vtk/vtkgdcmViewer2.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: vtkgdcmViewer2.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2006/05/02 10:09:43 $
   7   Version:   $Revision: 1.7 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18 // This example illustrates how the vtkGdcmReader vtk class can be
  19 // used in order to:
  20 //  * produce a simple (vtk based) Dicom image STACK VIEWER.
  21 //  * dump the stack considered as a volume in a vtkStructuredPoints
  22 //    vtk file: the vtk gdcm wrappers can be seen as a simple way to convert
  23 //    a stack of Dicom images into a native vtk volume.
  24 //
  25 // Usage:
  26 //  * the filenames of the Dicom images constituting the stack should be
  27 //    given as command line arguments,
  28 //  * you can navigate through the stack by hitting any character key,
  29 //  * the produced vtk file is named "foo.vtk" (in the invocation directory).
  30 //
  31 //----------------------------------------------------------------------------
  32 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  33 #include <vtkImageViewer2.h>
  34 #include <vtkStructuredPoints.h>
  35 #include <vtkStructuredPointsWriter.h>
  36 #include <vtkCommand.h>
  37 #include <vtkRenderer.h>
  38 #include <vtkImageMapToColors.h>
  39 #include <vtkLookupTable.h>
  40
  41 #include "vtkGdcmReader.h"
  42 #include "gdcmDocument.h"  // for NO_SHADOWSEQ
  43
  44 #ifndef vtkFloatingPointType
  45 #define vtkFloatingPointType float
  46 #endif
  47
  48 //----------------------------------------------------------------------------
  49 // Callback for the interaction
  50 class vtkgdcmObserver : public vtkCommand
  51 {
  52 public:
  53    virtual char const *GetClassName() const
  54    {
  55       return "vtkgdcmObserver";
  56    }
  57    static vtkgdcmObserver *New()
  58    {
  59       return new vtkgdcmObserver;
  60    }
  61    vtkgdcmObserver()
  62    {
  63       this->ImageViewer = NULL;
  64    }
  65    virtual void Execute(vtkObject *, unsigned long event, void* )
  66    {
  67       if ( this->ImageViewer )
  68       {
  69          if ( event == vtkCommand::CharEvent )
  70          {
  71  #if (VTK_MAJOR_VERSION >= 5)
  72             int max = ImageViewer->GetSliceMax();
  73             int slice = (ImageViewer->GetSlice() + 1 ) % ++max;
  74             ImageViewer->SetSlice( slice );
  75 #else
  76             int max = ImageViewer->GetWholeZMax();
  77             int slice = (ImageViewer->GetZSlice() + 1 ) % ++max;
  78             ImageViewer->SetZSlice( slice );
  79 #endif
  80 #if !( (VTK_MAJOR_VERSION >= 5) || ( VTK_MAJOR_VERSION == 4 && VTK_MINOR_VERSION >= 5 ) )
  81           // This used to be a bug in version VTK 4.4 and earlier
  82             ImageViewer->GetRenderer()->ResetCameraClippingRange();
  83 #endif
  84             ImageViewer->Render();
  85          }
  86       }
  87    }
  88    vtkImageViewer2 *ImageViewer;
  89 };
  90
  91
  92 int main(int argc, char *argv[])
  93 {
  94    if( argc < 2 )
  95       return 0;
  96
  97    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  98    reader->AllowLookupTableOff();
  99
 100    if( argc == 2 )
 101       reader->SetFileName( argv[1] );
 102    else
 103       for(int i=1; i< argc; i++)
 104          reader->AddFileName( argv[i] );
 105
 106 // TODO : allow user to choose Load Mode
 107    reader->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOWSEQ);
 108    reader->Update();
 109
 110    //print debug info:
 111    reader->GetOutput()->Print( cout );
 112
 113    vtkRenderWindowInteractor *iren = vtkRenderWindowInteractor::New();
 114
 115    vtkImageViewer2 *viewer = vtkImageViewer2::New();
 116
 117    if( reader->GetLookupTable() )
 118    {
 119       //convert to color:
 120       vtkImageMapToColors *map = vtkImageMapToColors::New ();
 121       map->SetInput (reader->GetOutput());
 122       map->SetLookupTable (reader->GetLookupTable());
 123       map->SetOutputFormatToRGB();
 124       viewer->SetInput ( map->GetOutput() );
 125       map->Delete();
 126    }
 127    else
 128    {
 129
 130    // For a single medical image, it would be more efficient to use
 131    // 0028|1050 [DS] [Window Center]
 132    // 0028|1051 [DS] [Window Width]
 133    // but vtkgdcmReader doesn't know about them :-(
 134
 135       vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 136       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 137       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 138
 139       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
 140    }
 141    viewer->SetupInteractor (iren);
 142
 143    //vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
 144    //viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
 145    //viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
 146
 147    // Here is where we setup the observer,
 148    vtkgdcmObserver *obs = vtkgdcmObserver::New();
 149    obs->ImageViewer = viewer;
 150    iren->AddObserver(vtkCommand::CharEvent,obs);
 151    obs->Delete();
 152
 153    //viewer->Render();
 154    iren->Initialize();
 155    iren->Start();
 156
 157    //if you wish you can export dicom to a vtk file
 158    vtkStructuredPointsWriter *writer = vtkStructuredPointsWriter::New();
 159    writer->SetInput( reader->GetOutput());
 160    writer->SetFileName( "foo.vtk" );
 161    writer->SetFileTypeToBinary();
 162    //writer->Write();
 163
 164    reader->Delete();
 165    iren->Delete();
 166    viewer->Delete();
 167    writer->Delete();
 168
 169    return 0;
 170 }