 123    reader->AllowLookupTableOff();
 124
 125
 126    if (strcmp (argv[argc-1], "o") == 0)
 127    {
 128       argc--; // Is it allowed?!?
 129       reader->SetKeepOverlays(true);
 130    }
 131
 132 // not a very clever way to pass several params
 133 // but it's just for checking
 134    if (strcmp (argv[argc-1], "n") == 0)
 135    {
 136       argc--; // Is it allowed?!?
 137       reader->SetFlipY(false);
 138    }
 139
 140    if( argc == 2 )
 141       reader->SetFileName( argv[1] );
 142    else
 143       for(int i=1; i< argc; i++)
 144          reader->AddFileName( argv[i] );
 145
 146 // TODO : allow user to choose Load Mode
 147    reader->SetLoadMode(GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ);
 148    reader->Update();
 149
 150    //print debug info:
 151    reader->GetOutput()->Print( cout );
 152
 153    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
 154 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
 155    vtkImageColorViewer *viewer = vtkImageColorViewer::New();
 156 #else
 157    vtkImageViewer2 *viewer = vtkImageViewer2::New();
 158 #endif
 159
 160    if( reader->GetLookupTable() )
 161    {
 162       //convert to color:
 163       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
 164       map->SetInput (reader->GetOutput());
 165       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
 166       map->SetOutputFormatToRGB();
 167       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
 168       map->Delete();
 169    }
 170    else
 171    {
 172
 173    // For a single medical image, it would be more efficient to use
 174    // 0028|1050 [DS] [Window Center]
 175    // 0028|1051 [DS] [Window Width]
 176    // but vtkgdcmReader doesn't know about them :-(
 177
 178    if( reader->GetOutput()->GetNumberOfScalarComponents() == 1 )
 179      {
 180      vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 181      viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 182      viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 183      }
 184       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
 185    }
 186    viewer->SetupInteractor (iren);
 187
 188    // Here is where we setup the observer,
 189    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
 190    obs->ImageViewer = viewer;
 191    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
 192    obs->Delete();
 193
 194 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
 195    viewer->Render(); // Don't ask why...
 196 #endif
 197    iren->Initialize();
 198    iren->Start();
 199
 200    //if you wish you can export dicom to a vtk file
 201    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
 202    writer->SetInput( reader->GetOutput());
 203    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
 204    writer->SetFileTypeToBinary();
 205    //writer->Write();
 206
 207    reader->Delete();
 208    iren->Delete();
 209    viewer->Delete();
 210    writer->Delete();
 211
 212    return 0;
 213 }