vtk/vtkgdcmViewer2.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer2.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/09/13 11:32:53 $
   7   Version:   $Revision: 1.14 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
  19 // used in order to:
  20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
  21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
  22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
  23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
  24 //
  25 // Usage:
  26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
  27 //    given as command line arguments,
  28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
  29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
  30 //  * if the last 'filename' == "o", overlays (group 60xx)  are loaded.
  31 //  * just a test!
  32 //
  33 //----------------------------------------------------------------------------
  34 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  35 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
  36 #include "vtkImageColorViewer.h"
  37 #else
  38 #include <vtkImageViewer2.h>
  39 #endif
  40 #include <vtkStructuredPoints.h>
  41 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
  42 #include <vtkCommand.h>
  43 #include <vtkRenderer.h>
  44 #include <vtkImageMapToColors.h>
  45 #include <vtkLookupTable.h>
  46
  47 #include "vtkGdcmReader.h"
  48 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
  49 #ifndef vtkFloatingPointType
  50 #define vtkFloatingPointType float
  51 #endif
  52
  53 //----------------------------------------------------------------------------
  54 // Callback for the interaction
  55 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
  56 {
  57 public:
  58    virtual char const *GetClassName() const
  59    {
  60       return "vtkgdcmObserver";
  61    }
  62    static vtkgdcmObserver *New()
  63    {
  64       return new vtkgdcmObserver;
  65    }
  66    vtkgdcmObserver()
  67    {
  68       this->ImageViewer = NULL;
  69    }
  70    virtual void Execute(vtkObject *, unsigned long event, void* )
  71    {
  72       if ( this->ImageViewer )
  73       {
  74          if ( event == vtkCommand::CharEvent )
  75          {
  76 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
  77             int max = ImageViewer->GetSliceMax();
  78             int slice = (ImageViewer->GetSlice() + 1 ) % ++max;
  79             ImageViewer->SetSlice( slice );
  80 #else
  81             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
  82             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
  83             ImageViewer->SetZSlice( slice );
  84 #endif
  85 #if !( (VTK_MAJOR_VERSION >= 5) || ( VTK_MAJOR_VERSION == 4 && VTK_MINOR_VERSION >= 5 ) )
  86          // This used to be a bug in version VTK 4.4 and earlier
  87             ImageViewer->GetRenderer()->ResetCameraClippingRange();
  88 #endif
  89             ImageViewer->Render();
  90          }
  91       }
  92    }
  93 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
  94    vtkImageColorViewer *ImageViewer;
  95 #else
  96    vtkImageViewer2 *ImageViewer;
  97 #endif
  98 };
  99
 100
 101 int main(int argc, char *argv[])
 102 {
 103    if( argc < 2 )
 104       return 0;
 105
 106    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
 107    reader->AllowLookupTableOff();
 108
 109
 110    if (strcmp (argv[argc-1], "o") == 0)
 111    {
 112       argc--; // Is it allowed?!?
 113       reader->SetKeepOverlays(true);
 114    }
 115
 116    if( argc == 2 )
 117       reader->SetFileName( argv[1] );
 118    else
 119       for(int i=1; i< argc; i++)
 120          reader->AddFileName( argv[i] );
 121
 122 // TODO : allow user to choose Load Mode
 123    reader->SetLoadMode(GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ);
 124    reader->Update();
 125
 126    //print debug info:
 127    reader->GetOutput()->Print( cout );
 128
 129    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
 130 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
 131    vtkImageColorViewer *viewer = vtkImageColorViewer::New();
 132 #else
 133    vtkImageViewer2 *viewer = vtkImageViewer2::New();
 134 #endif
 135
 136    if( reader->GetLookupTable() )
 137    {
 138       //convert to color:
 139       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
 140       map->SetInput (reader->GetOutput());
 141       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
 142       map->SetOutputFormatToRGB();
 143       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
 144       map->Delete();
 145    }
 146    else
 147    {
 148
 149    // For a single medical image, it would be more efficient to use
 150    // 0028|1050 [DS] [Window Center]
 151    // 0028|1051 [DS] [Window Width]
 152    // but vtkgdcmReader doesn't know about them :-(
 153
 154    if( reader->GetOutput()->GetNumberOfScalarComponents() == 1 )
 155      {
 156      vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 157      viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 158      viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 159      }
 160       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
 161    }
 162    viewer->SetupInteractor (iren);
 163
 164    // Here is where we setup the observer,
 165    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
 166    obs->ImageViewer = viewer;
 167    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
 168    obs->Delete();
 169
 170 #if VTK_MAJOR_VERSION >= 5
 171    viewer->Render(); // Don't ask why...
 172 #endif
 173    iren->Initialize();
 174    iren->Start();
 175
 176    //if you wish you can export dicom to a vtk file
 177    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
 178    writer->SetInput( reader->GetOutput());
 179    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
 180    writer->SetFileTypeToBinary();
 181    //writer->Write();
 182
 183    reader->Delete();
 184    iren->Delete();
 185    viewer->Delete();
 186    writer->Delete();
 187
 188    return 0;
 189 }